Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- TRCN0000477615
- Subject:
- XM_017026186.1
- Aligned Length:
- 2007
- Identities:
- 1946
- Gaps:
- 57
Alignment
Query 1 ---------------------------------------------------ATGACCCCCATCCTCACGGTCCT 23
|||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ATGCACCGAGGGCTCATCCATCCACAGAGCAGGGCAGTGGGAGGAGACGCCATGACCCCCATCCTCACGGTCCT 74
Query 24 GATCTGTCTCGGGCTGAGTCTGGGCCCCCGGACCCACGTGCAGGCAGGGCACCTCCCCAAGCCCACCCTCTGGG 97
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 75 GATCTGTCTCGGGCTGAGTCTGGGCCCCCGGACCCACGTGCAGGCAGGGCACCTCCCCAAGCCCACCCTCTGGG 148
Query 98 CTGAACCAGGCTCTGTGATCACCCAGGGGAGTCCTGTGACCCTCAGGTGTCAGGGGGGCCAGGAGACCCAGGAG 171
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 149 CTGAACCAGGCTCTGTGATCACCCAGGGGAGTCCTGTGACCCTCAGGTGTCAGGGGGGCCAGGAGACCCAGGAG 222
Query 172 TACCGTCTATATAGAGAAAAGAAAACAGCACCCTGGATTACACGGATCCCACAGGAGCTTGTGAAGAAGGGCCA 245
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223 TACCGTCTATATAGAGAAAAGAAAACAGCACCCTGGATTACACGGATCCCACAGGAGCTTGTGAAGAAGGGCCA 296
Query 246 GTTCCCCATCCCATCCATCACCTGGGAACATGCAGGGCGGTATCGCTGTTACTATGGTAGCGACACTGCAGGCC 319
||||||||||||||||||||||||||||||..||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 297 GTTCCCCATCCCATCCATCACCTGGGAACACACAGGGCGGTATCGCTGTTACTATGGTAGCGACACTGCAGGCC 370
Query 320 GCTCAGAGAGCAGTGACCCCCTGGAGCTGGTGGTGACAGGAGCCTACATCAAACCCACCCTCTCAGCCCAGCCC 393
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 371 GCTCAGAGAGCAGTGACCCCCTGGAGCTGGTGGTGACAGGAGCCTACATCAAACCCACCCTCTCAGCCCAGCCC 444
Query 394 AGCCCCGTGGTGAACTCAGGAGGGAATGTAACCCTCCAGTGTGACTCACAGGTGGCATTTGATGGCTTCATTCT 467
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 445 AGCCCCGTGGTGAACTCAGGAGGGAATGTAACCCTCCAGTGTGACTCACAGGTGGCATTTGATGGCTTCATTCT 518
Query 468 GTGTAAGGAAGGAGAAGATGAACACCCACAATGCCTGAACTCCCAGCCCCATGCCCGTGGGTCGTCCCGCGCCA 541
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 519 GTGTAAGGAAGGAGAAGATGAACACCCACAATGCCTGAACTCCCAGCCCCATGCCCGTGGGTCGTCCCGCGCCA 592
Query 542 TCTTCTCCGTGGGCCCCGTGAGCCCGAGTCGCAGGTGGTGGTACAGGTGCTATGCTTATGACTCGAACTCTCCC 615
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 593 TCTTCTCCGTGGGCCCCGTGAGCCCGAGTCGCAGGTGGTGGTACAGGTGCTATGCTTATGACTCGAACTCTCCC 666
Query 616 TATGAGTGGTCTCTACCCAGTGATCTCCTGGAGCTCCTGGTCCTAGGTGTTTCTAAGAAGCCATCACTCTCAGT 689
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 667 TATGAGTGGTCTCTACCCAGTGATCTCCTGGAGCTCCTGGTCCTAGGTGTTTCTAAGAAGCCATCACTCTCAGT 740
Query 690 GCAGCCAGGTCCTATCGTGGCCCCTGAGGAGACCCTGACTCTGCAGTGTGGCTCTGATGCTGGCTACAACAGAT 763
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 741 GCAGCCAGGTCCTATCGTGGCCCCTGAGGAGACCCTGACTCTGCAGTGTGGCTCTGATGCTGGCTACAACAGAT 814
Query 764 TTGTTCTGTATAAGGACGGGGAACGTGACTTCCTTCAGCTCGCTGGCGCACAGCCCCAGGCTGGGCTCTCCCAG 837
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 815 TTGTTCTGTATAAGGACGGGGAACGTGACTTCCTTCAGCTCGCTGGCGCACAGCCCCAGGCTGGGCTCTCCCAG 888
Query 838 GCCAACTTCACCCTGGGCCCTGTGAGCCGCTCCTACGGGGGCCAGTACAGATGCTACGGTGCACACAACCTCTC 911
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 889 GCCAACTTCACCCTGGGCCCTGTGAGCCGCTCCTACGGGGGCCAGTACAGATGCTACGGTGCACACAACCTCTC 962
Query 912 CTCCGAGTGGTCGGCCCCCAGCGACCCCCTGGACATCCTGATCGCAGGACAGTTCTATGACAGAGTCTCCCTCT 985
