Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000477515
• Subject: XM_005246644.4
• Aligned Length: 3048
• Identities: 2988
• Gaps: 58

Alignment

Query    1  ---------------------------------------------------------ATGCCATCGG-AAAGAA  16
                                                                     |||||||||| ||||||
Sbjct    1  ATGGATCCTTCAAACCAAAAATGTGGTGGAAGAAAGAAAACCGTGTCTTTCAGCAGCATGCCATCGGAAAAGAA  74

Query   17  AATTAGCAGTGCAAATGACTGCATCAGCTTCATGCAAGCTGGCTGTGAGTTGAAGAAAGTCCGGCCAAATTCTC  90
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  AATTAGCAGTGCAAATGACTGCATCAGCTTCATGCAAGCTGGCTGTGAGTTGAAGAAAGTCCGGCCAAATTCTC  148

Query   91  GCATTTACAACCGTTTTTTCACTCTGGACACAGACCTTCAAGCTCTTCGCTGGGAACCTTCAAAGAAAGACCTC  164
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  GCATTTACAACCGTTTTTTCACTCTGGACACAGACCTTCAAGCTCTTCGCTGGGAACCTTCAAAGAAAGACCTC  222

Query  165  GAGAAAGCCAAGCTTGATATTTCTGCCATAAAAGAGATCAGACTGGGGAAAAACACGGAAACATTTAGAAACAA  238
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  GAGAAAGCCAAGCTTGATATTTCTGCCATAAAAGAGATCAGACTGGGGAAAAACACGGAAACATTTAGAAACAA  296

Query  239  TGGCCTTGCTGACCAGATCTGTGAGGACTGTGCCTTTTCCATACTCCACGGGGAAAACTATGAGTCTCTGGACC  312
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  TGGCCTTGCTGACCAGATCTGTGAGGACTGTGCCTTTTCCATACTCCACGGGGAAAACTATGAGTCTCTGGACC  370

Query  313  TAGTTGCCAATTCAGCAGATGTGGCAAACATCTGGGTGTCTGGGTTACGGTACCTGGTTTCTCGAAGTAAGCAG  386
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  TAGTTGCCAATTCAGCAGATGTGGCAAACATCTGGGTGTCTGGGTTACGGTACCTGGTTTCTCGAAGTAAGCAG  444

Query  387  CCTCTTGATTTTATGGAGGGCAACCAGAACACACCACGGTTCATGTGGTTGAAAACAGTGTTTGAAGCAGCAGA  460
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  CCTCTTGATTTTATGGAGGGCAACCAGAACACACCACGGTTCATGTGGTTGAAAACAGTGTTTGAAGCAGCAGA  518

Query  461  TGTTGATGGGAATGGGATTATGTTGGAAGACACCTCTGTAGAGTTAATAAAACAACTCAACCCTACTCTGAAGG  534
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  TGTTGATGGGAATGGGATTATGTTGGAAGACACCTCTGTAGAGTTAATAAAACAACTCAACCCTACTCTGAAGG  592

Query  535  AAGCCAAGATCAGGTTAAAGTTTAAAGAAATCCAGAAGAGCAAGGAAAAACTAACCACCCGCGTGACCGAAGAG  608
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  AAGCCAAGATCAGGTTAAAGTTTAAAGAAATCCAGAAGAGCAAGGAAAAACTAACCACCCGCGTGACCGAAGAG  666

Query  609  GAATTTTGTGAAGCTTTTTGTGAACTTTGCACCAGGCCAGAAGTGTATTTCTTACTTGTACAGATATCTAAAAA  682
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  GAATTTTGTGAAGCTTTTTGTGAACTTTGCACCAGGCCAGAAGTGTATTTCTTACTTGTACAGATATCTAAAAA  740

Query  683  CAAAGAATATTTGGATGCCAATGATCTCATGCTCTTTTTAGAAGCTGAGCAAGGAGTCACCCATATCACCGAGG  756
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  CAAAGAATATTTGGATGCCAATGATCTCATGCTCTTTTTAGAAGCTGAGCAAGGAGTCACCCATATCACCGAGG  814

Query  757  ATATATGCTTAGACATCATAAGGAGATACGAACTTTCTGAAGAGGGACGTCAAAAAGGGTTTCTTGCAATTGAT  830
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  ATATATGCTTAGACATCATAAGGAGATACGAACTTTCTGAAGAGGGACGTCAAAAAGGGTTTCTTGCAATTGAT  888

Query  831  GGCTTTACCCAGTATTTATTGTCATCAGAATGTGACATTTTTGATCCTGAGCAAAAGAAGGTTGCCCAAGATAT  904
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  GGCTTTACCCAGTATTTATTGTCATCAGAATGTGACATTTTTGATCCTGAGCAAAAGAAGGTTGCCCAAGATAT  962

Query  905  GACCCAGCCATTATCTCACTACTATATCAATGCCTCTCATAACACCTATCTAATAGAAGACCAGTTCAGGGGGC  978
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  GACCCAGCCATTATCTCACTACTATATCAATGCCTCTCATAACACCTATCTAATAGAAGACCAGTTCAGGGGGC  1036

