Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- TRCN0000476974
- Subject:
- XM_017011996.2
- Aligned Length:
- 2765
- Identities:
- 2038
- Gaps:
- 682
Alignment
Query 1 ATGGCCGACATCAAGACGGGCATCTTCGCCAAGAACGTCCAGAAGCGACTCAACCGCGCGCAGGAAAAGGTCCT 74
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ATGGCCGACATCAAGACGGGCATCTTCGCCAAGAACGTCCAGAAGCGACTCAACCGCGCGCAGGAAAAGGTCCT 74
Query 75 CCAAAAGCTGGGGAAAGCTGATGAGACAAAAGACGAACAGTTCGAAGAATATGTCCAGAACTTCAAACGGCAAG 148
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 75 CCAAAAGCTGGGGAAAGCTGATGAGACAAAAGACGAACAGTTCGAAGAATATGTCCAGAACTTCAAACGGCAAG 148
Query 149 AAGCAGAGGGTACCAGACTTCAGCGAGAACTCCGAGGATATTTAGCAGCAATCAAAGGCATGCAGGAGGCCTCC 222
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 149 AAGCAGAGGGTACCAGACTTCAGCGAGAACTCCGAGGATATTTAGCAGCAATCAAAGGCATGCAGGAGGCCTCC 222
Query 223 ATGAAGCTCACAGAGTCGCTGCATGAAGTCTATGAGCCTGACTGGTATGGGCGGGAAGATGTGAAAATGGTTGG 296
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223 ATGAAGCTCACAGAGTCGCTGCATGAAGTCTATGAGCCTGACTGGTATGGGCGGGAAGATGTGAAAATGGTTGG 296
Query 297 TGAGAAATGTGATGTGCTGTGGGAAGACTTCCATCAAAAACTCGTGGATGGGTCCTTGCTAACACTGGATACCT 370
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 297 TGAGAAATGTGATGTGCTGTGGGAAGACTTCCATCAAAAACTCGTGGATGGGTCCTTGCTAACACTGGATACCT 370
Query 371 ACCTGGGGCAATTTCCTGACATAAAGAATCGCATCGCCAAGCGCAGCAGGAAGCTAGTGGACTATGACAGTGCC 444
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 371 ACCTGGGGCAATTTCCTGACATAAAGAATCGCATCGCCAAGCGCAGCAGGAAGCTAGTGGACTATGACAGTGCC 444
Query 445 CGCCACCATCTGGAAGCTCTGCAGAGCTCCAAGAGGAAGGATGAGAGTCGAATCTCTAAGGCAGAAGAAGAATT 518
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 445 CGCCACCATCTGGAAGCTCTGCAGAGCTCCAAGAGGAAGGATGAGAGTCGAATCTCTAAGGCAGAAGAAGAATT 518
Query 519 TCAGAAAGCACAGAAAGTGTTTGAAGAGTTTAACGTTGACTTACAAGAAGAGTTACCATCATTATGGTCAAGAC 592
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 519 TCAGAAAGCACAGAAAGTGTTTGAAGAGTTTAACGTTGACTTACAAGAAGAGTTACCATCATTATGGTCAAGAC 592
Query 593 GAGTTGGATTTTATGTTAATACTTTCAAAAACGTCTCCAGCCTTGAAGCCAAGTTTCATAAGGAAATTGCGGTG 666
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 593 GAGTTGGATTTTATGTTAATACTTTCAAAAACGTCTCCAGCCTTGAAGCCAAGTTTCATAAGGAAATTGCGGTG 666
Query 667 CTTTGCCACAAACTGTATGAAGTGATGACAAAACTGGGTGACCAGCACGCCGACAAGGCCTTCACCATCCAAGG 740
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 667 CTTTGCCACAAACTGTATGAAGTGATGACAAAACTGGGTGACCAGCACGCCGACAAGGCCTTCACCATCCAAGG 740
Query 741 AGCGCCCAGTGATTCGGGTCCTCTCCGCATTGCAAAGACACCATCACCGCCTGAGGAGCCTTCACCCCTCCCGA 814
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 741 AGCGCCCAGTGATTCGGGTCCTCTCCGCATTGCAAAGACACCATCACCGCCTGAGGAGCCTTCACCCCTCCCGA 814
