Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- TRCN0000477195
- Subject:
- XM_024446565.1
- Aligned Length:
- 1860
- Identities:
- 1541
- Gaps:
- 303
Alignment
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 1 ATGGATGAAACAGCTGAGCAGAACAGTTCTTTAGCTGTCGGCCTAAATGACCAACTTCATGACCTCTCAAGGTC 74
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 75 TCGCTCCCCGGCTGCACGCAGCTCAGCTTCCAACATTCGGGAAAGGCGTGCCCGGATCGCGAGGGGCCGCTGGG 148
Query 1 --------------------ATGCACCGCGGCGGGCAGCCTTTGAAAAAGCGGC--GCGG-CTCGTTCAA---G 48
|.| |||.|.||||.|| .||||| |||| ||||...|| |
Sbjct 149 ACCGAGTCCCGGACGTCGCGACG---CGCAGGGGGCTGC---------TGCGGCCGGCGGTCTCGGGAAAAGTG 210
Query 49 ATGG--CGGAGCTCGACCA----------GTTGCCTGACGAGAGCTCTTCAGCAAAAGCCCTTGTCAGTTTAAA 110
|.|| ||||| .||.||| |||.|..|| |..|||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 211 AGGGGACGGAG-GCGCCCAAGCAACGTGGGTTTCGGGA--ACTGCTCTTCAGCAAAAGCCCTTGTCAGTTTAAA 281
Query 111 AGAAGGAAGCTTATCTAACACGTGGAATGAAAAGTACAGTTCTTTACAGAAAACACCTGTTTGGAAAGGCAGGA 184
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 282 AGAAGGAAGCTTATCTAACACGTGGAATGAAAAGTACAGTTCTTTACAGAAAACACCTGTTTGGAAAGGCAGGA 355
Query 185 ATACAAGCTCTGCTGTGGAAATGCCTTTCAGAAATTCAAAACGAAGTCGACTTTTTTCTGATGAAGATGATAGG 258
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 356 ATACAAGCTCTGCTGTGGAAATGCCTTTCAGAAATTCAAAACGAAGTCGACTTTTTTCTGATGAAGATGATAGG 429
Query 259 CAAATAAATACAAGGTCACCTAAAAGAAACCAGAGGGTTGCAATGGTTCCACAGAAATTTACAGCAACAATGTC 332
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 430 CAAATAAATACAAGGTCACCTAAAAGAAACCAGAGGGTTGCAATGGTTCCACAGAAATTTACAGCAACAATGTC 503
Query 333 AACACCAGATAAGAAAGCTTCACAGAAGATTGGTTTTCGATTACGTAATCTGCTCAAGCTTCCTAAAGCACATA 406
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 504 AACACCAGATAAGAAAGCTTCACAGAAGATTGGTTTTCGATTACGTAATCTGCTCAAGCTTCCTAAAGCACATA 577
Query 407 AATGGTGTATATACGAGTGGTTCTATTCAAATATAGATAAACCACTTTTTGAAGGTGATAATGACTTCTGTGTA 480
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 578 AATGGTGTATATACGAGTGGTTCTATTCAAATATAGATAAACCACTTTTTGAAGGTGATAATGACTTCTGTGTA 651
Query 481 TGTCTAAAGGAATCTTTTCCTAATTTGAAAACAAGAAAGTTAACAAGAGTAGAATGGGGAAAAATTCGGCGGCT 554
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 652 TGTCTAAAGGAATCTTTTCCTAATTTGAAAACAAGAAAGTTAACAAGAGTAGAATGGGGAAAAATTCGGCGGCT 725
Query 555 TATGGGAAAACCACGGAGATGTTCTTCTGCATTTTTTGAGGAAGAGAGATCAGCATTAAAACAGAAACGGCAGA 628
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 726 TATGGGAAAACCACGGAGATGTTCTTCTGCATTTTTTGAGGAAGAGAGATCAGCATTAAAACAGAAACGGCAGA 799
Query 629 AAATAAGGCTCTTACAACAAAGGAAAGTTGCAGATGTTTCACAATTCAAAGATCTCCCAGATGAAATTCCTTTG 702
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 800 AAATAAGGCTCTTACAACAAAGGAAAGTTGCAGATGTTTCACAATTCAAAGATCTCCCAGATGAAATTCCTTTG 873
Query 703 CCTCTGGTTATTGGAACGAAAGTTACAGCACGATTACGTGGTGTTCATGATGGTTTGTTCACTGGACAAATAGA 776
