Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000477624
• Subject: XM_006717306.2
• Aligned Length: 2457
• Identities: 2160
• Gaps: 297

Alignment

Query    1  ATGGACATACAGCTGGACCCTGCCAGAGATGACCTGCCTCTCATGGCCAACACCAGCCACATACTTGTGAAGCA  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGGACATACAGCTGGACCCTGCCAGAGATGACCTGCCTCTCATGGCCAACACCAGCCACATACTTGTGAAGCA  74

Query   75  CTATGTACTGGATTTGGATGTGGATTTTGAAAGTCAAGTCATTGAGGGGACCATAGTGCTTTTCCTCGAGGATG  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  CTATGTACTGGATTTGGATGTGGATTTTGAAAGTCAAGTCATTGAGGGGACCATAGTGCTTTTCCTCGAGGATG  148

Query  149  GAAACAGATTCAAGAAACAGAATAGCTCTATTGAGGAAGCCTGCCAATCAGAATCAAACAAAGCCTGCAAATTT  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  GAAACAGATTCAAGAAACAGAATAGCTCTATTGAGGAAGCCTGCCAATCAGAATCAAACAAAGCCTGCAAATTT  222

Query  223  GGGATGCCTGAACCCTGCCATATTCCCGTGACAAATGCAAGGACCTTCTCATCTGAAATGGAATATAATGATTT  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  GGGATGCCTGAACCCTGCCATATTCCCGTGACAAATGCAAGGACCTTCTCATCTGAAATGGAATATAATGATTT  296

Query  297  TGCAATCTGTAGTAAAGGTGAAAAAGATACTTCTGATAAAGATGGTAACCATGACAACCAGGAACATGCTTCTG  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  TGCAATCTGTAGTAAAGGTGAAAAAGATACTTCTGATAAAGATGGTAACCATGACAACCAGGAACATGCTTCTG  370

Query  371  GGATTTCTAGCTCAAAGTACTGCTGTGACACAGGGAATCATGGGAGTGAGGATTTTTTGCTAGTGTTGGACTGC  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  GGATTTCTAGCTCAAAGTACTGCTGTGACACAGGGAATCATGGGAGTGAGGATTTTTTGCTAGTGTTGGACTGC  444

Query  445  TGTGATTTATCTGTGTTAAAAGTCGAGGAGGTGGATGTTGCTGCTGTGCCAGGTCTGGAAAAATTTACAAGGTC  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  TGTGATTTATCTGTGTTAAAAGTCGAGGAGGTGGATGTTGCTGCTGTGCCAGGTCTGGAAAAATTTACAAGGTC  518

Query  519  TCCTGAGCTCACGGTTGTTTCTGAGGAGTTCAGGAATCAGATTGTACGTGAACTTGTGACTTTGCCTGCAAATC  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  TCCTGAGCTCACGGTTGTTTCTGAGGAGTTCAGGAATCAGATTGTACGTGAACTTGTGACTTTGCCTGCAAATC  592

Query  593  GTTGGAGGGAGCAGTTAGACTATTACGCTCGCTGCAGCCAGGCTCCTGGCTGTGGGGAACTCCTCTTTGACACT  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  GTTGGAGGGAGCAGTTAGACTATTACGCTCGCTGCAGCCAGGCTCCTGGCTGTGGGGAACTCCTCTTTGACACT  666

Query  667  GACACTTGGAGCTTGCAGATAAGGAAGACAGGGGCTCAGACAGCTACTGACTTTCCTCATGCTATCAGGATATG  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  GACACTTGGAGCTTGCAGATAAGGAAGACAGGGGCTCAGACAGCTACTGACTTTCCTCATGCTATCAGGATATG  740

Query  741  GTACAAAACTAAACCTGAAGGGCGATCGGTTACATGGACCTCAGACCAGAGTGGCAGGCCATGTGTTTATACTG  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  GTACAAAACTAAACCTGAAGGGCGATCGGTTACATGGACCTCAGACCAGAGTGGCAGGCCATGTGTTTATACTG  814

