Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- TRCN0000477592
- Subject:
- NM_001164610.1
- Aligned Length:
- 2495
- Identities:
- 1800
- Gaps:
- 403
Alignment
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 1 ATGGCGTTCCCTCACCTACAACAGCCTAGTTTCCTTCTGGCTAGCCTGAAAGCTGACTCTATAAATAAGCCCTT 74
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 75 TGCACAACGTTGCCAAGATTTGGTGAAAGTCATTGAGGATTTTCCAGCCAAGGAATTGCATGCCGTCTTCCCAT 148
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 149 GGCTGGTGGAAAGCATCTTTGGCAGCCTGGATGGTGTCCTTGTTGGTTGGAATCTCCGATGCCTACAGGGACGT 222
Query 1 ------------------------------------------------------ATGATGAAGTTGGTTTATAA 20
||||||||||||||||||||
Sbjct 223 GTGAACCCTGTGGAGTACAGCACAGCGATGGAATTTCTAGACCCAAGTGGTCCAATGATGAAGTTGGTTTATAA 296
Query 21 GCTTCAAGCTGAAGACTATAAGTTCGACTTTCCTGTCTCCT-ACTTGCCTGGTCCTGTGAAGGCGTCCATCCAG 93
.||||||||||||||||||||.||.||.||||||||||||| .||| |||||.|||||||||||.|||||.||.
Sbjct 297 ACTTCAAGCTGAAGACTATAACTTTGATTTTCCTGTCTCCTGTCTT-CCTGGCCCTGTGAAGGCATCCATTCAA 369
Query 94 GAG--TGCATCCTCCCTGACAGTCCTCTGTACCACAACAAGGTCCAGTTCACCCCTACTGGGGGCCTTGGTCTG 165
||| || |||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||..||||.||.||.||||||||.|||
Sbjct 370 GAGAATG--TCCTCCCTGACAGTCCTCTGTACCACAACAAAGTCCAGTTTCCCCCGACCGGAGGCCTTGGCCTG 441
Query 166 AACTTGGCCCTGAATCCGTTCGAGTATTACATATTCTTCTTTGCCTTGAGCCTCATCACTCAGAAGCCACTTCC 239
|||.|||||||.|||||.||.||.||.||.||.||||.||||||.||||||||||||.||||.||||||.|..|
Sbjct 442 AACCTGGCCCTCAATCCATTTGAATACTATATGTTCTACTTTGCTTTGAGCCTCATCTCTCAAAAGCCAATGTC 515
Query 240 TGTGTCCCTCCACGTCCGTACTTCAGACTGTGCCTATTTCATCCTGGTGGACAGGTACCTGTCATGGTTCCTGC 313
|.||.|||||||.|||||||||||.||||||||||||||||.|||||||||.||||||||.|||||||||||.|
Sbjct 516 TATGACCCTCCATGTCCGTACTTCGGACTGTGCCTATTTCACCCTGGTGGATAGGTACCTATCATGGTTCCTAC 589
Query 314 CCACCGAAGGCAGTGTGCCCCCACCACTCTCCTCCAGCCCAGGGGGGACCAGCCCCTCACCACCTCCCAGGACA 387
||||.||||||||.||.||.||||||||||.||||||.|||||.||..||||||||||||||.|||||||.|||
Sbjct 590 CCACTGAAGGCAGCGTACCTCCACCACTCTGCTCCAGTCCAGGAGGCTCCAGCCCCTCACCAGCTCCCAGAACA 663
Query 388 CCAGCCATACCCTTTGCTTCCTATGGCCTCCACCACACTAGCCTCCTAAAGCGACACATCTCTCATCAGACATC 461
||||||||.||||||||.||||||||||| |||||||||||||.|.||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 664 CCAGCCATGCCCTTTGCCTCCTATGGCCT---CCACACTAGCCTCTTGAAGCGACACATCTCTCATCAGACATC 734
Query 462 TGTGAATGCAGACCCCGCCTCCCACGAGATCTGGAGGTCAGAAACTCTGCTCCAGGTTTTTGTTGAAATGTGGC 535
|||||||||||||||.||.|||||.|||||||||.|||||||||||||.||||||||||||||.||||||||||
Sbjct 735 TGTGAATGCAGACCCTGCATCCCATGAGATCTGGCGGTCAGAAACTCTCCTCCAGGTTTTTGTGGAAATGTGGC 808
Query 536 TTCATCACTATTCCTTGGAGATGTATCAAAAAATGCAGTCCCCTCATGCCAAGCTGGAGGTTCTGCACTACCGA 609
|||||||.||.|||.||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 809 TTCATCATTACTCCCTGGAGATGTACCAAAAAATGCAGTCCCCTCATGCCAAG--------------------- 861
Query 610 CTCAGTGTCTCCAGCGCCCTCTACAGCCCCGCCCAACCCAGCCTCCAGGCCCTCCACGCCTACCAAGAGTCGTT 683
|||||.||
Sbjct 862 ------------------------------------------------------------------GAGTCCTT 869
Query 684 CACGCCTACTGAGGAGCATGTGTTGGTGGTGCGCCTGCTGCTGAAGCACCTGCACGCCTTTGCCAACAGCCTGA 757
||||||||||||.|||||.|||.|||||||.|||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||
Sbjct 870 CACGCCTACTGAAGAGCACGTGCTGGTGGTACGCCTGCTGCTGAAGCACCTGCATGCCTTTGCCAACAGCCTGA 943
Query 758 AGCCAGAGCAGGCCTCACCCTCCGCCCACTCCCACGCCACCAGCCCCCTGGAGGAGTTCAAACGGGCTGCTGTC 831
|||||||.|||||.||.||.||.||.||||||||.||||||||.||.||||||||.|||||||||||.||.||.
