Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000477191
• Subject: XM_011519377.2
• Aligned Length: 2485
• Identities: 2451
• Gaps: 32

Alignment

Query    1  ATGCAGAATTCTGTATCAGTACCACCAAAAGAT-GAAGGTGAATCAAACATCCCTTCTGGAACAATACAGAGTA  73
                                           || ||..||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  -------------------------------ATGGATAGTGAATCAAACATCCCTTCTGGAACAATACAGAGTA  43

Query   74  GGAAAGGTTTGCAGAATAAGAGTCAGTTTAGGACCATTGCACCAAAAATTGTGCCCAAAGTCCTAACGTCCAGA  147
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   44  GGAAAGGTTTGCAGAATAAGAGTCAGTTTAGGACCATTGCACCAAAAATTGTGCCCAAAGTCCTAACGTCCAGA  117

Query  148  ATGCTGCCATGTCATTCACCATCACGCTCTGATCAGGTGAATCTGGGACCCTCCATCAACTCCAAGCTGCTGGG  221
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  118  ATGCTGCCATGTCATTCACCATCACGCTCTGATCAGGTGAATCTGGGACCCTCCATCAACTCCAAGCTGCTGGG  191

Query  222  GATGTCCACCCAGAACTATGCCCTGATGCAGGTTGCTGGCCAGGAGGGGACATTTTCTCTTGTTGCTCTGCCAC  295
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  192  GATGTCCACCCAGAACTATGCCCTGATGCAGGTTGCTGGCCAGGAGGGGACATTTTCTCTTGTTGCTCTGCCAC  265

Query  296  ATGTTGCCTCAGCTCAGCCAATTCAGAAACCCAGAATGTCCCTACCTGAAAACCTGAAACTTCCTATTCCTAGA  369
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  266  ATGTTGCCTCAGCTCAGCCAATTCAGAAACCCAGAATGTCCCTACCTGAAAACCTGAAACTTCCTATTCCTAGA  339

Query  370  TATCAACCCCCTAGAAATAGCAAAGCATCAAGAAAGAAACCCATCCTGATCTTTCCTAAGAGTGGCTGTAGCAA  443
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  340  TATCAACCCCCTAGAAATAGCAAAGCATCAAGAAAGAAACCCATCCTGATCTTTCCTAAGAGTGGCTGTAGCAA  413

Query  444  AGCTCCTGCCCAAACCCAAATGTGTCCTCAGATGTCCCCTTCCCCACCTCACCACCCTGAACTCCTGTACAAAC  517
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  414  AGCTCCTGCCCAAACCCAAATGTGTCCTCAGATGTCCCCTTCCCCACCTCACCACCCTGAACTCCTGTACAAAC  487

Query  518  CCAGTCCATTTGAGGAAGTACCATCACTAGAGCAAGCCCCAGCCAGCATTAGCACAGCTGCGCTGACCAATGGA  591
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  488  CCAGTCCATTTGAGGAAGTACCATCACTAGAGCAAGCCCCAGCCAGCATTAGCACAGCTGCGCTGACCAATGGA  561

Query  592  AGTGACCATGGGGACTTGAGACCACCAGTGACCAACACCCATGGCAGTCTGAACCCTCCTGCTACCCCAGCATC  665
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  562  AGTGACCATGGGGACTTGAGACCACCAGTGACCAACACCCATGGCAGTCTGAACCCTCCTGCTACCCCAGCATC  635

Query  666  ATCCACACCAGAGGAGCCTGCCAAGCAGGACCTCACAGCTCTTTCAGGGAAAGCACACTTTGTAAGCAAGATAA  739
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  636  ATCCACACCAGAGGAGCCTGCCAAGCAGGACCTCACAGCTCTTTCAGGGAAAGCACACTTTGTAAGCAAGATAA  709

Query  740  CATCTAGTAAACCTTCTGCTGTTGCCAGTGAAAAATTTAAAGAACAAGTTGATCTTGCAAAAACCATGACCAAT  813
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  710  CATCTAGTAAACCTTCTGCTGTTGCCAGTGAAAAATTTAAAGAACAAGTTGATCTTGCAAAAACCATGACCAAT  783

