Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000477630
• Subject: XR_933240.3
• Aligned Length: 2551
• Identities: 1719
• Gaps: 823

Alignment

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct    1  AAGCTGTTGGGCGCCGGAACTGGTCCGGCCCGACTCACGACCCCGCGGGACCCGGCCGGAACCCGGCCCGACCC  74

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct   75  CGGCGCGCGCGCGGCGGAGGACGAGGAAGAGTTGTGGCGAGGCAGATCCTGCCCCGTGGCCGCGGCCGTCTCGT  148

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct  149  AGGTGTCCCACCGGCCTTCCGGGTTCCAGCGCCAGGCCTGGTGCCTGCCCCAGGAGGATGAGCATTTGCATTGC  222

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct  223  CTGCACCTTATCGTGCCCTTCCACCTGCTGAAGCAGCTGTGCCTGCCGCTCTTGTGAACTGCGAACTTCCCCTT  296

Query    1  -----------------------------------------------ATGCCGCCCCATGTGGTGCTCACCTTC  27
                                                           ||||.||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  ACCTCCTCTCTCTGGCTCGGGAGCTGGCTCGGCCGCCTGTCAGTGCAATGCTGCCCCATGTGGTGCTCACCTTC  370

Query   28  CGGCGCCTGGGCTGCGCCTTGGCCTCCTGCCGGCTGGCGCCTGCGAGACACAGAGGAAGTGGTCTTCTGCACAC  101
            |||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  CGGCGCCTGGGCTGCGCCTTGGCGTCCTGCCGGCTGGCGCCTGCGAGACACAGAGGAAGTGGTCTTCTGCACAC  444

Query  102  AGCCCCAGTGGCCCGCTCGGACAGGAGCGCCCCGGTGTTCACCCGTGCCCTGGCCTTTGGGGACAGAATCGCCC  175
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  AGCCCCAGTGGCCCGCTCGGACAGGAGCGCCCCGGTGTTCACCCGTGCCCTGGCCTTTGGGGACAGAATCGCCC  518

Query  176  TGGTTGACCAGCACGGCCGCCACACGTACAGGGAGCTTTATTCCCGCAGCCTTCGCCTGTCCCAGGAGATCTGC  249
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  TGGTTGACCAGCACGGCCGCCACACGTACAGGGAGCTTTATTCCCGCAGCCTTCGCCTGTCCCAGGAGATCTGC  592

Query  250  AGGCTCTGCGGGTGTGTCGGCGGGGACCTCCGGGAGGAGAGGGTCTCCTTCCTATGTGCTAACGACGCCTCCTA  323
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.||||||||
Sbjct  593  AGGCTCTGCGGGTGTGTCGGCGGGGACCTCCGGGAGGAGAGGGTCTCCTTCCTATGCGCTAACGATGCCTCCTA  666

Query  324  CGTCGTGGCCCAGTGGGCCTCATGGATGAGCGGCGGTGTGGCAGTACCCCTCTACAGGAAGCATCCCGCGGCCC  397
            ||||||||||||||||||.|||||||||||.||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  CGTCGTGGCCCAGTGGGCGTCATGGATGAGTGGCGGTGTGGCAGTCCCCCTCTACAGGAAGCATCCCGCGGCCC  740

Query  398  AGCTGGAGTATGTCATCTGCGACTCCCAGAGCTCTGTGGTCCTTGTCAGCCAGGAGTACCTGGAGCTCCTGAGC  471
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  AGCTGGAGTATGTCATCTGCGACTCCCAGAGCTCTGTGGTCCTTGCCAGCCAGGAGTACCTGGAGCTCCTGAGC  814

Query  472  CCGGTGGTCAGGAAGCTGGGGGTCCCGCTGCTGCCGCTCACACCAGCCATCTACACTGGAGCAGTAGAGGAACC  545
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  CCGGTGGTCAGGAAGCTGGGGGTCCCGCTGCTGCCGCTCACACCAGCCATCTACACTGGAGCAGTAGAGGAACC  888

