Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000477687
• Subject: NM_010600.3
• Aligned Length: 2977
• Identities: 2555
• Gaps: 101

Alignment

Query    1  ATGACCATGGCTGGGGGCGATAGGGGACTAGTGGCCCCTCAAAACACGTTTCTGGAGAATATTGTTCGGCGGTC  74
            ||||||||||||||.|||....||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||.||.||.||||||||
Sbjct    1  ATGACCATGGCTGGCGGCCGGCGGGGACTAGTGGCCCCGCAGAACACGTTTCTGGAGAACATCGTGCGGCGGTC  74

Query   75  CAATGATACTAATTTTGTGTTGGGGAATGCTCAGATAGTGGACTGGCCTATTGTGTACAGCAATGATGGATTTT  148
            |||.||.|||||||||||||||||||||||.||||||||.||||||||.||.||||||||||||||||||||.|
Sbjct   75  CAACGACACTAATTTTGTGTTGGGGAATGCCCAGATAGTCGACTGGCCCATCGTGTACAGCAATGATGGATTCT  148

Query  149  GCAAGCTGTCTGGCTATCACAGGGCAGAAGTGATGCAAAAAAGCAGCACCTGCAGTTTTATGTATGGGGAGCTG  222
            ||||||||||||||||.|||.||||||||||||||||.|||||||||.|||||||||||||||||||.||||||
Sbjct  149  GCAAGCTGTCTGGCTACCACCGGGCAGAAGTGATGCAGAAAAGCAGCGCCTGCAGTTTTATGTATGGAGAGCTG  222

Query  223  ACTGATAAAGACACGATTGAAAAAGTGCGGCAAACATTTGAGAACTATGAGATGAATTCCTTTGAAATTCTGAT  296
            |||||.||.|||||..|||||||.||.||.||.||.|||||||||||.||||||||||||||.|||||||||||
Sbjct  223  ACTGACAAGGACACAGTTGAAAAGGTTCGCCAGACCTTTGAGAACTACGAGATGAATTCCTTCGAAATTCTGAT  296

Query  297  GTACAAGAAGAACAGGACACCTGTGTGGTTCTTTGTGAAAATTGCTCCAATTCGAAACGAACAGGATAAAGTGG  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.||.|||||.||..|.|||||||||||||||||||
Sbjct  297  GTACAAGAAGAACAGGACACCTGTGTGGTTTTTTGTGAAGATCGCTCCGATCAGGAACGAACAGGATAAAGTGG  370

Query  371  TTTTATTTCTTTGCACTTTCAGTGACATAACAGCTTTCAAACAGCCAATTGAGGATGATTCATGTAAAGGCTGG  444
            |..|.||.||||||||||||||.||||||||.||.|||||.|||||.||.|||||.||.||.||.|||||.|||
Sbjct  371  TCCTGTTCCTTTGCACTTTCAGCGACATAACTGCATTCAAGCAGCCCATCGAGGACGACTCCTGCAAAGGTTGG  444

Query  445  GGGAAGTTTGCTCGGCTGACAAGAGCACTGACAAGCAGCAGGGGTGTCCTGCAGCAGCTGGCTCCAAGCGTGCA  518
            |||||||||||.||.|||||.|||||.|||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||.||.||.||
Sbjct  445  GGGAAGTTTGCCCGACTGACCAGAGCTCTGACAAGCAGCAGGGGAGTCCTGCAGCAGCTGGCCCCCAGTGTACA  518

Query  519  AAAAGGCGAGAATGTCCACAAGCACTCCCGCCTGGCAGAGGTCCTACAGCTGGGCTCAGACATCCTTCCCCAGT  592
            .||.||.||||||||.|||||||||||.|||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||||
Sbjct  519  GAAGGGTGAGAATGTTCACAAGCACTCGCGCCTGGCAGAGGTCCTGCAGCTGGGTTCAGACATCCTTCCCCAGT  592

Query  593  ACAAGCAAGAGGCACCAAAGACTCCCCCTCACATCATCTTACATTATTGTGTTTTTAAGACCACGTGGGATTGG  666
            |||||||||||||.||||||||.|||||||||||||||.||||.||.|||||.|||||||||||||||||||||
Sbjct  593  ACAAGCAAGAGGCGCCAAAGACACCCCCTCACATCATCCTACACTACTGTGTCTTTAAGACCACGTGGGATTGG  666

Query  667  ATCATCTTGATCTTGACCTTCTATACAGCCATCTTGGTCCCTTATAATGTCTCCTTCAAAACCAGGCAGAATAA  740
            ||||||||||||.||||||||||.||||||||||||||||||||.||.||||||||.|||||||||||||||||
Sbjct  667  ATCATCTTGATCCTGACCTTCTACACAGCCATCTTGGTCCCTTACAACGTCTCCTTTAAAACCAGGCAGAATAA  740

