Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- TRCN0000477515
- Subject:
- NM_001114663.1
- Aligned Length:
- 3292
- Identities:
- 2638
- Gaps:
- 306
Alignment
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 1 ATGGCTGAGGGCGCGGCTAGCAGGGAGGCTCCGGCGCCTCTCGACGTTGCCGGGGGCGAAGACGACCCCCGAGC 74
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 75 CGGCGCCGACGCTGCCTCAGGGGACGCCCCACCCCCGGCCTTGGGGGGCCGGATGAGGGACCGTCGCAGTGGGG 148
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 149 TCGCGCTGCCGGGCGCTGCGGGGGTCCCCGCGGATAGCGAGGCCGGCCTCCTGGAGGCTGCACGAGCGACCCCC 222
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 223 CGGCGTAGCAGCATCATCAAGGATCCTTCAAACCAAAAATGTGGTGGCAGAAAGAAAACAGTGTCTTTCAGTAG 296
Query 1 -ATGCCATCGGA-AAGAAAATTAGCAGTGCAAATGACTGCATCAGCTTCATGCAAGCTGGCTGTGAGTTGAAGA 72
||||||||||| |||||.|||||||||||..|.||||||||.|||||||||||.||||||||.|||.||||||
Sbjct 297 CATGCCATCGGAGAAGAAGATTAGCAGTGCCCACGACTGCATTAGCTTCATGCAGGCTGGCTGCGAGCTGAAGA 370
Query 73 AAGTCCGGCCAAATTCTCGCATTTACAACCGTTTTTTCACTCTGGACACAGACCTTCAAGCTCTTCGCTGGGAA 146
||||.||.||.||.||||||||.||||||||.||||||||.||.||.||.|||||.||.|||||.|||||||||
Sbjct 371 AAGTGCGCCCGAACTCTCGCATCTACAACCGATTTTTCACCCTAGATACCGACCTCCAGGCTCTACGCTGGGAA 444
Query 147 CCTTCAAAGAAAGACCTCGAGAAAGCCAAGCTTGATATTTCTGCCATAAAAGAGATCAGACTGGGGAAAAACAC 220
|||||.|||||||||||.||.|||||||||||.||.|||||||||||.|||||||||||.||||||||.|||||
Sbjct 445 CCTTCCAAGAAAGACCTTGAAAAAGCCAAGCTGGACATTTCTGCCATCAAAGAGATCAGGCTGGGGAAGAACAC 518
Query 221 GGAAACATTTAGAAACAATGGCCTTGCTGACCAGATCTGTGAGGACTGTGCCTTTTCCATACTCCACGGGGAAA 294
.||.|||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||.|||||||
Sbjct 519 AGAGACATTCAGAAACAATGGCCTTGCTGACCAGATCTGTGAAGACTGTGCCTTCTCCATACTCCATGGGGAAA 592
Query 295 ACTATGAGTCTCTGGACCTAGTTGCCAATTCAGCAGATGTGGCAAACATCTGGGTGTCTGGGTTACGGTACCTG 368
|.||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||
Sbjct 593 ATTACGAGTCTCTGGACCTAGTTGCCAATTCAGCAGATGTGGCAAACATCTGGGTGTCGGGGTTACGGTACCTG 666
Query 369 GTTTCTCGAAGTAAGCAGCCTCTTGATTTTATGGAGGGCAACCAGAACACACCACGGTTCATGTGGTTGAAAAC 442
||.|||||.||||||||.||.|||||||||||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||.|||||||
Sbjct 667 GTCTCTCGTAGTAAGCAACCGCTTGATTTTATAGAGGGTAACCAGAACACACCACGGTTCATGTGGCTGAAAAC 740
Query 443 AGTGTTTGAAGCAGCAGATGTTGATGGGAATGGGATTATGTTGGAAGACACCTCTGTAGAGTTAATAAAACAAC 516
.||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.||||||||.||.||.||||||||||||||||
Sbjct 741 GGTGTTTGAAGCAGCAGATGTTGATGGAAATGGGATTATGTTAGAAGACACTTCAGTGGAGTTAATAAAACAAC 814
Query 517 TCAACCCTACTCTGAAGGAAGCCAAGATCAGGTTAAAGTTTAAAGAAATCCAGAAGAGCAAGGAAAAACTAACC 590
||||||||||||||||||||.|.||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.|||||||||||.
