Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000477630
• Subject: XM_017023021.1
• Aligned Length: 1728
• Identities: 1376
• Gaps: 339

Alignment

Query    1  ATGCCGCCCCATGTGGTGCTCACCTTCCGGCGCCTGGGCTGCGCCTTGGCCTCCTGCCGGCTGGCGCCTGCGAG  74
            ||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGCTGCCCCATGTGGTGCTCACCTTCCGGCGCCTGGGCTGCGCCTTGGCGTCCTGCCGGCTGGCGCCTGCGAG  74

Query   75  ACACAGAGGAAGTGGTCTTCTGCACACAGCCCCAGTGGCCCGCTCGGACAGGAGCGCCCCGGTGTTCACCCGTG  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  ACACAGAGGAAGTGGTCTTCTGCACACAGCCCCAGTGGCCCGCTCGGACAGGAGCGCCCCGGTGTTCACCCGTG  148

Query  149  CCCTGGCCTTTGGGGACAGAATCGCCCTGGTTGACCAGCACGGCCGCCACACGTACAGGGAGCTTTATTCCCGC  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  CCCTGGCCTTTGGGGACAGAATCGCCCTGGTTGACCAGCACGGCCGCCACACGTACAGGGAGCTTTATTCCCGC  222

Query  223  AGCCTTCGCCTGTCCCAGGAGATCTGCAGGCTCTGCGGGTGTGTCGGCGGGGACCTCCGGGAGGAGAGGGTCTC  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  AGCCTTCGCCTGTCCCAGGAGATCTGCAGGCTCTGCGGGTGTGTCGGCGGGGACCTCCGGGAGGAGAGGGTCTC  296

Query  297  CTTCCTATGTGCTAACGACGCCTCCTACGTCGTGGCCCAGTGGGCCTCATGGATGAGCGGCGGTGTGGCAGTAC  370
            |||||||||.||||||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.||||||||||||||.|
Sbjct  297  CTTCCTATGCGCTAACGATGCCTCCTACGTCGTGGCCCAGTGGGCGTCATGGATGAGTGGCGGTGTGGCAGTCC  370

Query  371  CCCTCTACAGGAAGCATCCCGCGGCCCAGCTGGAGTATGTCATCTGCGACTCCCAGAGCTCTGTGGTCCTTGTC  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|
Sbjct  371  CCCTCTACAGGAAGCATCCCGCGGCCCAGCTGGAGTATGTCATCTGCGACTCCCAGAGCTCTGTGGTCCTTGCC  444

Query  445  AGCCAGGAGTACCTGGAGCTCCTGAGCCCGGTGGTCAGGAAGCTGGGGGTCCCGCTGCTGCCGCTCACACCAGC  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  AGCCAGGAGTACCTGGAGCTCCTGAGCCCGGTGGTCAGGAAGCTGGGGGTCCCGCTGCTGCCGCTCACACCAGC  518

Query  519  CATCTACACTGGAGCAGTAGAGGAACCGGCAGAGGTCCCGGTCCCAGAGCAGGGATGGAGGAACAAGGGCGCCA  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  CATCTACACTGGAGCAGTAGAGGAACCGGCAGAGGTCCCGGTCCCAGAGCAGGGATGGAGGAACAAGGGCGCCA  592

Query  593  TGATCATCTACACCAGTGGGACCACGGGGAGGCCCAAGGGCGTGCTGAGCACGCACCAAAACATCAGGGCTGTG  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  TGATCATCTACACCAGTGGGACCACGGGGAGGCCCAAGGGCGTGCTGAGCACGCACCAAAACATCAGGGCTGTG  666

Query  667  GTGACCGGGCTGGTCCACAAGTGGGCATGGACCAAAGACGACGTGATCCTCCACGTGCTCCCGCTGCACCACGT  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  GTGACCGGGCTGGTCCACAAGTGGGCATGGACCAAAGACGACGTGATCCTCCACGTGCTCCCGCTGCACCACGT  740

Query  741  CCATGGTGTGGTCAACGCGCTGCTCTGTCCTCTCTGGGTGGGAGCCACCTGTGTGATGATGCCTGAGTTCAGCC  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  CCATGGTGTGGTCAACGCGCTGCTCTGTCCTCTCTGGGTGGGAGCCACCTGTGTGATGATGCCTGAGTTCAGCC  814

