Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000477527
• Subject: XM_017021732.1
• Aligned Length: 1074
• Identities: 826
• Gaps: 237

Alignment

Query    1  ATGATGGAGAAGTATGAAAAAATTGGGAAAATTGGAGAAGGATCCTATGGAGTTGTTTTCAAATGTAGAAACAG  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGATGGAGAAGTATGAAAAAATTGGGAAAATTGGAGAAGGATCCTATGGAGTTGTTTTCAAATGTAGAAACAG  74

Query   75  GGACACGGGTCAGATTGTGGCCATCAAGAAGTTTCTGGAATCAGAAGATGACCCTGTCATAAAGAAAATTGCCC  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  GGACACGGGTCAGATTGTGGCCATCAAGAAGTTTCTGGAATCAGAAGATGACCCTGTCATAAAGAAAATTGCCC  148

Query  149  TTCGGGAAATCCGAATGCTCAAGCAACTCAAGCATCCCAACCTTGTTAACCTCCTGGAAGTCTTCAGGAGGAAA  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  TTCGGGAAATCCGAATGCTCAAGCAACTCAAGCATCCCAACCTTGTTAACCTCCTGGAAGTCTTCAGGAGGAAA  222

Query  223  CGGAGGCTTCACCTGGTGTTTGAATATTGTGACCACACAGTTCTCCATGAGTTGGACAGATACCAAAGAGGGGT  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  CGGAGGCTTCACCTGGTGTTTGAATATTGTGACCACACAGTTCTCCATGAGTTGGACAGATACCAAAGAGGGGT  296

Query  297  ACCAGAACATCTCGTGAAGAGCATAACTTGGCAGACACTGCAAGCTGTAAATTTTTGCCATAAACACAATTGCA  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  ACCAGAACATCTCGTGAAGAGCATAACTTGGCAGACACTGCAAGCTGTAAATTTTTGCCATAAACACAATTGCA  370

Query  371  TACATAGAGACGTGAAGCCAGAAAATATCCTCATCACGAAACATTCCGTGATTAAGCTTTGTGACTTTGGATTT  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  TACATAGAGACGTGAAGCCAGAAAATATCCTCATCACGAAACATTCCGTGATTAAGCTTTGTGACTTTGGATTT  444

Query  445  GCTCGGCTTTTGACTGGACCGAGTGACTACTATACAGACTACGTGGCTACCAGGTGGTACCGCTCCCCTGAGCT  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  GCTCGGCTTTTGACTGGACCGAGTGACTACTATACAGACTACGTGGCTACCAGGTGGTACCGCTCCCCTGAGCT  518

Query  519  GCTGGTGGGGGACACGCAGTACGGCCCCCCGGTGGATGTTTGGGCAATTGGCTGTGTCTTTGCTGAGCTGCTGT  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  GCTGGTGGGGGACACGCAGTACGGCCCCCCGGTGGATGTTTGGGCAATTGGCTGTGTCTTTGCTGAGCTGCTGT  592

Query  593  CAGGAGTGCCTCTGTGGCCAGGAAAATCGGATGTGGATCAGCTGTATCTGATTAGGAAGACCTTGGGGGATCTC  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  CAGGAGTGCCTCTGTGGCCAGGAAAATCGGATGTGGATCAGCTGTATCTGATTAGGAAGACCTTGGGGGATCTC  666

Query  667  ATTCCTAGGCACCAGCAAGTGTTTAGCACGAATCAGTACTTCAGTGGAGTGAAAATTCCAGACCCTGAAGATAT  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  ATTCCTAGGCACCAGCAAGTGTTTAGCACGAATCAGTACTTCAGTGGAGTGAAAATTCCAGACCCTGAAGATAT  740

Query  741  GGAACCACTTGAATTAAAATTCCCAAACATCTCTTATCCTGCCCTGGGGCTCCTAAAGGGCTGTCTCCACATGG  814
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     ||.||..|.|  
Sbjct  741  GGAACCACTTGAATTAAAATTCCCAAACATCTCTTATCCTGCCCTGGGGCTCCTAAA-----GTTTCATCTT--  807

Query  815  ACCCTACTCAAAGGCTGACATGTGAACAGCTGTTGCATCACCCATATTTTGAAAACATCAGAGAAATAGAGGAT  888
                   |||||           |||.|                       ||||.||.|.|..|||| ||.  
Sbjct  808  -------TCAAA-----------GAAGA-----------------------AAAAAATGACATTAATA-AGT--  837

Query  889  TTGGCAAAAGAACACAACAAACCAACAAGGAAGACCCTAAGAAAGAGCCGAAAGCACCACTGCTTTACAGAAAC  962
                                                                                      
Sbjct  838  --------------------------------------------------------------------------  837

Query  963  ATCCAAGTTGCAGTACCTACCCCAGCTAACTGGCAGCAGCATCCTTCCAGCTTTGGATAATAAGAAGTACTACT  1036
                                                                                      
Sbjct  838  --------------------------------------------------------------------------  837

Query 1037  GTGATACCAAGAAACTTAACTACCGTTTTCCAAACATT  1074
                                                  
Sbjct  838  --------------------------------------  837