Query 815 GCCCGACAGCAAGTCCAAATCATACATTAGCACCTGCGTCTCCCGCACCAGCACGGCCTCGGTCACCTTCACAG 888
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 815 GCCCGACAGCAAGTCCAAATCATACATTAGCACCTGCGTCTCCCGCACCAGCACGGCCTCGGTCACCTTCACAG 888
Query 889 ACAAGGAAAGGGCCTCCTGTCCCACCTCTACCTAAAGTCACCCCGACAAAGGAACTGCAGCAGGAGAACATCAT 962
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 889 ACAAGGAAAGGGCCTCCTGTCCCACCTCTACCTAAAGTCACCCCGACAAAGGAACTGCAGCAGGAGAACATCAT 962
Query 963 CAGTTTCTTTGAGGACAACTTTGTTCCAGAAATCAGTGTGACAACACCTTCCCAGAATGAAGTCCCTGAGGTGA 1036
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 963 CAGTTTCTTTGAGGACAACTTTGTTCCAGAAATCAGTGTGACAACACCTTCCCAGAATGAAGTCCCTGAGGTGA 1036
Query 1037 AGAAAGAGGAGACTTTGCTGGATCTGGACTTTGATCCTTTCAAGCCCGAGGTGACACCTGCAGGTTCTGCTGGA 1110
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037 AGAAAGAGGAGACTTTGCTGGATCTGGACTTTGATCCTTTCAAGCCCGAGGTGACACCTGCAGGTTCTGCTGGA 1110
Query 1111 GTGACCCACTCACCCATGTCTCAGACATTGCCCTGGGACCTATGGACGAC------------AAG--------- 1163
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct 1111 GTGACCCACTCACCCATGTCTCAGACATTGCCCTGGGACCTATGGACGACTGACTCTTCAGAAAGTCTTTCCTT 1184
Query 1164 ------CACTGAT-TTGG-------TACAGCC--------GGC--------TTC-------------TGGT--- 1191
| ||||| .||| |.|||.| ||| ||| ||.|
Sbjct 1185 GTGTAAC-CTGATCATGGAGGAAACTCCAGACAGTGGGTTGGCCGAAGAAATTCAAAGATCTCAAAATGATATA 1257
Query 1192 GGTTCATTTAATGG--------------ATTCACACAG-----------------CCCCAGG------------ 1222
|||.||||||.|.| .|.||.|||| ||.||||
Sbjct 1258 GGTGCATTTACTTGGGGCCCTGACGCTAGTACAGACAGGGTCAGCCAAGAAGTTACCTCAGGTGGGTTTGGAGA 1331
Query 1223 ATACT-------TC-------------------------ATTATTCACAA-------------TGCAGACAGAC 1251
|.||| || |||||.|||.| |||.|||.|.|
Sbjct 1332 AGACTCTGCATGTCCCTCCGAAACAGAGCAAGACATAAGATTATCCACCAGCCTGCTTTCGTCTGCTGACTGGC 1405
Query 1252 C------------AGAGTATGATC-TGCAACTTGGC-------------TGAATCTGAAC-------------- 1285
| ||||..|||.| |||..|..||| ||.|..|||||
Sbjct 1406 CCACTGTAGCTGAAGAGAGTGAGCATGCCCCGGGGCCAGCCTTTCCAGGTGGAAATGAACAACTGCCCCCAAAG 1479
Query 1286 ----------AGGCT-------CC----------------------------------ACCCA-------CAGA 1301
||||| || ||||| ||||
Sbjct 1480 CCTGCGCCGGAGGCTGGAGTTGCCATTGCTGCTTGTGTGGAGATGGAGCAGCTGTATGACCCACTTGACTCAGA 1553
Query 1302 ---GCCA------------------------AAAGCA------------------------------------- 1311
|||| ||||.|
Sbjct 1554 CATGCCAGCCATGGACACAGCTGGCCTGTTCAAAGAAAGTCATGAAGATATGAAGAAGTCAGATGAAGAGGAAG 1627
Query 1312 --------------GAGGAGCCTCT---GGCTGCTGT-------------------CACACCT---GCCGTTGG 1346
||.||..|||| |||.|.||| .||| || ||..|||.
