Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- TRCN0000477061
- Subject:
- NR_109784.1
- Aligned Length:
- 2226
- Identities:
- 1134
- Gaps:
- 1092
Alignment
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 1 AGACGCCTGAGTCGGAGAGACAGGGGGCAGAGGTTGCCAAGCCCTGGCTGCCACTTGTCAGGTTCCCTGTGCTA 74
Query 1 ---ATGCATAATCTGTATTCCATCACTGGGTACCCGGACCCACCAGGGACCATGGAGGAGGAGGAGGAGGATGA 71
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 75 GACATGCATAATCTGTATTCCATCACTGGGTACCCGGACCCACCAGGGACCATGGAGGAGGAGGAGGAGGATGA 148
Query 72 TGACTATGAGAACTCAACACCTCCCTACAAGGACCTTCCTCCCAAGCCAGGGACCATGGAGGAGGAGGAGGAGG 145
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 149 TGACTATGAGAACTCAACACCTCCCTACAAGGACCTTCCTCCCAAGCCAGGGACCATGGAGGAGGAGGAGGAGG 222
Query 146 ATGATGACTATGAGAACTCAACACCTCCCTACAAGGACCTTCCTCCCAAGCCCAGGGACCATGGAGGAGGAGGA 219
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
Sbjct 223 ATGATGACTATGAGAACTCAACACCTCCCTACAAGGACCTTCCTCCCAAG-CCAGGGACCATGGAGGAGGAGGA 295
Query 220 GGAGGATGATGACTATGAGAACTCAACACCTCCCTACAAGGACCTTCCTCCCAAGCCAGGTTCAAGTGCTCCAC 293
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 296 GGAGGATGATGACTATGAGAACTCAACACCTCCCTACAAGGACCTTCCTCCCAAGCCAGGTTCAAGTGCTCCAC 369
Query 294 CAAGACCTCCAAGGGCAGCAAAGGAAACAGAGAAACCCCCACTTCCTTGCAAGCCCCGGAACATGACAGGCCTG 367
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 370 CAAGACCTCCAAGGGCAGCAAAGGAAACAGAGAAACCCCCACTTCCTTGCAAGCCCCGGAACATGACAGGCCTG 443
Query 368 GACCTCGCCGCTGTCACCTGTCCACCTCCTCAACTGGCTGTGAATCTTGAGCCTTCTCCATTGCAGCCATCCCT 441
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 444 GACCTCGCCGCTGTCACCTGTCCACCTCCTCAACTGGCTGTGAATCTTGAGCCTTCTCCATTGCAGCCATCCCT 517
Query 442 GGCCGCAACTCCAGTCCCCTGGCTCAATCAGAGGTCTGGAGGTCCTGGCTGCTGCCAGAAGAGGTGGATGGTGT 515
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 518 GGCCGCAACTCCAGTCCCCTGGCTCAATCAGAGGTCTGGAGGTCCTGGCTGCTGCCAGAAGAGGTGGATGGTGT 591
Query 516 ACCTGTGTCTGCTGGTGGTGACTTCCCTGTTCCTGGGCTGCCTTGGTCTCACTGTGACCCTGATTAAGTACCAG 589
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 592 ACCTGTGTCTGCTGGTGGTGACTTCCCTGTTCCTGGGCTGCCTTGGTCTCACTGTGACCCTGATTAAGTACCAG 665
Query 590 GAGTTGATGGAAGAACTGAGAATGTTAAGCTTTCAGCAGATGACGTGGCGAACAAATA---------------- 647
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 666 GAGTTGATGGAAGAACTGAGAATGTTAAGCTTTCAGCAGATGACGTGGCGAACAAATATCCGTGGTGGATGGGT 739
Query 648 -----------------------------------------------TGACTGGCATGGCAGGGCTAGCTGGCC 674
|||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 740 AGGATGGGTTCTCAGTCTGTAGCCCTCAAGCCCATCCCTTCTGACAGTGACTGGCATGGCAGGGCTAGCTGGCC 813
Query 675 TGAAGCATGACATTGCCCGTGTAAGAGCTGACACCAACCAGTCCCTGGTGGAACTTTGGGGCTTATTAGACTGC 748
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 814 TGAAGCATGACATTGCCCGTGTAAGAGCTGACACCAACCAGTCCCTGGTGGAACTTTGGGGCTTATTAGACTGC 887
Query 749 CGCCGAATTACCTGTCCTGAAGGCTGGCTGCCCTTTGAGGGCAAGTGTTACTACTTCTCCCCAAGCACCAAGTC 822
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 888 CGCCGAATTACCTGTCCTGAAGGCTGGCTGCCCTTTGAGGGCAAGTGTTACTACTTCTCCCCAAGCACCAAGTC 961
Query 823 ATGGGATGAGGCCCGGATGTTCTGCCAGGAGAATTACTCTCACTTGGTCATCATCAATAGCTTTGCTGAGCACA 896
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 962 ATGGGATGAGGCCCGGATGTTCTGCCAGGAGAATTACTCTCACTTGGTCATCATCAATAGCTTTGCTGAGCACA 1035
