Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000476974
• Subject: XM_011515271.3
• Aligned Length: 2583
• Identities: 2083
• Gaps: 498

Alignment

Query    1  ATGGCCGACATCAAGACGGGCATCTTCGCCAAGAACGTCCAGAAGCGACTCAACCGCGCGCAGGAAAAGGTCCT  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGGCCGACATCAAGACGGGCATCTTCGCCAAGAACGTCCAGAAGCGACTCAACCGCGCGCAGGAAAAGGTCCT  74

Query   75  CCAAAAGCTGGGGAAAGCTGATGAGACAAAAGACGAACAGTTCGAAGAATATGTCCAGAACTTCAAACGGCAAG  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  CCAAAAGCTGGGGAAAGCTGATGAGACAAAAGACGAACAGTTCGAAGAATATGTCCAGAACTTCAAACGGCAAG  148

Query  149  AAGCAGAGGGTACCAGACTTCAGCGAGAACTCCGAGGATATTTAGCAGCAATCAAAGGCATGCAGGAGGCCTCC  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  AAGCAGAGGGTACCAGACTTCAGCGAGAACTCCGAGGATATTTAGCAGCAATCAAAGGCATGCAGGAGGCCTCC  222

Query  223  ATGAAGCTCACAGAGTCGCTGCATGAAGTCTATGAGCCTGACTGGTATGGGCGGGAAGATGTGAAAATGGTTGG  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  ATGAAGCTCACAGAGTCGCTGCATGAAGTCTATGAGCCTGACTGGTATGGGCGGGAAGATGTGAAAATGGTTGG  296

Query  297  TGAGAAATGTGATGTGCTGTGGGAAGACTTCCATCAAAAACTCGTGGATGGGTCCTTGCTAACACTGGATACCT  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  TGAGAAATGTGATGTGCTGTGGGAAGACTTCCATCAAAAACTCGTGGATGGGTCCTTGCTAACACTGGATACCT  370

Query  371  ACCTGGGGCAATTTCCTGACATAAAGAATCGCATCGCCAAGCGCAGCAGGAAGCTAGTGGACTATGACAGTGCC  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  ACCTGGGGCAATTTCCTGACATAAAGAATCGCATCGCCAAGCGCAGCAGGAAGCTAGTGGACTATGACAGTGCC  444

Query  445  CGCCACCATCTGGAAGCTCTGCAGAGCTCCAAGAGGAAGGATGAGAGTCGAATCTCTAAGGCAGAAGAAGAATT  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  CGCCACCATCTGGAAGCTCTGCAGAGCTCCAAGAGGAAGGATGAGAGTCGAATCTCTAAGGCAGAAGAAGAATT  518

Query  519  TCAGAAAGCACAGAAAGTGTTTGAAGAGTTTAACGTTGACTTACAAGAAGAGTTACCATCATTATGGTCAAGAC  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  TCAGAAAGCACAGAAAGTGTTTGAAGAGTTTAACGTTGACTTACAAGAAGAGTTACCATCATTATGGTCAAGAC  592

Query  593  GAGTTGGATTTTATGTTAATACTTTCAAAAACGTCTCCAGCCTTGAAGCCAAGTTTCATAAGGAAATTGCGGTG  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  GAGTTGGATTTTATGTTAATACTTTCAAAAACGTCTCCAGCCTTGAAGCCAAGTTTCATAAGGAAATTGCGGTG  666

Query  667  CTTTGCCACAAACTGTATGAAGTGATGACAAAACTGGGTGACCAGCACGCCGACAAGGCCTTCACCATCCAAGG  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  CTTTGCCACAAACTGTATGAAGTGATGACAAAACTGGGTGACCAGCACGCCGACAAGGCCTTCACCATCCAAGG  740

Query  741  AGCGCCCAGTGATTCGGGTCCTCTCCGCATTGCAAAGACACCATCACCGCCTGAGGAGCCTTCACCCCTCCCGA  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  AGCGCCCAGTGATTCGGGTCCTCTCCGCATTGCAAAGACACCATCACCGCCTGAGGAGCCTTCACCCCTCCCGA  814