Query  815  TGGGATCTCCCATAAACAACAGGGCCCTTTTTCCATGCCAGGAGCCACCCGTTGCCATGTCAACATGGCAGGCT  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  TGGGATCTCCCATAAACAACAGGGCCCTTTTTCCATGCCAGGAGCCACCCGTTGCCATGTCAACATGGCAGGCT  888

Query  889  ACAGTTCGAGCAGCTGCATCTTTTGTTGTTTTAATGAGTGGGGAAAATTCTGCCAAACCAACGCAGCTTTGGGA  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  ACAGTTCGAGCAGCTGCATCTTTTGTTGTTTTAATGAGTGGGGAAAATTCTGCCAAACCAACGCAGCTTTGGGA  962

Query  963  AGAGTGCTCAAGCTGGTATTACTATGTAACTATGCCAATGCCAGCCTCCACCTTCACAATTGCAGTGGGATGCT  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  AGAGTGCTCAAGCTGGTATTACTATGTAACTATGCCAATGCCAGCCTCCACCTTCACAATTGCAGTGGGATGCT  1036

Query 1037  GGACAGAAATGAAGATGGAGACATGGTCATCAAATGATTTGGCAACAGAGAGACCCTTCTCACCTTCTGAGGCC  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  GGACAGAAATGAAGATGGAGACATGGTCATCAAATGATTTGGCAACAGAGAGACCCTTCTCACCTTCTGAGGCC  1110

Query 1111  AACTTCAGGCATGTTGGTGTTTGCAGTCACATGGAATACCCCTGCCGCTTCCAGAATGCTTCTGCCACCACCCA  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  AACTTCAGGCATGTTGGTGTTTGCAGTCACATGGAATACCCCTGCCGCTTCCAGAATGCTTCTGCCACCACCCA  1184

Query 1185  GGAGATCATTCCTCATCGGGTCTTTGCCCCTGTGTGCCTCACGGGTGCCTGCCAAGAGACCCTTCTGCGGCTGA  1258
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  GGAGATCATTCCTCATCGGGTCTTTGCCCCTGTGTGCCTCACGGGTGCCTGCCAAGAGACCCTTCTGCGGCTGA  1258

Query 1259  TCCCTCCTTGCCTCTCAGCAGCACATTCTGTTCTGGGAGCACACCCGTTCTCTCGGCTGGATGTTCTCATCGTC  1332
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  TCCCTCCTTGCCTCTCAGCAGCACATTCTGTTCTGGGAGCACACCCGTTCTCTCGGCTGGATGTTCTCATCGTC  1332

Query 1333  CCTGCCAACTTTCCAAGTCTGGGGATGGCC--------------------------------------------  1362
            ||||||||||||||||||||||||||||||                                            
Sbjct 1333  CCTGCCAACTTTCCAAGTCTGGGGATGGCCAGCCCACACATCATGTTCCTCTCTCAGAGCATCTTGACAGGAGG  1406

Query 1363  --------------------------------------------------------------------------  1362
                                                                                      
Sbjct 1407  GAACCATCTCTGTGGGACCCGCCTCTGCCATGAAATTGCCCATGCCTGGTTTGGCCTAGCCATCGGGGCCCGAG  1480

Query 1363  --------------------------------------------------------------------------  1362
                                                                                      
Sbjct 1481  ACTGGACGGAGGAGTGGCTGAGTGAAGGCTTCGCCACTCACTTGGAGGATGTGTTTTGGGCCACAGCACAGCAG  1554

Query 1363  --------------------------------------------------------------------------  1362
                                                                                      
Sbjct 1555  CTGGCCCCCTATGAGGCCCGGGAGCAGCAGGAGCTGAGGGCTTGTCTGCGCTGGCGTCGCCTCCAGGACGAGAT  1628

Query 1363  -------------------------------AGACCCAGTAAAGACAAAACTGGCCACACAAGTGACTCGGGAG  1405
                                           |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629  GCAATGCTCCCCCGAGGAGATGCAGGTGTTAAGACCCAGTAAAGACAAAACTGGCCACACAAGTGACTCGGGAG  1702

