Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- TRCN0000477634
- Subject:
- XM_011248502.1
- Aligned Length:
- 1497
- Identities:
- 1131
- Gaps:
- 207
Alignment
Query 1 ATG-----TAC-------------AAGATGAACATCTGCAACAAGCCCTCCAACAAGACGGCCCCTGAGAAGAG 56
||| ||| .|||||||||||||||||||.||||||||||||||.|||||.||||||||
Sbjct 1 ATGCTCTCTACTCTTCTCCCTCTGGAGATGAACATCTGCAACAAACCCTCCAACAAGACAGCCCCCGAGAAGAG 74
Query 57 TGTGTGGACGGCACCGGCACAGCCCAGCGGACCCTCCCCTGAGCTGCAGGGCCAGCGATCCCGCCGGAATGGGT 130
|||||||||.||.||..|||||..|||.||.||.|||||.||.||||||||||||||.||.||..|||||||.|
Sbjct 75 TGTGTGGACAGCGCCCTCACAGGACAGTGGGCCTTCCCCAGAACTGCAGGGCCAGCGCTCTCGAAGGAATGGAT 148
Query 131 GGAGCTGGCCCCCTCACCCGCTCCAGATTGTGGCCTGGCTGCTGTACCTCTTCTTTGCTGTGATCGGCTTTGGG 204
||||||||||.||.|||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.||.|||||.|||||||||
Sbjct 149 GGAGCTGGCCGCCCCACCCGCTCCAGATTGTGGCCTGGCTGCTCTACCTCTTCTTCGCGGTGATTGGCTTTGGG 222
Query 205 ATCCTTGTTCCCCTCCTGCCTCACCACTGGGTGCCCGCTGGCTACGCTTGCATGGGCGCCATCTTTGCTGGCCA 278
.||||||||||||||.|||||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||.|||||||||||||||||
Sbjct 223 GTCCTTGTTCCCCTCTTGCCTCACCACTGGGTGCCTGCTGGCTATGCTTGCATGGGGGCCATCTTTGCTGGCCA 296
Query 279 CCTTGTGGTGCACCTGACCGCCGTCTCCATCGATCCAGCAGATGCCAACGTGCGGGACAAGAGCTATGCGGGGC 352
||||||||||||||||||.||.||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||..|.||||
Sbjct 297 CCTTGTGGTGCACCTGACTGCTGTCTCCATCGATCCAGCAGATGCCAATGTGCGGGACAAGAGCTACTCTGGGC 370
Query 353 CCCTGCCCATCTTCAACCGAAGCCAGCACGCACATGTCATTGAAGACCTGCACTGCAACTTGTGCAACGTGGAT 426
|||||||||||||||||||.||||||||.||.|||||||||||||||||||||||||||.|.|||.|||||||.
Sbjct 371 CCCTGCCCATCTTCAACCGCAGCCAGCATGCGCATGTCATTGAAGACCTGCACTGCAACCTATGCGACGTGGAC 444
Query 427 GTGAGCGCTCGCTCCAAGCACTGCAGCGCCTGCAACAAGTGCGTGTGCGGTTTCGACCACCACTGCAAGTGGCT 500
|||||.||.||.|||||.|||||||||||||||||.||||||||.|||||.|||||.|||||.|||||||||||
Sbjct 445 GTGAGTGCGCGATCCAAACACTGCAGCGCCTGCAATAAGTGCGTATGCGGCTTCGATCACCATTGCAAGTGGCT 518
Query 501 CAACAACTGTGTGGGCGAGCGGAACTACCGGCTCTTTCTACACAGTGTTGCATCCGCTTTACTGGGCGTCCTGC 574
|||||||||.|||||||||.|||||||.||||||||||||||||||||.|||||.||||||.||||.|||||||
Sbjct 519 CAACAACTGCGTGGGCGAGAGGAACTATCGGCTCTTTCTACACAGTGTGGCATCTGCTTTATTGGGTGTCCTGC 592
Query 575 TCCTGGTGCTGGTGGCCACATATGTCTTCGTGGAGTTCTTTGTCAACCCCATGCGTCTGCGCACCAACCGACAC 648
|||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||.|||||||.||||
Sbjct 593 TCCTGGTGCTGGTGGCCACTTATGTCTTCGTGGAGTTCTTTGTCAACCCCATGCGACTTCGTACCAACCAACAC 666
Query 649 TTTGAAGTCCTGAAGAATCACACGGATGTGTGGTTCGTGTTCCTGCCTGCCGCCCCCGTGGAGACCCAGGCCCC 722
|||||||||.|||||||.|||||||||||||||||.||||||.|||||||.|||||.||||||||||||||.||
Sbjct 667 TTTGAAGTCTTGAAGAACCACACGGATGTGTGGTTTGTGTTCTTGCCTGCTGCCCCTGTGGAGACCCAGGCTCC 740
Query 723 TGCCATCCTGGCCCTGGCCGCCCTGCTCATCCTTCTGGGCCTCCTGTCCACAGCCCTCCTGGGGCACCTGCTCT 796
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||.||||||||.||.||.||||||||||
Sbjct 741 TGCCATCCTGGCCCTGGCCGCCCTGCTCATCCTTCTGGGCCTGCTTTCTACAGCCCTGCTTGGCCACCTGCTCT 814
Query 797 GCTTCCACATTTATCTCATGTGGCACAAGCTCACCACCTATGAGTACATCGTGCAGCACCGCCCACCACAGGAG 870
||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.|||.|.|||||.
