Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000477615
• Subject: NR_103518.2
• Aligned Length: 2809
• Identities: 1870
• Gaps: 935

Alignment

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct    1  CTCAGCCTGGGCGGCACAGCCAGATGCGAGATGCGTCTCTGCTGATCTGAGTCTGCCTGCAGCATGGACCTGGG  74

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct   75  TCTTCCCTGAAGCATCTCCAGGGCTGGAGGGACGACTGCCATGCACCGAGGGCTCATCCATCCACAGAGCAGGG  148

Query    1  -----------------ATGACCCCCATCCTCACGGTCCTGATCTGTCTCGGGCTGAGTCTGGGCCCCCGGACC  57
                             |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  CAGTGGGAGGAGACGCCATGACCCCCATCCTCACGGTCCTGATCTGTCTCGGGCTGAGTCTGGGCCCCCGGACC  222

Query   58  CACGTGCAGGCAGGGCACCTCCCCAAGCCCACCCTCTGGGCTGAACCAGGCTCTGTGATCACCCAGGGGAGTCC  131
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  CACGTGCAGGCAGGGCACCTCCCCAAGCCCACCCTCTGGGCTGAACCAGGCTCTGTGATCACCCAGGGGAGTCC  296

Query  132  TGTGACCCTCAGGTGTCAGGGGGGCCAGGAGACCCAGGAGTACCGTCTATATAGAGAAAAGAAAACAGCACCCT  205
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  TGTGACCCTCAGGTGTCAGGGGGGCCAGGAGACCCAGGAGTACCGTCTATATAGAGAAAAGAAAACAGCACCCT  370

Query  206  GGATTACACGGATCCCACAGGAGCTTGTGAAGAAGGGCCAGTTCCCCATCCCATCCATCACCTGGGAACATGCA  279
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||..||
Sbjct  371  GGATTACACGGATCCCACAGGAGCTTGTGAAGAAGGGCCAGTTCCCCATCCCATCCATCACCTGGGAACACACA  444

Query  280  GGGCGGTATCGCTGTTACTATGGTAGCGACACTGCAGGCCGCTCAGAGAGCAGTGACCCCCTGGAGCTGGTGGT  353
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  GGGCGGTATCGCTGTTACTATGGTAGCGACACTGCAGGCCGCTCAGAGAGCAGTGACCCCCTGGAGCTGGTGGT  518

Query  354  GACAGGAGCCTACATCAAACCCACCCTCTCAGCCCAGCCCAGCCCCGTGGTGAACTCAGGAGGGAATGTAACCC  427
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  GACAGGAGCCTACATCAAACCCACCCTCTCAGCCCAGCCCAGCCCCGTGGTGAACTCAGGAGGGAATGTAACCC  592

Query  428  TCCAGTGTGACTCACAGGTGGCATTTGATGGCTTCATTCTGTGTAAGGAAGGAGAAGATGAACACCCACAATGC  501
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  TCCAGTGTGACTCACAGGTGGCATTTGATGGCTTCATTCTGTGTAAGGAAGGAGAAGATGAACACCCACAATGC  666

Query  502  CTGAACTCCCAGCCCCATGCCCGTGGGTCGTCCCGCGCCATCTTCTCCGTGGGCCCCGTGAGCCCGAGTCGCAG  575
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  CTGAACTCCCAGCCCCATGCCCGTGGGTCGTCCCGCGCCATCTTCTCCGTGGGCCCCGTGAGCCCGAGTCGCAG  740

Query  576  GTGGTGGTACAGGTGCTATGCTTATGACTCGAACTCTCCCTATGAGTGGTCTCTACCCAGTGATCTCCTGGAGC  649
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  GTGGTGGTACAGGTGCTATGCTTATGACTCGAACTCTCCCTATGAGTGGTCTCTACCCAGTGATCTCCTGGAGC  814

Query  650  TCCTGGTCCTAGGTGTTTCTAAGAAGCCATCACTCTCAGTGCAGCCAGGTCCTATCGTGGCCCCTGAGGAGACC  723
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  TCCTGGTCCTAGGTGTTTCTAAGAAGCCATCACTCTCAGTGCAGCCAGGTCCTATCGTGGCCCCTGAGGAGACC  888

