Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- TRCN0000477630
- Subject:
- XM_011522942.1
- Aligned Length:
- 1852
- Identities:
- 1680
- Gaps:
- 146
Alignment
Query 1 ATGCCGCCCCATGTGGTGCTCACCTTCCGGCGCCTGGGCTGCGCCTTGGCCTCCTGCCGGCTGGCGCCTGCGAG 74
||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ATGCTGCCCCATGTGGTGCTCACCTTCCGGCGCCTGGGCTGCGCCTTGGCGTCCTGCCGGCTGGCGCCTGCGAG 74
Query 75 ACACAGAGGAAGTGGTCTTCTGCACACAGCCCCAGTGGCCCGCTCGGACAGGAGCGCCCCGGTGTTCACCCGTG 148
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 75 ACACAGAGGAAGTGGTCTTCTGCACACAGCCCCAGTGGCCCGCTCGGACAGGAGCGCCCCGGTGTTCACCCGTG 148
Query 149 CCCTGGCCTTTGGGGACAGAATCGCCCTGGTTGACCAGCACGGCCGCCACACGTACAGGGAGCTTTATTCCCGC 222
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 149 CCCTGGCCTTTGGGGACAGAATCGCCCTGGTTGACCAGCACGGCCGCCACACGTACAGGGAGCTTTATTCCCGC 222
Query 223 AGCCTTCGCCTGTCCCAGGAGATCTGCAGGCTCTGCGGGTGTGTCGGCGGGGACCTCCGGGAGGAGAGGGTCTC 296
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223 AGCCTTCGCCTGTCCCAGGAGATCTGCAGGCTCTGCGGGTGTGTCGGCGGGGACCTCCGGGAGGAGAGGGTCTC 296
Query 297 CTTCCTATGTGCTAACGACGCCTCCTACGTCGTGGCCCAGTGGGCCTCATGGATGAGCGGCGGTGTGGCAGTAC 370
|||||||||.||||||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.||||||||||||||.|
Sbjct 297 CTTCCTATGCGCTAACGATGCCTCCTACGTCGTGGCCCAGTGGGCGTCATGGATGAGTGGCGGTGTGGCAGTCC 370
Query 371 CCCTCTACAGGAAGCATCCCGCGGCCCAGCTGGAGTATGTCATCTGCGACTCCCAGAGCTCTGTGGTCCTTGTC 444
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|
Sbjct 371 CCCTCTACAGGAAGCATCCCGCGGCCCAGCTGGAGTATGTCATCTGCGACTCCCAGAGCTCTGTGGTCCTTGCC 444
Query 445 AGCCAGGAGTACCTGGAGCTCCTGAGCCCGGTGGTCAGGAAGCTGGGGGTCCCGCTGCTGCCGCTCACACCAGC 518
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 445 AGCCAGGAGTACCTGGAGCTCCTGAGCCCGGTGGTCAGGAAGCTGGGGGTCCCGCTGCTGCCGCTCACACCAGC 518
Query 519 CATCTACACTGGAGCAGTAGAGGAACCGGCAGAGGTCCCGGTCCCAGAGCAGGGATGGAGGAACAAGGGCGCCA 592
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 519 CATCTACACTGGAGCAGTAGAGGAACCGGCAGAGGTCCCGGTCCCAGAGCAGGGATGGAGGAACAAGGGCGCCA 592
Query 593 TGATCATCTACACCAGTGGGACCACGGGGAGGCCCAAGGGCGTGCTGAGCACGCACCAAAACATCAGGGCTGTG 666
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 593 TGATCATCTACACCAGTGGGACCACGGGGAGGCCCAAGGGCGTGCTGAGCACGCACCAAAACATCAGGGCTGTG 666
Query 667 GTGACCGGGCTGGTCCACAAGTGGGCATGGACCAAAGACGACGTGATCCTCCACGTGCTCCCGCTGCACCACGT 740
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 667 GTGACCGGGCTGGTCCACAAGTGGGCATGGACCAAAGACGACGTGATCCTCCACGTGCTCCCGCTGCACCACGT 740
Query 741 CCATGGTGTGGTCAACGCGCTGCTCTGTCCTCTCTGGGTGGGAGCCACCTGTGTGATGATGCCTGAGTTCAGCC 814
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 741 CCATGGTGTGGTCAACGCGCTGCTCTGTCCTCTCTGGGTGGGAGCCACCTGTGTGATGATGCCTGAGTTCAGCC 814
Query 815 CTCAGCAGGTTTGGGAAAAGTTCTTAAGTTCTGAAACGCCGCGGATCAATGTCTTTATGGCAGTGCCTACAATA 888
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 815 CTCAGCAGGTTTGGGAAAAGTTCTTAAGTTCTGAAACGCCGCGGATCAATGTCTTTATGGCAGTGCCTACAATA 888