Query  979  CAGCTGACATCAATGGGTACATTAGAGCTTTGAAAATGGGCTGTCGAAGCGTTGAACTCGATGTAAGTGATGGT  1052
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  CAGCTGACATCAATGGGTACATTAGAGCTTTGAAAATGGGCTGTCGAAGCGTTGAACTCGATGTAAGTGATGGT  1110

Query 1053  TCAGATAATGAACCAATCCTTTGTAATCGAAATAACATGACAACCCATGTTTCCTTTCGAAGTGTCATAGAGGT  1126
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  TCAGATAATGAACCAATCCTTTGTAATCGAAATAACATGACAACCCATGTTTCCTTTCGAAGTGTCATAGAGGT  1184

Query 1127  AATAAATAAATTTGCCTTTGTTGCTTCTGAATACCCACTCATTCTTTGCTTGGGAAATCACTGCTCCTTGCCGC  1200
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  AATAAATAAATTTGCCTTTGTTGCTTCTGAATACCCACTCATTCTTTGCTTGGGAAATCACTGCTCCTTGCCGC  1258

Query 1201  AGCAGAAGGTAATGGCTCAACAGATGAAAAAGGTCTTTGGCAATAAACTCTATACTGAAGCACCTTTGCCCTCA  1274
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  AGCAGAAGGTAATGGCTCAACAGATGAAAAAGGTCTTTGGCAATAAACTCTATACTGAAGCACCTTTGCCCTCA  1332

Query 1275  GAATCCTACCTCCCATCACCAGAAAAATTAAAAAGAATGATCATTGTGAAAGGAAAGAAGTTGCCTTCTGATCC  1348
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333  GAATCCTACCTCCCATCACCAGAAAAATTAAAAAGAATGATCATTGTGAAAGGAAAGAAGTTGCCTTCTGATCC  1406

Query 1349  AGATGTGTTAGAAGGAGAAGTAACAGATGAAGATGAAGAAGCTGAAATGTCTCGAAGGATGTCGGTAGATTACA  1422
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407  AGATGTGTTAGAAGGAGAAGTAACAGATGAAGATGAAGAAGCTGAAATGTCTCGAAGGATGTCGGTAGATTACA  1480

Query 1423  ATGGTGAGCAGAAGCAAATCCGACTCTGTAGGGAGCTCTCTGATTTGGTGTCTATTTGTAAATCTGTTCAATAC  1496
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481  ATGGTGAGCAGAAGCAAATCCGACTCTGTAGGGAGCTCTCTGATTTGGTGTCTATTTGTAAATCTGTTCAATAC  1554

Query 1497  AGGGATTTTGAACTATCTATGAAAAGCCAAAACTATTGGGAAATGTGTTCATTTAGTGAAACAGAGGCCAGCCG  1570
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555  AGGGATTTTGAACTATCTATGAAAAGCCAAAACTATTGGGAAATGTGTTCATTTAGTGAAACAGAGGCCAGCCG  1628

Query 1571  CATTGCAAATGAGTACCCAGAGGATTTTGTTAATTATAATAAGAAGTTCTTATCAAGAATCTATCCAAGTGCCA  1644
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629  CATTGCAAATGAGTACCCAGAGGATTTTGTTAATTATAATAAGAAGTTCTTATCAAGAATCTATCCAAGTGCCA  1702

Query 1645  TGAGGATCGATTCCAGTAACTTGAATCCACAGGACTTTTGGAATTGTGGCTGTCAGATTATAGCAATGAATTTT  1718
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||
Sbjct 1703  TGAGGATCGATTCCAGTAACTTGAATCCACAGGACTTTTGGAATTGTGGCTGTCAGATTGTAGCAATGAATTTT  1776

Query 1719  CAGACTCCGGGTCCAATGATGGACCATCACACGGGCTGGTTTCTTCAAAACGGGGGATGTGGTTATGTTCTAAG  1792
            |||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1777  CAGACTCCGGGTCCAATGATGGACCTTCACACGGGCTGGTTTCTTCAAAACGGGGGATGTGGTTATGTTCTAAG  1850

Query 1793  GCCGTCTATAATGCGAGATGAAGTTTCTTACTTCAGCGCAAATACAAAGGGCATTCTACCTGGGGTGTCTCCTC  1866
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1851  GCCGTCTATAATGCGAGATGAAGTTTCTTACTTCAGCGCAAATACAAAGGGCATTCTACCTGGGGTGTCTCCTC  1924

Query 1867  TAGCTCTTCATATCAAGATCATCAGTGGTCAGAATTTCCCAAAGCCCAAGGGAGCTTGTGCCAAAGGGGATGTC  1940
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1925  TAGCTCTTCATATCAAGATCATCAGTGGTCAGAATTTCCCAAAGCCCAAGGGAGCTTGTGCCAAAGGGGATGTC  1998

Query 1941  ATAGATCCCTATGTTTGTATAGAGATACACGGAATTCCAGCGGATTGTTCGGAACAAAGAACTAAAACTGTACA  2014
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1999  ATAGATCCCTATGTTTGTATAGAGATACACGGAATTCCAGCGGATTGTTCGGAACAAAGAACTAAAACTGTACA  2072

