Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- TRCN0000477053
- Subject:
- XM_011527856.3
- Aligned Length:
- 2382
- Identities:
- 2163
- Gaps:
- 216
Alignment
Query 1 ATGTCTGCGGAGAGCGGCCCTGGGACGAGATTGAGAAATCTGCCAGTAATGGGGGATGGACTAGAAACTTCCCA 74
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ATGTCTGCGGAGAGCGGCCCTGGGACGAGATTGAGAAATCTGCCAGTAATGGGGGATGGACTAGAAACTTCCCA 74
Query 75 AATGTCTACAACACAGGCCCAGGCCCAACCCCAGCCAGCCAACGCAGCCAGCACCAACCCCCCGCCCCCAGAGA 148
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 75 AATGTCTACAACACAGGCCCAGGCCCAACCCCAGCCAGCCAACGCAGCCAGCACCAACCCCCCGCCCCCAGAGA 148
Query 149 CCTCCAACCCTAACAAGCCCAAGAGGCAGACCAACCAACTGCAATACCTGCTCAGAGTGGTGCTCAAGACACTA 222
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 149 CCTCCAACCCTAACAAGCCCAAGAGGCAGACCAACCAACTGCAATACCTGCTCAGAGTGGTGCTCAAGACACTA 222
Query 223 TGGAAACACCAGTTTGCATGGCCTTTCCAGCAGCCTGTGGATGCCGTCAAGCTGAACCTCCCTGATTACTATAA 296
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223 TGGAAACACCAGTTTGCATGGCCTTTCCAGCAGCCTGTGGATGCCGTCAAGCTGAACCTCCCTGATTACTATAA 296
Query 297 GATCATTAAAACGCCTATGGATATGGGAACAATAAAGAAGCGCTTGGAAAACAACTATTACTGGAATGCTCAGG 370
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 297 GATCATTAAAACGCCTATGGATATGGGAACAATAAAGAAGCGCTTGGAAAACAACTATTACTGGAATGCTCAGG 370
Query 371 AATGTATCCAGGACTTCAACACTATGTTTACAAATTGTTACATCTACAACAAGCCTGGAGATGACATAGTCTTA 444
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 371 AATGTATCCAGGACTTCAACACTATGTTTACAAATTGTTACATCTACAACAAGCCTGGAGATGACATAGTCTTA 444
Query 445 ATGGCAGAAGCTCTGGAAAAGCTCTTCTTGCAAAAAATAAATGAGCTACCCACAGAAGAAACCGAGATCATGAT 518
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 445 ATGGCAGAAGCTCTGGAAAAGCTCTTCTTGCAAAAAATAAATGAGCTACCCACAGAAGAAACCGAGATCATGAT 518
Query 519 AGTCCAGGCAAAAGGAAGAGGACGTGGGAGGAAAGAAACAGGGACAGCAAAACCTGGCGTTTCCACGGTACCAA 592
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 519 AGTCCAGGCAAAAGGAAGAGGACGTGGGAGGAAAGAAACAGGGACAGCAAAACCTGGCGTTTCCACGGTACCAA 592
Query 593 ACACAACTCAAGCATCGACTCCTCCGCAGACCCAGACCCCTCAGCCGAATCCTCCTCCTGTGCAGGCCACGCCT 666
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 593 ACACAACTCAAGCATCGACTCCTCCGCAGACCCAGACCCCTCAGCCGAATCCTCCTCCTGTGCAGGCCACGCCT 666
Query 667 CACCCCTTCCCTGCCGTCACCCCGGACCTCATCGTCCAGACCCCTGTCATGACAGTGGTGCCTCCCCAGCCACT 740
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 667 CACCCCTTCCCTGCCGTCACCCCGGACCTCATCGTCCAGACCCCTGTCATGACAGTGGTGCCTCCCCAGCCACT 740