Query  815  CTCAGCAGGTTTGGGAAAAGTTCTTAAGTTCTGAAACGCCGCGGATCAATGTCTTTATGGCAGTGCCTACAATA  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  CTCAGCAGGTTTGGGAAAAGTTCTTAAGTTCTGAAACGCCGCGGATCAATGTCTTTATGGCAGTGCCTACAATA  888

Query  889  TACACCAAGCTGATGGAGTACTACGACAGGCATTTTACCCAGCCGCACGCCCAGGATTTCTTGCGTGCAGTTTG  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  TACACCAAGCTGATGGAGTACTACGACAGGCATTTTACCCAGCCGCACGCCCAGGATTTCTTGCGTGCAGTTTG  962

Query  963  TGAAGAAAAAATTAGGCTGATGGTCTCAGGCTCAGCTGCCCTGCCCCTCCCAGTGCTGGAGAAGTGGAAGAACA  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  TGAAGAAAAAATTAGGCTGATGGTCTCAGGCTCAGCTGCCCTGCCCCTCCCAGTGCTGGAGAAGTGGAAGAACA  1036

Query 1037  TCACGGGCCACACCCTGCTGGAGCGGTATGGCATGACCGAGATCGGCATGGCTCTGTCCGGGCCCCTGACCACT  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  TCACGGGCCACACCCTGCTGGAGCGGTATGGCATGACCGAGATCGGCATGGCTCTGTCCGGGCCCCTGACCACT  1110

Query 1111  GCCATGCGCCTGCCAGGTTCCGTGGGGACCCCACTGCCTGGAGTACAGGTGCGCATTGTCTCAGAAAACCCACA  1184
            |||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  GCCGTGCGCCTGCCAGGTTCCGTGGGGACCCCACTGCCTGGAGTACAGGTGCGCATTGTCTCAGAAAACCCACA  1184

Query 1185  GAGGGAAGCCTGCTCCTACACCATCCACGCAGAGGGAGACGAGAGGGGGACCAAGGTGACCCCAGGGTTTGAAG  1258
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  GAGGGAAGCCTGCTCCTACACCATCCACGCAGAGGGAGACGAGAGGGGGACCAAGGTGACCCCAGGGTTTGAAG  1258

Query 1259  AAAAGGAGGGGGAGCTGCTGGTGAGGGGACCCTCCGTGTTTCGAGAATACTGGAATAAACCAGAAGAAACTAAG  1332
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  AAAAGGAGGGGGAGCTGCTGGTGAGGGGACCCTCCGTGTTTCGAGAATACTGGAATAAACCAGAAGAAACTAAG  1332

Query 1333  AGTGCATTCACCCTGGATGGCTGGTTTAAGACAGGGGACACCGTGGTGTTTAAGGATGGCCAGTACTGGATCCG  1406
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||                    ||.||   .|||  ||| 
Sbjct 1333  AGTGCATTCACCCTGGATGGCTGGTTTAAGACAGGG--------------------TGTCC---TCTG--TCC-  1380

Query 1407  AGGCCGGACCTCAGTGGACATCATCAAGACTGGAGGCTACAAGGTCAGCGCCCTGGAGGTGGAGTGGCACCTGC  1480
               ||.||||.|                                                              
Sbjct 1381  ---CCAGACCCC--------------------------------------------------------------  1389

Query 1481  TGGCCCACCCCAGCATCACAGATGTGGCTGTGATTGGAGTTCCGGATATGACATGGGGCCAGCGGGTCACTGCT  1554
                                                                                      
Sbjct 1390  --------------------------------------------------------------------------  1389

Query 1555  GTGGTGACCCTCCGAGAAGGACACTCACTGTCCCACAGGGAGCTCAAAGAGTGGGCCAGAAATGTCCTGGCCCC  1628
                                                                                      
Sbjct 1390  --------------------------------------------------------------------------  1389

Query 1629  GTACGCGGTGCCCTCGGAGCTGGTGCTGGTGGAGGAGATCCCGCGGAACCAGATGGGCAAGATTGACAAGAAGG  1702
                                                                                      
Sbjct 1390  --------------------------------------------------------------------------  1389

Query 1703  CGCTCATCAGGCACTTCCACCCCTCA  1728
                                      
Sbjct 1390  --------------------------  1389