Query  741  TGTGGCCTGGCTGGTTGTTGATAGCATCGTGGATGTTATCTTTTTGGTGGACATTGTGCTCAATTTTCATACCA  814
            |||||||||||||||.||.||.||||||||||||||.||||||||||||||||||||..|.||||||||.||||
Sbjct  741  TGTGGCCTGGCTGGTGGTGGACAGCATCGTGGATGTCATCTTTTTGGTGGACATTGTTTTGAATTTTCACACCA  814

Query  815  CCTTTGTTGGACCAGCAGGGGAGGTGATTTCTGACCCCAAACTTATCCGCATGAACTACCTGAAGACGTGGTTT  888
            |||||||.||.|||||.|||||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  CCTTTGTCGGGCCAGCGGGGGAAGTGATATCTGACCCCAAACTTATCCGCATGAACTACCTGAAGACGTGGTTT  888

Query  889  GTGATTGACCTTCTGTCCTGTTTGCCATATGATGTCATCAACGCTTTTGAGAACGTGGATG-------------  949
            |||||.||||||||||||||||||||.|||||.||||||||||||||||||||||||||||             
Sbjct  889  GTGATCGACCTTCTGTCCTGTTTGCCGTATGACGTCATCAACGCTTTTGAGAACGTGGATGAGGTTAGTGCCTT  962

Query  950  --------------------------------------------------------------------AGGGCA  955
                                                                                ||||||
Sbjct  963  TATGGGTGATCCAGGGAAGATTGGTTTTGCTGATCAGATCCCACCACCACTGGAGGGGAGAGAGAGTCAGGGCA  1036

Query  956  TCAGCAGCCTGTTCAGCTCTCTAAAAGTTGTCCGGCTGCTCCGTCTTGGGCGAGTGGCCCGTAAGCTGGACCAC  1029
            ||||||||||||||||.|||||.||||||||.||||||||||||||.||||||||||||||.||.|||||.||.
Sbjct 1037  TCAGCAGCCTGTTCAGTTCTCTGAAAGTTGTGCGGCTGCTCCGTCTCGGGCGAGTGGCCCGCAAACTGGATCAT  1110

Query 1030  TACATTGAATATGGAGCTGCTGTGCTGGTCCTGCTGGTGTGTGTGTTTGGGCTGGCTGCACACTGGATGGCCTG  1103
            |||||.||.||||||||.||.||.|||||||||.|||||||.|||||||||||.|||||.||||||||||||||
Sbjct 1111  TACATCGAGTATGGAGCCGCGGTACTGGTCCTGTTGGTGTGCGTGTTTGGGCTTGCTGCCCACTGGATGGCCTG  1184

Query 1104  CATCTGGTACAGCATTGGGGACTATGAGATCTTTGACGAGGACACCAAGACAATCCGCAACAACAGCTGGCTGT  1177
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||||||||.||||||||||||||||||||.|
Sbjct 1185  CATCTGGTACAGCATTGGGGACTATGAGATCTTTGATGAAGACACCAAGACCATCCGCAACAACAGCTGGCTCT  1258

Query 1178  ACCAACTAGCGATGGACATTGGCACCCCTTACCAGTTTAATGGGTCTGGCTCAGGGAAGTGGGAAGGTGGTCCC  1251
            |||||||.||..|||||||.|||||.||.||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.||.
Sbjct 1259  ACCAACTGGCATTGGACATCGGCACTCCATACCAGTTTAATGGGTCTGGTTCAGGGAAGTGGGAAGGTGGGCCA  1332

Query 1252  AGCAAGAATTCTGTCTACATCTCCTCGTTGTATTTCACAATGACCAGCCTCACCAGTGTGGGCTTTGGGAACAT  1325
            ||||||||.||||||||||||||||||.||||.|||||.|||||.||.||||||||||||||||||||.|||||
Sbjct 1333  AGCAAGAACTCTGTCTACATCTCCTCGCTGTACTTCACCATGACAAGTCTCACCAGTGTGGGCTTTGGTAACAT  1406

Query 1326  CGCCCCATCCACAGACATTGAGAAGATCTTTGCAGTGGCCATCATGATGATTGGCTCACTTCTCTATGCCACCA  1399
            .|||||||||||||||||.|||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||.||||||||||
Sbjct 1407  TGCCCCATCCACAGACATCGAGAAGATCTTCGCAGTGGCCATCATGATGATTGGCTCTCTTCTGTATGCCACCA  1480

Query 1400  TCTTCGGGAATGTGACGACTATTTTCCAACAGATGTATGCCAACACCAACAGATACCATGAGATGCTCAACAGT  1473
            ||||.|||||.|||||.||.||||||||.||||||||.||||||||||||||.|||||.|||||||||||||||
Sbjct 1481  TCTTTGGGAACGTGACAACCATTTTCCAGCAGATGTACGCCAACACCAACAGGTACCACGAGATGCTCAACAGT  1554

