Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000476974
• Subject: XM_011244304.2
• Aligned Length: 2109
• Identities: 1671
• Gaps: 198

Alignment

Query    1  ATGGCCGACATCAAGACGGGCATCTTCGCCAAGAACGTCCAGAAGCGACTCAACCGCGCGCAGGAAAAGGTCCT  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.||.|||||.||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGGCCGACATCAAGACGGGCATCTTCGCCAAAAACGTGCAAAAGCGCCTCAACCGCGCGCAGGAAAAGGTCCT  74

Query   75  CCAAAAGCTGGGGAAAGCTGATGAGACAAAAGACGAACAGTTCGAAGAATATGTCCAGAACTTCAAACGGCAAG  148
            |||.|||||||||||.|||||.|||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.|
Sbjct   75  CCAGAAGCTGGGGAAGGCTGACGAGACAAAAGATGAACAGTTTGAAGAATATGTCCAGAACTTCAAACGGCAGG  148

Query  149  AAGCAGAGGGTACCAGACTTCAGCGAGAACTCCGAGGATATTTAGCAGCAATCAAAGGCATGCAGGAGGCCTCC  222
            |.||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.
Sbjct  149  AGGCAGAGGGTACCAGACTTCAGCGAGAACTCCGGGGATATTTAGCAGCAATCAAAGGTATGCAGGAGGCCTCA  222

Query  223  ATGAAGCTCACAGAGTCGCTGCATGAAGTCTATGAGCCTGACTGGTATGGGCGGGAAGATGTGAAAATGGTTGG  296
            |||||||||||.||.||.||.|||||||||||.|||||.|||||||||||.|||||||||||.||.||||||||
Sbjct  223  ATGAAGCTCACTGAATCTCTACATGAAGTCTACGAGCCAGACTGGTATGGACGGGAAGATGTAAAGATGGTTGG  296

Query  297  TGAGAAATGTGATGTGCTGTGGGAAGACTTCCATCAAAAACTCGTGGATGGGTCCTTGCTAACACTGGATACCT  370
            ||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||.||||||||.||||||||.||||
Sbjct  297  TGAGAAGTGTGATGTGCTGTGGGAAGACTTCCATCAAAAGCTAGTGGATGGCTCCTTGCTGACACTGGACACCT  370

Query  371  ACCTGGGGCAATTTCCTGACATAAAGAATCGCATCGCCAAGCGCAGCAGGAAGCTAGTGGACTATGACAGTGCC  444
            |||||||.||.||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.|||||.|||||.|||||.
Sbjct  371  ACCTGGGCCAGTTTCCTGACATAAAGAATCGCATCGCTAAGCGCAGCAGGAAGCTTGTGGATTATGATAGTGCT  444

Query  445  CGCCACCATCTGGAAGCTCTGCAGAGCTCCAAGAGGAAGGATGAGAGTCGAATCTCTAAGGCAGAAGAAGAATT  518
            |||||.||.|||||.|||||||||||.|||||..||||.|||||||||||.|||||||||||||||||.||.||
Sbjct  445  CGCCATCACCTGGAGGCTCTGCAGAGTTCCAAACGGAAAGATGAGAGTCGGATCTCTAAGGCAGAAGAGGAGTT  518

Query  519  TCAGAAAGCACAGAAAGTGTTTGAAGAGTTTAACGTTGACTTACAAGAAGAGTTACCATCATTATGGTCAAGAC  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||||||||||||||.||.|||||.||||||||.|
Sbjct  519  TCAGAAAGCACAGAAAGTGTTTGAAGAGTTCAATGTTGACTTACAAGAAGAGTTGCCGTCATTGTGGTCAAGTC  592

Query  593  GAGTTGGATTTTATGTTAATACTTTCAAAAACGTCTCCAGCCTTGAAGCCAAGTTTCATAAGGAAATTGCGGTG  666
            |||||||.|||||.||.||||||||||||||.||||||||||||||.||||||||||||||||||||.||.|||
Sbjct  593  GAGTTGGCTTTTACGTCAATACTTTCAAAAATGTCTCCAGCCTTGAGGCCAAGTTTCATAAGGAAATCGCAGTG  666

Query  667  CTTTGCCACAAACTGTATGAAGTGATGACAAAACTGGGTGACCAGCACGCCGACAAGGCCTTCACCATCCAAGG  740
            |||||||||||.||.||||||||||||||.|||||.|||||.|||||.||.|||||||||||||.|||.|||||
Sbjct  667  CTTTGCCACAAGCTCTATGAAGTGATGACGAAACTCGGTGATCAGCATGCTGACAAGGCCTTCAGCATTCAAGG  740

