Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000477625
• Subject: XM_011533421.2
• Aligned Length: 2155
• Identities: 1390
• Gaps: 758

Alignment

Query    1  ATGGCAGCAGATGAAAGCTCACAGAACACTTTGCGGCTCCAGTTCAAGGCAATGCAGGAGATGCAGCACAAACG  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGGCAGCAGATGAAAGCTCACAGAACACTTTGCGGCTCCAGTTCAAGGCAATGCAGGAGATGCAGCACAAACG  74

Query   75  GTTACAGAAGCAGATGGAGAAAAAGAGGGAAAAAGAACTGAGCCTCAAAAGCAGAGCTGACGACCAAGAGGAGC  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  GTTACAGAAGCAGATGGAGAAAAAGAGGGAAAAAGAACTGAGCCTCAAAAGCAGAGCTGACGACCAAGAGGAGC  148

Query  149  CCTTGGAGGTTTCAGATGGCCTCAGCCTTCTCCACGCAGGGGAGCCAAACTCGAAAAATAGCTTTGAGAAGAGG  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  CCTTGGAGGTTTCAGATGGCCTCAGCCTTCTCCACGCAGGGGAGCCAAACTCGAAAAATAGCTTTGAGAAGAGG  222

Query  223  GTGCTTGAAGATGAGATTGAACACCTTCGAAATGAGCTCAGGGAAACGGTGGACGAGAACGGGCGATTGTATAA  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  GTGCTTGAAGATGAGATTGAACACCTTCGAAATGAGCTCAGGGAAACGGTGGACGAGAACGGGCGATTGTATAA  296

Query  297  GCTGCTGAAGGAAAGGGACTTTGAAATCAAACACCTCAAAAAGAAAATAGAAGAGGACAGATTTGCCTTCACAG  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  GCTGCTGAAGGAAAGGGACTTTGAAATCAAACACCTCAAAAAGAAAATAGAAGAGGACAGATTTGCCTTCACAG  370

Query  371  GGACAGCCGGTGTAGCCGGAGACGTGGTCGCCACCAAAATTGTGGAGCTATCAAAAAAGAACCGGCTGTTGATG  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  GGACAGCCGGTGTAGCCGGAGACGTGGTCGCCACCAAAATTGTGGAGCTATCAAAAAAGAACCGGCTGTTGATG  444

Query  445  GCAGAATCAGAGGGTGCAAAAACCAGGGTGAAGCAGCTGACCAATCGCATCCAGGAGCTGGAGCGGGAACTGCA  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  GCAGAATCAGAGGGTGCAAAAACCAGGGTGAAGCAGCTGACCAATCGCATCCAGGAGCTGGAGCGGGAACTGCA  518

Query  519  GACAGCCCTGACCAGGCTGTCAGCCAAGGGGGCCACCGACGCAGGAGCCAAGCCACCGAGGGCCCAGATGGGAG  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  GACAGCCCTGACCAGGCTGTCAGCCAAGGGGGCCACCGACGCAGGAGCCAAGCCACCGAGGGCCCAGATGGGAG  592

Query  593  ACAGAGCATTGCTGGAGACCCCAGAGGTGAAGGCCCTGCAGGACAGGCTGGTGGCCACCAACTTGAAGATGAGT  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  ACAGAGCATTGCTGGAGACCCCAGAGGTGAAGGCCCTGCAGGACAGGCTGGTGGCCACCAACTTGAAGATGAGT  666

Query  667  GACCTCCGAAACCAGATCCAGTCTGTGAAGCAGGAGCTGCGGATGGCACAGAAGGTTTTGGCCAGAGAGGTTGG  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  GACCTCCGAAACCAGATCCAGTCTGTGAAGCAGGAGCTGCGGATGGCACAGAAGGTTTTGGCCAGAGAGGTTGG  740

Query  741  GGAAGACATCAACGTTCAGCAGCTCCTATCTTCGCCAGGGACCTGGAGGGGTCGGGCTCAACAAATTCTTGTTT  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  GGAAGACATCAACGTTCAGCAGCTCCTATCTTCGCCAGGGACCTGGAGGGGTCGGGCTCAACAAATTCTTGTTT  814

Query  815  TGCAGAGCAAGGTTCAAGAGCTTGAGAAGCAATTGGGCCAGGCCCGGAGCCAGTCTGCGGGAACAGCCAGTGAT  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  TGCAGAGCAAGGTTCAAGAGCTTGAGAAGCAATTGGGCCAGGCCCGGAGCCAGTCTGCGGGAACAGCCAGTGAT  888

Query  889  GAGTTGTCTGTCTATCCAGACCCAAGGAAGCTGTCGGCACAGGAGAAAAACCTGCTGAGGATCCGCAGCCTGGA  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  GAGTTGTCTGTCTATCCAGACCCAAGGAAGCTGTCGGCACAGGAGAAAAACCTGCTGAGGATCCGCAGCCTGGA  962

