Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- TRCN0000477515
- Subject:
- XM_011511351.2
- Aligned Length:
- 3048
- Identities:
- 2988
- Gaps:
- 58
Alignment
Query 1 ---------------------------------------------------------ATGCCATCGG-AAAGAA 16
|||||||||| ||||||
Sbjct 1 ATGGATCCTTCAAACCAAAAATGTGGTGGAAGAAAGAAAACCGTGTCTTTCAGCAGCATGCCATCGGAAAAGAA 74
Query 17 AATTAGCAGTGCAAATGACTGCATCAGCTTCATGCAAGCTGGCTGTGAGTTGAAGAAAGTCCGGCCAAATTCTC 90
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 75 AATTAGCAGTGCAAATGACTGCATCAGCTTCATGCAAGCTGGCTGTGAGTTGAAGAAAGTCCGGCCAAATTCTC 148
Query 91 GCATTTACAACCGTTTTTTCACTCTGGACACAGACCTTCAAGCTCTTCGCTGGGAACCTTCAAAGAAAGACCTC 164
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 149 GCATTTACAACCGTTTTTTCACTCTGGACACAGACCTTCAAGCTCTTCGCTGGGAACCTTCAAAGAAAGACCTC 222
Query 165 GAGAAAGCCAAGCTTGATATTTCTGCCATAAAAGAGATCAGACTGGGGAAAAACACGGAAACATTTAGAAACAA 238
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223 GAGAAAGCCAAGCTTGATATTTCTGCCATAAAAGAGATCAGACTGGGGAAAAACACGGAAACATTTAGAAACAA 296
Query 239 TGGCCTTGCTGACCAGATCTGTGAGGACTGTGCCTTTTCCATACTCCACGGGGAAAACTATGAGTCTCTGGACC 312
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 297 TGGCCTTGCTGACCAGATCTGTGAGGACTGTGCCTTTTCCATACTCCACGGGGAAAACTATGAGTCTCTGGACC 370
Query 313 TAGTTGCCAATTCAGCAGATGTGGCAAACATCTGGGTGTCTGGGTTACGGTACCTGGTTTCTCGAAGTAAGCAG 386
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 371 TAGTTGCCAATTCAGCAGATGTGGCAAACATCTGGGTGTCTGGGTTACGGTACCTGGTTTCTCGAAGTAAGCAG 444
Query 387 CCTCTTGATTTTATGGAGGGCAACCAGAACACACCACGGTTCATGTGGTTGAAAACAGTGTTTGAAGCAGCAGA 460
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 445 CCTCTTGATTTTATGGAGGGCAACCAGAACACACCACGGTTCATGTGGTTGAAAACAGTGTTTGAAGCAGCAGA 518
Query 461 TGTTGATGGGAATGGGATTATGTTGGAAGACACCTCTGTAGAGTTAATAAAACAACTCAACCCTACTCTGAAGG 534
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 519 TGTTGATGGGAATGGGATTATGTTGGAAGACACCTCTGTAGAGTTAATAAAACAACTCAACCCTACTCTGAAGG 592
Query 535 AAGCCAAGATCAGGTTAAAGTTTAAAGAAATCCAGAAGAGCAAGGAAAAACTAACCACCCGCGTGACCGAAGAG 608
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 593 AAGCCAAGATCAGGTTAAAGTTTAAAGAAATCCAGAAGAGCAAGGAAAAACTAACCACCCGCGTGACCGAAGAG 666
Query 609 GAATTTTGTGAAGCTTTTTGTGAACTTTGCACCAGGCCAGAAGTGTATTTCTTACTTGTACAGATATCTAAAAA 682
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 667 GAATTTTGTGAAGCTTTTTGTGAACTTTGCACCAGGCCAGAAGTGTATTTCTTACTTGTACAGATATCTAAAAA 740
