Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000477516
• Subject: NM_181352.2
• Aligned Length: 3835
• Identities: 3304
• Gaps: 521

Alignment

Query    1  ------------------------ATGGACAGTTTAGAAGAACCTCAGAAAAAAGTCTTTAAGGCTCGAAAAAC  50
                                    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGCATCAGGACCAGAGATTCAGAATGGACAGTTTAGAAGAACCTCAGAAAAAAGTCTTTAAGGCTCGAAAAAC  74

Query   51  GATGAGAGTGAGTGATCGTCAGCAACTTGAAGCAGTGTACAAGGTCAAAGAAGAACTGTTGAAAACTGATGTCA  124
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  GATGAGAGTGAGTGATCGTCAGCAACTTGAAGCAGTGTACAAGGTCAAAGAAGAACTGTTGAAAACTGATGTCA  148

Query  125  AGCTGTTAAATGGCAACCATGAAAATGGAGATTTGGACCCAACCTCACCTTTGGAAAACATGGATTACATTAAA  198
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  AGCTGTTAAATGGCAACCATGAAAATGGAGATTTGGACCCAACCTCACCTTTGGAAAACATGGATTACATTAAA  222

Query  199  GACAAGGAAGAGGTGAATGGCATTGAAGAGATTTGTTTTGATCCTGAAGGAAGTAAAGCAGAATGGAAGGAAAC  272
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  GACAAGGAAGAGGTGAATGGCATTGAAGAGATTTGTTTTGATCCTGAAGGAAGTAAAGCAGAATGGAAGGAAAC  296

Query  273  ACCCTGTATCCTAAGTGTTAATGTAAAAAACAAGCAGGATGATGATTTAAATTGTGAACCTTTGTCTCCCCATA  346
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  ACCCTGTATCCTAAGTGTTAATGTAAAAAACAAGCAGGATGATGATTTAAATTGTGAACCTTTGTCTCCCCATA  370

Query  347  ATATAACTCCAGAACCAGTCTCTAAACTGCCTGCTGAACCAGTTTCTGGTGATCCAGCCCCTGGTGATCTGGAT  420
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  ATATAACTCCAGAACCAGTCTCTAAACTGCCTGCTGAACCAGTTTCTGGTGATCCAGCCCCTGGTGATCTGGAT  444

Query  421  GCCGGAGATCCAGCCTCCGGAGTACTGGCCTCTGGTGATTCCACCTCTGGTGATCCCACCTCTAGCGAGCCCTC  494
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  GCCGGAGATCCAGCCTCCGGAGTACTGGCCTCTGGTGATTCCACCTCTGGTGATCCCACCTCTAGCGAGCCCTC  518

Query  495  CTCTAGTGATGCTGCCTCTGGTGATGCAACCTCTGGTGATGCCCCTTCTGGTGATGTGTCCCCTGGTGATGCCA  568
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  CTCTAGTGATGCTGCCTCTGGTGATGCAACCTCTGGTGATGCCCCTTCTGGTGATGTGTCCCCTGGTGATGCCA  592

Query  569  CCTCTGGTGATGCCACTGCTGATGATCTCTCCTCTGGTGATCCCACCTCTAGTGATCCCATCCCAGGTGAACCG  642
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  CCTCTGGTGATGCCACTGCTGATGATCTCTCCTCTGGTGATCCCACCTCTAGTGATCCCATCCCAGGTGAACCG  666

Query  643  GTCCCTGTTGAACCCATTTCTGGTGATTGTGCCGCTGATGATATAGCCTCTAGTGAAATAACTTCTGTTGATCT  716
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  GTCCCTGTTGAACCCATTTCTGGTGATTGTGCCGCTGATGATATAGCCTCTAGTGAAATAACTTCTGTTGATCT  740

Query  717  GGCTTCTGGAGCACCAGCTTCCACTGATCCAGCCTCTGATGATCTGGCCTCTGGTGATCTATCCTCTAGTGAAC  790
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  GGCTTCTGGAGCACCAGCTTCCACTGATCCAGCCTCTGATGATCTGGCCTCTGGTGATCTATCCTCTAGTGAAC  814

Query  791  TGGCCTCTGATGATCTGGCCACTGGTGAACTGGCCTCTGATGAGCTGACTTCTGAATCAACCTTTGATCGTACC  864
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  TGGCCTCTGATGATCTGGCCACTGGTGAACTGGCCTCTGATGAGCTGACTTCTGAATCAACCTTTGATCGTACC  888

Query  865  TTTGAACCAAAGTCTGTACCAGTTTGTGAACCAGTTCCTGAAATTGACAATATAGAACCAAGTAGCAATAAAGA  938
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  TTTGAACCAAAGTCTGTACCAGTTTGTGAACCAGTTCCTGAAATTGACAATATAGAACCAAGTAGCAATAAAGA  962