Query 889 TACACCAAGCTGATGGAGTACTACGACAGGCATTTTACCCAGCCGCACGCCCAGGATTTCTTGCGTGCAGTTTG 962
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 889 TACACCAAGCTGATGGAGTACTACGACAGGCATTTTACCCAGCCGCACGCCCAGGATTTCTTGCGTGCAGTTTG 962
Query 963 TGAAGAAAAAATTAGGCTGATGGTCTCAGGCTCAGCTGCCCTGCCCCTCCCAGTGCTGGAGAAGTGGAAGAACA 1036
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 963 TGAAGAAAAAATTAGGCTGATGGTCTCAGGCTCAGCTGCCCTGCCCCTCCCAGTGCTGGAGAAGTGGAAGAACA 1036
Query 1037 TCACGGGCCACACCCTGCTGGAGCGGTATGGCATGACCGAGATCGGCATGGCTCTGTCCGGGCCCCTGACCACT 1110
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037 TCACGGGCCACACCCTGCTGGAGCGGTATGGCATGACCGAGATCGGCATGGCTCTGTCCGGGCCCCTGACCACT 1110
Query 1111 GCCATGCGCCTGCCAGGTTCCGTGGGGACCCCACTGCCTGGAGTACAGGTGCGCATTGTCTCAGAAAACCCACA 1184
|||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111 GCCGTGCGCCTGCCAGGTTCCGTGGGGACCCCACTGCCTGGAGTACAGGTGCGCATTGTCTCAGAAAACCCACA 1184
Query 1185 GAGGGAAGCCTGCTCCTACACCATCCACGCAGAGGGAGACGAGAGGGGGACCAAGGTGACCCCAGGGTTTGAAG 1258
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185 GAGGGAAGCCTGCTCCTACACCATCCACGCAGAGGGAGACGAGAGGGGGACCAAGGTGACCCCAGGGTTTGAAG 1258
Query 1259 AAAAGGAGGGGGAGCTGCTGGTGAGGGGACCCTCCGTGTTTCGAGAATACTGGAATAAACCAGAAGAAACTAAG 1332
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259 AAAAGGAGGGGGAGCTGCTGGTGAGGGGACCCTCCGTGTTTCGAGAATACTGGAATAAACCAGAAGAAACTAAG 1332
Query 1333 AGTGCATTCACCCTGGATGGCTGGTTTAAGACAGGGGACACCGTGGTGTTTAAGGATGGCCAGTACTGGATCCG 1406
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333 AGTGCATTCACCCTGGATGGCTGGTTTAAGACAGGGGACACCGTGGTGTTTAAGGATGGCCAGTACTGGATCCG 1406
Query 1407 AGGCCGGACCTCAGTGGACATCATCAAGACTGGAGGCTACAAGGTCAGCGCCCTGGAGGTGGAGTGGCACCTGC 1480
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407 AGGCCGGACCTCAGTGGACATCATCAAGACTGGAGGCTACAAGGTCAGCGCCCTGGAGGTGGAGTGGCACCTGC 1480
Query 1481 TGGCCCACCCCAGCATCACAGATGTGGCTGTGATTGGAGTTCCGGATATGACATGGGGCCAGCGGGTCACTGCT 1554
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481 TGGCCCACCCCAGCATCACAGATGTGGCTGTGATTGGAGTTCCGGATATGACATGGGGCCAGCGGGTCACTGCT 1554
Query 1555 GTGGTGACCCTCCGAGAAGGACACTCACTGTCCCACAGGGAGCTCAAAGAGTGGGCCAG--------------- 1613
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555 GTGGTGACCCTCCGAGAAGGACACTCACTGTCCCACAGGGAGCTCAAAGAGTGGGCCAGGTTGAAAGAACACCC 1628
Query 1614 ---------------------------AAATGT---------------CCTGGCCCC--GTACGCGGTGCCCT- 1642
||||.| |||.|||.| |.|.|||| ||.||
Sbjct 1629 AACCAAGAGGAGAGAAAACAGCATTCTAAATATCGGAAGGAAACGAAACCTCGCCTCAGGCATGCGG-GCTCTG 1701
Query 1643 ------------------CGGAGCTGG-TGCTG------GTGGAG---------GAGATCCCGCGGAACCAGAT 1682
||||| || ||||| |||.|| .|||| |||.|||||
Sbjct 1702 ACGGGCAGGATGGCGGCACGGAG--GGCTGCTGTATCCAGTGAAGTCAGCAGTTCAGAT------GAAACAGAT 1767
Query 1683 ------------GGGCA-AGATTGACAAGA---AGGC--------------GCTCATCAGGCACTTCCACCCCT 1726
.|.|| |.||||.||||| |.|| .||.|.||| |||
Sbjct 1768 AACTCCCTTAAAAGACACAAATTGCCAAGACTGACGCAAACACTGAAACAGACTGAACAG----TTC------- 1830
Query 1727 CA 1728
Sbjct 1831 -- 1830