Query 741 GCAGACGCCCCCGCCAGTGCCCCCCCAGCCACAACCCCCACCCGCTCCAGCTCCCCAGCCCGTACAGAGCCACC 814
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 741 GCAGACGCCCCCGCCAGTGCCCCCCCAGCCACAACCCCCACCCGCTCCAGCTCCCCAGCCCGTACAGAGCCACC 814
Query 815 CACCCATCATCGCGGCCACCCCACAGCCTGTGAAGACAAAGAAGGGAGTGAAGAGGAAAGCAGACACCACCACC 888
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 815 CACCCATCATCGCGGCCACCCCACAGCCTGTGAAGACAAAGAAGGGAGTGAAGAGGAAAGCAGACACCACCACC 888
Query 889 CCCACCACCATTGACCCCATTCACGAGCCACCCTCGCTGCCCCCGGAGCCCAAGACCACCAAGCTGGGCCAGCG 962
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 889 CCCACCACCATTGACCCCATTCACGAGCCACCCTCGCTGCCCCCGGAGCCCAAGACCACCAAGCTGGGCCAGCG 962
Query 963 GCGGGAGAGCAGCCGGCCTGTGAAACCTCCAAAGAAGGACGTGCCCGACTCTCAGCAGCACCCAGCACCAGAGA 1036
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 963 GCGGGAGAGCAGCCGGCCTGTGAAACCTCCAAAGAAGGACGTGCCCGACTCTCAGCAGCACCCAGCACCAGAGA 1036
Query 1037 AGAGCAGCAAGGTCTCGGAGCAGCTCAAGTGCTGCAGCGGCATCCTCAAGGAGATGTTTGCCAAGAAGCACGCC 1110
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037 AGAGCAGCAAGGTCTCGGAGCAGCTCAAGTGCTGCAGCGGCATCCTCAAGGAGATGTTTGCCAAGAAGCACGCC 1110
Query 1111 GCCTACGCCTGGCCCTTCTACAAGCCTGTGGACGTGGAGGCACTGGGCCTACACGACTACTGTGACATCATCAA 1184
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111 GCCTACGCCTGGCCCTTCTACAAGCCTGTGGACGTGGAGGCACTGGGCCTACACGACTACTGTGACATCATCAA 1184
Query 1185 GCACCCCATGGACATGAGCACAATCAAGTCTAAACTGGAGGCCCGTGAGTACCGTGATGCTCAGGAGTTTGGTG 1258
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185 GCACCCCATGGACATGAGCACAATCAAGTCTAAACTGGAGGCCCGTGAGTACCGTGATGCTCAGGAGTTTGGTG 1258
Query 1259 CTGACGTCCGATTGATGTTCTCCAACTGCTATAAGTACAACCCTCCTGACCATGAGGTGGTGGCCATGGCCCGC 1332
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259 CTGACGTCCGATTGATGTTCTCCAACTGCTATAAGTACAACCCTCCTGACCATGAGGTGGTGGCCATGGCCCGC 1332
Query 1333 AAGCTCCAGGATGTGTTCGAAATGCGCTTTGCCAAGATGCCGGACGAGCCTGAGGAGCCAGTGGTGGCCGTGTC 1406
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333 AAGCTCCAGGATGTGTTCGAAATGCGCTTTGCCAAGATGCCGGACGAGCCTGAGGAGCCAGTGGTGGCCGTGTC 1406
Query 1407 CTCCCCGGCAGTGCCCCCTCCCACCAAGGTTGTGGCCCCGCCCTCATCCAGCGACAGCAGCAGCGATAGCTCCT 1480
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407 CTCCCCGGCAGTGCCCCCTCCCACCAAGGTTGTGGCCCCGCCCTCATCCAGCGACAGCAGCAGCGATAGCTCCT 1480
Query 1481 CGGACAGTGACAGTTCGACTGATGACTCTGAGGAGGAGCGAGCCCAGCGGCTGGCTGAGCTCCAGGAGCAGCTC 1554
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481 CGGACAGTGACAGTTCGACTGATGACTCTGAGGAGGAGCGAGCCCAGCGGCTGGCTGAGCTCCAGGAGCAGCTC 1554
