Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- TRCN0000477195
- Subject:
- XM_005273102.3
- Aligned Length:
- 1860
- Identities:
- 1643
- Gaps:
- 201
Alignment
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 1 ATGGATGAAACAGCTGAGCAGAACAGTTCTTTAGCTGTCGGCCTAAATGACCAACTTCATGACCTCTCAAGGTC 74
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 75 TCGCTCCCCGGCTGCACGCAGCTCAGCTTCCAACATTCGGGAAAGGCGTGCCCGGATCGCGAGGGGCCGCTGGG 148
Query 1 --------------------ATGCACCGCGGCGGGCAGCCTTTGAAAAAGCGGC--GCGG-CTCGTTCAA---G 48
|.| |||.|.||||.|| .||||| |||| ||||...|| |
Sbjct 149 ACCGAGTCCCGGACGTCGCGACG---CGCAGGGGGCTGC---------TGCGGCCGGCGGTCTCGGGAAAAGTG 210
Query 49 ATGG--CGGAGCTCGACCA----------GTTGCCTGACGAGAGCTCTTCAGCAAAAGCCCTTGTCAGTTTAAA 110
|.|| ||||| .||.||| |||.|..|| |..|||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 211 AGGGGACGGAG-GCGCCCAAGCAACGTGGGTTTCGGGA--ACTGCTCTTCAGCAAAAGCCCTTGTCAGTTTAAA 281
Query 111 AGAAGGAAGCTTATCTAACACGTGGAATGAAAAGTACAGTTCTTTACAGAAAACACCTGTTTGGAAAGGCAGGA 184
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 282 AGAAGGAAGCTTATCTAACACGTGGAATGAAAAGTACAGTTCTTTACAGAAAACACCTGTTTGGAAAGGCAGGA 355
Query 185 ATACAAGCTCTGCTGTGGAAATGCCTTTCAGAAATTCAAAACGAAGTCGACTTTTTTCTGATGAAGATGATAGG 258
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 356 ATACAAGCTCTGCTGTGGAAATGCCTTTCAGAAATTCAAAACGAAGTCGACTTTTTTCTGATGAAGATGATAGG 429
Query 259 CAAATAAATACAAGGTCACCTAAAAGAAACCAGAGGGTTGCAATGGTTCCACAGAAATTTACAGCAACAATGTC 332
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 430 CAAATAAATACAAGGTCACCTAAAAGAAACCAGAGGGTTGCAATGGTTCCACAGAAATTTACAGCAACAATGTC 503
Query 333 AACACCAGATAAGAAAGCTTCACAGAAGATTGGTTTTCGATTACGTAATCTGCTCAAGCTTCCTAAAGCACATA 406
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 504 AACACCAGATAAGAAAGCTTCACAGAAGATTGGTTTTCGATTACGTAATCTGCTCAAGCTTCCTAAAGCACATA 577
Query 407 AATGGTGTATATACGAGTGGTTCTATTCAAATATAGATAAACCACTTTTTGAAGGTGATAATGACTTCTGTGTA 480
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 578 AATGGTGTATATACGAGTGGTTCTATTCAAATATAGATAAACCACTTTTTGAAGGTGATAATGACTTCTGTGTA 651
Query 481 TGTCTAAAGGAATCTTTTCCTAATTTGAAAACAAGAAAGTTAACAAGAGTAGAATGGGGAAAAATTCGGCGGCT 554
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 652 TGTCTAAAGGAATCTTTTCCTAATTTGAAAACAAGAAAGTTAACAAGAGTAGAATGGGGAAAAATTCGGCGGCT 725
Query 555 TATGGGAAAACCACGGAGATGTTCTTCTGCATTTTTTGAGGAAGAGAGATCAGCATTAAAACAGAAACGGCAGA 628
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 726 TATGGGAAAACCACGGAGATGTTCTTCTGCATTTTTTGAGGAAGAGAGATCAGCATTAAAACAGAAACGGCAGA 799
Query 629 AAATAAGGCTCTTACAACAAAGGAAAGTTGCAGATGTTTCACAATTCAAAGATCTCCCAGATGAAATTCCTTTG 702
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 800 AAATAAGGCTCTTACAACAAAGGAAAGTTGCAGATGTTTCACAATTCAAAGATCTCCCAGATGAAATTCCTTTG 873
Query 703 CCTCTGGTTATTGGAACGAAAGTTACAGCACGATTACGTGGTGTTCATGATGGTTTGTTCACTGGACAAATAGA 776
