Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000477516
• Subject: XM_005253424.4
• Aligned Length: 3832
• Identities: 3304
• Gaps: 518

Alignment

Query    1  ------------------------ATGGACAGTTTAGAAGAACCTCAGAAAAAAGTCTTTAAGGCTCGAAAAAC  50
                                    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGCATCAGGACCAGAGATTCAGAATGGACAGTTTAGAAGAACCTCAGAAAAAAGTCTTTAAGGCTCGAAAAAC  74

Query   51  GATGAGAGTGAGTGATCGTCAGCAACTTGAAGCAGTGTACAAGGTCAAAGAAGAACTGTTGAAAACTGATGTCA  124
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  GATGAGAGTGAGTGATCGTCAGCAACTTGAAGCAGTGTACAAGGTCAAAGAAGAACTGTTGAAAACTGATGTCA  148

Query  125  AGCTGTTAAATGGCAACCATGAAAATGGAGATTTGGACCCAACCTCACCTTTGGAAAACATGGATTACATTAAA  198
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  AGCTGTTAAATGGCAACCATGAAAATGGAGATTTGGACCCAACCTCACCTTTGGAAAACATGGATTACATTAAA  222

Query  199  GACAAGGAAGAGGTGAATGGCATTGAAGAGATTTGTTTTGATCCTGAAGGAAGTAAAGCAGAATGGAAGGAAAC  272
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  GACAAGGAAGAGGTGAATGGCATTGAAGAGATTTGTTTTGATCCTGAAGGAAGTAAAGCAGAATGGAAGGAAAC  296

Query  273  ACCCTGTATCCTAAGTGTTAATGTAAAAAACAAGCAGGATGATGATTTAAATTGTGAACCTTTGTCTCCCCATA  346
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  ACCCTGTATCCTAAGTGTTAATGTAAAAAACAAGCAGGATGATGATTTAAATTGTGAACCTTTGTCTCCCCATA  370

Query  347  ATATAACTCCAGAACCAGTCTCTAAACTGCCTGCTGAACCAGTTTCTGGTGATCCAGCCCCTGGTGATCTGGAT  420
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  ATATAACTCCAGAACCAGTCTCTAAACTGCCTGCTGAACCAGTTTCTGGTGATCCAGCCCCTGGTGATCTGGAT  444

Query  421  GCCGGAGATCCAGCCTCCGGAGTACTGGCCTCTGGTGATTCCACCTCTGGTGATCCCACCTCTAGCGAGCCCTC  494
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  GCCGGAGATCCAGCCTCCGGAGTACTGGCCTCTGGTGATTCCACCTCTGGTGATCCCACCTCTAGCGAGCCCTC  518

Query  495  CTCTAGTGATGCTGCCTCTGGTGATGCAACCTCTGGTGATGCCCCTTCTGGTGATGTGTCCCCTGGTGATGCCA  568
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  CTCTAGTGATGCTGCCTCTGGTGATGCAACCTCTGGTGATGCCCCTTCTGGTGATGTGTCCCCTGGTGATGCCA  592

Query  569  CCTCTGGTGATGCCACTGCTGATGATCTCTCCTCTGGTGATCCCACCTCTAGTGATCCCATCCCAGGTGAACCG  642
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  CCTCTGGTGATGCCACTGCTGATGATCTCTCCTCTGGTGATCCCACCTCTAGTGATCCCATCCCAGGTGAACCG  666

Query  643  GTCCCTGTTGAACCCATTTCTGGTGATTGTGCCGCTGATGATATAGCCTCTAGTGAAATAACTTCTGTTGATCT  716
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  GTCCCTGTTGAACCCATTTCTGGTGATTGTGCCGCTGATGATATAGCCTCTAGTGAAATAACTTCTGTTGATCT  740

Query  717  GGCTTCTGGAGCACCAGCTTCCACTGATCCAGCCTCTGATGATCTGGCCTCTGGTGATCTATCCTCTAGTGAAC  790
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  GGCTTCTGGAGCACCAGCTTCCACTGATCCAGCCTCTGATGATCTGGCCTCTGGTGATCTATCCTCTAGTGAAC  814

Query  791  TGGCCTCTGATGATCTGGCCACTGGTGAACTGGCCTCTGATGAGCTGACTTCTGAATCAACCTTTGATCGTACC  864
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  TGGCCTCTGATGATCTGGCCACTGGTGAACTGGCCTCTGATGAGCTGACTTCTGAATCAACCTTTGATCGTACC  888