Query 683 CAAAGAATATTTGGATGCCAATGATCTCATGCTCTTTTTAGAAGCTGAGCAAGGAGTCACCCATATCACCGAGG 756
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 741 CAAAGAATATTTGGATGCCAATGATCTCATGCTCTTTTTAGAAGCTGAGCAAGGAGTCACCCATATCACCGAGG 814
Query 757 ATATATGCTTAGACATCATAAGGAGATACGAACTTTCTGAAGAGGGACGTCAAAAAGGGTTTCTTGCAATTGAT 830
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 815 ATATATGCTTAGACATCATAAGGAGATACGAACTTTCTGAAGAGGGACGTCAAAAAGGGTTTCTTGCAATTGAT 888
Query 831 GGCTTTACCCAGTATTTATTGTCATCAGAATGTGACATTTTTGATCCTGAGCAAAAGAAGGTTGCCCAAGATAT 904
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 889 GGCTTTACCCAGTATTTATTGTCATCAGAATGTGACATTTTTGATCCTGAGCAAAAGAAGGTTGCCCAAGATAT 962
Query 905 GACCCAGCCATTATCTCACTACTATATCAATGCCTCTCATAACACCTATCTAATAGAAGACCAGTTCAGGGGGC 978
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 963 GACCCAGCCATTATCTCACTACTATATCAATGCCTCTCATAACACCTATCTAATAGAAGACCAGTTCAGGGGGC 1036
Query 979 CAGCTGACATCAATGGGTACATTAGAGCTTTGAAAATGGGCTGTCGAAGCGTTGAACTCGATGTAAGTGATGGT 1052
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037 CAGCTGACATCAATGGGTACATTAGAGCTTTGAAAATGGGCTGTCGAAGCGTTGAACTCGATGTAAGTGATGGT 1110
Query 1053 TCAGATAATGAACCAATCCTTTGTAATCGAAATAACATGACAACCCATGTTTCCTTTCGAAGTGTCATAGAGGT 1126
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111 TCAGATAATGAACCAATCCTTTGTAATCGAAATAACATGACAACCCATGTTTCCTTTCGAAGTGTCATAGAGGT 1184
Query 1127 AATAAATAAATTTGCCTTTGTTGCTTCTGAATACCCACTCATTCTTTGCTTGGGAAATCACTGCTCCTTGCCGC 1200
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185 AATAAATAAATTTGCCTTTGTTGCTTCTGAATACCCACTCATTCTTTGCTTGGGAAATCACTGCTCCTTGCCGC 1258
Query 1201 AGCAGAAGGTAATGGCTCAACAGATGAAAAAGGTCTTTGGCAATAAACTCTATACTGAAGCACCTTTGCCCTCA 1274
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259 AGCAGAAGGTAATGGCTCAACAGATGAAAAAGGTCTTTGGCAATAAACTCTATACTGAAGCACCTTTGCCCTCA 1332
Query 1275 GAATCCTACCTCCCATCACCAGAAAAATTAAAAAGAATGATCATTGTGAAAGGAAAGAAGTTGCCTTCTGATCC 1348
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333 GAATCCTACCTCCCATCACCAGAAAAATTAAAAAGAATGATCATTGTGAAAGGAAAGAAGTTGCCTTCTGATCC 1406
Query 1349 AGATGTGTTAGAAGGAGAAGTAACAGATGAAGATGAAGAAGCTGAAATGTCTCGAAGGATGTCGGTAGATTACA 1422
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407 AGATGTGTTAGAAGGAGAAGTAACAGATGAAGATGAAGAAGCTGAAATGTCTCGAAGGATGTCGGTAGATTACA 1480
Query 1423 ATGGTGAGCAGAAGCAAATCCGACTCTGTAGGGAGCTCTCTGATTTGGTGTCTATTTGTAAATCTGTTCAATAC 1496