Query  741  AGCGCCCAGTGATTCGGGTCCTCTCCGCATTGCAAAGACACCATCACCGCCTGAGGAGCCTTCACCCCTCCCGA  814
            |||.||||||||.|||||||||||.|||||||||||||||||||||||.||.|||||||||||.|||||.||.|
Sbjct  741  AGCTCCCAGTGACTCGGGTCCTCTTCGCATTGCAAAGACACCATCACCTCCAGAGGAGCCTTCTCCCCTGCCCA  814

Query  815  GCCCGACAGCAAGTCCAAATCATACATTAGCACCTGCGTCTCCCGCACCAGCACGGCCTCGGTCACCTTCACAG  888
            ||||.||.||.|||||.||.||.||||||||||||||.|||||.||.||||..||.||..|.||||||||||||
Sbjct  815  GCCCCACGGCTAGTCCCAACCACACATTAGCACCTGCATCTCCTGCCCCAGTGCGACCCAGATCACCTTCACAG  888

Query  889  ACAAGGAAAGGGCCTCCTGTCCCACCTCTACCTAAAGTCACCCCGACAAAGGAACTGCAGCAGGAGAACATCAT  962
            |||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.||||||||||||.|.||||||||||||||
Sbjct  889  ACAAGGAAAGGGCCTCCTGTCCCACCTCTGCCTAAAGTCACCCCAACAAAGGAACTGAAACAGGAGAACATCAT  962

Query  963  CAGTTTCTTTGAGGACAACTTTGTTCCAGAAATCAGTGTGACAACACCTTCCCAGAATGAAGTCCCTGAGGTGA  1036
            ||.|||||||||||||||||||||.||||||||||.|||||||||||||||||||||.||||||...|||||||
Sbjct  963  CAATTTCTTTGAGGACAACTTTGTACCAGAAATCAATGTGACAACACCTTCCCAGAACGAAGTCTTGGAGGTGA  1036

Query 1037  AGAAAGAGGAGACTTTGCTGGATCTGGACTTTGATCCTTTCAAGCCCGAGGTGACACCTGCAGGTTCTGCTGGA  1110
            ||||.||.|||||||||||||||.||||||||||.||||||||||||||.|||.|.||.|||||||||||||.|
Sbjct 1037  AGAAGGAAGAGACTTTGCTGGATTTGGACTTTGACCCTTTCAAGCCCGATGTGGCTCCGGCAGGTTCTGCTGCA  1110

Query 1111  GTGACCCACTCACCCATGTCTCAGACATTGCCCTGGGACCTATGGACGACAAGCACTGATTTGGTACAGCCGGC  1184
            |.|||||||||.|||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||.||.||
Sbjct 1111  GCGACCCACTCTCCCATGTCTCAGACATTGCCCTGGGACTTATGGACGACAAGCACTGATTTGGTACAACCAGC  1184

Query 1185  TTCTGGTGGTTCATTTAATGGATTCACACAGCCCCAGGATACTTCATTATTCACAATGCAGACAGACCAGAGTA  1258
            ||||||.|||||||||||||..|||||.|||.|||||||.||||||||||||||.|||||||||||.||||.||
Sbjct 1185  TTCTGGGGGTTCATTTAATGATTTCACCCAGGCCCAGGACACTTCATTATTCACCATGCAGACAGATCAGAATA  1258

Query 1259  TGATCTGCAACTTGGCTGAATCTGAACAGGCTCCACCCACAGAGCCAAAAGCAGAGGAGCCTCTGGCTGCTGTC  1332
            |||||                           ||.|||                                    
Sbjct 1259  TGATC---------------------------CCTCCC------------------------------------  1269

Query 1333  ACACCTGCCGTTGGTCTGGACCTTGGAATGGACACTCGGGCTGAGGAGCCAGTGGAGGAGGCAGTGATCATACC  1406
                                    |.||..||.|||  |||    |||.|.|||||               |.|
Sbjct 1270  ------------------------GCAACTGATACT--GGC----GAGACTGTGGA---------------AAC  1298

Query 1407  TGGAGCTGATGCTGATGCAGCTGTTGGAACCTTGGTGTCAGCAGCTGAGGGGGCCCCAGGAGAGGAAGCAGAGG  1480
            ||.||    |||                             ||.|||||||.|||||.|..|||||||||||||
Sbjct 1299  TGCAG----TGC-----------------------------CAACTGAGGGTGCCCCGGTGGAGGAAGCAGAGG  1339