Query  939  TGATGATTTTCTTGAAAAAAATGGAGCTGATGAAAAATTAGAGCAAATTCAGAGTAAAGACTCATTGGATGAGA  1012
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  TGATGATTTTCTTGAAAAAAATGGAGCTGATGAAAAATTAGAGCAAATTCAGAGTAAAGACTCATTGGATGAGA  1036

Query 1013  AAAATAAAGCTGATAATAATATTGATGCTAATGAAGAAACTCTAGAAACAGATGATACAACTATTTGTTCAGAT  1086
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  AAAATAAAGCTGATAATAATATTGATGCTAATGAAGAAACTCTAGAAACAGATGATACAACTATTTGTTCAGAT  1110

Query 1087  CGACCTCCTGAAAATGAAAAGAAGGTAGAGGAAGATATTATCACAGAGCTTGCTCTTGGAGAAGATGCTATATC  1160
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  CGACCTCCTGAAAATGAAAAGAAGGTAGAGGAAGATATTATCACAGAGCTTGCTCTTGGAGAAGATGCTATATC  1184

Query 1161  TAGCAGTATGGAAATTGACCAAGGTGAAAAGAATGAAGATGAAACTTCTGCAGATCTTGTAGAAACGATTAATG  1234
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  TAGCAGTATGGAAATTGACCAAGGTGAAAAGAATGAAGATGAAACTTCTGCAGATCTTGTAGAAACGATTAATG  1258

Query 1235  AAAATGTTATTGAAGATAACAAAAGTGAGAATATCTTAGAAAATACAGACTCTATGGAGACAGATGAAATCATT  1308
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  AAAATGTTATTGAAGATAACAAAAGTGAGAATATCTTAGAAAATACAGACTCTATGGAGACAGATGAAATCATT  1332

Query 1309  CCTATTTTGGAAAAGCTTGCACCTTCTGAGGATGAACTTACTTGCTTTTCTAAAACATCTCTCCTTCCAATCGA  1382
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333  CCTATTTTGGAAAAGCTTGCACCTTCTGAGGATGAACTTACTTGCTTTTCTAAAACATCTCTCCTTCCAATCGA  1406

Query 1383  TGAGACAAATCCAGATTTGGAAGAGAAAATGGAAAGTTCTTTTGGTTCACCATCTAAACAAGAAAGTAGTGAGA  1456
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407  TGAGACAAATCCAGATTTGGAAGAGAAAATGGAAAGTTCTTTTGGTTCACCATCTAAACAAGAAAGTAGTGAGA  1480

Query 1457  GTTTGCCAAAAGAAGCCTTTCTGGTCCTCTCTGATGAAGAGGATATTTCGGGTGAAAAAGATGAGTCTGAAGTT  1530
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481  GTTTGCCAAAAGAAGCCTTTCTGGTCCTCTCTGATGAAGAGGATATTTCGGGTGAAAAAGATGAGTCTGAAGTT  1554

Query 1531  ATATCGCAAAATGAAACGTGCTCTC---CAGAAGTAGAAAGTAATGAAAAGGACAACAGACCTGAGGAAGAAGA  1601
            |||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||
Sbjct 1555  ATATCGCAAAATGAAACGTGCTCTCCAGCAGAAGTAGAAAGTAATGAAAAGGACAACAAACCTGAGGAAGAAGA  1628

Query 1602  GCAAGTAATACATGAAGATGATGAAAGACCTTCTGAGAAAAATGAATTTTCTAGACGAAAACGTTCTAAATCAG  1675
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629  GCAAGTAATACATGAAGATGATGAAAGACCTTCTGAGAAAAATGAATTTTCTAGACGAAAACGTTCTAAATCAG  1702

Query 1676  AAGACATGGACAATGTACAGTCTAAACGTCGTCGATATATGGAAGAAGAATATGAGGCAGAATTTCAAGTAAAG  1749
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1703  AAGACATGGACAATGTACAGTCTAAACGTCGTCGATATATGGAAGAAGAATATGAGGCAGAATTTCAAGTAAAG  1776

Query 1750  ATTACAGCCAAAGGAGACATTAACCAGAAACTTCAAAAGGTTATACAGTGGTTGCTGGAAGAAAAATTGTGTGC  1823
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1777  ATTACAGCCAAAGGAGACATTAACCAGAAACTTCAAAAGGTTATACAGTGGTTGCTGGAAGAAAAATTGTGTGC  1850