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481 ATGGTGAGCAGAAGCAAATCCGACTCTGTAGGGAGCTCTCTGATTTGGTGTCTATTTGTAAATCTGTTCAATAC 1554
Query 1497 AGGGATTTTGAACTATCTATGAAAAGCCAAAACTATTGGGAAATGTGTTCATTTAGTGAAACAGAGGCCAGCCG 1570
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555 AGGGATTTTGAACTATCTATGAAAAGCCAAAACTATTGGGAAATGTGTTCATTTAGTGAAACAGAGGCCAGCCG 1628
Query 1571 CATTGCAAATGAGTACCCAGAGGATTTTGTTAATTATAATAAGAAGTTCTTATCAAGAATCTATCCAAGTGCCA 1644
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629 CATTGCAAATGAGTACCCAGAGGATTTTGTTAATTATAATAAGAAGTTCTTATCAAGAATCTATCCAAGTGCCA 1702
Query 1645 TGAGGATCGATTCCAGTAACTTGAATCCACAGGACTTTTGGAATTGTGGCTGTCAGATTATAGCAATGAATTTT 1718
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||
Sbjct 1703 TGAGGATCGATTCCAGTAACTTGAATCCACAGGACTTTTGGAATTGTGGCTGTCAGATTGTAGCAATGAATTTT 1776
Query 1719 CAGACTCCGGGTCCAATGATGGACCATCACACGGGCTGGTTTCTTCAAAACGGGGGATGTGGTTATGTTCTAAG 1792
|||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1777 CAGACTCCGGGTCCAATGATGGACCTTCACACGGGCTGGTTTCTTCAAAACGGGGGATGTGGTTATGTTCTAAG 1850
Query 1793 GCCGTCTATAATGCGAGATGAAGTTTCTTACTTCAGCGCAAATACAAAGGGCATTCTACCTGGGGTGTCTCCTC 1866
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1851 GCCGTCTATAATGCGAGATGAAGTTTCTTACTTCAGCGCAAATACAAAGGGCATTCTACCTGGGGTGTCTCCTC 1924
Query 1867 TAGCTCTTCATATCAAGATCATCAGTGGTCAGAATTTCCCAAAGCCCAAGGGAGCTTGTGCCAAAGGGGATGTC 1940
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1925 TAGCTCTTCATATCAAGATCATCAGTGGTCAGAATTTCCCAAAGCCCAAGGGAGCTTGTGCCAAAGGGGATGTC 1998
Query 1941 ATAGATCCCTATGTTTGTATAGAGATACACGGAATTCCAGCGGATTGTTCGGAACAAAGAACTAAAACTGTACA 2014
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1999 ATAGATCCCTATGTTTGTATAGAGATACACGGAATTCCAGCGGATTGTTCGGAACAAAGAACTAAAACTGTACA 2072
Query 2015 GCAAAACAGTGATAATCCTATTTTTGATGAAACTTTTGAGTTCCAAGTAAACCTACCTGAGCTGGCCATGATCC 2088
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2073 GCAAAACAGTGATAATCCTATTTTTGATGAAACTTTTGAGTTCCAAGTAAACCTACCTGAGCTGGCCATGATCC 2146
Query 2089 GTTTTGTTGTTCTGGATGATGACTACATTGGGGATGAGTTTATAGGGCAATATACGATACCATTTGAATGTTTG 2162
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2147 GTTTTGTTGTTCTGGATGATGACTACATTGGGGATGAGTTTATAGGGCAATATACGATACCATTTGAATGTTTG 2220
Query 2163 CAGCCTGGATATCGGCATGTTCCCCTGCGTTCTTTTGTGGGTGACATCATGGAGCACGTAACCCTTTTTGTCCA 2236
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2221 CAGCCTGGATATCGGCATGTTCCCCTGCGTTCTTTTGTGGGTGACATCATGGAGCACGTAACCCTTTTTGTCCA 2294