Sbjct 815 TCAACCCTACTCTGAAGGAATCTAAGATCAGGTTAAAATTTAAAGAAATCCAGAAGAGCAAAGAAAAACTAACT 888
Query 591 ACCCGCGTGACCGAAGAGGAATTTTGTGAAGCTTTTTGTGAACTTTGCACCAGGCCAGAAGTGTATTTCTTACT 664
|||||.|||||.||||||||||||||||||||.|||||.|||||.||||||||||||||||||||.||||||||
Sbjct 889 ACCCGGGTGACAGAAGAGGAATTTTGTGAAGCATTTTGCGAACTGTGCACCAGGCCAGAAGTGTACTTCTTACT 962
Query 665 TGTACAGATATCTAAAAACAAAGAATATTTGGATGCCAATGATCTCATGCTCTTTTTAGAAGCTGAGCAAGGAG 738
|||.|||||||||||.||||||||.||..|||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||||||||.|
Sbjct 963 TGTCCAGATATCTAAGAACAAAGAGTACCTGGATGCCAATGACCTCATGCTCTTCTTAGAAGCTGAGCAAGGTG 1036
Query 739 TCACCCATATCACCGAGGATATATGCTTAGACATCATAAGGAGATACGAACTTTCTGAAGAGGGACGTCAAAAA 812
|||||||.|||||.||||||||.||.|||||||||||.||||||||.||.||.||||||||.||.||.||.|||
Sbjct 1037 TCACCCACATCACTGAGGATATGTGTTTAGACATCATTAGGAGATATGAGCTCTCTGAAGATGGCCGCCAGAAA 1110
Query 813 GGGTTTCTTGCAATTGATGGCTTTACCCAGTATTTATTGTCATCAGAATGTGACATTTTTGATCCTGAGCAAAA 886
||.||.||||||||||||||.||||||||||||||||||||..||||||||||||||||||||||.||||||||
Sbjct 1111 GGCTTCCTTGCAATTGATGGGTTTACCCAGTATTTATTGTCTCCAGAATGTGACATTTTTGATCCAGAGCAAAA 1184
Query 887 GAAGGTTGCCCAAGATATGACCCAGCCATTATCTCACTACTATATCAATGCCTCTCATAACACCTATCTAATAG 960
.||.||||||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||||||||.||||||||.|||||.||.||||
Sbjct 1185 AAAAGTTGCCCAAGATATGACCCAACCCTTATCTCACTACTATATCAATGCGTCTCATAATACCTACCTGATAG 1258
Query 961 AAGACCAGTTCAGGGGGCCAGCTGACATCAATGGGTACATTAGAGCTTTGAAAATGGGCTGTCGAAGCGTTGAA 1034
||||.|||||||||||.|||||.||.|||||||||||..|.|||||.|||||.|||||||||.|||||.||||.