Query  815  GCCCGACAGCAAGTCCAAATCATACATTAGCACCTGCGTCTCCCGCACCAGCACGGCCTCGGTCACCTTCACAG  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  GCCCGACAGCAAGTCCAAATCATACATTAGCACCTGCGTCTCCCGCACCAGCACGGCCTCGGTCACCTTCACAG  888

Query  889  ACAAGGAAAGGGCCTCCTGTCCCACCTCTACCTAAAGTCACCCCGACAAAGGAACTGCAGCAGGAGAACATCAT  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  ACAAGGAAAGGGCCTCCTGTCCCACCTCTACCTAAAGTCACCCCGACAAAGGAACTGCAGCAGGAGAACATCAT  962

Query  963  CAGTTTCTTTGAGGACAACTTTGTTCCAGAAATCAGTGTGACAACACCTTCCCAGAATGAAGTCCCTGAGGTGA  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  CAGTTTCTTTGAGGACAACTTTGTTCCAGAAATCAGTGTGACAACACCTTCCCAGAATGAAGTCCCTGAGGTGA  1036

Query 1037  AGAAAGAGGAGACTTTGCTGGATCTGGACTTTGATCCTTTCAAGCCCGAGGTGACACCTGCAGGTTCTGCTGGA  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  AGAAAGAGGAGACTTTGCTGGATCTGGACTTTGATCCTTTCAAGCCCGAGGTGACACCTGCAGGTTCTGCTGGA  1110

Query 1111  GTGACCCACTCACCCATGTCTCAGACATTGCCCTGGGACCTATGGACGAC-----------AA-----------  1162
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||           ||           
Sbjct 1111  GTGACCCACTCACCCATGTCTCAGACATTGCCCTGGGACCTATGGACGACTGACTCTTCAGAAAGTCTTTCCTT  1184

Query 1163  --------------------------------------------------------------------------  1162
                                                                                      
Sbjct 1185  GTGTAACCTGATCATGGAGGAAACTCCAGACAGTGGGTTGGCCGAAGAAATTCAAAGATCTCAAAATGATATAG  1258

Query 1163  ---------------GCACTGA-------------------------------------------TTTGG----  1174
                           ||.||||                                           |||||    
Sbjct 1259  GTGCATTTACTTGGGGCCCTGACGCTAGTACAGACAGGGTCAGCCAAGAAGTTACCTCAGGTGGGTTTGGAGAA  1332

Query 1175  ----------------------------------TA-----------CAGCC----------------------  1181
                                              ||           |||||                      
Sbjct 1333  GACTCTGCATGTCCCTCCGAAACAGAGCAAGACATAAGATTATCCACCAGCCTGCTTTCGTCTGCTGACTGGCC  1406

Query 1182  --------------------------------------------------------------------------  1181
                                                                                      
Sbjct 1407  CACTGTAGCTGAAGAGAGTGAGCATGCCCCGGGGCCAGCCTTTCCAGGTGGAAATGAACAACTGCCCCCAAAGC  1480

Query 1182  --------------------------------------------------------------------------  1181
                                                                                      
Sbjct 1481  CTGCGCCGGAGGCTGGAGTTGCCATTGCTGCTTGTGTGGAGATGGAGCAGCTGTATGACCCACTTGACTCAGAC  1554

Query 1182  --------------------------------------------------------------------------  1181
                                                                                      
Sbjct 1555  ATGCCAGCCATGGACACAGCTGGCCTGTTCAAAGAAAGTCATGAAGATATGAAGAAGTCAGATGAAGAGGAAGA  1628

Query 1182  ---------------------------------------------------GGCTTCTGGTGGTTCATTTAATG  1204
                                                               |||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629  GAAACAGAAGATGGAAGATTCTCTGTGGGCAGGTGTGGAGGCGTGTCAAAAGGCTTCTGGTGGTTCATTTAATG  1702

Query 1205  GATTCACACAGCCCCAGGATACTTCATTATTCACAATGCAGACAGACCAGAGTATGATCTGCAACTTGGCTGAA  1278
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1703  GATTCACACAGCCCCAGGATACTTCATTATTCACAATGCAGACAGACCAGAGTATGATCTGCAACTTGGCTGAA  1776