Query 1555 AAAGCCGTGCACGAGCAGCTTGCAGCCCTCTCTCAGCCCCAGCAGAACAAACCAAAGAAAAAGGAGAAAGACAA 1628
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555 AAAGCCGTGCACGAGCAGCTTGCAGCCCTCTCTCAGCCCCAGCAGAACAAACCAAAGAAAAAGGAGAAAGACAA 1628
Query 1629 GAAGGAAAAGAAAAAAGAAAAGCACAAAAGGAAAGAGGAAGTGGAAGAGAATAAAAAAAGCAAAGCCAAGGAAC 1702
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629 GAAGGAAAAGAAAAAAGAAAAGCACAAAAGGAAAGAGGAAGTGGAAGAGAATAAAAAAAGCAAAGCCAAGGAAC 1702
Query 1703 CTCCTCCTAAAAAGACGAAGAAAAATAATAGCAGCAACAGCAATGTGAGCAAGAAGGAGCCAGCGCCCATGAAG 1776
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1703 CTCCTCCTAAAAAGACGAAGAAAAATAATAGCAGCAACAGCAATGTGAGCAAGAAGGAGCCAGCGCCCATGAAG 1776
Query 1777 AGCAAGCCCCCTCCCACGTATGAGTCGGAGGAAGAGGACAAGTGCAAGCCTATGTCCTATGAGGAGAAGCGGCA 1850
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1777 AGCAAGCCCCCTCCCACGTATGAGTCGGAGGAAGAGGACAAGTGCAAGCCTATGTCCTATGAGGAGAAGCGGCA 1850
Query 1851 GCTCAGCTTGGACATCAACAAGCTCCCCGGCGAGAAGCTGGGCCGCGTGGTGCACATCATCCAGTCACGGGAGC 1924
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1851 GCTCAGCTTGGACATCAACAAGCTCCCCGGCGAGAAGCTGGGCCGCGTGGTGCACATCATCCAGTCACGGGAGC 1924
Query 1925 CCTCCCTGAAGAATTCCAACCCCGACGAGATTGAAATCGACTTTGAGACCCTGAAGCCGTCCACACTGCGTGAG 1998
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1925 CCTCCCTGAAGAATTCCAACCCCGACGAGATTGAAATCGACTTTGAGACCCTGAAGCCGTCCACACTGCGTGAG 1998
Query 1999 CTGGAGCGCTATGTCACCTCCTGTTTGCGGAAGAAAAGGAAACCTCAAGCTGAGAAAGTTGATGTGATTGCCGG 2072
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1999 CTGGAGCGCTATGTCACCTCCTGTTTGCGGAAGAAAAGGAAACCTCAAGCTGAGAAAGTTGATGTGATTGCCGG 2072
Query 2073 CTCCTCCAAGATGAAGGGCTTCTCGTCCTCAGAGTCGGAGAGCTCCAGTGAGTCCAGCTCCTCTGACAGCGAAG 2146
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2073 CTCCTCCAAGATGAAGGGCTTCTCGTCCTCAGAGTCGGAGAGCTCCAGTGAGTCCAGCTCCTCTGACAGCGAAG 2146
Query 2147 ACTCCGAAACAGCTTTCTGCACCAGTGGAGACTTCGTGTCCCCAGGGCCTTCCCCGTATCACAGTCACGTGCAG 2220
|||||||||||| .|.||||.
Sbjct 2147 ACTCCGAAACAG-GTCCTGCC----------------------------------------------------- 2166
Query 2221 TGCGGCCGCTTCAGGGAGATGCTTCGCTGGTTTCTGGTGGATGTGGAGCAGACTGCAGCTGGCCAGCCGCATCG 2294
Sbjct 2167 -------------------------------------------------------------------------- 2166
Query 2295 CCAGTCTGCTGCTGGCCCTGCCATCACCTGGGCCCCAGCCATTGCCTACCCCTCCCCAGAGTGTGCTCGTTGCT 2368
Sbjct 2167 -------------------------------------------------------------------------- 2166
Query 2369 GTGTTGGCTGCTCC 2382
Sbjct 2167 -------------- 2166