Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000477515
• Subject: XM_005246643.4
• Aligned Length: 3063
• Identities: 2988
• Gaps: 73

Alignment

Query    1  ------------------------------------------------------------------------AT  2
                                                                                    ||
Sbjct    1  ATGAAGAATAAACTTCAGGATCCTTCAAACCAAAAATGTGGTGGAAGAAAGAAAACCGTGTCTTTCAGCAGCAT  74

Query    3  GCCATCGG-AAAGAAAATTAGCAGTGCAAATGACTGCATCAGCTTCATGCAAGCTGGCTGTGAGTTGAAGAAAG  75
            |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  GCCATCGGAAAAGAAAATTAGCAGTGCAAATGACTGCATCAGCTTCATGCAAGCTGGCTGTGAGTTGAAGAAAG  148

Query   76  TCCGGCCAAATTCTCGCATTTACAACCGTTTTTTCACTCTGGACACAGACCTTCAAGCTCTTCGCTGGGAACCT  149
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  TCCGGCCAAATTCTCGCATTTACAACCGTTTTTTCACTCTGGACACAGACCTTCAAGCTCTTCGCTGGGAACCT  222

Query  150  TCAAAGAAAGACCTCGAGAAAGCCAAGCTTGATATTTCTGCCATAAAAGAGATCAGACTGGGGAAAAACACGGA  223
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  TCAAAGAAAGACCTCGAGAAAGCCAAGCTTGATATTTCTGCCATAAAAGAGATCAGACTGGGGAAAAACACGGA  296

Query  224  AACATTTAGAAACAATGGCCTTGCTGACCAGATCTGTGAGGACTGTGCCTTTTCCATACTCCACGGGGAAAACT  297
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  AACATTTAGAAACAATGGCCTTGCTGACCAGATCTGTGAGGACTGTGCCTTTTCCATACTCCACGGGGAAAACT  370

Query  298  ATGAGTCTCTGGACCTAGTTGCCAATTCAGCAGATGTGGCAAACATCTGGGTGTCTGGGTTACGGTACCTGGTT  371
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  ATGAGTCTCTGGACCTAGTTGCCAATTCAGCAGATGTGGCAAACATCTGGGTGTCTGGGTTACGGTACCTGGTT  444

Query  372  TCTCGAAGTAAGCAGCCTCTTGATTTTATGGAGGGCAACCAGAACACACCACGGTTCATGTGGTTGAAAACAGT  445
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  TCTCGAAGTAAGCAGCCTCTTGATTTTATGGAGGGCAACCAGAACACACCACGGTTCATGTGGTTGAAAACAGT  518

Query  446  GTTTGAAGCAGCAGATGTTGATGGGAATGGGATTATGTTGGAAGACACCTCTGTAGAGTTAATAAAACAACTCA  519
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  GTTTGAAGCAGCAGATGTTGATGGGAATGGGATTATGTTGGAAGACACCTCTGTAGAGTTAATAAAACAACTCA  592

Query  520  ACCCTACTCTGAAGGAAGCCAAGATCAGGTTAAAGTTTAAAGAAATCCAGAAGAGCAAGGAAAAACTAACCACC  593
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  ACCCTACTCTGAAGGAAGCCAAGATCAGGTTAAAGTTTAAAGAAATCCAGAAGAGCAAGGAAAAACTAACCACC  666

Query  594  CGCGTGACCGAAGAGGAATTTTGTGAAGCTTTTTGTGAACTTTGCACCAGGCCAGAAGTGTATTTCTTACTTGT  667
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  CGCGTGACCGAAGAGGAATTTTGTGAAGCTTTTTGTGAACTTTGCACCAGGCCAGAAGTGTATTTCTTACTTGT  740

Query  668  ACAGATATCTAAAAACAAAGAATATTTGGATGCCAATGATCTCATGCTCTTTTTAGAAGCTGAGCAAGGAGTCA  741
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  ACAGATATCTAAAAACAAAGAATATTTGGATGCCAATGATCTCATGCTCTTTTTAGAAGCTGAGCAAGGAGTCA  814

Query  742  CCCATATCACCGAGGATATATGCTTAGACATCATAAGGAGATACGAACTTTCTGAAGAGGGACGTCAAAAAGGG  815
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  CCCATATCACCGAGGATATATGCTTAGACATCATAAGGAGATACGAACTTTCTGAAGAGGGACGTCAAAAAGGG  888

Query  816  TTTCTTGCAATTGATGGCTTTACCCAGTATTTATTGTCATCAGAATGTGACATTTTTGATCCTGAGCAAAAGAA  889
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  TTTCTTGCAATTGATGGCTTTACCCAGTATTTATTGTCATCAGAATGTGACATTTTTGATCCTGAGCAAAAGAA  962

Query  890  GGTTGCCCAAGATATGACCCAGCCATTATCTCACTACTATATCAATGCCTCTCATAACACCTATCTAATAGAAG  963
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  GGTTGCCCAAGATATGACCCAGCCATTATCTCACTACTATATCAATGCCTCTCATAACACCTATCTAATAGAAG  1036