Query 1824  GCTGCAGTGTGCTGTATTTGATAAGACTTTGGCAGAATTGAAAACACGAGTGGAAAAGATTGAATGTAACAAGA  1897
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1851  GCTGCAGTGTGCTGTATTTGATAAGACTTTGGCAGAATTGAAAACACGAGTGGAAAAGATTGAATGTAACAAGA  1924

Query 1898  GGCATAAAACAGTTCTCACTGAACTACAGGCCAAGATAGCCAGGTTAACCAAACGCTTTGAAGCAGCCAAAGAA  1971
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1925  GGCATAAAACAGTTCTCACTGAACTACAGGCCAAGATAGCCAGGTTAACCAAACGCTTTGAAGCAGCCAAAGAA  1998

Query 1972  GATCTTAAGAAAAGACATGAACATCCACCCAACCCACCAGTATCACCAGGAAAAACTGTAAATGATGTCAACAG  2045
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1999  GATCTTAAGAAAAGACATGAACATCCACCCAACCCACCAGTATCACCAGGAAAAACTGTAAATGATGTCAACAG  2072

Query 2046  CAATAATAACATGTCTTACAGAAATGCAGGCACAGTGAGACAGATGCTGGAGTCCAAAAGAAATGTAAGCGAGA  2119
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2073  CAATAATAACATGTCTTACAGAAATGCAGGCACAGTGAGACAGATGCTGGAGTCCAAAAGAAATGTAAGCGAGA  2146

Query 2120  GTGCACCACCATCCTTTCAAACTCCTGTGAATACAGTATCTTCAACCAATCTTGTCACTCCTCCAGCAGTTGTC  2193
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2147  GTGCACCACCATCCTTTCAAACTCCTGTGAATACAGTATCTTCAACCAATCTTGTCACTCCTCCAGCAGTTGTC  2220

Query 2194  AGTAGTCAACCTAAATTGCAGACTCCAGTGACTTCGGGTTCCCTCACAGCAACGTCAGTTCTTCCTGCACCCAA  2267
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2221  AGTAGTCAACCTAAATTGCAGACTCCAGTGACTTCGGGTTCCCTCACAGCAACGTCAGTTCTTCCTGCACCCAA  2294

Query 2268  TACAGCTACTGTAGTTGCTACTACTCAGGTGCCTAGTGGAAATCCCCAGCCTACAATCTCTTTACAGCCTTTGC  2341
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2295  TACAGCTACTGTAGTTGCTACTACTCAGGTGCCTAGTGGAAATCCCCAGCCTACAATCTCTTTACAGCCTTTGC  2368

Query 2342  CAGTGATTTTGCATGTACCTGTTGCAGTATCCTCCCAGCCTCAGCTTCTACAGAGCCATCCAGGGACTTTGGTG  2415
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2369  CAGTGATTTTGCATGTACCTGTTGCAGTATCCTCCCAGCCTCAGCTTCTACAGAGCCATCCAGGGACTTTGGTG  2442

Query 2416  ACTAATCAACCATCTGGCAATGTTGAATTCATTTCTGTGCAAAGCCCACCTACAGTGAGTGGTCTTACCAAAAA  2489
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2443  ACTAATCAACCATCTGGCAATGTTGAATTCATTTCTGTGCAAAGCCCACCTACAGTGAGTGGTCTTACCAAAAA  2516

Query 2490  TCCAGTATCCTTGCCATCCTTGCCAAATCCCACTAAACCAAACAACGTTCCTTCTGTGCCCAGTCCTAGTATTC  2563
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2517  TCCAGTATCCTTGCCATCCTTGCCAAATCCCACTAAACCAAACAACGTTCCTTCTGTGCCCAGTCCTAGTATTC  2590

Query 2564  AAAGGAACCCTACTGCCAGTGCTGCACCATTGGGAACAACACTTGCTGTGCAGGCTGTTCCAACAGCACACTCT  2637
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2591  AAAGGAACCCTACTGCCAGTGCTGCACCATTGGGAACAACACTTGCTGTGCAGGCTGTTCCAACAGCACACTCT  2664

Query 2638  ATTGTACAAGCCACAAGGACTTCTTTACCCACAGTGGGCCCATCAGGACTCTATAGTCCATCAACTAATCGAGG  2711
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2665  ATTGTACAAGCCACAAGGACTTCTTTACCCACAGTGGGCCCATCAGGACTCTATAGTCCATCAACTAATCGAGG  2738

Query 2712  TCCTATACAGATGAAAATTCCAATTTCTGCATTTAGTACTTCGTCTGCTGCAGAACAGAACAGCAATACCACCC  2785
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2739  TCCTATACAGATGAAAATTCCAATTTCTGCATTTAGTACTTCGTCTGCTGCAGAACAGAACAGCAATACCACCC  2812

