Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- TRCN0000477625
- Subject:
- XM_011533420.2
- Aligned Length:
- 2147
- Identities:
- 1419
- Gaps:
- 706
Alignment
Query 1 ATGGCAGCAGATGAAAGCTCACAGAACACTTTGCGGCTCCAGTTCAAGGCAATGCAGGAGATGCAGCACAAACG 74
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ATGGCAGCAGATGAAAGCTCACAGAACACTTTGCGGCTCCAGTTCAAGGCAATGCAGGAGATGCAGCACAAACG 74
Query 75 GTTACAGAAGCAGATGGAGAAAAAGAGGGAAAAAGAACTGAGCCTCAAAAGCAGAGCTGACGACCAAGAGGAGC 148
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 75 GTTACAGAAGCAGATGGAGAAAAAGAGGGAAAAAGAACTGAGCCTCAAAAGCAGAGCTGACGACCAAGAGGAGC 148
Query 149 CCTTGGAGGTTTCAGATGGCCTCAGCCTTCTCCACGCAGGGGAGCCAAACTCGAAAAATAGCTTTGAGAAGAGG 222
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 149 CCTTGGAGGTTTCAGATGGCCTCAGCCTTCTCCACGCAGGGGAGCCAAACTCGAAAAATAGCTTTGAGAAGAGG 222
Query 223 GTGCTTGAAGATGAGATTGAACACCTTCGAAATGAGCTCAGGGAAACGGTGGACGAGAACGGGCGATTGTATAA 296
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223 GTGCTTGAAGATGAGATTGAACACCTTCGAAATGAGCTCAGGGAAACGGTGGACGAGAACGGGCGATTGTATAA 296
Query 297 GCTGCTGAAGGAAAGGGACTTTGAAATCAAACACCTCAAAAAGAAAATAGAAGAGGACAGATTTGCCTTCACAG 370
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 297 GCTGCTGAAGGAAAGGGACTTTGAAATCAAACACCTCAAAAAGAAAATAGAAGAGGACAGATTTGCCTTCACAG 370
Query 371 GGACAGCCGGTGTAGCCGGAGACGTGGTCGCCACCAAAATTGTGGAGCTATCAAAAAAGAACCGGCTGTTGATG 444
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 371 GGACAGCCGGTGTAGCCGGAGACGTGGTCGCCACCAAAATTGTGGAGCTATCAAAAAAGAACCGGCTGTTGATG 444
Query 445 GCAGAATCAGAGGGTGCAAAAACCAGGGTGAAGCAGCTGACCAATCGCATCCAGGAGCTGGAGCGGGAACTGCA 518
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 445 GCAGAATCAGAGGGTGCAAAAACCAGGGTGAAGCAGCTGACCAATCGCATCCAGGAGCTGGAGCGGGAACTGCA 518
Query 519 GACAGCCCTGACCAGGCTGTCAGCCAAGGGGGCCACCGACGCAGGAGCCAAGCCACCGAGGGCCCAGATGGGAG 592
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 519 GACAGCCCTGACCAGGCTGTCAGCCAAGGGGGCCACCGACGCAGGAGCCAAGCCACCGAGGGCCCAGATGGGAG 592
Query 593 ACAGAGCATTGCTGGAGACCCCAGAGGTGAAGGCCCTGCAGGACAGGCTGGTGGCCACCAACTTGAAGATGAGT 666
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 593 ACAGAGCATTGCTGGAGACCCCAGAGGTGAAGGCCCTGCAGGACAGGCTGGTGGCCACCAACTTGAAGATGAGT 666
Query 667 GACCTCCGAAACCAGATCCAGTCTGTGAAGCAGGAGCTGCGGATGGCACAGAAGGTTTTGGCCAGAGAGGTTGG 740
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 667 GACCTCCGAAACCAGATCCAGTCTGTGAAGCAGGAGCTGCGGATGGCACAGAAGGTTTTGGCCAGAGAGGTTGG 740
Query 741 GGAAGACATCAACGTTCAGCAGCTCCTATCTTCGCCAGGGACCTGGAGGGGTCGGGCTCAACAAATTCTTGTTT 814
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 741 GGAAGACATCAACGTTCAGCAGCTCCTATCTTCGCCAGGGACCTGGAGGGGTCGGGCTCAACAAATTCTTGTTT 814
Query 815 TGCAGAGCAAGGTTCAAGAGCTTGAGAAGCAATTGGGCCAGGCCCGGAGCCAGTCTGCGGGAACAGCCAGTGAT 888
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 815 TGCAGAGCAAGGTTCAAGAGCTTGAGAAGCAATTGGGCCAGGCCCGGAGCCAGTCTGCGGGAACAGCCAGTGAT 888
Query 889 GAGTTGTCTGTCTATCCAGACCCAAGGAAGCTGTCGGCACAGGAGAAAAACCTGCTGAGGATCCGCAGCCTGGA 962
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 889 GAGTTGTCTGTCTATCCAGACCCAAGGAAGCTGTCGGCACAGGAGAAAAACCTGCTGAGGATCCGCAGCCTGGA 962
Query 963 AAGGGAAAAACAGGAAGGCTTGGAGAAACTTGCCAGTGAACGGGATGTCCTCCAGAGAGAGCTTGAAGAGCTAA 1036