Query 1279  TCTGAACAGGCTCCACCCACAGAGCCAAAAGCAGAGGAGCCTCTGGCTGCTGTCACACCTGCCGTTGGTCTGGA  1352
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1777  TCTGAACAGGCTCCACCCACAGAGCCAAAAGCAGAGGAGCCTCTGGCTGCTGTCACACCTGCCGTTGGTCTGGA  1850

Query 1353  CCTTGGAATGGACACTCGGGCTGAGGAGCCAGTGGAGGAGGCAGTGATCATACCTGGAGCTGATGCTGATGCAG  1426
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1851  CCTTGGAATGGACACTCGGGCTGAGGAGCCAGTGGAGGAGGCAGTGATCATACCTGGAGCTGATGCTGATGCAG  1924

Query 1427  CTGTTGGAACCTTGGTGTCAGCAGCTGAGGGGGCCCCAGGAGAGGAAGCAGAGGCGGAGACGGCCACTGTCCCT  1500
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||
Sbjct 1925  CTGTTGGAACCTTGGTGTCAGCAGCTGAGGGGGCCCCAGGAGAGGAAGCAGAGGCGGAGAAGGCCACTGTCCCT  1998

Query 1501  GCCGGGGAAGGAGTAAGTTTAGAGGAGGCCAAAATTGGAACTGAAACCACTGAGGGTGCAGAGAGTGCCCAACC  1574
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1999  GCCGGGGAAGGAGTAAGTTTAGAGGAGGCCAAAATTGGAACTGAAACCACTGAGGGTGCAGAGAGTGCCCAACC  2072

Query 1575  TGAAGCAGAGGAGCTCGAAGCAACAGTGCCTCAGGAGAAGGTCATTCCTTCGGTGGTCATAGAGCCTGCCTCCA  1648
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2073  TGAAGCAGAGGAGCTCGAAGCAACAGTGCCTCAGGAGAAGGTCATTCCTTCGGTGGTCATAGAGCCTGCCTCCA  2146

Query 1649  ACCATGAAGAGGAAGGAGAAAACGAAATAACTATAGGTGCAGAGCCCAAGGAGACCACCGAGGACGCGGCTCCT  1722
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2147  ACCATGAAGAGGAAGGAGAAAACGAAATAACTATAGGTGCAGAGCCCAAGGAGACCACCGAGGACGCGGCTCCT  2220

Query 1723  CCGGGCCCCACCAGCGAGACACCGGAGCTGGCTACGGAGCAGAAGCCTATCCAGGACCCTCAGCCCACGCCTTC  1796
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2221  CCGGGCCCCACCAGCGAGACACCGGAGCTGGCTACGGAGCAGAAGCCTATCCAGGACCCTCAGCCCACGCCTTC  2294

Query 1797  TGCACCAGCCATGGGGGCTGCTGACCAGCTAGCATCTGCAAGGGAGGCCTCTCAGGAATTGCCTCCTGGCTTTC  1870
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2295  TGCACCAGCCATGGGGGCTGCTGACCAGCTAGCATCTGCAAGGGAGGCCTCTCAGGAATTGCCTCCTGGCTTTC  2368

Query 1871  TCTACAAGGTGGAAACACTGCATGATTTTGAGGCAGCAAATTCTGATGAACTTACCTTACAAAGGGGTGATGTG  1944
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2369  TCTACAAGGTGGAAACACTGCATGATTTTGAGGCAGCAAATTCTGATGAACTTACCTTACAAAGGGGTGATGTG  2442

Query 1945  GTGCTGGTGGTCCCCTCAGATTCAGAAGCTGATCAGGATGCAGGCTGGCTGGTGGGAGTGAAGGAATCAGACTG  2018
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2443  GTGCTGGTGGTCCCCTCAGATTCAGAAGCTGATCAGGATGCAGGCTGGCTGGTGGGAGTGAAGGAATCAGACTG  2516

Query 2019  GCTTCAGTACAGAGACCTTGCCACCTACAAAGGCCTCTTTCCAGAGAACTTCACCCGACGCTTAGAT  2085
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2517  GCTTCAGTACAGAGACCTTGCCACCTACAAAGGCCTCTTTCCAGAGAACTTCACCCGACGCTTAGAT  2583