Sbjct 815 GCTTCCACATTTATCTAATGTGGCACAAGCTCACCACCTATGAATACATCGTGCAGCACCGTCCAGCTCAGGAA 888
Query 871 GCCAAGGGGGTTCACAGGGAGCTCGAGTCATGTCCTCCCAAGATGCGGCCCATTCAGGAGATGGAGTTCTACAT 944
||.||||.|...||||.||||||.||||||||.||.|.||||.|||||.|||||||||||||||||||||||||
Sbjct 889 GCAAAGGAGACCCACAAGGAGCTGGAGTCATGCCCCCGCAAGGTGCGGTCCATTCAGGAGATGGAGTTCTACAT 962
Query 945 GCGGACCTTCAGACATATGCGCCCAGAGCCCCCTGGCCAGGCCGGGCCAGCAGCAGTGAATGCCAAACACTCTC 1018
|.||||||||||.|||.||||.|||||||||.||||||||||..||.||||||||.|.||||||||
Sbjct 963 GAGGACCTTCAGCCATGTGCGTCCAGAGCCCTCTGGCCAGGCTAGGACAGCAGCATTAAATGCCAA-------- 1028
Query 1019 GCCCTGCCTCCCCGGATCCGACCCCAGGTAGGAGGGACTGTGCTGGGCCTCCGGTCCAGGTGGAGTGGGATAGA 1092
Sbjct 1029 -------------------------------------------------------------------------- 1028
Query 1093 AAGAAGCCTCTACCCTGGCGCTCGCCTCTGCTTCTTTTGGCGATGTGGGGCCCTCAGGCTCCCCCGTGTCTCTG 1166
Sbjct 1029 -------------------------------------------------------------------------- 1028
Query 1167 CAGAAAAAGAGGAAGAGGCGCGTGTATAAAGTGCGAACGTCTGAGACCTCGGATCCG---GC------------ 1225
||||||||||||.||||.|||||||.|.|||..|.|||||.|..||.||| ||| ||
Sbjct 1029 ---AAAAAGAGGAAGCGGCGAGTGTATAGATTGCCCAGGTCTGGGGTCTTGGA-CCGAGAGCTCCCACTGCCCA 1098
Query 1226 -GT--CGGG-GCCTAGGGCCCCCAGCCGCCGCTCCAGCTCGTCGACGGATTCCGCGGAC----GCCAGCCCTGT 1291
|| |||| |.||.||.|.||.|||||||||||||||||.||..|.|||||| || ||||||||.||
Sbjct 1099 GGTTACGGGAGACTGGGACTCCTAGCCGCCGCTCCAGCTCTTCATCTGATTCC----ACCAGTGCCAGCCCAGT 1168
Query 1292 GCACGCCGCTGGCCCTGCCGGCGCCTACCACTCGGCGTCGGCAGAGTCCGTGGACGAGATTCCAGTGGCGCAGA 1365
|||.||.|.||||.||||.|||||||||.|||||||.||.||.||||||.||||.||||||||||||||.||||
Sbjct 1169 GCATGCTGGTGGCTCTGCAGGCGCCTACTACTCGGCATCAGCTGAGTCCATGGAAGAGATTCCAGTGGCCCAGA 1242
Query 1366 CGCGCCTGGGCAGCGCCGCTCTGGCCGCCCCGCGGGGCC-GGGGCCGACAGCCCACGCTGGCGCGGCAGGCGCG 1438
|||||||||||||.|||||.||||..||||| .||.||| ||||.|||.||.|...||||||.|..|||||.||
Sbjct 1243 CGCGCCTGGGCAGTGCCGCACTGGGTGCCCC-AGGAGCCAGGGGTCGAGAGTCTGGGCTGGCTCTACAGGCACG 1315
Query 1439 TGCGCCCGCCGTTTTCG 1455
|.||||.||.|||||.|
Sbjct 1316 TTCGCCTGCTGTTTTTG 1332