Query 1474  GTTCGGGACTTCCTGAAGCTCTACCAGGTGCCAAAAGGATTGAGTGAGCGAGTAATGGATTATATTGTGTCCAC  1547
            ||.|||||.|||||||||||||||||||||||.|||||..||||||||||.||.|||||.||.|||||||||||
Sbjct 1555  GTCCGGGATTTCCTGAAGCTCTACCAGGTGCCCAAAGGGCTGAGTGAGCGGGTCATGGACTACATTGTGTCCAC  1628

Query 1548  TTGGTCCATGTCCAGAGGCATTGACACAGAGAAGGTCCTGCAGATCTGCCCCAAGGACATGAGAGCCGACATCT  1621
            .||||||||||||.|||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||.|
Sbjct 1629  CTGGTCCATGTCCCGAGGCATCGACACAGAGAAGGTCCTGCAGATCTGCCCCAAGGACATGCGAGCCGACATTT  1702

Query 1622  GCGTGCACCTGAACCGCAAGGTGTTCAAGGAGCACCCGGCCTTCCGGCTGGCCAGTGATGGCTGCCTCCGGGCA  1695
            |||||||||||||||||||.||||||||.||.|||||.|||||.||..|||||||.|||||||||||.|||||.
Sbjct 1703  GCGTGCACCTGAACCGCAAAGTGTTCAAAGAACACCCTGCCTTTCGATTGGCCAGCGATGGCTGCCTGCGGGCC  1776

Query 1696  CTGGCCATGGAGTTCCAGACGGTGCACTGTGCCCCAGGGGACCTCATCTACCATGCAGGAGAGAGCGTTGACAG  1769
            .|||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.|||||.||||||||.||.|||||
Sbjct 1777  TTGGCCATGGAGTTCCAGACAGTGCACTGTGCCCCAGGGGACCTCATCTATCATGCTGGAGAGAGTGTGGACAG  1850

Query 1770  CCTCTGCTTTGTGGTTTCTGGCTCCCTGGAGGTGATCCAAGATGATGAGGTGGTGGCCATTCTAGGAAAAGGAG  1843
            |||||||||.|||||.||.||||||||||||||||||||.|||||.||||||||||||||.|||||.|||||||
Sbjct 1851  CCTCTGCTTCGTGGTCTCAGGCTCCCTGGAGGTGATCCAGGATGACGAGGTGGTGGCCATCCTAGGGAAAGGAG  1924

Query 1844  ACGTGTTTGGAGATGTGTTCTGGAAGGAAGCCACCCTTGCCCAGTCCTGTGCCAATGTTAGGGCCTTGACCTAC  1917
            ||||||||||.|||||.||||||||||||||.||||||||.|||||||||||.|||||..||||||||||||||
Sbjct 1925  ACGTGTTTGGGGATGTTTTCTGGAAGGAAGCTACCCTTGCACAGTCCTGTGCTAATGTCCGGGCCTTGACCTAC  1998

Query 1918  TGTGATCTGCATGTGATCAAGCGGGATGCCCTGCAGAAAGTGCTGGAATTCTACACGGCCTTCTCCCATTCCTT  1991
            |||||.|||||.|||||||||.||||.|||||.|||||||||||.|||||||||||.|||||||||||.|||||
Sbjct 1999  TGTGACCTGCACGTGATCAAGAGGGACGCCCTTCAGAAAGTGCTAGAATTCTACACAGCCTTCTCCCACTCCTT  2072

Query 1992  CTCCCGGAACCTGATTCTGACGTACAACTTGAGGAAGAGGATTGTGTTCCGGAAGATCAGCGACGTGAAACGTG  2065
            ||||||||||||||||||.||.||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|
Sbjct 2073  CTCCCGGAACCTGATTCTCACCTACAACCTGAGGAAGAGGATTGTGTTCCGGAAGATCAGCGACGTGAAACGAG  2146

Query 2066  AAGAGGAAGAACGCATGAAACGAAAGAATGAGGCCCCCCTGATCTTGCCCCCGGACCACCCTGTCCGGCGCCTC  2139
            |||||||.||..|.||||||||.|||||.|||||||||||.|||.||||.||.||||||||.|||.|..|.|||
Sbjct 2147  AAGAGGAGGAGAGGATGAAACGGAAGAACGAGGCCCCCCTTATCCTGCCTCCTGACCACCCCGTCAGAAGACTC  2220

Query 2140  TTCCAGAGATTCCGACAGCAGAAAGAGGCCAGGCTGGCAGCTGAGAGAGGGGGCCGGGACCTGGATGACCTAGA  2213
            |||||.||.|||||.|||||||||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||
Sbjct 2221  TTCCAAAGGTTCCGCCAGCAGAAAGAAGCCAGGCTGGCAGCCGAGAGAGGGGGCCGGGACCTGGATGACCTGGA  2294