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 963 CTCCGAGTGGTCGGCCCCCAGCGACCCCCTGGACATCCTGATCGCAGGACAGTTCTATGACAGAGTCTCCCTCT 1036
Query 986 CGGTGCAGCCGGGCCCCACGGTGGCCTCAGGAGAGAACGTGACCCTGCTGTGTCAGTCACAGGGATGGATGCAA 1059
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037 CGGTGCAGCCGGGCCCCACGGTGGCCTCAGGAGAGAACGTGACCCTGCTGTGTCAGTCACAGGGATGGATGCAA 1110
Query 1060 ACTTTCCTTCTGACCAAGGAGGGGGCAGCTGATGACCCATGGCGTCTAAGATCAACGTACCAATCTCAAAAATA 1133
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111 ACTTTCCTTCTGACCAAGGAGGGGGCAGCTGATGACCCATGGCGTCTAAGATCAACGTACCAATCTCAAAAATA 1184
Query 1134 CCAGGCTGAATTCCCCATGGGTCCTGTGACCTCAGCCCATGCGGGGACCTACAGGTGCTACGGCTCACAGAGCT 1207
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185 CCAGGCTGAATTCCCCATGGGTCCTGTGACCTCAGCCCATGCGGGGACCTACAGGTGCTACGGCTCACAGAGCT 1258
Query 1208 CCAAACCCTACCTGCTGACTCACCCCAGTGACCCCCTGGAGCTCGTGGTCTCAGGACCGTCTGGGGGCCCCAGC 1281
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259 CCAAACCCTACCTGCTGACTCACCCCAGTGACCCCCTGGAGCTCGTGGTCTCAGGACCGTCTGGGGGCCCCAGC 1332
Query 1282 TCCCCGACAACAGGCCCCACCTCCACATCT---GGCCCTGAGGACCAGCCCCTCACCCCCACCGGGTCGGATCC 1352
|||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333 TCCCCGACAACAGGCCCCACCTCCACATCTGCAGGCCCTGAGGACCAGCCCCTCACCCCCACCGGGTCGGATCC 1406
Query 1353 CCAGAGTGGTCTGGGAAGGCACCTGGGGGTTGTGATCGGCATCTTGGTGGCCGTCATCCTACTGCTCCTCCTCC 1426
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407 CCAGAGTGGTCTGGGAAGGCACCTGGGGGTTGTGATCGGCATCTTGGTGGCCGTCATCCTACTGCTCCTCCTCC 1480
Query 1427 TCCTCCTCCTCTTCCTCATCCTCCGACATCGACGTCAGGGCAAACACTGGACATCGACCCAGAGAAAGGCTGAT 1500
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481 TCCTCCTCCTCTTCCTCATCCTCCGACATCGACGTCAGGGCAAACACTGGACATCGACCCAGAGAAAGGCTGAT 1554
Query 1501 TTCCAACATCCTGCAGGGGCTGTGGGGCCAGAGCCCACAGACAGAGGCCTGCAGTGGAGGTCCAGCCCAGCTGC 1574
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555 TTCCAACATCCTGCAGGGGCTGTGGGGCCAGAGCCCACAGACAGAGGCCTGCAGTGGAGGTCCAGCCCAGCTGC 1628
Query 1575 CGATGCCCAGGAAGAAAACCTCTATGCTGCCGTGAAGCACACACAGCCTGAGGATGGGGTGGAGATGGACACTC 1648
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629 CGATGCCCAGGAAGAAAACCTCTATGCTGCCGTGAAGCACACACAGCCTGAGGATGGGGTGGAGATGGACACTC 1702
Query 1649 G---GAGCCCACACGATGAAGACCCCCAGGCAGTGACGTATGCCGAGGTGAAACACTCCAGACCTAGGAGAGAA 1719
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1703 GGCAGAGCCCACACGATGAAGACCCCCAGGCAGTGACGTATGCCGAGGTGAAACACTCCAGACCTAGGAGAGAA 1776
Query 1720 ATGGCCTCTCCTCCTTCCCCACTGTCTGGGGAATTCCTGGACACAAAGGACAGACAGGCGGAAGAGGACAGGCA 1793
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1777 ATGGCCTCTCCTCCTTCCCCACTGTCTGGGGAATTCCTGGACACAAAGGACAGACAGGCGGAAGAGGACAGGCA 1850
Query 1794 GATGGACACTGAGGCTGCTGCATCTGAAGCCCCCCAGGATGTGACCTACGCCCAGCTGCACAGCTTGACCCTTA 1867
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|
Sbjct 1851 GATGGACACTGAGGCTGCTGCATCTGAAGCCCCCCAGGATGTGACCTACGCCCAGCTGCACAGCTTGACCCTCA 1924
Query 1868 GACGGAAGGCAACTGAGCCTCCTCCATCCCAGGAAGGGCCCTCTCCAGCTGTGCCCAGCATCTACGCCACTCTG 1941
|||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1925 GACGGGAGGCAACTGAGCCTCCTCCATCCCAGGAAGGGCCCTCTCCAGCTGTGCCCAGCATCTACGCCACTCTG 1998
Query 1942 GCCATCCAC 1950
|||||||||
Sbjct 1999 GCCATCCAC 2007