Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- TRCN0000477053
- Subject:
- NM_198094.2
- Aligned Length:
- 2385
- Identities:
- 1945
- Gaps:
- 219
Alignment
Query 1 ATGTCTGCGGAGAGCGGCCCTGGGACGAGATTGAGAAATCTGCCAGTAATGGGGGATGGACTAGAAACTTCCCA 74
||||||.|||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||
Sbjct 1 ATGTCTACGGAGAGCGGCCCTGGGACAAGATTGAGAAATCTGCCAGTAATGGGGGATGGACTAGAAACCTCCCA 74
Query 75 AATGTCTACAACACAGGCCCAGGCCCAACCCCAGCCAGCCAACGCAGCCAGCACCAACCCCCCGCCCCCAGAGA 148
||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||||||||.||.||.||||||||||
Sbjct 75 AATGTCTACAACGCAGGCCCAGGCCCAACCCCAGCCAGCAAATGCAGCCAGCACCAATCCTCCACCCCCAGAGA 148
Query 149 CCTCCAACCCTAACAAGCCCAAGAGGCAGACCAACCAACTGCAATACCTGCTCAGAGTGGTGCTCAAGACACTA 222
|||||||||||||||||||||||||.|||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 149 CCTCCAACCCTAACAAGCCCAAGAGACAGACAAACCAACTGCAATATCTGCTCAGAGTGGTGCTCAAGACACTA 222
Query 223 TGGAAACACCAGTTTGCATGGCCTTTCCAGCAGCCTGTGGATGCCGTCAAGCTGAACCTCCCTGATTACTATAA 296
|||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223 TGGAAACACCAGTTTGCGTGGCCTTTCCAGCAGCCCGTGGATGCCGTCAAGCTGAACCTCCCTGATTACTATAA 296
Query 297 GATCATTAAAACGCCTATGGATATGGGAACAATAAAGAAGCGCTTGGAAAACAACTATTACTGGAATGCTCAGG 370
|||.||||||||.||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 297 GATTATTAAAACACCCATGGATATGGGAACAATAAAGAAGCGCTTGGAAAACAACTATTACTGGAATGCTCAGG 370
Query 371 AATGTATCCAGGACTTCAACACTATGTTTACAAATTGTTACATCTACAACAAGCCTGGAGATGACATAGTCTTA 444
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.||||||
Sbjct 371 AATGTATCCAGGACTTCAACACTATGTTTACAAATTGTTACATCTATAACAAGCCTGGAGATGACATCGTCTTA 444
Query 445 ATGGCAGAAGCTCTGGAAAAGCTCTTCTTGCAAAAAATAAATGAGCTACCCACAGAAGAAACCGAGATCATGAT 518
|||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.|||||.||.||.|||||||||||.|||||||||||
Sbjct 445 ATGGCAGAAGCTCTGGAGAAGCTCTTCTTGCAAAAAATCAATGAACTGCCTACAGAAGAAACTGAGATCATGAT 518
Query 519 AGTCCAGGCAAAAGGAAGAGGACGTGGGAGGAAAGAAACAGGGACAGCAAAACCTGGCGTTTCCACGGTACCAA 592
||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||.|||||||.|||||.||.|||||||||||||
Sbjct 519 AGTCCAGGCAAAAGGAAGAGGACGAGGGAGGAAAGAAACAGGGGCAGCAAAGCCTGGTGTATCCACGGTACCAA 592
Query 593 ACACAACTCAAGCATCGACTCCTCCGCAGACCCAGACCCCTCAGCCGAA---TCCTCCTCCTGTGCAGGCCACG 663
||||||||||||||||.|||.||||||||||||||||.|||||||.||| ||||||.||||||||||||||.
Sbjct 593 ACACAACTCAAGCATCAACTTCTCCGCAGACCCAGACGCCTCAGCAGAACCCTCCTCCACCTGTGCAGGCCACA 666
Query 664 CCTCACCCCTTCCCTGCCGTCACCCCGGACCTCATCGTCCAGACCCCTGTCATGACAGTGGTGCCTCCCCAGCC 737
.||||||||||.|||||.||||||||.||||||||.|.||||.|.||||||||||||.|||||||.||.|||||
Sbjct 667 ACTCACCCCTTTCCTGCTGTCACCCCAGACCTCATTGCCCAGCCTCCTGTCATGACAATGGTGCCCCCTCAGCC 740
Query 738 ACTGCAGACGCCCCCGCCAGTGCCCCCCCAGCCACAACCCCCACCCGCTCCAGCTCCCCAGCCCGTACAGAGCC 811
|||.|||||.||..|.||.||.|||||||||||||.|||||||||.|||||||.|||.|||||.||.|||||.|
Sbjct 741 ACTTCAGACTCCTTCACCGGTACCCCCCCAGCCACCACCCCCACCTGCTCCAGTTCCACAGCCTGTGCAGAGTC 814
Query 812 ACCCACCCATCATCGCGGCCACCCCACAGCCTGTGAAGACAAAGAAGGGAGTGAAGAGGAAAGCAGACACCACC 885
||||.||||||||.|||.|||||||.||||||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||.||||||
Sbjct 815 ACCCGCCCATCATTGCGACCACCCCCCAGCCTGTGAAGACAAAGAAAGGGGTGAAGAGGAAAGCAGATACCACC 888
Query 886 ACCCCCACCACCATTGACCCCATTCACGAGCCACCCTCGCTGCCCCCGGAGCCCAAGACCACCAAGCTGGGCCA 959
|||||.||||||||.|||||||||||.|||||||||||.|||.||||.||||||||||||.||||||||||.|.