Sbjct 1259 AAGATCAGTTCAGGGGACCAGCAGATATCAATGGGTATGTGAGAGCATTGAAGATGGGCTGTAGAAGCATTGAG 1332
Query 1035 CTCGATGTAAGTGATGGTTCAGATAATGAACCAATCCTTTGTAATCGAAATAACATGACAACCCATG----TTT 1104
||||||||.|||||||||.|.||||||||.||.||||||||||||.|.||.|||||| .||||| |||
Sbjct 1333 CTCGATGTGAGTGATGGTCCGGATAATGAGCCCATCCTTTGTAATAGGAACAACATG----GCCATGCACCTTT 1402
Query 1105 CCTTTCGAAGTGTCATAGAGGTAATAAATAAATTTGCCTTTGTTGCTTCTGAATACCCACTCATTCTTTGCTTG 1178
|||||||||||||..|.|||||.||||||||.|||||||||||||||||.||.||||||||||||||.||||||
Sbjct 1403 CCTTTCGAAGTGTTCTGGAGGTGATAAATAAGTTTGCCTTTGTTGCTTCAGAGTACCCACTCATTCTCTGCTTG 1476
Query 1179 GGAAATCACTGCTCCTTGCCGCAGCAGAAGGTAATGGCTCAACAGATGAAAAAGGTCTTTGGCAATAAACTCTA 1252
||.|||||||||||..||||.||||||||.||.|||||.||.||||||||||||||.||||||.|.|||||.||
Sbjct 1477 GGGAATCACTGCTCTCTGCCTCAGCAGAAAGTCATGGCACAGCAGATGAAAAAGGTGTTTGGCGAGAAACTTTA 1550
Query 1253 TACTGAAGCACCTTTGCCCTCAGAATCCTACCTCCCATCACCAGAAAAATTAAAAAGAATGATCATTGTGAAAG 1326
|||.||||||||||||.|.|||||||||||||||||||||||.||||||.||||||..|||||.||||||||||
Sbjct 1551 TACAGAAGCACCTTTGTCTTCAGAATCCTACCTCCCATCACCTGAAAAACTAAAAAATATGATTATTGTGAAAG 1624
Query 1327 GAAAGAAGTTGCCTTCTGATCCAGATGTGTTAGAAGGAGAAGTAACAGATGAAGATGAAGAAGCTGAAATGTCT 1400
|||||||.||||||||.||..|||||.||||||||||||||||.||.||.||.||.||||||||.||.|||||.
Sbjct 1625 GAAAGAAATTGCCTTCGGAATCAGATCTGTTAGAAGGAGAAGTGACCGACGAGGACGAAGAAGCCGAGATGTCG 1698
Query 1401 CGAAGGATGTCGGTAGATTACAATGGTGAGCAGAAGCAAATCCGACTCTGTAGGGAGCTCTCTGATTTGGTGTC 1474
||.||||||||.|..||||||||.|||||||||||.||.|||.|.|||||..|.|||||||||||.|||||.||
Sbjct 1699 CGGAGGATGTCAGGGGATTACAACGGTGAGCAGAAACATATCTGGCTCTGCCGAGAGCTCTCTGACTTGGTATC 1772
Query 1475 TATTTGTAAATCTGTTCAATACAGGGATTTTGAACTATCTATGAAAAGCCAAAACTATTGGGAAATGTGTTCAT 1548
.||.||.|||||||||||..||||||||||||||||.||||||||||.|||||||||.||||||||||||||||
Sbjct 1773 CATCTGCAAATCTGTTCAGCACAGGGATTTTGAACTGTCTATGAAAACCCAAAACTACTGGGAAATGTGTTCAT 1846
Query 1549 TTAGTGAAACAGAGGCCAGCCGCATTGCAAATGAGTACCCAGAGGATTTTGTTAATTATAATAAGAAGTTCTTA 1622
||||||||||||||||||||||.|||||.|||||.|||||||||||.||.||.||||||||.||||||||||||
Sbjct 1847 TTAGTGAAACAGAGGCCAGCCGGATTGCCAATGAATACCCAGAGGACTTCGTGAATTATAACAAGAAGTTCTTA 1920
Query 1623 TCAAGAATCTATCCAAGTGCCATGAGGATCGATTCCAGTAACTTGAATCCACAGGACTTTTGGAATTGTGGCTG 1696
|||||..||||.||.|||||||||.||||.|||||||||||.|||||.|||||||||||.|||||.||||||||
Sbjct 1921 TCAAGGGTCTACCCTAGTGCCATGCGGATAGATTCCAGTAATTTGAACCCACAGGACTTCTGGAACTGTGGCTG 1994
Query 1697 TCAGATTATAGCAATGAATTTTCAGACTCCGGGTCCAATGATGGACCATCACACGGGCTGGTTTCTTCAAAACG 1770
