Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000477634
• Subject: XM_006531358.3
• Aligned Length: 1553
• Identities: 1168
• Gaps: 214

Alignment

Query    1  ATGTACAAGATGAACATCTGCAACAAGCCCTCCAACAAGACGGCCCCTGAGAAGAGTGTGTGGACGGCACCGGC  74
                     |||||||||||||||||.||||||||||||||.|||||.|||||||||||||||||.||.||..|
Sbjct    1  ---------ATGAACATCTGCAACAAACCCTCCAACAAGACAGCCCCCGAGAAGAGTGTGTGGACAGCGCCCTC  65

Query   75  ACAGCCCAGCGGACCCTCCCCTGAGCTGCAGGGCCAGCGATCCCGCCGGAATGGGTGGAGCTGGCCCCCTCACC  148
            ||||..|||.||.||.|||||.||.||||||||||||||.||.||..|||||||.|||||||||||.||.||||
Sbjct   66  ACAGGACAGTGGGCCTTCCCCAGAACTGCAGGGCCAGCGCTCTCGAAGGAATGGATGGAGCTGGCCGCCCCACC  139

Query  149  CGCTCCAGATTGTGGCCTGGCTGCTGTACCTCTTCTTTGCTGTGATCGGCTTTGGGATCCTTGTTCCCCTCCTG  222
            |||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.||.|||||.|||||||||.||||||||||||||.||
Sbjct  140  CGCTCCAGATTGTGGCCTGGCTGCTCTACCTCTTCTTCGCGGTGATTGGCTTTGGGGTCCTTGTTCCCCTCTTG  213

Query  223  CCTCACCACTGGGTGCCCGCTGGCTACGCTTGCATGGGCGCCATCTTTGCTGGCCACCTTGTGGTGCACCTGAC  296
            |||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  214  CCTCACCACTGGGTGCCTGCTGGCTATGCTTGCATGGGGGCCATCTTTGCTGGCCACCTTGTGGTGCACCTGAC  287

Query  297  CGCCGTCTCCATCGATCCAGCAGATGCCAACGTGCGGGACAAGAGCTATGCGGGGCCCCTGCCCATCTTCAACC  370
            .||.||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||..|.||||||||||||||||||||||
Sbjct  288  TGCTGTCTCCATCGATCCAGCAGATGCCAATGTGCGGGACAAGAGCTACTCTGGGCCCCTGCCCATCTTCAACC  361

Query  371  GAAGCCAGCACGCACATGTCATTGAAGACCTGCACTGCAACTTGTGCAACGTGGATGTGAGCGCTCGCTCCAAG  444
            |.||||||||.||.|||||||||||||||||||||||||||.|.|||.|||||||.|||||.||.||.|||||.
Sbjct  362  GCAGCCAGCATGCGCATGTCATTGAAGACCTGCACTGCAACCTATGCGACGTGGACGTGAGTGCGCGATCCAAA  435

Query  445  CACTGCAGCGCCTGCAACAAGTGCGTGTGCGGTTTCGACCACCACTGCAAGTGGCTCAACAACTGTGTGGGCGA  518
            |||||||||||||||||.||||||||.|||||.|||||.|||||.||||||||||||||||||||.||||||||
Sbjct  436  CACTGCAGCGCCTGCAATAAGTGCGTATGCGGCTTCGATCACCATTGCAAGTGGCTCAACAACTGCGTGGGCGA  509

Query  519  GCGGAACTACCGGCTCTTTCTACACAGTGTTGCATCCGCTTTACTGGGCGTCCTGCTCCTGGTGCTGGTGGCCA  592
            |.|||||||.||||||||||||||||||||.|||||.||||||.||||.|||||||||||||||||||||||||
Sbjct  510  GAGGAACTATCGGCTCTTTCTACACAGTGTGGCATCTGCTTTATTGGGTGTCCTGCTCCTGGTGCTGGTGGCCA  583

Query  593  CATATGTCTTCGTGGAGTTCTTTGTCAACCCCATGCGTCTGCGCACCAACCGACACTTTGAAGTCCTGAAGAAT  666
            |.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||.|||||||.|||||||||||||.|||||||.
Sbjct  584  CTTATGTCTTCGTGGAGTTCTTTGTCAACCCCATGCGACTTCGTACCAACCAACACTTTGAAGTCTTGAAGAAC  657

Query  667  CACACGGATGTGTGGTTCGTGTTCCTGCCTGCCGCCCCCGTGGAGACCCAGGCCCCTGCCATCCTGGCCCTGGC  740
            |||||||||||||||||.||||||.|||||||.|||||.||||||||||||||.||||||||||||||||||||
Sbjct  658  CACACGGATGTGTGGTTTGTGTTCTTGCCTGCTGCCCCTGTGGAGACCCAGGCTCCTGCCATCCTGGCCCTGGC  731