Query  814  TTATCACCAACCATTCTTGGCAATGCAGTTCAGTTGATCTCTTCAGTCCCCAAAGGGAAACTGCCAATCCCACC  887
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  784  TTATCACCAACCATTCTTGGCAATGCAGTTCAGTTGATCTCTTCAGTCCCCAAAGGGAAACTGCCAATCCCACC  857

Query  888  CTACTCAAGAATGAAGACAATGGAGGTTTACAAAATCAAATCAGATGCTAACATTGCAGGTTTTTCTTTACCAG  961
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  858  CTACTCAAGAATGAAGACAATGGAGGTTTACAAAATCAAATCAGATGCTAACATTGCAGGTTTTTCTTTACCAG  931

Query  962  GACCTAAGGCCGACTGTGATAAGATACCCTCCACCACAGAAGGCTTTAATGCAGCCACCAAGGTGGCAAGCAGG  1035
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  932  GACCTAAGGCCGACTGTGATAAGATACCCTCCACCACAGAAGGCTTTAATGCAGCCACCAAGGTGGCAAGCAGG  1005

Query 1036  CTACCTGTTCCACAAGTGTCACAGCAGAGTGCCTGTGAAAGTGCCTTTTGTCCACCCACCAAACTTGATCTTAA  1109
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1006  CTACCTGTTCCACAAGTGTCACAGCAGAGTGCCTGTGAAAGTGCCTTTTGTCCACCCACCAAACTTGATCTTAA  1079

Query 1110  CCACAAAACAAAACTGAACAGTGGAGCAGCAAAGAGAAAAGGAAGAAAACGGAAGGTACCAGATGAAATTTTGG  1183
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1080  CCACAAAACAAAACTGAACAGTGGAGCAGCAAAGAGAAAAGGAAGAAAACGGAAGGTACCAGATGAAATTTTGG  1153

Query 1184  CATTTCAGGGAAAAAGGAGGAAATATATCATTAATAAGTGTAGAGATGGTAAAGAAAGAGTAAAAAATGATCCC  1257
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1154  CATTTCAGGGAAAAAGGAGGAAATATATCATTAATAAGTGTAGAGATGGTAAAGAAAGAGTAAAAAATGATCCC  1227

Query 1258  CAAGAATTCAGAGACCAAAAGCTGGGGACCCTGAAAAAATACCGTAGCATTATGCCCAAACCTATCATGGTCAT  1331
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1228  CAAGAATTCAGAGACCAAAAGCTGGGGACCCTGAAAAAATACCGTAGCATTATGCCCAAACCTATCATGGTCAT  1301

Query 1332  ACCCACTTTGGCCTCCCTGGCTTCTCCAACTACACTACAGTCCCAGATGCTTGGGGGCCTAGGACAGGATGTTT  1405
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1302  ACCCACTTTGGCCTCCCTGGCTTCTCCAACTACACTACAGTCCCAGATGCTTGGGGGCCTAGGACAGGATGTTT  1375

Query 1406  TGTTAAATAATTCACTCACTCCTAAATATCTTGGCTGTAAGCAAGACAACAGCTCTTCCCCTAAGCCCAGCTCC  1479
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1376  TGTTAAATAATTCACTCACTCCTAAATATCTTGGCTGTAAGCAAGACAACAGCTCTTCCCCTAAGCCCAGCTCC  1449

Query 1480  GTGTTCAGAAATGGATTCTCTGGCATTAAGAAGCCTTGGCACAGATGTCACGTCTGCAACCACCACTTCCAGTT  1553
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1450  GTGTTCAGAAATGGATTCTCTGGCATTAAGAAGCCTTGGCACAGATGTCACGTCTGCAACCACCACTTCCAGTT  1523

Query 1554  CAAACAGCACCTTCGAGACCACATGAATACACACACCAACAGACGCCCTTACAGTTGTCGGATTTGTCGCAAGT  1627
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1524  CAAACAGCACCTTCGAGACCACATGAATACACACACCAACAGACGCCCTTACAGTTGTCGGATTTGTCGCAAGT  1597

Query 1628  CCTATGTACGTCCTGGCAGCCTGAGCACACACATGAAACTTCATCATGGTGAGAACCGTCTGAAGAAACTCATG  1701
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1598  CCTATGTACGTCCTGGCAGCCTGAGCACACACATGAAACTTCATCATGGTGAGAACCGTCTGAAGAAACTCATG  1671