Query 1406  CATCTGTTATCAAGCATGGACTTAATCCGGAGAAGATCTTCATGCAGGTGCATTATTTAAAGGGCTACTTCCTT  1479
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1703  CATCTGTTATCAAGCATGGACTTAATCCGGAGAAGATCTTCATGCAGGTGCATTATTTAAAGGGCTACTTCCTT  1776

Query 1480  CTTCGGTTTCTTGCCAAAAGACTTGGAGATGAAACCTATTTTTCATTTTTAAGAAAATTTGTGCACACATTTCA  1553
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1777  CTTCGGTTTCTTGCCAAAAGACTTGGAGATGAAACCTATTTTTCATTTTTAAGAAAATTTGTGCACACATTTCA  1850

Query 1554  TGGACAGCTGATTCTTTCCCAGGATTTCCTTCAAATGCTACTGGAGAACATTCCAGAAGAAAAAAGGCTTGAGC  1627
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1851  TGGACAGCTGATTCTTTCCCAGGATTTCCTTCAAATGCTACTGGAGAACATTCCAGAAGAAAAAAGGCTTGAGC  1924

Query 1628  TGTCTGTTGAAAACATCTACCAAGACTGGCTTGAGAGTTCCGGAATACCAAAGCCGCTGCAGAGGGAGCGTCGC  1701
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1925  TGTCTGTTGAAAACATCTACCAAGACTGGCTTGAGAGTTCCGGAATACCAAAGCCGCTGCAGAGGGAGCGTCGC  1998

Query 1702  GCCGGGGCGGAGTGCGGGCTTGCGCGGCAAGTGCGCGCCGAGGTCACGAAATGGATTGGAGTGAACCGGAGACC  1775
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1999  GCCGGGGCGGAGTGCGGGCTTGCGCGGCAAGTGCGCGCCGAGGTCACGAAATGGATTGGAGTGAACCGGAGACC  2072

Query 1776  CCGAAAACGGAAGCGCAGGGAGAAGGAAGAGGTGTTTGAAAAGCTTCTTCCAGACCAGCTGGTCTTGCTTCTGG  1849
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2073  CCGAAAACGGAAGCGCAGGGAGAAGGAAGAGGTGTTTGAAAAGCTTCTTCCAGACCAGCTGGTCTTGCTTCTGG  2146

Query 1850  AGCATCTCTTGGAGCAGAAGACTCTGAGCCCCCGAACTCTGCAAAGCCTCCAGAGGACATACCACCTCCAGGAT  1923
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2147  AGCATCTCTTGGAGCAGAAGACTCTGAGCCCCCGAACTCTGCAAAGCCTCCAGAGGACATACCACCTCCAGGAT  2220

Query 1924  CAGGATGCAGAGGTTCGCCATCGGTGGTGTGAACTCATTGTTAAGCACAAGTTCACGAAAGCCTACAAAAGTGT  1997
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2221  CAGGATGCAGAGGTTCGCCATCGGTGGTGTGAACTCATTGTTAAGCACAAGTTCACGAAAGCCTACAAAAGTGT  2294

Query 1998  GGAGAGGTTCCTTCAGGAGGATCAGGCCATGGGTGTGTACCTCTACGGGGAGCTGATGGTGAGTGAGGACGCCA  2071
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2295  GGAGAGGTTCCTTCAGGAGGATCAGGCCATGGGTGTGTACCTCTACGGGGAGCTGATGGTGAGTGAGGACGCCA  2368

Query 2072  GACAGCAGCAGCTCGCCCGTAGGTGCTTCGAGCGGACCAAGGAGCAGATGGATAGGTCCTCAGCCCAGGTGGTG  2145
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2369  GACAGCAGCAGCTCGCCCGTAGGTGCTTCGAGCGGACCAAGGAGCAGATGGATAGGTCCTCAGCCCAGGTGGTG  2442

Query 2146  GCCGAAATGTTATTT  2160
            |||||||||||||||
Sbjct 2443  GCCGAAATGTTATTT  2457