Query  741  CGCCCTGCTCATCCTTCTGGGCCTCCTGTCCACAGCCCTCCTGGGGCACCTGCTCTGCTTCCACATTTATCTCA  814
            ||||||||||||||||||||||||.||.||.||||||||.||.||.||||||||||||||||||||||||||.|
Sbjct  732  CGCCCTGCTCATCCTTCTGGGCCTGCTTTCTACAGCCCTGCTTGGCCACCTGCTCTGCTTCCACATTTATCTAA  805

Query  815  TGTGGCACAAGCTCACCACCTATGAGTACATCGTGCAGCACCGCCCACCACAGGAGGCCAAGGGGGTTCACAGG  888
            |||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.|||.|.|||||.||.||||.|...||||.|
Sbjct  806  TGTGGCACAAGCTCACCACCTATGAATACATCGTGCAGCACCGTCCAGCTCAGGAAGCAAAGGAGACCCACAAG  879

Query  889  GAGCTCGAGTCATGTCCTCCCAAGATGCGGCCCATTCAGGAGATGGAGTTCTACATGCGGACCTTCAGACATAT  962
            |||||.||||||||.||.|.||               ||||||||||||||||||||.||||||||||.|||.|
Sbjct  880  GAGCTGGAGTCATGCCCCCGCA---------------AGGAGATGGAGTTCTACATGAGGACCTTCAGCCATGT  938

Query  963  GCGCCCAGAGCCCCCTGGCCAGGCCGGGCCAGCAGCAGTGAATGCCAAACACTCTCGCCCTGCCTCCCCGGATC  1036
            |||.|||||||||.||||||||||..||.||||||||.|.||||||||            |.|.||||.|..||
Sbjct  939  GCGTCCAGAGCCCTCTGGCCAGGCTAGGACAGCAGCATTAAATGCCAA------------TCCTTCCCAGTTTC  1000

Query 1037  ---CGACCCCAGGTAGGAGGGACTGTGCTGGGCCTCCGGTCCAGGTGGAGTGGGATAGAAAGAAGCCTCTACCC  1107
               |.||||.|||                           |||.|||||       |..|     ||.||||||
Sbjct 1001  TTGCCACCCAAGG---------------------------CCAAGTGGA-------ACCA-----CCACTACCC  1035

Query 1108  TGGCGCTCGCCTCTGCTTCTTTTGGCGATGTGGGGCCCTCAGGCTCCCCCGTGTCTCTG---------------  1166
            |        |||                        ||||||.|.|.|   ||.|||||               
Sbjct 1036  T--------CCT------------------------CCTCAGACACAC---TGGCTCTGCCTCCACGGATCCAA  1074

Query 1167  ---CAGAAAAAGAGGAAGAGGCGCGTGTATAAAGTGCGAACGTCTGAGACCTCGGATCCG---GC---------  1225
               |||||||||||||||.||||.|||||||.|.|||..|.|||||.|..||.||| |||   ||         
Sbjct 1075  CCCCAGAAAAAGAGGAAGCGGCGAGTGTATAGATTGCCCAGGTCTGGGGTCTTGGA-CCGAGAGCTCCCACTGC  1147

Query 1226  ----GT--CGGG-GCCTAGGGCCCCCAGCCGCCGCTCCAGCTCGTCGACGGATTCCGCGGAC----GCCAGCCC  1288
                ||  |||| |.||.||.|.||.|||||||||||||||||.||..|.||||||    ||    ||||||||
Sbjct 1148  CCAGGTTACGGGAGACTGGGACTCCTAGCCGCCGCTCCAGCTCTTCATCTGATTCC----ACCAGTGCCAGCCC  1217

Query 1289  TGTGCACGCCGCTGGCCCTGCCGGCGCCTACCACTCGGCGTCGGCAGAGTCCGTGGACGAGATTCCAGTGGCGC  1362
            .|||||.||.|.||||.||||.|||||||||.|||||||.||.||.||||||.||||.||||||||||||||.|
Sbjct 1218  AGTGCATGCTGGTGGCTCTGCAGGCGCCTACTACTCGGCATCAGCTGAGTCCATGGAAGAGATTCCAGTGGCCC  1291

Query 1363  AGACGCGCCTGGGCAGCGCCGCTCTGGCCGCCCCGCGGGGCC-GGGGCCGACAGCCCACGCTGGCGCGGCAGGC  1435
            ||||||||||||||||.|||||.||||..||||| .||.||| ||||.|||.||.|...||||||.|..|||||
Sbjct 1292  AGACGCGCCTGGGCAGTGCCGCACTGGGTGCCCC-AGGAGCCAGGGGTCGAGAGTCTGGGCTGGCTCTACAGGC  1364

Query 1436  GCGTGCGCCCGCCGTTTTCG-----------------------------------------------------  1455
            .|||.||||.||.|||||.|                                                     
Sbjct 1365  ACGTTCGCCTGCTGTTTTTGTGAGCCCGAGCAGTGGCGAGCCCGGAACACCTGGAGGCGGCGACGGCCTGCCT  1437