Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000477540
• Subject: NM_001301047.3
• Aligned Length: 813
• Identities: 705
• Gaps: 108

Alignment

Query   1  ATGCGGTCCCGGGTTCTGTGGGGCGCTGCCCGGTGGCTCTGGCCCCGCCGGGCCGTTGGCCCAGCCCGCCGGCC  74
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   1  ATGCGGTCCCGGGTTCTGTGGGGCGCTGCCCGGTGGCTCTGGCCCCGCCGGGCCGTTGGCCCAGCCCGCCGGCC  74

Query  75  CCTGAGCTCCGGTAGCCCGCCGCTGGAGGAGCTGTTCACCCGGGGCGGGCCCTTGCGGACCTTCCTCGAGCGCC  148
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  75  CCTGAGCTCCGGTAGCCCGCCGCTGGAGGAGCTGTTCACCCGGGGCGGGCCCTTGCGGACCTTCCTCGAGCGCC  148

Query 149  AGGCGGGGTCTGAAGCCCATTTGAAGGTCAGGAGGCCCGAGTTGCTGGCGGTGATCAAACTGCTGAACGAGAAG  222
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 149  AGGCGGGGTCTGAAGCCCATTTGAAGGTCAGGAGGCCCGAGTTGCTGGCGGTGATCAAACTGCTGAACGAGAAG  222

Query 223  GAGCGGGAGCTGCGGGAGACTGAGCACTTGCTGCACGATGAGAATGAAGATTTAAGGAAACTTGCAGAGAATGA  296
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223  GAGCGGGAGCTGCGGGAGACTGAGCACTTGCTGCACGATGAGAATGAAGATTTAAGGAAACTTGCAGAGAATGA  296

Query 297  AATCACTTTGTGTCAAAAAGAAATAACTCAGCTGAAGCATCAGATTATCTTACTTTTGGTTCCCTCAGAAGAAA  370
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 297  AATCACTTTGTGTCAAAAAGAAATAACTCAGCTGAAGCATCAGATTATCTTACTTTTGGTTCCCTCAGAAGAAA  370

Query 371  CAGATGAAAATGATTTGATCCTGGAAGTAACTGCAGGAGTTGGAGGTCAGGAGGCAATGTTGTTTACATCAGAG  444
           |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||                               
Sbjct 371  CAGATGAAAATGATTTGATCCTGGAAGTAACTGCAGGAGTTGG-------------------------------  413

Query 445  ATATTTGATATGTATCAGCAATATGCTGCATTTAAAAGATGGCATTTTGAAACCCTGGAATATTTTCCAAGTGA  518
                                                                                     
Sbjct 414  --------------------------------------------------------------------------  413

Query 519  ACTAGGTGGCCTTAGACATGCATCTGCCAGCATTGGGGGTTCAGAAGCCTATAGGCACATGAAATTTGAAGGAG  592
              |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 414  ---AGGTGGCCTTAGACATGCATCTGCCAGCATTGGGGGTTCAGAAGCCTATAGGCACATGAAATTTGAAGGAG  484

Query 593  GTGTTCACAGAGTACAAAGAGTGCCAAAGACAGAAAAGCAAGGCCGCGTCCATACTAGCACCATGACTGTAGCA  666
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 485  GTGTTCACAGAGTACAAAGAGTGCCAAAGACAGAAAAGCAAGGCCGCGTCCATACTAGCACCATGACTGTAGCA  558

Query 667  ATATTACCCCAGCCTACTGAGATTAATCTGGTGATTAATCCGAAAGATTTGAGAATTGACACTAAGCGAGCCAG  740
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 559  ATATTACCCCAGCCTACTGAGATTAATCTGGTGATTAATCCGAAAGATTTGAGAATTGACACTAAGCGAGCCAG  632

Query 741  TGGAGCTGGGGGGCAGCATGTAAATACCACGGACAGTGCTGTCCGGATAGTTCATCTTCCAACAGATTGGAAG  813
           |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 633  TGGAGCTGGGGGGCAGCATGTAAATACCACGGACAGTGCTGTCCGGATAGTTCATCTTCCAACAGATTGGAAG  705