Query 2214  TGTGGAGAAGGGCAATGTCCTTACAGAGCATGCCTCCGCCAACCACAGCCTCGTGAAGGCCAGCGTGGTCACCG  2287
            |||.||.||||||||||.|||.||.||.|||.||||.||||||||||||||.|||||||||||.||||||||.|
Sbjct 2295  TGTAGAAAAGGGCAATGCCCTCACGGACCATACCTCAGCCAACCACAGCCTGGTGAAGGCCAGTGTGGTCACGG  2368

Query 2288  TGCGTGAGAGTCCTGCCACGCCCGTATCCTTCCAGGCAGCCTCCACCTCCGGGGTGCCAGACCACGCAAAGCTA  2361
            ||||||||||.||.||||||||.||.|||||||||||.|||.||||||||....||.||||||||||.|||||.
Sbjct 2369  TGCGTGAGAGCCCCGCCACGCCTGTGTCCTTCCAGGCGGCCACCACCTCCACCATGTCAGACCACGCCAAGCTG  2442

Query 2362  CAGGCGCCAGGGTCCGAGTGCCTGGGCCCCAANTNGNTTGGGGGC----------GATTGTGCCAAGCGCAAAA  2425
            ||.||.||.||.||.||||||||.||.|||||          |||          ||...|||||||||||||.
Sbjct 2443  CATGCCCCCGGATCTGAGTGCCTAGGTCCCAA----------GGCAGTCAGCTGTGACCCTGCCAAGCGCAAAG  2506

Query 2426  GCTGGGCCCGCTTCAAAGATGCTTGCGGGAAGAGTGAGGACTGGAACAAGGTGTCCAAGGCTGAGTCGATGGAG  2499
            ||||||||||.|||||||||||.||.||.|||.|||||||.||||||||||||||||||||.|||||.||||||
Sbjct 2507  GCTGGGCCCGTTTCAAAGATGCCTGTGGAAAGGGTGAGGATTGGAACAAGGTGTCCAAGGCAGAGTCCATGGAG  2580

Query 2500  ACACTTCCCGAGAGGACAAAAGCGTCAGGCGAGGCCACACTGAAGAAGACAGACTCGTGTGACAGTGGCATCAC  2573
            ||.||.||||||||||||||.||..|.||.||||||||.|||||||||||||||||.||||||||.||.|||||
Sbjct 2581  ACGCTGCCCGAGAGGACAAAGGCACCGGGTGAGGCCACGCTGAAGAAGACAGACTCCTGTGACAGCGGAATCAC  2654

Query 2574  CAAGAGCGACTTGCGCCTGGACAACGTGGGTGAGGCCAGGAGTCCCCAGGATCGGAGTCCCATCCTGGCAGAGG  2647
            ||||||||||.|||||.|||||||.|||||||||.||||||||||.|||||.|||||.||||||.||||.||||
Sbjct 2655  CAAGAGCGACCTGCGCTTGGACAATGTGGGTGAGACCAGGAGTCCTCAGGACCGGAGCCCCATCTTGGCTGAGG  2728

Query 2648  TCAAGCATTCGTTCTACCCCATCCCTGAGCAGACGCTGCAGGCCACAGTCCTGGAGGTGAGGCACGAGCTGAAG  2721
            ||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||...|.|||||||||
Sbjct 2729  TCAAGCATTCTTTCTACCCCATCCCTGAGCAGACGCTGCAGGCCACAGTGCTGGAGGTGAAATATGAGCTGAAG  2802

Query 2722  GAGGACATCAAGGCCTTAAACGCCAAAATGACCAATATTGAGAAACAGCTCTCTGAGATACTCAGGATATTAAC  2795
            |||||.|||||||||||.||.||||||||||||...||||||||.|||||.||||||||||||||||||.|||.
Sbjct 2803  GAGGATATCAAGGCCTTGAATGCCAAAATGACCTCCATTGAGAAGCAGCTGTCTGAGATACTCAGGATACTAAT  2876

Query 2796  TTCCAGAAGATCCTCTCAGTCTCCTCAGGAGTTGTTTGAAATATCGAGGCCACAGTCCCCAGAATCAGAGAGAG  2869
            .||||||.|.|||.|.||.||||||||||||..|..|||.||.||.|||||.|||||||||||.|||||.||||
Sbjct 2877  GTCCAGAGGGTCCGCCCAATCTCCTCAGGAGACGGGTGAGATCTCCAGGCCCCAGTCCCCAGAGTCAGACAGAG  2950

Query 2870  ACATTTTTGGAGCCAGC  2886
            |||||||||||||.|||
Sbjct 2951  ACATTTTTGGAGCAAGC  2967