Sbjct 889 ACCCCTACCACCATCGACCCCATTCATGAGCCACCCTCACTGGCCCCAGAGCCCAAGACCGCCAAGCTGGGTCC 962
Query 960 GCGGCGGGAGAGCAGCCGGCCTGTGAAACCTCCAAAGAAGGACGTGCCCGACTCTCAGCAGCACCCAGCACCAG 1033
.|||||||||||||||.|.||||||||.||||||||||||||.||.||.|||||.|||||||||||||..||||
Sbjct 963 TCGGCGGGAGAGCAGCAGACCTGTGAAGCCTCCAAAGAAGGATGTACCGGACTCACAGCAGCACCCAGGGCCAG 1036
Query 1034 AGAAGAGCAGCAAGGTCTCGGAGCAGCTCAAGTGCTGCAGCGGCATCCTCAAGGAGATGTTTGCCAAGAAGCAC 1107
||||||||||||||.||||.||||||||.|||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||.
Sbjct 1037 AGAAGAGCAGCAAGATCTCTGAGCAGCTAAAGTGCTGCAGTGGCATCCTCAAGGAGATGTTTGCCAAGAAACAT 1110
Query 1108 GCCGCCTACGCCTGGCCCTTCTACAAGCCTGTGGACGTGGAGGCACTGGGCCTACACGACTACTGTGACATCAT 1181
||.|||||.||||||||.|||||||||||||||||.||||||||||||||.||.||||||||||||||||||||
Sbjct 1111 GCTGCCTATGCCTGGCCTTTCTACAAGCCTGTGGATGTGGAGGCACTGGGTCTGCACGACTACTGTGACATCAT 1184
Query 1182 CAAGCACCCCATGGACATGAGCACAATCAAGTCTAAACTGGAGGCCCGTGAGTACCGTGATGCTCAGGAGTTTG 1255
|||.||.||||||||||||||||||||||||||||||||.|||.||||.||||||.|.|||||.|||||.||||
Sbjct 1185 CAAACATCCCATGGACATGAGCACAATCAAGTCTAAACTAGAGTCCCGAGAGTACAGAGATGCCCAGGAATTTG 1258
Query 1256 GTGCTGACGTCCGATTGATGTTCTCCAACTGCTATAAGTACAACCCTCCTGACCATGAGGTGGTGGCCATGGCC 1329
|||||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||.|||||.||||||||.
Sbjct 1259 GTGCTGATGTCCGATTGATGTTCTCCAACTGCTACAAGTACAACCCCCCTGACCATGAAGTGGTAGCCATGGCT 1332
Query 1330 CGCAAGCTCCAGGATGTGTTCGAAATGCGCTTTGCCAAGATGCCGGACGAGCCTGAGGAGCCAGTGGTGGCCGT 1403
||.||.||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.||.||||||||.||||||||.||..|.||
Sbjct 1333 CGAAAACTCCAGGATGTGTTTGAAATGCGCTTTGCCAAGATGCCTGATGAGCCTGAAGAGCCAGTTGTTACAGT 1406
Query 1404 GTCCTCCCCGGCAGTGCCCCCTCCCACCAAGGTTGTGGCCCCGCCCTCATCCAGCGACAGCAGCAGCGATAGCT 1477
||||||.||.||||||||.||.||.||.|||||.||.|||||.||||||||.||.||||||||||||||.||.|
Sbjct 1407 GTCCTCTCCTGCAGTGCCACCCCCTACAAAGGTGGTAGCCCCACCCTCATCTAGTGACAGCAGCAGCGACAGTT 1480
Query 1478 CCTCGGACAGTGACAGTTCGACTGATGACTCTGAGGAGGAGCGAGCCCAGCGGCTGGCTGAGCTCCAGGAGCAG 1551
|.||.|||||.||||||||.|||||.|||||||||||.|||||||||||||||||||||||.||||||||.|||
Sbjct 1481 CTTCCGACAGCGACAGTTCCACTGACGACTCTGAGGAAGAGCGAGCCCAGCGGCTGGCTGAACTCCAGGAACAG 1554
Query 1552 CTCAAAGCCGTGCACGAGCAGCTTGCAGCCCTCTCTCAGCCCCAGCAGAACAAACCAAAGAAAAAGGAGAAAGA 1625
|||||.||||||||.||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.||
Sbjct 1555 CTCAAGGCCGTGCATGAGCAGCTTGCAGCCCTCTCACAGCCCCAGCAGAACAAACCAAAGAAAAAGGAGAAGGA 1628