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 963 AAGGGAAAAACAGGAAGGCTTGGAGAAACTTGCCAGTGAACGGGATGTCCTCCAGAGAGAGCTTGAAGAGCTAA 1036
Query 1037 AAAAGAAGTTCGAGGGCATGAGGTCTCGGAACAAGCTGCTGTCAAGTGAGATGAAGACCCTCAAGAGTCAGATG 1110
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037 AAAAGAAGTTCGAGGGCATGAGGTCTCGGAACAAGCTGCTGTCAAGTGAGATGAAGACCCTCAAGAGTCAGATG 1110
Query 1111 GGAACCCTGGTGGTGAAGGGCCGGCATGATGACGAGCTCATCGACGCCCTCATGGACCAGCTGAAGCAGCTACA 1184
|||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111 GGAACCCTGGTGGAGAAGGGCCGGCATGATGACGAGCTCATCGACGCCCTCATGGACCAGCTGAAGCAGCTACA 1184
Query 1185 GGAGATCCTAGGCAGCCTGAGTCTGCAGGAGGAGAAAACGCGAGTGTCCCAGCACCACCTGGACCAGCAACTGA 1258
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185 GGAGATCCTAGGCAGCCTGAGTCTGCAGGAGGAGAAAACGCGAGTGTCCCAGCACCACCTGGACCAGCAACTGA 1258
Query 1259 ACAGCGAGGCTCAGCGGAGCAACAGCCTAGTCGCCCAGCTGCAGGCCATGGTAGCTGAGCGGGAGGCCAAAGTG 1332
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259 ACAGCGAGGCTCAGCGGAGCAACAGCCTAGTCGCCCAGCTGCAGGCCATGGTAGCTGAGCGGGAGGCCAAAGTG 1332
Query 1333 CGACAGCTGGAGATGGAGATCGGACAACTCAATGTGCACTATCTTCGGAATAAAGGAGTGGGTGAGGGGTCCAG 1406
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |.|.|.|||| |..||..|.|||
Sbjct 1333 CGACAGCTGGAGATGGAGATCGGACAACTCAATGTGCAC--------GCACACAGGA---GAAGACTGTTCC-- 1393
Query 1407 TGGCCGCGAGGTCAGCCCTGCCTATACCCAGTTCCTGGA--GGACCCAGGCCTGACCAAGTCCCCGGCCTCAGC 1478
|..|..|||||||| |||| |||.| ||..|||.||.|.||| |.||.|.||
Sbjct 1394 TACCTCCGAGGTCA-------------CCAG---CTGAATGGGGGCCAAGCATTACC----CACCAGACT---- 1443
Query 1479 AGGCGATCATGTTGGCAGGCTTGGATCTTCTCGCTCTGTGACCAGCCTGGGCCACACACTGGTGGAATCTGCTC 1552
Sbjct 1444 -------------------------------------------------------------------------- 1443
Query 1553 TCACGAGGCCTTCCCTGCCCAGTCCCCACAGGACCTCACCTAGGTTCTCGGACTCCCCAGAACAAAAAGGCTGG 1626
Sbjct 1444 -------------------------------------------------------------------------- 1443
Query 1627 CAGGCACAAGTGTCAGAGATCAAGGCCCTCTGGCAGGCTGCCGAGGTGGAGCGTGACCGGCTCACCGAGTTTGT 1700
Sbjct 1444 -------------------------------------------------------------------------- 1443
Query 1701 CACTGTCCTGCAGAAACGGGTGGAGGAGAGCAACAGCAAGCTCCTGGAGTCAGAGAGGAAGCTGCAGGAGGAGC 1774
Sbjct 1444 -------------------------------------------------------------------------- 1443
Query 1775 GACACCGCACCGTGGTGCTGGAGCAACATCTGGAGAAGATACGCCTGGAGCCAGGGAAGGCATCAGCCTCCCAG 1848
Sbjct 1444 -------------------------------------------------------------------------- 1443
Query 1849 AGAGCAGCTCCCAGGACCAAAACAGGTCTGCCCACCTCTAACAACAGGCACAACCCAACCGGGAGCGAGAAGAA 1922
Sbjct 1444 -------------------------------------------------------------------------- 1443
Query 1923 GGACCCATCCTTTGCCCAGCTCTCCGATGTGCCCGTGGAATCCCAAATGGAAGAGCTGACAACCAGGCTGGCCA 1996
Sbjct 1444 -------------------------------------------------------------------------- 1443
Query 1997 TCCAGGTGGAGGAGAATGAAATGCTAAAGGCTGCCCTGGGCAGTGCCCTGCGGGGAAAGGAGGAGGACTTCCGG 2070
Sbjct 1444 -------------------------------------------------------------------------- 1443
Query 2071 ATGTACCATGAGATCCTGGGCCAGGTGAAAAGTGTCTTCCTGCAGGCCCTGCGGCAGCAGAAGACAGGCAAGCA 2144
Sbjct 1444 -------------------------------------------------------------------------- 1443
Query 2145 A 2145
Sbjct 1444 - 1443