Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000477218
• Subject: XM_017018231.1
• Aligned Length: 898
• Identities: 814
• Gaps: 59

Alignment

Query   1  ATG------GCACAT--GGGATTCCTT--CTCAAGGCAAAGTTACCATAACGGTGGATGAGTACAGCTCAAACC  64
           |||      ||| ||  .|.||||.||  .|...||.|||   ||.|||       ||.|.||..||       
Sbjct   1  ATGAGGTTTGCA-ATACTGTATTCATTTGTTATTGGAAAA---ACAATA-------ATAAATATGGC-------  56

Query  65  CCACCCAGGCATTCACGCACTACAACATCAACCAGAGCAGATTCCAGCCTCCACATGTA-CATA-----TGGTC  132
                          ||     .||.|..||.||||    ||...||||...|.|| || ||||     |||||
Sbjct  57  ---------------CG-----GAAGAGGAATCAGA----ATGGAAGCCATAATAT-TATCATATTTTTTGGTC  105

Query 133  GACCCCATCCCATATGACACTCCAAAACCAGCGGGCCACACGCGGTTTGTCTGCATCTCAGACACACACTCCAG  206
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 106  GACCCCATCCCATATGACACTCCAAAACCAGCGGGCCACACGCGGTTTGTCTGCATCTCAGACACACACTCCAG  179

Query 207  AACAGATGGTATCCAGATGCCTTATGGGGACATCCTTCTCCACACAGGCGATTTCACCGAGCTGGGACTGCCCT  280
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 180  AACAGATGGTATCCAGATGCCTTATGGGGACATCCTTCTCCACACAGGCGATTTCACCGAGCTGGGACTGCCCT  253

Query 281  CAGAGGTTAAGAAGTTTAATGACTGGTTAGGAAACCTGCCATATGAATATAAAATAGTGATTGCTGGGAATCAT  354
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 254  CAGAGGTTAAGAAGTTTAATGACTGGTTAGGAAACCTGCCATATGAATATAAAATAGTGATTGCTGGGAATCAT  327

Query 355  GAACTGACATTTGATAAGGAATTCATGGCAGACCTTGTTAAACAGGACTACTACCGTTTCCCCTCTGTGTCCAA  428
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 328  GAACTGACATTTGATAAGGAATTCATGGCAGACCTTGTTAAACAGGACTACTACCGTTTCCCCTCTGTGTCCAA  401

Query 429  ATTGAAACCAGAGGACTTTGACAATGTTCAGTCCCTCCTGACAAACAGTATTTACTTACAAGATTCGGAGGTAA  502
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 402  ATTGAAACCAGAGGACTTTGACAATGTTCAGTCCCTCCTGACAAACAGTATTTACTTACAAGATTCGGAGGTAA  475

Query 503  CAGTGAAGGGATTCAGGATATACGGTGCACCTTGGACCCCGTGGTTTAATGGATGGGGCTTTAACCTACCCAGA  576
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 476  CAGTGAAGGGATTCAGGATATACGGTGCACCTTGGACCCCGTGGTTTAATGGATGGGGCTTTAACCTACCCAGA  549

Query 577  GGTCAGTCTCTGCTGGACAAGTGGAACCTCATCCCTGAGGGCATTGACATACTCATGACACATGGACCTCCTCT  650
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 550  GGTCAGTCTCTGCTGGACAAGTGGAACCTCATCCCTGAGGGCATTGACATACTCATGACACATGGACCTCCTCT  623

Query 651  AGGTTTTCGAGACTGGGTTCCAAAGGAGCTTCAAAGAGTGGGCTGTGTGGAGCTGTTAAACACGGTTCAGAGGC  724
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 624  AGGTTTTCGAGACTGGGTTCCAAAGGAGCTTCAAAGAGTGGGCTGTGTGGAGCTGTTAAACACGGTTCAGAGGC  697

Query 725  GAGTCCGGCCCAAGCTCCATGTGTTTGGTGGAATCCATGAAGGTTATGGCATCATGACCGACGGTTACACAACG  798
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 698  GAGTCCGGCCCAAGCTCCATGTGTTTGGTGGAATCCATGAAGGTTATGGCATCATGACCGACGGTTACACAACG  771

Query 799  TACATCAATGCCTCGACGTGTACAGTCAGCTTTCAACCGACCAACCCTCCAATTATATTTGACCTTCCAAACCC  872
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 772  TACATCAATGCCTCGACGTGTACAGTCAGCTTTCAACCGACCAACCCTCCAATTATATTTGACCTTCCAAACCC  845

Query 873  ACAGGGTTCC  882
           ||||||||||
Sbjct 846  ACAGGGTTCC  855