Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- TRCN0000477615
- Subject:
- XR_935716.2
- Aligned Length:
- 2237
- Identities:
- 1323
- Gaps:
- 912
Alignment
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 1 TCTTCCCTATTTCCCTGCATTTCTCTTCTGTGCTCACTGCCACACGCAGCTCAGCCTGGGCGGCACAGCCAGAT 74
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 75 GCGAGATGCGTCTCTGCTGATCTGAGTCTGCCTGCAGCATGGACCTGGGTCTTCCCTGAAGCATCTCCAGGGCT 148
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 149 GGAGGGACGACTGCCATGATGACAGCACCCCATGAGAAGAAGGACCCAGCCTCCGATTGGCCACACTCTGTGTG 222
Query 1 -----------------------------------------------------------------ATGACCCCC 9
|||||||||
Sbjct 223 TCTCTCTATCCTGCCAGCACCGAGGGCTCATCCATCCACAGAGCAGGGCAGTGGGAGGAGACGCCATGACCCCC 296
Query 10 ATCCTCACGGTCCTGATCTGTCTCGGGCTGAGTCTGGGCCCCCGGACCCACGTGCAGGCAGGGCACCTCCCCAA 83
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 297 ATCCTCACGGTCCTGATCTGTCTCGGGCTGAGTCTGGGCCCCCGGACCCACGTGCAGGCAGGGCACCTCCCCAA 370
Query 84 GCCCACCCTCTGGGCTGAACCAGGCTCTGTGATCACCCAGGGGAGTCCTGTGACCCTCAGGTGTCAGGGGGGCC 157
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 371 GCCCACCCTCTGGGCTGAACCAGGCTCTGTGATCACCCAGGGGAGTCCTGTGACCCTCAGGTGTCAGGGGGGCC 444
Query 158 AGGAGACCCAGGAGTACCGTCTATATAGAGAAAAGAAAACAGCACCCTGGATTACACGGATCCCACAGGAGCTT 231
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 445 AGGAGACCCAGGAGTACCGTCTATATAGAGAAAAGAAAACAGCACCCTGGATTACACGGATCCCACAGGAGCTT 518
Query 232 GTGAAGAAGGGCCAGTTCCCCATCCCATCCATCACCTGGGAACATGCAGGGCGGTATCGCTGTTACTATGGTAG 305
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||..||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 519 GTGAAGAAGGGCCAGTTCCCCATCCCATCCATCACCTGGGAACACACAGGGCGGTATCGCTGTTACTATGGTAG 592
Query 306 CGACACTGCAGGCCGCTCAGAGAGCAGTGACCCCCTGGAGCTGGTGGTGACAGGAGCCTACATCAAACCCACCC 379
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 593 CGACACTGCAGGCCGCTCAGAGAGCAGTGACCCCCTGGAGCTGGTGGTGACAGGAGCCTACATCAAACCCACCC 666
Query 380 TCTCAGCCCAGCCCAGCCCCGTGGTGAACTCAGGAGGGAATGTAACCCTCCAGTGTGACTCACAGGTGGCATTT 453
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 667 TCTCAGCCCAGCCCAGCCCCGTGGTGAACTCAGGAGGGAATGTAACCCTCCAGTGTGACTCACAGGTGGCATTT 740
Query 454 GATGGCTTCATTCTGTGTAAGGAAGGAGAAGATGAACACCCACAATGCCTGAACTCCCAGCCCCATGCCCGTGG 527
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 741 GATGGCTTCATTCTGTGTAAGGAAGGAGAAGATGAACACCCACAATGCCTGAACTCCCAGCCCCATGCCCGTGG 814
Query 528 GTCGTCCCGCGCCATCTTCTCCGTGGGCCCCGTGAGCCCGAGTCGCAGGTGGTGGTACAGGTGCTATGCTTATG 601
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 815 GTCGTCCCGCGCCATCTTCTCCGTGGGCCCCGTGAGCCCGAGTCGCAGGTGGTGGTACAGGTGCTATGCTTATG 888
Query 602 ACTCGAACTCTCCCTATGAGTGGTCTCTACCCAGTGATCTCCTGGAGCTCCTGGTCCTAGGTGTTTCTAAGAAG 675
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 889 ACTCGAACTCTCCCTATGAGTGGTCTCTACCCAGTGATCTCCTGGAGCTCCTGGTCCTAGGTGTTTCTAAGAAG 962
Query 676 CCATCACTCTCAGTGCAGCCAGGTCCTATCGTGGCCCCTGAGGAGACCCTGACTCTGCAGTGTGGCTCTGATGC 749
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 963 CCATCACTCTCAGTGCAGCCAGGTCCTATCGTGGCCCCTGAGGAGACCCTGACTCTGCAGTGTGGCTCTGATGC 1036
Query 750 TGGCTACAACAGATTTGTTCTGTATAAGGACGGGGAACGTGACTTCCTTCAGCTCGCTGGCGCACAGCCCCAGG 823