|||||||.|.||.|||||||||||.|||||.||||||||||||||||..|||||.|||||||||||||||||.|
Sbjct 1995 TCAGATTGTGGCGATGAATTTTCAAACTCCCGGTCCAATGATGGACCTCCACACTGGCTGGTTTCTTCAAAATG 2068
Query 1771 GGGGATGTGGTTATGTTCTAAGGCCGTCTATAATGCGAGATGAAGTTTCTTACTTCAGCGCAAATACAAAGGGC 1844
|.||||||||.||.||.||.|||||.|||||.|||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2069 GAGGATGTGGCTACGTCCTCAGGCCATCTATCATGCGAGATGAAGTTTCGTACTTCAGCGCAAATACAAAGGGC 2142
Query 1845 ATTCTACCTGGGGTGTCTCCTCTAGCTCTTCATATCAAGATCATCAGTGGTCAGAATTTCCCAAAGCCCAAGGG 1918
|||.|.|||||.||||||||.||.|.||||||.|||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.||
Sbjct 2143 ATTGTCCCTGGCGTGTCTCCCCTGGTTCTTCACATCAAGATCATCAGTGGTCAGAACTTCCCAAAGCCCAAAGG 2216
Query 1919 AGCTTGTGCCAAAGGGGATGTCATAGATCCCTATGTTTGTATAGAGATACACGGAATTCCAGCGGATTGTTCGG 1992
|||.|||||||||||||||||||||||.||||||||||||.|.|||||.||||||||||||||.|||||.|..|
Sbjct 2217 AGCCTGTGCCAAAGGGGATGTCATAGACCCCTATGTTTGTGTGGAGATTCACGGAATTCCAGCTGATTGCTGCG 2290
Query 1993 AACAAAGAACTAAAACTGTACAGCAAAACAGTGATAATCCTATTTTTGATGAAACTTTTGAGTTCCAAGTAAAC 2066
|.||||||||||||||||||||.||.|||||.||||||||.|||||||||||||||||.|||||.|||||.|||
Sbjct 2291 AGCAAAGAACTAAAACTGTACAACAGAACAGCGATAATCCAATTTTTGATGAAACTTTCGAGTTTCAAGTCAAC 2364
Query 2067 CTACCTGAGCTGGCCATGATCCGTTTTGTTGTTCTGGATGATGACTACATTGGGGATGAGTTTATAGGGCAATA 2140
||.||.||||||.|||||.||||||||||..||.||||||||||.||.||||||||||||||.||.|||||.||
Sbjct 2365 CTTCCCGAGCTGACCATGGTCCGTTTTGTCATTTTGGATGATGATTATATTGGGGATGAGTTCATTGGGCAGTA 2438
Query 2141 TACGATACCATTTGAATGTTTGCAGCCTGGATATCGGCATGTTCCCCTGCGTTCTTTTGTGGGTGACATCATGG 2214
||||||.||||||||||||.|||||||.||.||.|||||.||||||.||||.||.|||||.||.||.|||||||
Sbjct 2439 TACGATCCCATTTGAATGTCTGCAGCCCGGGTACCGGCACGTTCCCTTGCGCTCCTTTGTTGGGGATATCATGG 2512
Query 2215 AGCACGTAACCCTTTTTGTCCACATAGCAATAACTAATCGAAGTGGAGGAGGAAAGGCACAGAAGCGCAGTCTT 2288
|||||||.||||||||.||.||||||||||||||.|||||.||||||||||||||..||||||||||.||.|||
Sbjct 2513 AGCACGTGACCCTTTTCGTTCACATAGCAATAACCAATCGCAGTGGAGGAGGAAAACCACAGAAGCGAAGCCTT 2586
Query 2289 TCAGTGAGAATGGGGAAGAAAGTTCGGGAATATACCATGCTCAGGAATATCGGTCTTAAAACCATTGATGACAT 2362
||.|||||||||||||||||||||||.|||||.|||||||||||||||||.||||||||||||||.|||||.||
Sbjct 2587 TCTGTGAGAATGGGGAAGAAAGTTCGAGAATACACCATGCTCAGGAATATTGGTCTTAAAACCATAGATGATAT 2660
Query 2363 CTTTAAAATAGCGGTTCATCCATTACGAGAAGCCATAGATATGAGAGAAAATATGCAGAATGCAATCGTGTCTA 2436
|||.||||||||.||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.||.||.||||||.