Query 2015  GCAAAACAGTGATAATCCTATTTTTGATGAAACTTTTGAGTTCCAAGTAAACCTACCTGAGCTGGCCATGATCC  2088
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2073  GCAAAACAGTGATAATCCTATTTTTGATGAAACTTTTGAGTTCCAAGTAAACCTACCTGAGCTGGCCATGATCC  2146

Query 2089  GTTTTGTTGTTCTGGATGATGACTACATTGGGGATGAGTTTATAGGGCAATATACGATACCATTTGAATGTTTG  2162
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2147  GTTTTGTTGTTCTGGATGATGACTACATTGGGGATGAGTTTATAGGGCAATATACGATACCATTTGAATGTTTG  2220

Query 2163  CAGCCTGGATATCGGCATGTTCCCCTGCGTTCTTTTGTGGGTGACATCATGGAGCACGTAACCCTTTTTGTCCA  2236
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2221  CAGCCTGGATATCGGCATGTTCCCCTGCGTTCTTTTGTGGGTGACATCATGGAGCACGTAACCCTTTTTGTCCA  2294

Query 2237  CATAGCAATAACTAATCGAAGTGGAGGAGGAAAGGCACAGAAGCGCAGTCTTTCAGTGAGAATGGGGAAGAAAG  2310
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2295  CATAGCAATAACTAATCGAAGTGGAGGAGGAAAGGCACAGAAGCGCAGTCTTTCAGTGAGAATGGGGAAGAAAG  2368

Query 2311  TTCGGGAATATACCATGCTCAGGAATATCGGTCTTAAAACCATTGATGACATCTTTAAAATAGCGGTTCATCCA  2384
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2369  TTCGGGAATATACCATGCTCAGGAATATCGGTCTTAAAACCATTGATGACATCTTTAAAATAGCGGTTCATCCA  2442

Query 2385  TTACGAGAAGCCATAGATATGAGAGAAAATATGCAGAATGCAATCGTGTCTATTAAGGAACTATGTGGACTCCC  2458
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2443  TTACGAGAAGCCATAGATATGAGAGAAAATATGCAGAATGCAATCGTGTCTATTAAGGAACTATGTGGACTCCC  2516

Query 2459  TCCAATTGCCAGTCTGAAGCAGTGCCTGTTAACTCTGTCATCTCGGCTCATCACCAGTGACAATACTCCTTCAG  2532
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2517  TCCAATTGCCAGTCTGAAGCAGTGCCTGTTAACTCTGTCATCTCGGCTCATCACCAGTGACAATACTCCTTCAG  2590

Query 2533  TCTCACTTGTGATGAAAGACAGCTTTCCTTACCTGGAGCCTCTGGGTGCAATTCCAGATGTGCAGAAAAAGATG  2606
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2591  TCTCACTTGTGATGAAAGACAGCTTTCCTTACCTGGAGCCTCTGGGTGCAATTCCAGATGTGCAGAAAAAGATG  2664

Query 2607  CTGACTGCTTATGATCTGATGATTCAAGAGAGCCGGTTTCTCATAGAAATGGCGGACACAGTCCAGGAAAAGAT  2680
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2665  CTGACTGCTTATGATCTGATGATTCAAGAGAGCCGGTTTCTCATAGAAATGGCGGACACAGTCCAGGAAAAGAT  2738

Query 2681  TGTACAGTGTCAGAAAGCAGGGATGGAGTTCCATGAAGAACTTCATAATTTGGGGGCAAAAGAAGGCTTGAAGG  2754
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2739  TGTACAGTGTCAGAAAGCAGGGATGGAGTTCCATGAAGAACTTCATAATTTGGGGGCAAAAGAAGGCTTGAAGG  2812

Query 2755  GAAGAAAACTCAACAAAGCAACTGAGAGCTTTGCTTGGAACATTACAGTATTGAAGGGCCAAGGAGATCTGTTG  2828
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2813  GAAGAAAACTCAACAAAGCAACTGAGAGCTTTGCTTGGAACATTACAGTATTGAAGGGCCAAGGAGATCTGTTG  2886

Query 2829  AAGAATGCCAAGAATGAAGCTATAGAAAACATGAAGCAGATCCAGCTGGCATGCCTGTCCTGTGGACTGAGTAA  2902
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2887  AAGAATGCCAAGAATGAAGCTATAGAAAACATGAAGCAGATCCAGCTGGCATGCCTGTCCTGTGGACTGAGTAA  2960

Query 2903  AGCCCCCAGCAGCAGTGCTGAGGCCAAGAGCAAGCGCAGCCTGGAAGCCATAGAGGAGAAGGAAAGTAGTGAGG  2976
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2961  AGCCCCCAGCAGCAGTGCTGAGGCCAAGAGCAAGCGCAGCCTGGAAGCCATAGAGGAGAAGGAAAGTAGTGAGG  3034

Query 2977  AGAATGGGAAGCTG  2990
            ||||||||||||||
Sbjct 3035  AGAATGGGAAGCTG  3048