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037 TGGCTACAACAGATTTGTTCTGTATAAGGACGGGGAACGTGACTTCCTTCAGCTCGCTGGCGCACAGCCCCAGG 1110
Query 824 CTGGGCTCTCCCAGGCCAACTTCACCCTGGGCCCTGTGAGCCGCTCCTACGGGGGCCAGTACAGATGCTACGGT 897
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111 CTGGGCTCTCCCAGGCCAACTTCACCCTGGGCCCTGTGAGCCGCTCCTACGGGGGCCAGTACAGATGCTACGGT 1184
Query 898 GCACACAACCTCTCCTCCGAGTGGTCGGCCCCCAGCGACCCCCTGGACATCCTGATCGCAGGACAGTTCTATGA 971
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185 GCACACAACCTCTCCTCCGAGTGGTCGGCCCCCAGCGACCCCCTGGACATCCTGATC----------------- 1241
Query 972 CAGAGTCTCCCTCTCGGTGCAGCCGGGCCCCACGGTGGCCTCAGGAGAGAACGTGACCCTGCTGTGTCAGTCAC 1045
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1242 ------------------GCAGCCGGGCCCCACGGTGGCCTCAGGAGAGAACGTGACCCTGCTGTGTCAGTCAC 1297
Query 1046 AGGGATGGATGCAAACTTTCCTTCTGACCAAGGAGGGGGCAGCTGATGACCCATGGCGTCTAAGATCAACGTAC 1119
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1298 AGGGATGGATGCAAACTTTCCTTCTGACCAAGGAGGGGGCAGCTGATGACCCATGGCGTCTAAGATCAACGTAC 1371
Query 1120 CAATCTCAAAAATACCAGGCTGAATTCCCCATGGGTCCTGTGACCTCAGCCCATGCGGGGACCTACAGGTGCTA 1193
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1372 CAATCTCAAAAATACCAGGCTGAATTCCCCATGGGTCCTGTGACCTCAGCCCATGCGGGGACCTACAGGTGCTA 1445
Query 1194 CGGCTCACAGAGCTCCAAACCCTACCTGCTGACTCACCCCAGTGACCCCCTGGAGCTCGTGGTCTCAGGACCGT 1267
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1446 CGGCTCACAGAGCTCCAAACCCTACCTGCTGACTCACCCCAGTGACCCCCTGGAGCTCGTGGTCTCAGGACCGT 1519
Query 1268 CTGGGGGCCCCAGCTCCCCGACAACAGGCCCCACCTCCACATCTGGCCCTGAGGACCAGCCCCTCACCCCCACC 1341
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1520 CTGGGGGCCCCAGCTCCCCGACAACAGGCCCCACCTCCACATCTGGCCCTGAGGACCAGCCCCTCACCCCCACC 1593
Query 1342 GGGTCGGATCCCCAGAGTGGTCTGGGAAGGCACCTGGGGGTTGTGATCGGCATCTTGGTGGCCGTCATCCTACT 1415
|||||||||||||||||||
Sbjct 1594 GGGTCGGATCCCCAGAGTG------------------------------------------------------- 1612
Query 1416 GCTCCTCCTCCTCCTCCTCCTCTTCCTCATCCTCCGACATCGACGTCAGGGCAAACACTGGACATCGACCCAGA 1489
Sbjct 1613 -------------------------------------------------------------------------- 1612
Query 1490 GAAAGGCTGATTTCCAACATCCTGCAGGGGCTGTGGGGCCAGAGCCCACAGACAGAGGCCTGCAGTGGAGGTCC 1563
Sbjct 1613 -------------------------------------------------------------------------- 1612
Query 1564 AGCCCAGCTGCCGATGCCCAGGAAGAAAACCTCTATGCTGCCGTGAAGCACACACAGCCTGAGGATGGGGTGGA 1637
Sbjct 1613 -------------------------------------------------------------------------- 1612
Query 1638 GATGGACACTCGGAGCCCACACGATGAAGACCCCCAGGCAGTGACGTATGCCGAGGTGAAACACTCCAGACCTA 1711
Sbjct 1613 -------------------------------------------------------------------------- 1612
Query 1712 GGAGAGAAATGGCCTCTCCTCCTTCCCCACTGTCTGGGGAATTCCTGGACACAAAGGACAGACAGGCGGAAGAG 1785
Sbjct 1613 -------------------------------------------------------------------------- 1612
Query 1786 GACAGGCAGATGGACACTGAGGCTGCTGCATCTGAAGCCCCCCAGGATGTGACCTACGCCCAGCTGCACAGCTT 1859
Sbjct 1613 -------------------------------------------------------------------------- 1612
Query 1860 GACCCTTAGACGGAAGGCAACTGAGCCTCCTCCATCCCAGGAAGGGCCCTCTCCAGCTGTGCCCAGCATCTACG 1933
Sbjct 1613 -------------------------------------------------------------------------- 1612
Query 1934 CCACTCTGGCCATCCAC 1950
Sbjct 1613 ----------------- 1612