Query  724  CTGACTCTGCAGTGTGGCTCTGATGCTGGCTACAACAGATTTGTTCTGTATAAGGACGGGGAACGTGACTTCCT  797
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  CTGACTCTGCAGTGTGGCTCTGATGCTGGCTACAACAGATTTGTTCTGTATAAGGACGGGGAACGTGACTTCCT  962

Query  798  TCAGCTCGCTGGCGCACAGCCCCAGGCTGGGCTCTCCCAGGCCAACTTCACCCTGGGCCCTGTGAGCCGCTCCT  871
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  TCAGCTCGCTGGCGCACAGCCCCAGGCTGGGCTCTCCCAGGCCAACTTCACCCTGGGCCCTGTGAGCCGCTCCT  1036

Query  872  ACGGGGGCCAGTACAGATGCTACGGTGCACACAACCTCTCCTCCGAGTGGTCGGCCCCCAGCGACCCCCTGGAC  945
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  ACGGGGGCCAGTACAGATGCTACGGTGCACACAACCTCTCCTCCGAGTGGTCGGCCCCCAGCGACCCCCTGGAC  1110

Query  946  ATCCTGATCGCAGGACAGTTCTATGACAGAGTCTCCCTCTCGGTGCAGCCGGGCCCCACGGTGGCCTCAGGAGA  1019
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  ATCCTGATCGCAGGACAGTTCTATGACAGAGTCTCCCTCTCGGTGCAGCCGGGCCCCACGGTGGCCTCAGGAGA  1184

Query 1020  GAACGTGACCCTGCTGTGTCAGTCACAGGGATGGATGCAAACTTTCCTTCTGACCAAGGAGGGGGCAGCTGATG  1093
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  GAACGTGACCCTGCTGTGTCAGTCACAGGGATGGATGCAAACTTTCCTTCTGACCAAGGAGGGGGCAGCTGATG  1258

Query 1094  ACCCATGGCGTCTAAGATCAACGTACCAATCTCAAAAATACCAGGCTGAATTCCCCATGGGTCCTGTGACCTCA  1167
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  ACCCATGGCGTCTAAGATCAACGTACCAATCTCAAAAATACCAGGCTGAATTCCCCATGGGTCCTGTGACCTCA  1332

Query 1168  GCCCATGCGGGGACCTACAGGTGCTACGGCTCACAGAGCTCCAAACCCTACCTGCTGACTCACCCCAGTGACCC  1241
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333  GCCCATGCGGGGACCTACAGGTGCTACGGCTCACAGAGCTCCAAACCCTACCTGCTGACTCACCCCAGTGACCC  1406

Query 1242  CCTGGAGCTCGTGGTCTCAGGACCGTCTGGGGGCCCCAGCTCCCCGACAACAGGCCCCACCTCCACATCTGGCC  1315
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407  CCTGGAGCTCGTGGTCTCAGGACCGTCTGGGGGCCCCAGCTCCCCGACAACAGGCCCCACCTCCACATCTGGCC  1480

Query 1316  CTGAGGACCAGCCCCTCACCCCCACCGGGTCGGATCCCCAGAGTGGTCTGGGAAGGCACCTGGGGGTTGTGATC  1389
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481  CTGAGGACCAGCCCCTCACCCCCACCGGGTCGGATCCCCAGAGTGGTCTGGGAAGGCACCTGGGGGTTGTGATC  1554

Query 1390  GGCATCTTGGTGGCCGTCATCCTACTGCTCCTCCTCCTCCTCCTCCTCTTCCTCATCCTCCGACATCGACGTCA  1463
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555  GGCATCTTGGTGGCCGTCATCCTACTGCTCCTCCTCCTCCTCCTCCTCTTCCTCATCCTCCGACATCGACGTCA  1628

Query 1464  GGGCAAACACTGGACATCGACCCAGAGAAAGGCTGATTTCCAACATCCTGCAGGGGCTGTGGGGCCAGAGCCCA  1537
            ||||||||||||||||||||                                                      
Sbjct 1629  GGGCAAACACTGGACATCGA------------------------------------------------------  1648

Query 1538  CAGACAGAGGCCTGCAGTGGAGGTCCAGCCCAGCTGCCGATGCCCAGGAAGAAAACCTCTATGCTGCCGTGAAG  1611
                                  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1649  ----------------------GTCCAGCCCAGCTGCCGATGCCCAGGAAGAAAACCTCTATGCTGCCGTGAAG  1700