Sbjct 944 AGCCAGATCAGGCTTCGCCATCTGCACACTCCCATGCCACCAGTCCGCTGGAGGAATTCAAACGGGCCGCAGTG 1017
Query 832 CCGAGGTTCGTCCAGCAGAAACTCTACCTCTTCTTGCAGCATTGCTTTGGCCACTGGCCCCTGGACGCATCGTT 905
||..|.||.|||||||||||.||.|||.|||||.|||||||.||.||||||||||||||.|||||.|||.|.||
Sbjct 1018 CCTCGCTTTGTCCAGCAGAAGCTGTACGTCTTCCTGCAGCACTGTTTTGGCCACTGGCCTCTGGATGCAACCTT 1091
Query 906 CAGAGCTGTCCTGGAGATGTGGCTGAGCTACCTGCAGCCGTGGCGGTACGCGCCTGACAAGCAGGCTCCGGGCA 979
||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||.|||.||||.||.|||||.||.|||||||.|||||
Sbjct 1092 CAGAGCTGTCTTGGAGATGTGGCTGAGCTACCTGCAGCCATGGAGGTATGCCCCTGAGAAACAGGCTCAGGGCA 1165
Query 980 GCGACTCCCAGCCCCGGTGTGTGTCGGAGAAATGGGCACCCTTTGTCCAGGAGAACCTGCTGATGTACACCAAG 1053
||||..|||||||.|||||||||||.|||||.|||||||||||..|||||||.|||||||||||||||||||||
Sbjct 1166 GCGATCCCCAGCCACGGTGTGTGTCAGAGAAGTGGGCACCCTTCATCCAGGAAAACCTGCTGATGTACACCAAG 1239
Query 1054 TTGTTTGTGGGCTTTCTGAACCGCGCGCTCCGCACAGACCTGGTCAGCCCCAAGCACGCGCTCATGGTGTTCCG 1127
.||||||||.|||||||||||||.||.||.|||||||||||.||||||||||||.|.||.||||||||.|||||
Sbjct 1240 CTGTTTGTGAGCTTTCTGAACCGTGCCCTACGCACAGACCTTGTCAGCCCCAAGAATGCACTCATGGTCTTCCG 1313
Query 1128 AGTGGCCAAAGTCTTTGCCCAGCCCAACCTGGCTGAGATGATTCAGAAAGGTGAGCAGCTATTCCTGGAGCCAG 1201
||||||.||.||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.|||||||||||.|
Sbjct 1314 AGTGGCTAAGGTCTTTGCCCAGCCCAACCTGGCTGAGATGATCCAGAAAGGTGAGCAGCTGTTCCTGGAGCCGG 1387
Query 1202 AGCTGGTCATCCCCCACCGCCAGCACCGACTCTTCACGGCCCCCACATTCACTGGGAGCTTCCTGTCACCCTGG 1275
||||..||||||||||||||||.|||||.||||||||.|.|.|||| .||||||||||||||.|||
Sbjct 1388 AGCTCATCATCCCCCACCGCCAACACCGGCTCTTCACAGTCACCAC---------CAGCTTCCTGTCACCATGG 1452
Query 1276 CCACCAGCGGTCACTGATGCCTCCTTCAAGGTGAAGAGCCACGTCTACAGCCTGGAGGGCCAGGACTGCAAGTA 1349
||.||.|..||.||.||||||||||||||||||||||||||.|||||.|||||.||||||||.||||||||.||
Sbjct 1453 CCCCCTGTTGTGACAGATGCCTCCTTCAAGGTGAAGAGCCATGTCTATAGCCTAGAGGGCCAAGACTGCAAATA 1526
Query 1350 CACCCCGATGTTTGGGCCCGAGGCCCGCACCCTGGTCCTGCGCCTCGCTCAGCTCATCACACAGGCCAAACACA 1423
.|||||.||||||||.||.||...|||.|||||||||.|||||||.|||||||||||||||||||||||.||.|
Sbjct 1527 TACCCCAATGTTTGGTCCTGAAATCCGAACCCTGGTCTTGCGCCTTGCTCAGCTCATCACACAGGCCAAGCAGA 1600
Query 1424 CAGCCAAGTCCATCTCCGACCAGTGTGCGGAGAGCCCGGCTGGCCACTCCTTCCTCTCATGGCTGGGCTTTAGC 1497
|.||||||||||||||.||.||||.||.|||.|||||..||||||.|||||||||.|||||||||..||||.||
Sbjct 1601 CTGCCAAGTCCATCTCTGATCAGTATGTGGAAAGCCCAACTGGCCGCTCCTTCCTGTCATGGCTGACCTTTGGC 1674