Query 1626 CAAGAAGGAAAAGAAAAAAGAAAAGCACAAAAGGAAAGAGGAAGTGGAAGAGAATAAAAAAAGCAAAGCCAAGG 1699
||||||||||||||||||.|||||||||||||.||||||.||||||||.||.|||||||||||||||.||||||
Sbjct 1629 CAAGAAGGAAAAGAAAAAGGAAAAGCACAAAAAGAAAGAAGAAGTGGAGGAAAATAAAAAAAGCAAAACCAAGG 1702
Query 1700 AACCTCCTCCTAAAAAGACGAAGAAAAATAATAGCAGCAACAGCAATGTGAGCAAGAAGGAGCCAGCGCCCATG 1773
|||.||||||.||||||||.|||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||||..||||.|
Sbjct 1703 AACTTCCTCCCAAAAAGACAAAGAAAAATAACAGCAGCAACAGCAATGTGAGCAAGAAGGAACCAGTACCCACG 1776
Query 1774 AAGAGCAAGCCCCCTCCCACGTATGAGTCGGAGGAAGAGGACAAGTGCAAGCCTATGTCCTATGAGGAGAAGCG 1847
||||.||||||.||||||||.|||||.||.||.||.|||||.|||||.|||||.|||||.||||||||||||||
Sbjct 1777 AAGACCAAGCCGCCTCCCACATATGAATCAGAAGAGGAGGATAAGTGTAAGCCCATGTCTTATGAGGAGAAGCG 1850
Query 1848 GCAGCTCAGCTTGGACATCAACAAGCTCCCCGGCGAGAAGCTGGGCCGCGTGGTGCACATCATCCAGTCACGGG 1921
||||||.||..|.||.||||||||.||.||.||.||||||||.|||||.||.||.|||||.||.||||||.|||
Sbjct 1851 GCAGCTAAGTCTAGATATCAACAAACTTCCTGGTGAGAAGCTAGGCCGTGTAGTACACATAATTCAGTCAAGGG 1924
Query 1922 AGCCCTCCCTGAAGAATTCCAACCCCGACGAGATTGAAATCGACTTTGAGACCCTGAAGCCGTCCACACTGCGT 1995
|.||.||.||.||.||.|||||||||||.||||||||.||.||||||||||||||||||||.||.|||||.||.
Sbjct 1925 AACCATCACTTAAAAACTCCAACCCCGATGAGATTGAGATTGACTTTGAGACCCTGAAGCCATCTACACTACGA 1998
Query 1996 GAGCTGGAGCGCTATGTCACCTCCTGTTTGCGGAAGAAAAGGAAACCTCAAGCTGAGAAAGTTGATGTGATTGC 2069
|||.|||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.||||||||
Sbjct 1999 GAGTTGGAGCGATATGTCACCTCCTGTTTGCGGAAGAAAAGGAAACCTCAAGCTGAAAAAGTTGACGTGATTGC 2072
Query 2070 CGGCTCCTCCAAGATGAAGGGCTTCTCGTCCTCAGAGTCGGAGAGCTCCAGTGAGTCCAGCTCCTCTGACAGCG 2143
.||.||.||||||||||||||.|||||.|||||.||||||||||||.||||.||.|||||||||||||||||.|
Sbjct 2073 TGGTTCTTCCAAGATGAAGGGATTCTCATCCTCTGAGTCGGAGAGCACCAGCGAATCCAGCTCCTCTGACAGTG 2146
Query 2144 AAGACTCCGAAACAGCTTTCTGCACCAGTGGAGACTTCGTGTCCCCAGGGCCTTCCCCGTATCACAGTCACGTG 2217
|||||||.||||||| .|.||||.
Sbjct 2147 AAGACTCTGAAACAG-GTCCTGCC-------------------------------------------------- 2169
Query 2218 CAGTGCGGCCGCTTCAGGGAGATGCTTCGCTGGTTTCTGGTGGATGTGGAGCAGACTGCAGCTGGCCAGCCGCA 2291
Sbjct 2170 -------------------------------------------------------------------------- 2169
Query 2292 TCGCCAGTCTGCTGCTGGCCCTGCCATCACCTGGGCCCCAGCCATTGCCTACCCCTCCCCAGAGTGTGCTCGTT 2365
Sbjct 2170 -------------------------------------------------------------------------- 2169
Query 2366 GCTGTGTTGGCTGCTCC 2382
Sbjct 2170 ----------------- 2169