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 874 CCTCTGGTTATTGGAACGAAAGTTACAGCACGATTACGTGGTGTTCATGATGGTTTGTTCACTGGACAAATAGA 947
Query 777 TGCTGTGGATACTCTTAATGCTACTTATAGAGTAACTTTTGATAGGACAGGGCTTGGAACCCATACCATCCCTG 850
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 948 TGCTGTGGATACTCTTAATGCTACTTATAGAGTAACTTTTGATAGGACAGGGCTTGGAACCCATACCATCCCTG 1021
Query 851 ACTATGAAGTTCTCAGTAATGAACCTCATGAGACAATGCCAATTGCTGCCTTTGGACAAAAACAGCGGCCTTCT 924
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1022 ACTATGAAGTTCTCAGTAATGAACCTCATGAGACAATGCCAATTGCTGCCTTTGGACAAAAACAGCGGCCTTCT 1095
Query 925 CGATTTTTTATGACCCCACCACGGTTACATTATACTCCTCCTCTCCAGTCACCAATTATAGATAATGATCCTTT 998
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1096 CGATTTTTTATGACCCCACCACGGTTACATTATACTCCTCCTCTCCAGTCACCAATTATA-------------- 1155
Query 999 ATTAGGACAGTCGCCGTGGAGAAGTAAAATTTCTGGCTCTGACACTGAAACATTAGGTGGTTTTCCAGTAGAAT 1072
Sbjct 1156 -------------------------------------------------------------------------- 1155
Query 1073 TTCTTATCCAAGTGACCAGATTATCAAAAATTCTCATGATTAAAAAGGAACATATCAAGAAATTAAGGGAAATG 1146
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1156 --------------ACCAGATTATCAAAAATTCTCATGATTAAAAAGGAACATATCAAGAAATTAAGGGAAATG 1215
Query 1147 AACACAGAAGCAGAAAAATTGAAATCATATTCCATGCCCATCAGCATTGAATTTCAGCGGAGATATGCAACAAT 1220
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1216 AACACAGAAGCAGAAAAATTGAAATCATATTCCATGCCCATCAGCATTGAATTTCAGCGGAGATATGCAACAAT 1289
Query 1221 TGTTCTGGAGCTTGAACAGCTGAACAAGGACCTAAACAAAGTTTTGCATAAAGTTCAACAGTATTGCTATGAGC 1294
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1290 TGTTCTGGAGCTTGAACAGCTGAACAAGGACCTAAACAAAGTTTTGCATAAAGTTCAACAGTATTGCTATGAGC 1363
Query 1295 TTGCTCCAGACCAGGGGCTCCAGCCTGCAGATCAGCCAACAGATATGAGACGCAGGTGTGAGGAAGAAGCACAG 1368
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1364 TTGCTCCAGACCAGGGGCTCCAGCCTGCAGATCAGCCAACAGATATGAGACGCAGGTGTGAGGAAGAAGCACAG 1437
Query 1369 GAAATTGTTCGGCATGCAAATTCCTCAACAGGACAGCCCTGCGTTGAAAATGAAAATCTGACAGACTTAATTTC 1442
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1438 GAAATTGTTCGGCATGCAAATTCCTCAACAGGACAGCCCTGCGTTGAAAATGAAAATCTGACAGACTTAATTTC 1511
Query 1443 CAGGCTTACAGCTATTTTGTTACAAATTAAGTGTCTAGCAGAAGGAGGAGACCTGAATTCCTTTGAATTCAAAT 1516
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1512 CAGGCTTACAGCTATTTTGTTACAAATTAAGTGTCTAGCAGAAGGAGGAGACCTGAATTCCTTTGAATTCAAAT 1585
Query 1517 CACTTACAGACTCATTAAATGATATCAAGAGTACAATAGACGCTTCTAATATCAGTTGCTTTCAGAATAATGTA 1590
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1586 CACTTACAGACTCATTAAATGATATCAAGAGTACAATAGACGCTTCTAATATCAGTTGCTTTCAGAATAATGTA 1659
Query 1591 GAAATCCATGTTGCACATATTCAGAGTGGCCTGAGCCAGATGGGAAACTTACATGCCTTTGCAGCAAATAACAC 1664
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1660 GAAATCCATGTTGCACATATTCAGAGTGGCCTGAGCCAGATGGGAAACTTACATGCCTTTGCAGCAAATAACAC 1733
Query 1665 CAACAGAGAC 1674
||||||||||
Sbjct 1734 CAACAGAGAC 1743