Query  964  ACCAGTTCAGGGGGCCAGCTGACATCAATGGGTACATTAGAGCTTTGAAAATGGGCTGTCGAAGCGTTGAACTC  1037
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  ACCAGTTCAGGGGGCCAGCTGACATCAATGGGTACATTAGAGCTTTGAAAATGGGCTGTCGAAGCGTTGAACTC  1110

Query 1038  GATGTAAGTGATGGTTCAGATAATGAACCAATCCTTTGTAATCGAAATAACATGACAACCCATGTTTCCTTTCG  1111
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  GATGTAAGTGATGGTTCAGATAATGAACCAATCCTTTGTAATCGAAATAACATGACAACCCATGTTTCCTTTCG  1184

Query 1112  AAGTGTCATAGAGGTAATAAATAAATTTGCCTTTGTTGCTTCTGAATACCCACTCATTCTTTGCTTGGGAAATC  1185
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  AAGTGTCATAGAGGTAATAAATAAATTTGCCTTTGTTGCTTCTGAATACCCACTCATTCTTTGCTTGGGAAATC  1258

Query 1186  ACTGCTCCTTGCCGCAGCAGAAGGTAATGGCTCAACAGATGAAAAAGGTCTTTGGCAATAAACTCTATACTGAA  1259
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  ACTGCTCCTTGCCGCAGCAGAAGGTAATGGCTCAACAGATGAAAAAGGTCTTTGGCAATAAACTCTATACTGAA  1332

Query 1260  GCACCTTTGCCCTCAGAATCCTACCTCCCATCACCAGAAAAATTAAAAAGAATGATCATTGTGAAAGGAAAGAA  1333
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333  GCACCTTTGCCCTCAGAATCCTACCTCCCATCACCAGAAAAATTAAAAAGAATGATCATTGTGAAAGGAAAGAA  1406

Query 1334  GTTGCCTTCTGATCCAGATGTGTTAGAAGGAGAAGTAACAGATGAAGATGAAGAAGCTGAAATGTCTCGAAGGA  1407
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407  GTTGCCTTCTGATCCAGATGTGTTAGAAGGAGAAGTAACAGATGAAGATGAAGAAGCTGAAATGTCTCGAAGGA  1480

Query 1408  TGTCGGTAGATTACAATGGTGAGCAGAAGCAAATCCGACTCTGTAGGGAGCTCTCTGATTTGGTGTCTATTTGT  1481
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481  TGTCGGTAGATTACAATGGTGAGCAGAAGCAAATCCGACTCTGTAGGGAGCTCTCTGATTTGGTGTCTATTTGT  1554

Query 1482  AAATCTGTTCAATACAGGGATTTTGAACTATCTATGAAAAGCCAAAACTATTGGGAAATGTGTTCATTTAGTGA  1555
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555  AAATCTGTTCAATACAGGGATTTTGAACTATCTATGAAAAGCCAAAACTATTGGGAAATGTGTTCATTTAGTGA  1628

Query 1556  AACAGAGGCCAGCCGCATTGCAAATGAGTACCCAGAGGATTTTGTTAATTATAATAAGAAGTTCTTATCAAGAA  1629
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629  AACAGAGGCCAGCCGCATTGCAAATGAGTACCCAGAGGATTTTGTTAATTATAATAAGAAGTTCTTATCAAGAA  1702

Query 1630  TCTATCCAAGTGCCATGAGGATCGATTCCAGTAACTTGAATCCACAGGACTTTTGGAATTGTGGCTGTCAGATT  1703
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1703  TCTATCCAAGTGCCATGAGGATCGATTCCAGTAACTTGAATCCACAGGACTTTTGGAATTGTGGCTGTCAGATT  1776

Query 1704  ATAGCAATGAATTTTCAGACTCCGGGTCCAATGATGGACCATCACACGGGCTGGTTTCTTCAAAACGGGGGATG  1777
            .|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1777  GTAGCAATGAATTTTCAGACTCCGGGTCCAATGATGGACCTTCACACGGGCTGGTTTCTTCAAAACGGGGGATG  1850

Query 1778  TGGTTATGTTCTAAGGCCGTCTATAATGCGAGATGAAGTTTCTTACTTCAGCGCAAATACAAAGGGCATTCTAC  1851
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1851  TGGTTATGTTCTAAGGCCGTCTATAATGCGAGATGAAGTTTCTTACTTCAGCGCAAATACAAAGGGCATTCTAC  1924

Query 1852  CTGGGGTGTCTCCTCTAGCTCTTCATATCAAGATCATCAGTGGTCAGAATTTCCCAAAGCCCAAGGGAGCTTGT  1925
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1925  CTGGGGTGTCTCCTCTAGCTCTTCATATCAAGATCATCAGTGGTCAGAATTTCCCAAAGCCCAAGGGAGCTTGT  1998

Query 1926  GCCAAAGGGGATGTCATAGATCCCTATGTTTGTATAGAGATACACGGAATTCCAGCGGATTGTTCGGAACAAAG  1999
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1999  GCCAAAGGGGATGTCATAGATCCCTATGTTTGTATAGAGATACACGGAATTCCAGCGGATTGTTCGGAACAAAG  2072