Query 1498 TCCATGGACACCAATGGCTCCTACACAGCCAACGACCTGGACGAGATGGGGCAAGACAGTGTCCGGAAGACAGA 1571
..||..|||||.|||.|||.||||.|||||||.||||||||.||.||.||.||.|||||..||||.||||||||
Sbjct 1675 CTCACAGACACAAATAGCTGCTACCCAGCCAATGACCTGGATGAAATAGGTCAGGACAGCATCCGCAAGACAGA 1748
Query 1572 TGAATACCTGGAGAAGGCCCTGGAGTACCTGCGCCAGATATTCCGGCTCAGCGAAGCGCAGCTCAGG--CAGTT 1643
.||.|||.|.||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||| || |||.|
Sbjct 1749 CGAGTACTTAGAAAAGGCCCTGGAGTACCTGCGCCAGATATTCCGGCTCAGCGAAGCCCAGCT--GGCCCAGCT 1820
Query 1644 CACACTCGCCTTGGGCACCACCCAGGATGAGAATGGAAAAAAGCAACTCCCCGACTGCATCGTGGGTGAGGACG 1717
|||.||.|||.||||.|...|.|.|||.||||||||.||..||||.|||||.||.|||||.|||||.||.||.|
Sbjct 1821 CACGCTTGCCCTGGGGAGTGCTCGGGACGAGAATGGGAAGCAGCAGCTCCCAGATTGCATTGTGGGGGAAGAAG 1894
Query 1718 GACTCATCCTTACGCCCCTGGGGCGGTACCAGATCATCAATGGGCTGCGAAGGTTTGAAATTGAGTACCAGGGG 1791
|||||||||||||.|||.||||.||.|||||||||||.|||||.|||||||||||.||.||||||||||||||.
Sbjct 1895 GACTCATCCTTACACCCTTGGGCCGCTACCAGATCATTAATGGTCTGCGAAGGTTCGAGATTGAGTACCAGGGA 1968
Query 1792 GACCCGGAGCTGCAGCCCATCCGGAGCTATGAGATCGCCAGCTTGGTCCGCACACTCTTTAGGCTGTCGTCTGC 1865
|||...|||||||||||||||||||||||.||.|||.||||..|||||||..|||||||..|||||||.|||||
Sbjct 1969 GACTTAGAGCTGCAGCCCATCCGGAGCTACGAAATCACCAGTCTGGTCCGTGCACTCTTCCGGCTGTCCTCTGC 2042
Query 1866 CATCAACCACAGATTTGCAGGACAGATGGCGGCTCTGTGTTCCCGGGATGACTTCCTCGGCAGCTTCTGTCGCT 1939
||||||||..|||||||||||.||||||||.||||||||.||||||.||||||||||.||||||||||||||||
Sbjct 2043 CATCAACCGTAGATTTGCAGGCCAGATGGCAGCTCTGTGCTCCCGGAATGACTTCCTTGGCAGCTTCTGTCGCT 2116
Query 1940 ACCACCTCACAGAACCTGGGCTGGCCAGCAGGCACCTGCTGAGCCCTGTGGGGCGGAGGCAGGTGGCCGGCCAC 2013
||||||||||.||.||||...||..||.|||.||.||||||||||||||.|||||||||||||| |
Sbjct 2117 ACCACCTCACTGAGCCTGCCTTGAGCAACAGACATCTGCTGAGCCCTGTAGGGCGGAGGCAGGT---------C 2181
Query 2014 ACC---------CGCGGCCCCAGGCTCAGCCTGCGCTTCCTGGGCAGTTACCGGACGCTGGTCTCGCTGCTGCT 2078
||| ||.|||||||||||||||||.||.||||||||||||||||||||.|||.||..|||.|||.|
Sbjct 2182 ACCAATCCTGCACGGGGCCCCAGGCTCAGCCTCCGTTTCCTGGGCAGTTACCGGACACTGCTCCTGCTCCTGAT 2255
Query 2079 GGCCTTCTTCGTGGCCTCTCTGTTCTGCGTCGGGCCCCTCCCATGCACGCTGCTGCTCACCCTGGGCTATGTCC 2152
|||||||||.|||||.||||||||||||.|.||||||||..|.|||.|..||||.||...|||.||.||.||||
Sbjct 2256 GGCCTTCTTTGTGGCTTCTCTGTTCTGCATTGGGCCCCTGTCCTGCTCCTTGCTCCTGGTCCTAGGATACGTCC 2329
Query 2153 TCTACGCCTCTGCCATGACACTGCTGACCGAGCGGGGGAAGCTGCACCAGCCC 2205
||||.|||...||.|||||||||||.||.||.|||||||||||||||||||.|
Sbjct 2330 TCTATGCCATAGCTATGACACTGCTCACTGAACGGGGGAAGCTGCACCAGCTC 2382