Query 1612  CACACACAGCCTGAGGATGGGGTGGAGATGGACACTCGGAGCCCACACGATGAAGACCCCCAGGCAGTGACGTA  1685
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1701  CACACACAGCCTGAGGATGGGGTGGAGATGGACACTCGGAGCCCACACGATGAAGACCCCCAGGCAGTGACGTA  1774

Query 1686  TGCCGAGGTGAAACACTCCAGACCTAGGAGAGAAATGGCCTCTCCTCCTTCCCCACTGTCTGGGGAATTCCTGG  1759
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1775  TGCCGAGGTGAAACACTCCAGACCTAGGAGAGAAATGGCCTCTCCTCCTTCCCCACTGTCTGGGGAATTCCTGG  1848

Query 1760  ACACAAAGGACAGACAGGCGGAAGAGGACAGGCAGATGGACACTGAGGCTGCTGCATCTGAAGCCCCCCAGGAT  1833
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1849  ACACAAAGGACAGACAGGCGGAAGAGGACAGGCAGATGGACACTGAGGCTGCTGCATCTGAAGCCCCCCAGGAT  1922

Query 1834  GTGACCTACGCCCAGCTGCACAGCTTGACCCTTAGACGGAAGGCAACTGAGCCTCCTCCATCCCAGGAAGGGCC  1907
            ||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1923  GTGACCTACGCCCAGCTGCACAGCTTGACCCTCAGACGGGAGGCAACTGAGCCTCCTCCATCCCAGGAAGGGCC  1996

Query 1908  CTCTCCAGCTGTGCCCAGCATCTACGCCACTCTGGCCATCCAC-------------------------------  1950
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||                               
Sbjct 1997  CTCTCCAGCTGTGCCCAGCATCTACGCCACTCTGGCCATCCACTAGCCCAGGGGGGGACGCAGACCCCACACTC  2070

Query 1951  --------------------------------------------------------------------------  1950
                                                                                      
Sbjct 2071  CATGGAGTCTGGAATGCATGGGAGCTGCCCCCCCAGTGGACACCATTGGACCCCACCCAGCCTGGATCTACCCC  2144

Query 1951  --------------------------------------------------------------------------  1950
                                                                                      
Sbjct 2145  AGGAGACTCTGGGAACTTTTAGGGGTCACTCAATTCTGCAGTATAAATAACTAATGTCTCTACAATTTTGAAAT  2218

Query 1951  --------------------------------------------------------------------------  1950
                                                                                      
Sbjct 2219  AAAGCAACAGACTTCTCAATAATCAATGAAGTAGCTGAGAAAACTAAGTCAGAAAGTGCATTAAACTGAATCAC  2292

Query 1951  --------------------------------------------------------------------------  1950
                                                                                      
Sbjct 2293  AATGTAAATATTACACATCAAGCGATGAAACTGGAAAACTACAAGCCACGAATGAATGAATTAGGAAAGAAAAA  2366

Query 1951  --------------------------------------------------------------------------  1950
                                                                                      
Sbjct 2367  AAGTAGGAAATGAATGATCTTGGCTTTCCTATAAGAAATTTAGGGCAGGGCACGGTGGCTCACGCCTGTAATTC  2440

Query 1951  --------------------------------------------------------------------------  1950
                                                                                      
Sbjct 2441  CAGCACTTTGGGAGGCCGAGGCGGGCAGATCACGAGTTCAGGAGATCGAGACCATCTTGGCCAACATGGTGAAA  2514

Query 1951  --------------------------------------------------------------------------  1950
                                                                                      
Sbjct 2515  CCCTGTCTCTCCTAAAAATACAAAAATTAGCTGGATGTGGTGGCAGTGCCTGTAATCCCAGCTATTTGGGAGGC  2588

Query 1951  --------------------------------------------------------------------------  1950
                                                                                      
Sbjct 2589  TGAGGCAGGAGAATCGCTTGAACCAGGGAGTCAGAGGTTTCAGTGAGCCAAGATCGCACCACTGCTCTCCAGCC  2662

Query 1951  -----------------------------------------------------------------------  1950
                                                                                   
Sbjct 2663  TGGCGACAGAGGGAGACTCCATCTCAAATTAAAAAAAAAAAAAAAAAAGAAAGAAAAAAAAAAAAAAAAAA  2733