Query 897 ATTTTGTGGCCAAGGCCCATGGCTCTCCACGGGTGTACTGGCTGGGGCTGAATGACAGGGCCCAGGAAGGGGAC 970
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1036 ATTTTGTGGCCAAGGCCCATGGCTCTCCACGGGTGTACTGGCTGGGGCTGAATGACAGGGCCCAGGAAGGGGAC 1109
Query 971 TGGAGGTGGCTGGATGGGTCTCCTGTGACATTAAGCTTCTGGGAGCCAGAGGAACCCAATAACATCCACGATGA 1044
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1110 TGGAGGTGGCTGGATGGGTCTCCTGTGACATTAAGCTTCTGGGAGCCAGAGGAACCCAATAACATCCACGATGA 1183
Query 1045 GGACTGTGCTACCATGAACAAAGGTGGCACCTGGAATGATCTCTCTTGCTACAAAACTACGTATTGGATTTGTG 1118
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1184 GGACTGTGCTACCATGAACAAAGGTGGCACCTGGAATGATCTCTCTTGCTACAAAACTACGTATTGGATTTGTG 1257
Query 1119 AGCGGAAATGTTCCTGT--------------------------------------------------------- 1135
|||||||||||||||||
Sbjct 1258 AGCGGAAATGTTCCTGTTGAAGCCCAGGGCCGAGGCTGGGGGTCCATATCTGAGTGTCTCTTTGAGATGAGAAT 1331
Query 1136 -------------------------------------------------------------------------- 1135
Sbjct 1332 CTCCTGCCCTTTCGTGGACGGCCTTGCCTCTTCGTGAGTGGACACACAGATGTGCCTCAAACAGGATTGGCACC 1405
Query 1136 -------------------------------------------------------------------------- 1135
Sbjct 1406 CTGGATGCAGCAAGTTCCCAGGGGTGCAAGTCAGGCTGTTTCTAGAGTGAGGACTTGGGCTTGCCCTAGTAGAT 1479
Query 1136 -------------------------------------------------------------------------- 1135
Sbjct 1480 GGTGAGCTGGGAGGATGCTCAGAGCTTGGTGGTGGGAGGTCTCCCACTTCTGGGGTTGAAAGGATCTTCACTAA 1553
Query 1136 -------------------------------------------------------------------------- 1135
Sbjct 1554 GTTCCTGATCATGACTCTTGGGAAGTGATACTAGCCCTGAGGACCCTGGGGCTGGTGTTGAACCTGGGATGAAA 1627
Query 1136 -------------------------------------------------------------------------- 1135
Sbjct 1628 TATCCTGGCGCCTGTGAACCACAAAGAGCTGGGACTGGGCTCCTTTTCCTGCAGCCTCAAACTTCTGGGCTCAG 1701
Query 1136 -------------------------------------------------------------------------- 1135
Sbjct 1702 GTGATCCTCCCATCTCAGCCTCCTGAGTAGCTGGGACTACACATGCGCACCACCATGCCTGGCCAATTTTTTGT 1775
Query 1136 -------------------------------------------------------------------------- 1135
Sbjct 1776 AGCATTTAAAGAGAGGGAGTCTCACTATGTTGCCCAGGCCAGTCTCAAACTCCTTGCCTCAATGGATCCTCCTA 1849
Query 1136 -------------------------------------------------------------------------- 1135
Sbjct 1850 CTTGGGCTTCCCAAATTGTGAGGATTACAGGTGTGAGCCACTGTGCCTGGCTCAAAATTATTATTATTATTTTT 1923
Query 1136 -------------------------------------------------------------------------- 1135
Sbjct 1924 ATAGAGATGAGGTCTCACTCTGTTGCCGAGGCTGGTCTCAAACTCCTGGGGTCAAGCAATCCTTCCGTGATGGC 1997
Query 1136 -------------------------------------------------------------------------- 1135
Sbjct 1998 CTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCATGTGTCACCGTACCTGGCCGATATTTTTATTTTTATTTTTACTTTCCC 2071
Query 1136 -------------------------------------------------------------------------- 1135
Sbjct 2072 CATCTTTTCCTTTTTTTTTTTTTTCCAAACAAAAGCTTTGAAAGTGGTGACAGAAAAATTTCCCTTTGAGCTAG 2145
Query 1136 -------------------------------------------------------------------------- 1135
Sbjct 2146 ACCTCTAGATCTGCCTCGCACAGAAATACATTAAGTGGGCTGGTCTCATGTAGTCCCCACATCATTGCAAATTA 2219
Query 1136 ------ 1135
Sbjct 2220 CAAACC 2225