Query  865  TTTGAACCAAAGTCTGTACCAGTTTGTGAACCAGTTCCTGAAATTGACAATATAGAACCAAGTAGCAATAAAGA  938
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  TTTGAACCAAAGTCTGTACCAGTTTGTGAACCAGTTCCTGAAATTGACAATATAGAACCAAGTAGCAATAAAGA  962

Query  939  TGATGATTTTCTTGAAAAAAATGGAGCTGATGAAAAATTAGAGCAAATTCAGAGTAAAGACTCATTGGATGAGA  1012
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  TGATGATTTTCTTGAAAAAAATGGAGCTGATGAAAAATTAGAGCAAATTCAGAGTAAAGACTCATTGGATGAGA  1036

Query 1013  AAAATAAAGCTGATAATAATATTGATGCTAATGAAGAAACTCTAGAAACAGATGATACAACTATTTGTTCAGAT  1086
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  AAAATAAAGCTGATAATAATATTGATGCTAATGAAGAAACTCTAGAAACAGATGATACAACTATTTGTTCAGAT  1110

Query 1087  CGACCTCCTGAAAATGAAAAGAAGGTAGAGGAAGATATTATCACAGAGCTTGCTCTTGGAGAAGATGCTATATC  1160
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  CGACCTCCTGAAAATGAAAAGAAGGTAGAGGAAGATATTATCACAGAGCTTGCTCTTGGAGAAGATGCTATATC  1184

Query 1161  TAGCAGTATGGAAATTGACCAAGGTGAAAAGAATGAAGATGAAACTTCTGCAGATCTTGTAGAAACGATTAATG  1234
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  TAGCAGTATGGAAATTGACCAAGGTGAAAAGAATGAAGATGAAACTTCTGCAGATCTTGTAGAAACGATTAATG  1258

Query 1235  AAAATGTTATTGAAGATAACAAAAGTGAGAATATCTTAGAAAATACAGACTCTATGGAGACAGATGAAATCATT  1308
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  AAAATGTTATTGAAGATAACAAAAGTGAGAATATCTTAGAAAATACAGACTCTATGGAGACAGATGAAATCATT  1332

Query 1309  CCTATTTTGGAAAAGCTTGCACCTTCTGAGGATGAACTTACTTGCTTTTCTAAAACATCTCTCCTTCCAATCGA  1382
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333  CCTATTTTGGAAAAGCTTGCACCTTCTGAGGATGAACTTACTTGCTTTTCTAAAACATCTCTCCTTCCAATCGA  1406

Query 1383  TGAGACAAATCCAGATTTGGAAGAGAAAATGGAAAGTTCTTTTGGTTCACCATCTAAACAAGAAAGTAGTGAGA  1456
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407  TGAGACAAATCCAGATTTGGAAGAGAAAATGGAAAGTTCTTTTGGTTCACCATCTAAACAAGAAAGTAGTGAGA  1480

Query 1457  GTTTGCCAAAAGAAGCCTTTCTGGTCCTCTCTGATGAAGAGGATATTTCGGGTGAAAAAGATGAGTCTGAAGTT  1530
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481  GTTTGCCAAAAGAAGCCTTTCTGGTCCTCTCTGATGAAGAGGATATTTCGGGTGAAAAAGATGAGTCTGAAGTT  1554

Query 1531  ATATCGCAAAATGAAACGTGCTCTCCAGAAGTAGAAAGTAATGAAAAGGACAACAGACCTGAGGAAGAAGAGCA  1604
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||
Sbjct 1555  ATATCGCAAAATGAAACGTGCTCTCCAGAAGTAGAAAGTAATGAAAAGGACAACAAACCTGAGGAAGAAGAGCA  1628

Query 1605  AGTAATACATGAAGATGATGAAAGACCTTCTGAGAAAAATGAATTTTCTAGACGAAAACGTTCTAAATCAGAAG  1678
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629  AGTAATACATGAAGATGATGAAAGACCTTCTGAGAAAAATGAATTTTCTAGACGAAAACGTTCTAAATCAGAAG  1702

Query 1679  ACATGGACAATGTACAGTCTAAACGTCGTCGATATATGGAAGAAGAATATGAGGCAGAATTTCAAGTAAAGATT  1752
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1703  ACATGGACAATGTACAGTCTAAACGTCGTCGATATATGGAAGAAGAATATGAGGCAGAATTTCAAGTAAAGATT  1776

Query 1753  ACAGCCAAAGGAGACATTAACCAGAAACTTCAAAAGGTTATACAGTGGTTGCTGGAAGAAAAATTGTGTGCGCT  1826
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1777  ACAGCCAAAGGAGACATTAACCAGAAACTTCAAAAGGTTATACAGTGGTTGCTGGAAGAAAAATTGTGTGCGCT  1850