Sbjct 2661 CTTCAAAATAGCAGTTCATCCCTTACGAGAAGCCATAGATATGAGAGAAAACATGCAGAACGCCATAGTGTCTG 2734
Query 2437 TTAAGGAACTATGTGGACTCCCTCCAATTGCCAGTCTGAAGCAGTGCCTGTTAACTCTGTCATCTCGGCTCATC 2510
|||||||.||.|||||||||||.||.||||||||||||||.||||||||||||||.|||||.|||||.||||||
Sbjct 2735 TTAAGGAGCTGTGTGGACTCCCGCCGATTGCCAGTCTGAAACAGTGCCTGTTAACCCTGTCCTCTCGTCTCATC 2808
Query 2511 ACCAGTGACAATACTCCTTCAGTCTCACTTGTGATGAAAGACAGCTTTCCTTACCTGGAGCCTCTGGGTGCAAT 2584
||||||||||.||||||.||.||.||.||.||||||||.|||.||||||||||||||||||||||||||||.||
Sbjct 2809 ACCAGTGACAGTACTCCCTCTGTGTCTCTGGTGATGAAGGACTGCTTTCCTTACCTGGAGCCTCTGGGTGCCAT 2882
Query 2585 TCCAGATGTGCAGAAAAAGATGCTGACTGCTTATGATCTGATGATTCAAGAGAGCCGGTTTCTCATAGAAATGG 2658
|||||||||||||||.|.|||||||.||||.|||||||||||||||||||||||||||.|.|||||||||||||
Sbjct 2883 TCCAGATGTGCAGAAGAGGATGCTGGCTGCATATGATCTGATGATTCAAGAGAGCCGGGTCCTCATAGAAATGG 2956
Query 2659 CGGACACAGTCCAGGAAAAGATTGTACAGTGTCAGAAAGCAGGGATGGAGTTCCATGAAGAACTTCATAATTTG 2732
|.||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.||||||||||||.||
Sbjct 2957 CTGACACAGTTCAGGAAAAGATTGTACAGTGTCAGAAAGCAGGGATGGAATTCCATGAGGAACTTCATAATCTG 3030
Query 2733 GGGGCAAAAGAAGGCTTGAAGGGAAGAAAACTCAACAAAGCAACTGAGAGCTTTGCTTGGAACATTACAGTATT 2806
||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||.|.|||||||||.||||||||.|||||.|||||
Sbjct 3031 GGGGCAAAGGAAGGCTTGAAGGGAAGAAAACTCAACAAGGCCATTGAGAGCTTCGCTTGGAATATTACGGTATT 3104
Query 2807 GAAGGGCCAAGGAGATCTGTTGAAGAATGCCAAGAATGAAGCTATAGAAAACATGAAGCAGATCCAGCTGGCAT 2880
||||||.||||||||.|||.||||||||||||||||||||||..|.||.|||||.|||||.|||||||||||.|
Sbjct 3105 GAAGGGACAAGGAGACCTGCTGAAGAATGCCAAGAATGAAGCCGTGGAGAACATAAAGCAAATCCAGCTGGCCT 3178
Query 2881 GCCTGTCCTGTGGACTGAGTAAAGCCCCCAGCAGCAGTGCTGAGGCCAAGAGCAAGCGCAGCCTGGAAGCCATA 2954
||.||||.||||||||||||||||.|||..||.|..|..|.|||||||||.|||||||||||.|||||||.|||
Sbjct 3179 GCTTGTCTTGTGGACTGAGTAAAGGCCCTGGCGGTGGCTCAGAGGCCAAGGGCAAGCGCAGCTTGGAAGCGATA 3252
Query 2955 GAGGAGAAGGAAAGTAGTGAGGAGAATGGGAAGCTG 2990
||||||||.|||||||||||||||||.|||||||||
Sbjct 3253 GAGGAGAAAGAAAGTAGTGAGGAGAACGGGAAGCTG 3288