Query  963  AAGGGAAAAACAGGAAGGCTTGGAGAAACTTGCCAGTGAACGGGATGTCCTCCAGAGAGAGCTTGAAGAGCTAA  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  AAGGGAAAAACAGGAAGGCTTGGAGAAACTTGCCAGTGAACGGGATGTCCTCCAGAGAGAGCTTGAAGAGCTAA  1036

Query 1037  AAAAGAAGTTCGAGGGCATGAGGTCTCGGAACAAGCTGCTGTCAAGTGAGATGAAGACCCTCAAGAGTCAGATG  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  AAAAGAAGTTCGAGGGCATGAGGTCTCGGAACAAGCTGCTGTCAAGTGAGATGAAGACCCTCAAGAGTCAGATG  1110

Query 1111  GGAACCCTGGTGGTGAAGGGCCGGCATGATGACGAGCTCATCGACGCCCTCATGGACCAGCTGAAGCAGCTACA  1184
            |||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  GGAACCCTGGTGGAGAAGGGCCGGCATGATGACGAGCTCATCGACGCCCTCATGGACCAGCTGAAGCAGCTACA  1184

Query 1185  GGAGATCCTAGGCAGCCTGAGTCTGCAGGAGGAGAAAACGCGAGTGTCCCAGCACCACCTGGACCAGCAACTGA  1258
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  GGAGATCCTAGGCAGCCTGAGTCTGCAGGAGGAGAAAACGCGAGTGTCCCAGCACCACCTGGACCAGCAACTGA  1258

Query 1259  ACAGCGAGGCTCAGCGGAGCAACAGCCTAGTCGCCCAGCTGCAGGCCATGGTAGCTGAGCGGGAGGCCAAAGTG  1332
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  ACAGCGAGGCTCAGCGGAGCAACAGCCTAGTCGCCCAGCTGCAGGCCATGGTAGCTGAGCGGGAGGCCAAAGTG  1332

Query 1333  CGACAGCTGGAGATGGAGATCGGACAACTCAATGTGCAC---------TATCTTC-GGAATAAAGGAGTGGGTG  1396
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||         ||||.|| |||.|.|||..|      
Sbjct 1333  CGACAGCTGGAGATGGAGATCGGACAACTCAATGTGCACCTGTGGCCTTATCCTCAGGATTCAAGATG------  1400

Query 1397  AGGGGTCCAGTGGCCGCGAGGTCAGCCCTGCCTATACCCAGTTCCTGGAGGACCCAGGCCTGACCAAGTCCCCG  1470
                     |||||.|                                                          
Sbjct 1401  ---------GTGGCAG----------------------------------------------------------  1407

Query 1471  GCCTCAGCAGGCGATCATGTTGGCAGGCTTGGATCTTCTCGCTCTGTGACCAGCCTGGGCCACACACTGGTGGA  1544
                                                                                      
Sbjct 1408  --------------------------------------------------------------------------  1407

Query 1545  ATCTGCTCTCACGAGGCCTTCCCTGCCCAGTCCCCACAGGACCTCACCTAGGTTCTCGGACTCCCCAGAACAAA  1618
                                                                                      
Sbjct 1408  --------------------------------------------------------------------------  1407

Query 1619  AAGGCTGGCAGGCACAAGTGTCAGAGATCAAGGCCCTCTGGCAGGCTGCCGAGGTGGAGCGTGACCGGCTCACC  1692
                                                                                      
Sbjct 1408  --------------------------------------------------------------------------  1407

Query 1693  GAGTTTGTCACTGTCCTGCAGAAACGGGTGGAGGAGAGCAACAGCAAGCTCCTGGAGTCAGAGAGGAAGCTGCA  1766
                                                                                      
Sbjct 1408  --------------------------------------------------------------------------  1407

Query 1767  GGAGGAGCGACACCGCACCGTGGTGCTGGAGCAACATCTGGAGAAGATACGCCTGGAGCCAGGGAAGGCATCAG  1840
                                                                                      
Sbjct 1408  --------------------------------------------------------------------------  1407

Query 1841  CCTCCCAGAGAGCAGCTCCCAGGACCAAAACAGGTCTGCCCACCTCTAACAACAGGCACAACCCAACCGGGAGC  1914
                                                                                      
Sbjct 1408  --------------------------------------------------------------------------  1407

Query 1915  GAGAAGAAGGACCCATCCTTTGCCCAGCTCTCCGATGTGCCCGTGGAATCCCAAATGGAAGAGCTGACAACCAG  1988
                                                                                      
Sbjct 1408  --------------------------------------------------------------------------  1407

Query 1989  GCTGGCCATCCAGGTGGAGGAGAATGAAATGCTAAAGGCTGCCCTGGGCAGTGCCCTGCGGGGAAAGGAGGAGG  2062
                                                                                      
Sbjct 1408  --------------------------------------------------------------------------  1407

Query 2063  ACTTCCGGATGTACCATGAGATCCTGGGCCAGGTGAAAAGTGTCTTCCTGCAGGCCCTGCGGCAGCAGAAGACA  2136
                                                                                      
Sbjct 1408  --------------------------------------------------------------------------  1407

Query 2137  GGCAAGCAA  2145
                     
Sbjct 1408  ---------  1407