Query 2786  CAAGAATTGAAAACCAGACAAACAAAACAATAGATGCTTCTGTCAGTAAGAAAGCAGCTGATAGCACATCACAG  2859
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2813  CAAGAATTGAAAACCAGACAAACAAAACAATAGATGCTTCTGTCAGTAAGAAAGCAGCTGATAGCACATCACAG  2886

Query 2860  TGTGGAAAAGCCACTGGCAGTGATTCAAGTGGTGTCATTGATCTCACAATGGATGATGAAGAGAGTGGAGCTTC  2933
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2887  TGTGGAAAAGCCACTGGCAGTGATTCAAGTGGTGTCATTGATCTCACAATGGATGATGAAGAGAGTGGAGCTTC  2960

Query 2934  ACAAGACCCCAAAAAACTAAATCACACTCCTGTATCAACCATGAGTTCTTCTCAGCCTGTGTCACGACCATTGC  3007
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2961  ACAAGACCCCAAAAAACTAAATCACACTCCTGTATCAACCATGAGTTCTTCTCAGCCTGTGTCACGACCATTGC  3034

Query 3008  AACCCATACAACCAGCACCGCCTCTTCAACCATCTGGGGTGCCAACAAGTGGACCATCTCAGACCACCATACAC  3081
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3035  AACCCATACAACCAGCACCGCCTCTTCAACCATCTGGGGTGCCAACAAGTGGACCATCTCAGACCACCATACAC  3108

Query 3082  TTACTACCTACAGCTCCAACTACCGTGAATGTAACACATCGTCCAGTAACTCAGGTGACCACAAGACTCCCTGT  3155
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3109  TTACTACCTACAGCTCCAACTACCGTGAATGTAACACATCGTCCAGTAACTCAGGTGACCACAAGACTCCCTGT  3182

Query 3156  ACCAAGAGCTCCTGCAAACCACCAGGTGGTTTATACAACTCTTCCTGCACCACCAGCTCAGGCTCCCTTGCGAG  3229
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3183  ACCAAGAGCTCCTGCAAACCACCAGGTGGTTTATACAACTCTTCCTGCACCACCAGCTCAGGCTCCCTTGCGAG  3256

Query 3230  GAACTGTTATGCAGGCTCCTGCTGTTCGGCAGGTCAATCCCCAAAATA--GTAAGAGATT--------------  3287
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||.|.|| ||              
Sbjct 3257  GAACTGTTATGCAGGCTCCTGCTGTTCGGCAGGTCAATCCCCAAAATAGTGTTACAG-TTCGAGTGCCTCAAAC  3329

Query 3288  -------TTTCTTGTA---TATGG-----CCCCAAGAT--ACATG-----------------------------  3315
                   |.|.|||||   .||||     |||...|||  |||.|                             
Sbjct 3330  AACCACATATGTTGTAAACAATGGACTAACCCTGGGATCAACAGGACCTCAGCTCACAGTGCATCACCGACCAC  3403

Query 3316  --------------------------------------------------------------------------  3315
                                                                                      
Sbjct 3404  CACAAGTGCATACTGAGCCCCCACGCCCCGTGCACCCAGCACCCTTACCAGAAGCTCCACAACCACAGCGTCTG  3477

Query 3316  --------------------------------------------------------------------------  3315
                                                                                      
Sbjct 3478  CCCCCAGAAGCTGCCAGCACATCTCTGCCTCAGAAGCCACACTTGAAGTTAGCACGCGTTCAGAGTCAAAATGG  3551

Query 3316  --------------------------------------------------------------------------  3315
                                                                                      
Sbjct 3552  CATAGTACTGTCATGGAGTGTCCTGGAGGTGGATCGAAGCTGTGCCACTGTTGATAGCTACCATCTCTATGCTT  3625

Query 3316  --------------------------------------------------------------------------  3315
                                                                                      
Sbjct 3626  ACCATGAGGAACCCAGTGCCACTGTGCCCTCACAATGGAAAAAGATTGGGGAAGTCAAGGCACTTCCCTTGCCC  3699

Query 3316  --------------------------------------------------------------------------  3315
                                                                                      
Sbjct 3700  ATGGCATGTACTCTCACCCAGTTTGTATCTGGTAGCAAATACTACTTTGCAGTACGAGCCAAGGATATTTATGG  3773

Query 3316  -------------------------------------------------------------  3315
                                                                         
Sbjct 3774  ACGTTTTGGGCCTTTCTGTGATCCTCAGTCAACAGATGTGATCTCTTCTACCCAGAGCAGT  3834