Sbjct 1628 AGAAACAGAAGATGGAAGATTCTCTGTGGGCAGGTGTGGAGGCGTGTCAAAAGGTAGACA-CTGGAGCTATTGA 1700
Query 1347 TCT-----------------------------------------------GGAC-------------------C 1354
|.| |||| |
Sbjct 1701 TATCAAGACACTAGAAGGTACAGAGGAATTTGAAGAGAAAGCATGTGAAAGGACAGGAAACAGAGTGGTAGAAC 1774
Query 1355 TT------------GGAA---------------------------------TGGACACT--------------- 1368
|| |||| ||||.|||
Sbjct 1775 TTCTTAATACCATAGGAAAGGAAGACCATAAGACCTTAAAAATTAATGAAGTGGAAACTAGAAAAGATCTAAGA 1848
Query 1369 ---CGGGCTGAGGA----------GCCAGT-------------------------------------------- 1385
.||..|.|||| ||||.|
Sbjct 1849 GCAGGGTATAAGGAAAGTACAAACGCCAATGAAAATTATTTTGAGAAAACTGACCTATTAGAAAAGGACATGGA 1922
Query 1386 -GGAGGAG------------------------------------------------------------------ 1392
|||||||
Sbjct 1923 AGGAGGAGATATGGCAAAAGAACTTAGTGACAGAGACCAAGGTCTACATGATGGAATTCAAAAGGCTTCTGGTG 1996
Query 1393 -------------------------------------------------GCAG--------------------- 1396
||||
Sbjct 1997 GTTCATTTAATGGATTCACACAGCCCCAGGATACTTCATTATTCACAATGCAGACAGACCAGAGTATGATCTGC 2070
Query 1397 ----TGATCATACCTGGAGCTGATGCTGATGCAGCTGTTGGAACCTTGGTGTCAGCAGCTGAGGGGGCCCCAGG 1466
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2071 AACTTGATCATACCTGGAGCTGATGCTGATGCAGCTGTTGGAACCTTGGTGTCAGCAGCTGAGGGGGCCCCAGG 2144
Query 1467 AGAGGAAGCAGAGGCGGAGACGGCCACTGTCCCTGCCGGGGAAGGAGTAAGTTTAGAGGAGGCCAAAATTGGAA 1540
||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2145 AGAGGAAGCAGAGGCGGAGAAGGCCACTGTCCCTGCCGGGGAAGGAGTAAGTTTAGAGGAGGCCAAAATTGGAA 2218
Query 1541 CTGAAACCACTGAGGGTGCAGAGAGTGCCCAACCTGAAGCAGAGGAGCTCGAAGCAACAGTGCCTCAGGAGAAG 1614
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2219 CTGAAACCACTGAGGGTGCAGAGAGTGCCCAACCTGAAGCAGAGGAGCTCGAAGCAACAGTGCCTCAGGAGAAG 2292
Query 1615 GTCATTCCTTCGGTGGTCATAGAGCCTGCCTCCAACCATGAAGAGGAAGGAGAAAACGAAATAACTATAGGTGC 1688
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2293 GTCATTCCTTCGGTGGTCATAGAGCCTGCCTCCAACCATGAAGAGGAAGGAGAAAACGAAATAACTATAGGTGC 2366
Query 1689 AGAGCCCAAGGAGACCACCGAGGACGCGGCTCCTCCGGGCCCCACCAGCGAGACACCGGAGCTGGCTACGGAGC 1762
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2367 AGAGCCCAAGGAGACCACCGAGGACGCGGCTCCTCCGGGCCCCACCAGCGAGACACCGGAGCTGGCTACGGAGC 2440
Query 1763 AGAAGCCTATCCAGGACCCTCAGCCCACGCCTTCTGCACCAGCCATGGGGGCTGCTGACCAGCTAGCATCTGCA 1836
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2441 AGAAGCCTATCCAGGACCCTCAGCCCACGCCTTCTGCACCAGCCATGGGGGCTGCTGACCAGCTAGCATCTGCA 2514
Query 1837 AGGGAGGCCTCTCAGGAATTGCCTCCTGGCTTTCTCTACAAGGTGGAAACACTGCATGATTTTGAGGCAGCAAA 1910
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2515 AGGGAGGCCTCTCAGGAATTGCCTCCTGGCTTTCTCTACAAGGTGGAAACACTGCATGATTTTGAGGCAGCAAA 2588
Query 1911 TTCTGATGAACTTACCTTACAAAGGGGTGATGTGGTGCTGGTGGTCCCCTCAGATTCAGAAGCTGATCAGGATG 1984
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2589 TTCTGATGAACTTACCTTACAAAGGGGTGATGTGGTGCTGGTGGTCCCCTCAGATTCAGAAGCTGATCAGGATG 2662
Query 1985 CAGGCTGGCTGGTGGGAGTGAAGGAATCAGACTGGCTTCAGTACAGAGACCTTGCCACCTACAAAGGCCTCTTT 2058
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2663 CAGGCTGGCTGGTGGGAGTGAAGGAATCAGACTGGCTTCAGTACAGAGACCTTGCCACCTACAAAGGCCTCTTT 2736
Query 2059 CCAGAGAACTTCACCCGACGCTTAGAT 2085
|||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2737 CCAGAGAACTTCACCCGACGCTTAGAT 2763