Query 1827  GCAGTGTGCTGTATTTGATAAGACTTTGGCAGAATTGAAAACACGAGTGGAAAAGATTGAATGTAACAAGAGGC  1900
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1851  GCAGTGTGCTGTATTTGATAAGACTTTGGCAGAATTGAAAACACGAGTGGAAAAGATTGAATGTAACAAGAGGC  1924

Query 1901  ATAAAACAGTTCTCACTGAACTACAGGCCAAGATAGCCAGGTTAACCAAACGCTTTGAAGCAGCCAAAGAAGAT  1974
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1925  ATAAAACAGTTCTCACTGAACTACAGGCCAAGATAGCCAGGTTAACCAAACGCTTTGAAGCAGCCAAAGAAGAT  1998

Query 1975  CTTAAGAAAAGACATGAACATCCACCCAACCCACCAGTATCACCAGGAAAAACTGTAAATGATGTCAACAGCAA  2048
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1999  CTTAAGAAAAGACATGAACATCCACCCAACCCACCAGTATCACCAGGAAAAACTGTAAATGATGTCAACAGCAA  2072

Query 2049  TAATAACATGTCTTACAGAAATGCAGGCACAGTGAGACAGATGCTGGAGTCCAAAAGAAATGTAAGCGAGAGTG  2122
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2073  TAATAACATGTCTTACAGAAATGCAGGCACAGTGAGACAGATGCTGGAGTCCAAAAGAAATGTAAGCGAGAGTG  2146

Query 2123  CACCACCATCCTTTCAAACTCCTGTGAATACAGTATCTTCAACCAATCTTGTCACTCCTCCAGCAGTTGTCAGT  2196
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2147  CACCACCATCCTTTCAAACTCCTGTGAATACAGTATCTTCAACCAATCTTGTCACTCCTCCAGCAGTTGTCAGT  2220

Query 2197  AGTCAACCTAAATTGCAGACTCCAGTGACTTCGGGTTCCCTCACAGCAACGTCAGTTCTTCCTGCACCCAATAC  2270
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2221  AGTCAACCTAAATTGCAGACTCCAGTGACTTCGGGTTCCCTCACAGCAACGTCAGTTCTTCCTGCACCCAATAC  2294

Query 2271  AGCTACTGTAGTTGCTACTACTCAGGTGCCTAGTGGAAATCCCCAGCCTACAATCTCTTTACAGCCTTTGCCAG  2344
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2295  AGCTACTGTAGTTGCTACTACTCAGGTGCCTAGTGGAAATCCCCAGCCTACAATCTCTTTACAGCCTTTGCCAG  2368

Query 2345  TGATTTTGCATGTACCTGTTGCAGTATCCTCCCAGCCTCAGCTTCTACAGAGCCATCCAGGGACTTTGGTGACT  2418
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2369  TGATTTTGCATGTACCTGTTGCAGTATCCTCCCAGCCTCAGCTTCTACAGAGCCATCCAGGGACTTTGGTGACT  2442

Query 2419  AATCAACCATCTGGCAATGTTGAATTCATTTCTGTGCAAAGCCCACCTACAGTGAGTGGTCTTACCAAAAATCC  2492
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2443  AATCAACCATCTGGCAATGTTGAATTCATTTCTGTGCAAAGCCCACCTACAGTGAGTGGTCTTACCAAAAATCC  2516

Query 2493  AGTATCCTTGCCATCCTTGCCAAATCCCACTAAACCAAACAACGTTCCTTCTGTGCCCAGTCCTAGTATTCAAA  2566
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2517  AGTATCCTTGCCATCCTTGCCAAATCCCACTAAACCAAACAACGTTCCTTCTGTGCCCAGTCCTAGTATTCAAA  2590

Query 2567  GGAACCCTACTGCCAGTGCTGCACCATTGGGAACAACACTTGCTGTGCAGGCTGTTCCAACAGCACACTCTATT  2640
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2591  GGAACCCTACTGCCAGTGCTGCACCATTGGGAACAACACTTGCTGTGCAGGCTGTTCCAACAGCACACTCTATT  2664

Query 2641  GTACAAGCCACAAGGACTTCTTTACCCACAGTGGGCCCATCAGGACTCTATAGTCCATCAACTAATCGAGGTCC  2714
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2665  GTACAAGCCACAAGGACTTCTTTACCCACAGTGGGCCCATCAGGACTCTATAGTCCATCAACTAATCGAGGTCC  2738

Query 2715  TATACAGATGAAAATTCCAATTTCTGCATTTAGTACTTCGTCTGCTGCAGAACAGAACAGCAATACCACCCCAA  2788
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2739  TATACAGATGAAAATTCCAATTTCTGCATTTAGTACTTCGTCTGCTGCAGAACAGAACAGCAATACCACCCCAA  2812