Query  546  GGCAGAGGTCCCGGTCCCAGAGCAGGGATGGAGGAACAAGGGCGCCATGATCATCTACACCAGTGGGACCACGG  619
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  GGCAGAGGTCCCGGTCCCAGAGCAGGGATGGAGGAACAAGGGCGCCATGATCATCTACACCAGTGGGACCACGG  962

Query  620  GGAGGCCCAAGGGCGTGCTGAGCACGCACCAAAACATCAGGGCTGTGGTGACCGGGCTGGTCCACAAGTGGGCA  693
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  GGAGGCCCAAGGGCGTGCTGAGCACGCACCAAAACATCAGGGCTGTGGTGACCGGGCTGGTCCACAAGTGGGCA  1036

Query  694  TGGACCAAAGACGACGTGATCCTCCACGTGCTCCCGCTGCACCACGTCCATGGTGTGGTCAACGCGCTGCTCTG  767
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  TGGACCAAAGACGACGTGATCCTCCACGTGCTCCCGCTGCACCACGTCCATGGTGTGGTCAACGCGCTGCTCTG  1110

Query  768  TCCTCTCTGGGTGGGAGCCACCTGTGTGATGATGCCTGAGTTCAGCCCTCAGCAGGTTTGGGAAAAGTTCTTAA  841
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  TCCTCTCTGGGTGGGAGCCACCTGTGTGATGATGCCTGAGTTCAGCCCTCAGCAGGTTTGGGAAAAGTTCTTAA  1184

Query  842  GTTCTGAAACGCCGCGGATCAATGTCTTTATGGCAGTGCCTACAATATACACCAAGCTGATGGAGTACTACGAC  915
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  GTTCTGAAACGCCGCGGATCAATGTCTTTATGGCAGTGCCTACAATATACACCAAGCTGATGGAGTACTACGAC  1258

Query  916  AGGCATTTTACCCAGCCGCACGCCCAGGATTTCTTGCGTGCAGTTTGTGAAGAAAAAATTAGGCTGATGGTCTC  989
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  AGGCATTTTACCCAGCCGCACGCCCAGGATTTCTTGCGTGCAGTTTGTGAAGAAAAAATTAGGCTGATGGTCTC  1332

Query  990  AGGCTCAGCTGCCCTGCCCCTCCCAGTGCTGGAGAAGTGGAAGAACATCACGGGCCACACCCTGCTGGAGCGGT  1063
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333  AGGCTCAGCTGCCCTGCCCCTCCCAGTGCTGGAGAAGTGGAAGAACATCACGGGCCACACCCTGCTGGAGCGGT  1406

Query 1064  ATGGCATGACCGAGATCGGCATGGCTCTGTCCGGGCCCCTGACCACTGCCATGCGCCTGC--------------  1123
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||              
Sbjct 1407  ATGGCATGACCGAGATCGGCATGGCTCTGTCCGGGCCCCTGACCACTGCCGTGCGCCTGCCAGGATGTGCTGGT  1480

Query 1124  --------------------------------------------------------------------------  1123
                                                                                      
Sbjct 1481  TTTGTCCAGTGCCACCGGCCACAGTCACCACGTAATATGGACGGAATGAGCAAAGCCCGGCTCGCTGAGGCTGC  1554

Query 1124  ------CAGGTTCCGTGGGGACCCCACTGCCTGGAGTACAGGTGCGCATTGTCTCAGAAAACCCACAGAGGGAA  1191
                  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555  AGGCTGCAGGTTCCGTGGGGACCCCACTGCCTGGAGTACAGGTGCGCATTGTCTCAGAAAACCCACAGAGGGAA  1628

Query 1192  GCCTGCTCCTACACCATCCACGCAGAGGGAGACGAGAGGGGGACCAAGGTGACCCCAGGGTTTGAAGAAAAGGA  1265
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629  GCCTGCTCCTACACCATCCACGCAGAGGGAGACGAGAGGGGGACCAAGGTGACCCCAGGGTTTGAAGAAAAGGA  1702