Query 2237 CATAGCAATAACTAATCGAAGTGGAGGAGGAAAGGCACAGAAGCGCAGTCTTTCAGTGAGAATGGGGAAGAAAG 2310
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2295 CATAGCAATAACTAATCGAAGTGGAGGAGGAAAGGCACAGAAGCGCAGTCTTTCAGTGAGAATGGGGAAGAAAG 2368
Query 2311 TTCGGGAATATACCATGCTCAGGAATATCGGTCTTAAAACCATTGATGACATCTTTAAAATAGCGGTTCATCCA 2384
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2369 TTCGGGAATATACCATGCTCAGGAATATCGGTCTTAAAACCATTGATGACATCTTTAAAATAGCGGTTCATCCA 2442
Query 2385 TTACGAGAAGCCATAGATATGAGAGAAAATATGCAGAATGCAATCGTGTCTATTAAGGAACTATGTGGACTCCC 2458
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2443 TTACGAGAAGCCATAGATATGAGAGAAAATATGCAGAATGCAATCGTGTCTATTAAGGAACTATGTGGACTCCC 2516
Query 2459 TCCAATTGCCAGTCTGAAGCAGTGCCTGTTAACTCTGTCATCTCGGCTCATCACCAGTGACAATACTCCTTCAG 2532
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2517 TCCAATTGCCAGTCTGAAGCAGTGCCTGTTAACTCTGTCATCTCGGCTCATCACCAGTGACAATACTCCTTCAG 2590
Query 2533 TCTCACTTGTGATGAAAGACAGCTTTCCTTACCTGGAGCCTCTGGGTGCAATTCCAGATGTGCAGAAAAAGATG 2606
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2591 TCTCACTTGTGATGAAAGACAGCTTTCCTTACCTGGAGCCTCTGGGTGCAATTCCAGATGTGCAGAAAAAGATG 2664
Query 2607 CTGACTGCTTATGATCTGATGATTCAAGAGAGCCGGTTTCTCATAGAAATGGCGGACACAGTCCAGGAAAAGAT 2680
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2665 CTGACTGCTTATGATCTGATGATTCAAGAGAGCCGGTTTCTCATAGAAATGGCGGACACAGTCCAGGAAAAGAT 2738
Query 2681 TGTACAGTGTCAGAAAGCAGGGATGGAGTTCCATGAAGAACTTCATAATTTGGGGGCAAAAGAAGGCTTGAAGG 2754
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2739 TGTACAGTGTCAGAAAGCAGGGATGGAGTTCCATGAAGAACTTCATAATTTGGGGGCAAAAGAAGGCTTGAAGG 2812
Query 2755 GAAGAAAACTCAACAAAGCAACTGAGAGCTTTGCTTGGAACATTACAGTATTGAAGGGCCAAGGAGATCTGTTG 2828
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2813 GAAGAAAACTCAACAAAGCAACTGAGAGCTTTGCTTGGAACATTACAGTATTGAAGGGCCAAGGAGATCTGTTG 2886
Query 2829 AAGAATGCCAAGAATGAAGCTATAGAAAACATGAAGCAGATCCAGCTGGCATGCCTGTCCTGTGGACTGAGTAA 2902
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2887 AAGAATGCCAAGAATGAAGCTATAGAAAACATGAAGCAGATCCAGCTGGCATGCCTGTCCTGTGGACTGAGTAA 2960
Query 2903 AGCCCCCAGCAGCAGTGCTGAGGCCAAGAGCAAGCGCAGCCTGGAAGCCATAGAGGAGAAGGAAAGTAGTGAGG 2976
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2961 AGCCCCCAGCAGCAGTGCTGAGGCCAAGAGCAAGCGCAGCCTGGAAGCCATAGAGGAGAAGGAAAGTAGTGAGG 3034
Query 2977 AGAATGGGAAGCTG 2990
||||||||||||||
Sbjct 3035 AGAATGGGAAGCTG 3048