Query 2789  GAATTGAAAACCAGACAAACAAAACAATAGATGCTTCTGTCAGTAAGAAAGCAGCTGATAGCACATCACAGTGT  2862
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2813  GAATTGAAAACCAGACAAACAAAACAATAGATGCTTCTGTCAGTAAGAAAGCAGCTGATAGCACATCACAGTGT  2886

Query 2863  GGAAAAGCCACTGGCAGTGATTCAAGTGGTGTCATTGATCTCACAATGGATGATGAAGAGAGTGGAGCTTCACA  2936
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2887  GGAAAAGCCACTGGCAGTGATTCAAGTGGTGTCATTGATCTCACAATGGATGATGAAGAGAGTGGAGCTTCACA  2960

Query 2937  AGACCCCAAAAAACTAAATCACACTCCTGTATCAACCATGAGTTCTTCTCAGCCTGTGTCACGACCATTGCAAC  3010
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2961  AGACCCCAAAAAACTAAATCACACTCCTGTATCAACCATGAGTTCTTCTCAGCCTGTGTCACGACCATTGCAAC  3034

Query 3011  CCATACAACCAGCACCGCCTCTTCAACCATCTGGGGTGCCAACAAGTGGACCATCTCAGACCACCATACACTTA  3084
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3035  CCATACAACCAGCACCGCCTCTTCAACCATCTGGGGTGCCAACAAGTGGACCATCTCAGACCACCATACACTTA  3108

Query 3085  CTACCTACAGCTCCAACTACCGTGAATGTAACACATCGTCCAGTAACTCAGGTGACCACAAGACTCCCTGTACC  3158
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3109  CTACCTACAGCTCCAACTACCGTGAATGTAACACATCGTCCAGTAACTCAGGTGACCACAAGACTCCCTGTACC  3182

Query 3159  AAGAGCTCCTGCAAACCACCAGGTGGTTTATACAACTCTTCCTGCACCACCAGCTCAGGCTCCCTTGCGAGGAA  3232
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3183  AAGAGCTCCTGCAAACCACCAGGTGGTTTATACAACTCTTCCTGCACCACCAGCTCAGGCTCCCTTGCGAGGAA  3256

Query 3233  CTGTTATGCAGGCTCCTGCTGTTCGGCAGGTCAATCCCCAAAATA--GTAAGAGATT-----------------  3287
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||.|.|| ||                 
Sbjct 3257  CTGTTATGCAGGCTCCTGCTGTTCGGCAGGTCAATCCCCAAAATAGTGTTACAG-TTCGAGTGCCTCAAACAAC  3329

Query 3288  ----TTTCTTGTA---TATGG-----CCCCAAGAT--ACATG--------------------------------  3315
                |.|.|||||   .||||     |||...|||  |||.|                                
Sbjct 3330  CACATATGTTGTAAACAATGGACTAACCCTGGGATCAACAGGACCTCAGCTCACAGTGCATCACCGACCACCAC  3403

Query 3316  --------------------------------------------------------------------------  3315
                                                                                      
Sbjct 3404  AAGTGCATACTGAGCCCCCACGCCCCGTGCACCCAGCACCCTTACCAGAAGCTCCACAACCACAGCGTCTGCCC  3477

Query 3316  --------------------------------------------------------------------------  3315
                                                                                      
Sbjct 3478  CCAGAAGCTGCCAGCACATCTCTGCCTCAGAAGCCACACTTGAAGTTAGCACGCGTTCAGAGTCAAAATGGCAT  3551

Query 3316  --------------------------------------------------------------------------  3315
                                                                                      
Sbjct 3552  AGTACTGTCATGGAGTGTCCTGGAGGTGGATCGAAGCTGTGCCACTGTTGATAGCTACCATCTCTATGCTTACC  3625

Query 3316  --------------------------------------------------------------------------  3315
                                                                                      
Sbjct 3626  ATGAGGAACCCAGTGCCACTGTGCCCTCACAATGGAAAAAGATTGGGGAAGTCAAGGCACTTCCCTTGCCCATG  3699

Query 3316  --------------------------------------------------------------------------  3315
                                                                                      
Sbjct 3700  GCATGTACTCTCACCCAGTTTGTATCTGGTAGCAAATACTACTTTGCAGTACGAGCCAAGGATATTTATGGACG  3773

Query 3316  ----------------------------------------------------------  3315
                                                                      
Sbjct 3774  TTTTGGGCCTTTCTGTGATCCTCAGTCAACAGATGTGATCTCTTCTACCCAGAGCAGT  3831