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 874 CCTCTGGTTATTGGAACGAAAGTTACAGCACGATTACGTGGTGTTCATGATGGTTTGTTCACTGGACAAATAGA 947
Query 777 TGCTGTGGATACTCTTAATGCTACTTATAGAGTAACTTTTGATAGGACAGGGCTTGGAACCCATACCATCCCTG 850
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 948 TGCTGTGGATACTCTTAATGCTACTTATAGAGTAACTTTTGATAGGACAGGGCTTGGAACCCATACCATCCCTG 1021
Query 851 ACTATGAAGTTCTCAGTAATGAACCTCATGAGACAATGCCAATTGCTGCCTTTGGACAAAAACAGCGGCCTTCT 924
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1022 ACTATGAAGTTCTCAGTAATGAACCTCATGAGACAATGCCAATTGCTGCCTTTGGACAAAAACAGCGGCCTTCT 1095
Query 925 CGATTTTTTATGACCCCACCACGGTTACATTATACTCCTCCTCTCCAGTCACCAATTATAGATAATGATCCTTT 998
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1096 CGATTTTTTATGACCCCACCACGGTTACATTATACTCCTCCTCTCCAGTCACCAATTATAGATAATGATCCTTT 1169
Query 999 ATTAGGACAGTCGCCGTGGAGAAGTAAAATTTCTGGCTCTGACACTGAAACATTAGGTGGTTTTCCAGTAGAAT 1072
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1170 ATTAGGACAGTCGCCGTGGAGAAGTAAAATTTCTGGCTCTGACACTGAAACATTAGGTGGTTTTCCAGTAGAAT 1243
Query 1073 TTCTTATCCAAGTGACCAGATTATCAAAAATTCTCATGATTAAAAAGGAACATATCAAGAAATTAAGGGAAATG 1146
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1244 TTCTTATCCAAGTGACCAGATTATCAAAAATTCTCATGATTAAAAAGGAACATATCAAGAAATTAAGGGAAATG 1317
Query 1147 AACACAGAAGCAGAAAAATTGAAATCATATTCCATGCCCATCAGCATTGAATTTCAGCGGAGATATGCAACAAT 1220
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1318 AACACAGAAGCAGAAAAATTGAAATCATATTCCATGCCCATCAGCATTGAATTTCAGCGGAGATATGCAACAAT 1391
Query 1221 TGTTCTGGAGCTTGAACAGCTGAACAAGGACCTAAACAAAGTTTTGCATAAAGTTCAACAGTATTGCTATGAGC 1294
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1392 TGTTCTGGAGCTTGAACAGCTGAACAAGGACCTAAACAAAGTTTTGCATAAAGTTCAACAGTATTGCTATGAGC 1465
Query 1295 TTGCTCCAGACCAGGGGCTCCAGCCTGCAGATCAGCCAACAGATATGAGACGCAGGTGTGAGGAAGAAGCACAG 1368
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1466 TTGCTCCAGACCAGGGGCTCCAGCCTGCAGATCAGCCAACAGATATGAGACGCAGGTGTGAGGAAGAAGCACAG 1539
Query 1369 GAAATTGTTCGGCATGCAAATTCCTCAACAGGACAGCCCTGCGTTGAAAATGAAAATCTGACAGACTTAATTTC 1442
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1540 GAAATTGTTCGGCATGCAAATTCCTCAACAGGACAGCCCTGCGTTGAAAATGAAAATCTGACAGACTTAATTTC 1613
Query 1443 CAGGCTTACAGCTATTTTGTTACAAATTAAGTGTCTAGCAGAAGGAGGAGACCTGAATTCCTTTGAATTCAAAT 1516
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1614 CAGGCTTACAGCTATTTTGTTACAAATTAAGTGTCTAGCAGAAGGAGGAGACCTGAATTCCTTTGAATTCAAAT 1687
Query 1517 CACTTACAGACTCATTAAATGATATCAAGAGTACAATAGACGCTTCTAATATCAGTTGCTTTCAGAATAATGTA 1590
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1688 CACTTACAGACTCATTAAATGATATCAAGAGTACAATAGACGCTTCTAATATCAGTTGCTTTCAGAATAATGTA 1761
Query 1591 GAAATCCATGTTGCACATATTCAGAGTGGCCTGAGCCAGATGGGAAACTTACATGCCTTTGCAGCAAATAACAC 1664
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1762 GAAATCCATGTTGCACATATTCAGAGTGGCCTGAGCCAGATGGGAAACTTACATGCCTTTGCAGCAAATAACAC 1835
Query 1665 CAACAGAGAC 1674
||||||||||
Sbjct 1836 CAACAGAGAC 1845