Query 1481  CGGAGACGGCCACTGTCCCTGCCGGGGAAGGAGTAAGTTTAGAGGAGGCCAAAATTGGAAC--TGAAACCACTG  1552
            |.||||.|||..|..|||||||.||.|||||||.||||..|||||..||||||||||  ||  .||||.|||.|
Sbjct 1340  CAGAGAAGGCAGCCCTCCCTGCTGGAGAAGGAGGAAGTCCAGAGGGAGCCAAAATTG--ACGGGGAAAGCACGG  1411

Query 1553  AGGGTG----CAGAGAGTGCCCAACCTGAAGCAGAGGAGCTCGAAGCAACAGTG--CCTCAGGAGAAGGTCATT  1620
            ||..||    |||.|||.||    |||.||.|||.|||||.||||||  ..|||  ||||      |||||||.
Sbjct 1412  AGCTTGCAATCAGTGAGAGC----CCTCAACCAGTGGAGCCCGAAGC--GGGTGCTCCTC------AGGTCATC  1473

Query 1621  CCTTCGGTGGTCATAGAGCCTGCCTCCAACCATGAAGAGGAAGGAGAAAAC---GAAATAACTATAGGTGCAGA  1691
            |||||.||.|||||.|||||.||||||||||||||||..|||||||||.||   ||||...|||..|||.|.||
Sbjct 1474  CCTTCTGTTGTCATTGAGCCAGCCTCCAACCATGAAGGAGAAGGAGAACACCAAGAAACTGCTACGGGTACTGA  1547

Query 1692  GCCCAAGGAGACCACCGAGGACGCGGCTCCTCCGGGCCCCACCAGC----GAGACACCGGAGCTGGCTACGGAG  1761
            .||.|.||||.||.|.|||||.|.||||.|.|.||||    .||||    ||||..|.|||..|||||||.|||
Sbjct 1548  ACCGAGGGAGGCCGCTGAGGATGTGGCTGCCCAGGGC----TCAGCGGGTGAGAAGCAGGAAGTGGCTACAGAG  1617

Query 1762  CAGAAGCCTATCCAGGACCCTCAGCCCAC---GCCT---TCTGCACCAGCCATGGGGGCT---GCTGACCAGCT  1826
            |..|.||||   |.|||..|||||.|.||   ||||   ||||||         ||.|||   |.||.|..|||
Sbjct 1618  CCCACGCCT---CTGGATTCTCAGGCAACTCTGCCTGCATCTGCA---------GGTGCTGTGGATGCCTCGCT  1679

Query 1827  AGCATCTGCAAGGGAGGCCTCTCAGGAATTGCCTCCTGGCTTTCTCTACAAGGTGGAAACACTGCATGATTTTG  1900
               .||||||.||||.|||.||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.|
Sbjct 1680  ---GTCTGCAGGGGATGCCACTCAGGAACTGCCTCCTGGCTTTCTCTACAAGGTGGAAACCCTGCATGATTTCG  1750

Query 1901  AGGCAGCAAATTCTGATGAACTTACCTTACAAAGGGGTGATGTGGTGCTGGTGGTCCCCTCAGATTCAGAAGCT  1974
            |||||||.||.|||||||||||||.|.|||||||||||||.|||||.||.|||||.||.|||||.||||||||.
Sbjct 1751  AGGCAGCGAACTCTGATGAACTTAACCTACAAAGGGGTGACGTGGTACTCGTGGTGCCTTCAGACTCAGAAGCC  1824

Query 1975  GATCAGGATGCAGGCTGGCTGGTGGGAGTGAAGGAATCAGACTGGCTTCAGTACAGAGACCTTGCCACCTACAA  2048
            ||.|||||||||||||||.|||||||.||||||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||.|||||
Sbjct 1825  GACCAGGATGCAGGCTGGTTGGTGGGGGTGAAGGAGTCAGACTGGCTTCAGTACAGAGACCTGGCCACGTACAA  1898

Query 2049  AGGCCTCTTTCCAGAGAACTTCACCCGACGCTTAGAT  2085
            ||||||||||||||||||||||||.||.|||.|.||.
Sbjct 1899  AGGCCTCTTTCCAGAGAACTTCACGCGGCGCCTGGAG  1935