Query 1266  GGGGGAGCTGCTGGTGAGGGGACCCTCCGTGTTTCGAGAATACTGGAATAAACCAGAAGAAACTAAGAGTGCAT  1339
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1703  GGGGGAGCTGCTGGTGAGGGGACCCTCCGTGTTTCGAGAATACTGGAATAAACCAGAAGAAACTAAGAGTGCAT  1776

Query 1340  TCACCCTGGATGGCTGGTTTAAGACAGGGGACACCGTGGTGTTTAAGGATGGCCAGTACTGGATCCGAGGCCGG  1413
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1777  TCACCCTGGATGGCTGGTTTAAGACAGGGGACACCGTGGTGTTTAAGGATGGCCAGTACTGGATCCGAGGCCGG  1850

Query 1414  ACCTCAGTGGACATCATCAAGACTGGAGGCTACAAGGTCAGCGCCCTGGAGGTGGAGTGGCACCTGCTGGCCCA  1487
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1851  ACCTCAGTGGACATCATCAAGACTGGAGGCTACAAGGTCAGCGCCCTGGAGGTGGAGTGGCACCTGCTGGCCCA  1924

Query 1488  CCCCAGCATCACAGATGTGGCTGTGATTGGAGTTCCGGATATGACATGGGGCCAGCGGGTCACTGCTGTGGTGA  1561
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1925  CCCCAGCATCACAGATGTGGCTGTGATTGGAGTTCCGGATATGACATGGGGCCAGCGGGTCACTGCTGTGGTGA  1998

Query 1562  CCCTCCGAGAAGGACACTCACTGTCCCACAGGGAGCTCAAAGAGTGGGCCAGAAATGTCCTGGCCCCGTACGCG  1635
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1999  CCCTCCGAGAAGGACACTCACTGTCCCACAGGGAGCTCAAAGAGTGGGCCAGAAATGTCCTGGCCCCGTACGCG  2072

Query 1636  GTGCCCTCGGAGCTGGTGCTGGTGGAGGAGATCCCGCGGAACCAGATGGGCAAGATTGACAAGAAGGCGCTCAT  1709
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2073  GTGCCCTCGGAGCTGGTGCTGGTGGAGGAGATCCCGCGGAACCAGATGGGCAAGATTGACAAGAAGGCGCTCAT  2146

Query 1710  CAGGCACTTCCACCCCTCA-------------------------------------------------------  1728
            |||||||||||||||||||                                                       
Sbjct 2147  CAGGCACTTCCACCCCTCATGACCCGGCAGACTGGGACTGCGGGTCTGGTGGGGAGCAGCAGACGTCCCCTTCA  2220

Query 1729  --------------------------------------------------------------------------  1728
                                                                                      
Sbjct 2221  CACCGAGAACCACGGGGGCCCGTCCAAGACCTGGCCTCCCTTAAACCTGAACCCCCCAAATCAGGTCACGTAGA  2294

Query 1729  --------------------------------------------------------------------------  1728
                                                                                      
Sbjct 2295  ATCAAGAACTGTTTGGGATGAAATCACCATGTGGGGTCCCCAGCCTCGGGCCAGTTGTTGCAGCTCAAGGAGAC  2368

Query 1729  --------------------------------------------------------------------------  1728
                                                                                      
Sbjct 2369  CGTCCCTGGTGTCACCTCTGCCTGGTCACCGCCGACCTCATCTGTGCAGCGCGGTGCAGCCAGCCCCTGGCCCC  2442

Query 1729  --------------------------------------------------------------------------  1728
                                                                                      
Sbjct 2443  ACGTGCTGAGGCACCTCCCGCCCCACAGTGCCCTGCAGTTGCCAGGCTCTCCAGGGCAGGTCCCAGAGGTTTCC  2516

Query 1729  -----------------------------------  1728
                                               
Sbjct 2517  CACAAAAAACAAAGACTCCACTGGAGGAAACAAGC  2551