Query 1702  TGTTGTGAGTTTTGTGCAAAAGTGTTTGGCCACATCCGAGTCTATTTTGGCCATCTGAAAGAAGTGCATAGGGT  1775
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1672  TGTTGTGAGTTTTGTGCAAAAGTGTTTGGCCACATCCGAGTCTATTTTGGCCATCTGAAAGAAGTGCATAGGGT  1745

Query 1776  TGTGATCAGCACTGAGCCTGCGCCCAGTGAACTGCAGCCAGGAGACATACCAAAGAACAGAGACATGAGTGTGC  1849
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1746  TGTGATCAGCACTGAGCCTGCGCCCAGTGAACTGCAGCCAGGAGACATACCAAAGAACAGAGACATGAGTGTGC  1819

Query 1850  GAGGCATGGAGGGATCATTGGAGAGGGAAAACAAGTCCAACCTGGAAGAAGACTTCCTTCTAAACCAGGCAGAC  1923
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1820  GAGGCATGGAGGGATCATTGGAGAGGGAAAACAAGTCCAACCTGGAAGAAGACTTCCTTCTAAACCAGGCAGAC  1893

Query 1924  GAAGTCAAATTACAAATCAAATGTGGTCGTTGTCAGATTACTGCTCAGTCTTTTGCGGAAATAAAATTTCATTT  1997
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1894  GAAGTCAAATTACAAATCAAATGTGGTCGTTGTCAGATTACTGCTCAGTCTTTTGCGGAAATAAAATTTCATTT  1967

Query 1998  ACTTGATGTTCATGGAGAGGAAATTGAGGGCAGGCTACAAGAAGGGACCTTCCCAGGAAGCAAGGGGACTCAGG  2071
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1968  ACTTGATGTTCATGGAGAGGAAATTGAGGGCAGGCTACAAGAAGGGACCTTCCCAGGAAGCAAGGGGACTCAGG  2041

Query 2072  AAGAGTTGGTGCAGCACGCTAGCCCCGACTGGAAAAGGCATCCTGAGAGAGGGAAGCCGGAGAAGGTTCATTCC  2145
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2042  AAGAGTTGGTGCAGCACGCTAGCCCCGACTGGAAAAGGCATCCTGAGAGAGGGAAGCCGGAGAAGGTTCATTCC  2115

Query 2146  TCCTCCGAGGAATCACATGCATGTCCAAGACTGAAAAGGCAGCTCCACCTTCATCAGAATGGCGTGGAAATGCT  2219
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2116  TCCTCCGAGGAATCACATGCATGTCCAAGACTGAAAAGGCAGCTCCACCTTCATCAGAATGGCGTGGAAATGCT  2189

Query 2220  CATGGAAAATGAAGGACCCCAGTCAGGAACCAACAAGCCAAGGGAAACCTGCCAGGGCCCTGAGTGTCCTGGCC  2293
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2190  CATGGAAAATGAAGGACCCCAGTCAGGAACCAACAAGCCAAGGGAAACCTGCCAGGGCCCTGAGTGTCCTGGCC  2263

Query 2294  TCCACACGTTTCTCTTGTGGTCCCATTCAGGCTTTAACTGCCTGCTTTGTGCAGAGATGCTGGGACGGAAAGAG  2367
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2264  TCCACACGTTTCTCTTGTGGTCCCATTCAGGCTTTAACTGCCTGCTTTGTGCAGAGATGCTGGGACGGAAAGAG  2337

Query 2368  GACCTCCTCCACCACTGGAAGCACCAGCATAACTGTGAGGACCCTTCCAAACTGTGGGCTATTTTAAATACGGT  2441
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2338  GACCTCCTCCACCACTGGAAGCACCAGCATAACTGTGAGGACCCTTCCAAACTGTGGGCTATTTTAAATACGGT  2411

Query 2442  CTCCAACCAGGGAGTGATCGAACTTTCCAGTGAAGCTGAGAAA  2484
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2412  CTCCAACCAGGGAGTGATCGAACTTTCCAGTGAAGCTGAGAAA  2454