Query 2000  AACTAAAACTGTACAGCAAAACAGTGATAATCCTATTTTTGATGAAACTTTTGAGTTCCAAGTAAACCTACCTG  2073
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2073  AACTAAAACTGTACAGCAAAACAGTGATAATCCTATTTTTGATGAAACTTTTGAGTTCCAAGTAAACCTACCTG  2146

Query 2074  AGCTGGCCATGATCCGTTTTGTTGTTCTGGATGATGACTACATTGGGGATGAGTTTATAGGGCAATATACGATA  2147
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2147  AGCTGGCCATGATCCGTTTTGTTGTTCTGGATGATGACTACATTGGGGATGAGTTTATAGGGCAATATACGATA  2220

Query 2148  CCATTTGAATGTTTGCAGCCTGGATATCGGCATGTTCCCCTGCGTTCTTTTGTGGGTGACATCATGGAGCACGT  2221
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2221  CCATTTGAATGTTTGCAGCCTGGATATCGGCATGTTCCCCTGCGTTCTTTTGTGGGTGACATCATGGAGCACGT  2294

Query 2222  AACCCTTTTTGTCCACATAGCAATAACTAATCGAAGTGGAGGAGGAAAGGCACAGAAGCGCAGTCTTTCAGTGA  2295
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2295  AACCCTTTTTGTCCACATAGCAATAACTAATCGAAGTGGAGGAGGAAAGGCACAGAAGCGCAGTCTTTCAGTGA  2368

Query 2296  GAATGGGGAAGAAAGTTCGGGAATATACCATGCTCAGGAATATCGGTCTTAAAACCATTGATGACATCTTTAAA  2369
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2369  GAATGGGGAAGAAAGTTCGGGAATATACCATGCTCAGGAATATCGGTCTTAAAACCATTGATGACATCTTTAAA  2442

Query 2370  ATAGCGGTTCATCCATTACGAGAAGCCATAGATATGAGAGAAAATATGCAGAATGCAATCGTGTCTATTAAGGA  2443
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2443  ATAGCGGTTCATCCATTACGAGAAGCCATAGATATGAGAGAAAATATGCAGAATGCAATCGTGTCTATTAAGGA  2516

Query 2444  ACTATGTGGACTCCCTCCAATTGCCAGTCTGAAGCAGTGCCTGTTAACTCTGTCATCTCGGCTCATCACCAGTG  2517
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2517  ACTATGTGGACTCCCTCCAATTGCCAGTCTGAAGCAGTGCCTGTTAACTCTGTCATCTCGGCTCATCACCAGTG  2590

Query 2518  ACAATACTCCTTCAGTCTCACTTGTGATGAAAGACAGCTTTCCTTACCTGGAGCCTCTGGGTGCAATTCCAGAT  2591
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2591  ACAATACTCCTTCAGTCTCACTTGTGATGAAAGACAGCTTTCCTTACCTGGAGCCTCTGGGTGCAATTCCAGAT  2664

Query 2592  GTGCAGAAAAAGATGCTGACTGCTTATGATCTGATGATTCAAGAGAGCCGGTTTCTCATAGAAATGGCGGACAC  2665
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2665  GTGCAGAAAAAGATGCTGACTGCTTATGATCTGATGATTCAAGAGAGCCGGTTTCTCATAGAAATGGCGGACAC  2738

Query 2666  AGTCCAGGAAAAGATTGTACAGTGTCAGAAAGCAGGGATGGAGTTCCATGAAGAACTTCATAATTTGGGGGCAA  2739
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2739  AGTCCAGGAAAAGATTGTACAGTGTCAGAAAGCAGGGATGGAGTTCCATGAAGAACTTCATAATTTGGGGGCAA  2812

Query 2740  AAGAAGGCTTGAAGGGAAGAAAACTCAACAAAGCAACTGAGAGCTTTGCTTGGAACATTACAGTATTGAAGGGC  2813
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2813  AAGAAGGCTTGAAGGGAAGAAAACTCAACAAAGCAACTGAGAGCTTTGCTTGGAACATTACAGTATTGAAGGGC  2886

Query 2814  CAAGGAGATCTGTTGAAGAATGCCAAGAATGAAGCTATAGAAAACATGAAGCAGATCCAGCTGGCATGCCTGTC  2887
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2887  CAAGGAGATCTGTTGAAGAATGCCAAGAATGAAGCTATAGAAAACATGAAGCAGATCCAGCTGGCATGCCTGTC  2960

Query 2888  CTGTGGACTGAGTAAAGCCCCCAGCAGCAGTGCTGAGGCCAAGAGCAAGCGCAGCCTGGAAGCCATAGAGGAGA  2961
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2961  CTGTGGACTGAGTAAAGCCCCCAGCAGCAGTGCTGAGGCCAAGAGCAAGCGCAGCCTGGAAGCCATAGAGGAGA  3034

Query 2962  AGGAAAGTAGTGAGGAGAATGGGAAGCTG  2990
            |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3035  AGGAAAGTAGTGAGGAGAATGGGAAGCTG  3063