Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000477687
• Subject: NM_172362.3
• Aligned Length: 2967
• Identities: 2876
• Gaps: 81

Alignment

Query    1  ATGACCATGGCTGGGGGCGATAGGGGACTAGTGGCCCCTCAAAACACGTTTCTGGAGAATATTGTTCGGCGGTC  74
            ||||||||||||||||||...|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGACCATGGCTGGGGGCAGGAGGGGACTAGTGGCCCCTCAAAACACGTTTCTGGAGAATATTGTTCGGCGGTC  74

Query   75  CAATGATACTAATTTTGTGTTGGGGAATGCTCAGATAGTGGACTGGCCTATTGTGTACAGCAATGATGGATTTT  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  CAATGATACTAATTTTGTGTTGGGGAATGCTCAGATAGTGGACTGGCCTATTGTGTACAGCAATGATGGATTTT  148

Query  149  GCAAGCTGTCTGGCTATCACAGGGCAGAAGTGATGCAAAAAAGCAGCACCTGCAGTTTTATGTATGGGGAGCTG  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  GCAAGCTGTCTGGCTATCACAGGGCAGAAGTGATGCAAAAAAGCAGCACCTGCAGTTTTATGTATGGGGAGCTG  222

Query  223  ACTGATAAAGACACGATTGAAAAAGTGCGGCAAACATTTGAGAACTATGAGATGAATTCCTTTGAAATTCTGAT  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  ACTGATAAAGACACGATTGAAAAAGTGCGGCAAACATTTGAGAACTATGAGATGAATTCCTTTGAAATTCTGAT  296

Query  297  GTACAAGAAGAACAGGACACCTGTGTGGTTCTTTGTGAAAATTGCTCCAATTCGAAACGAACAGGATAAAGTGG  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  GTACAAGAAGAACAGGACACCTGTGTGGTTCTTTGTGAAAATTGCTCCAATTCGAAACGAACAGGATAAAGTGG  370

Query  371  TTTTATTTCTTTGCACTTTCAGTGACATAACAGCTTTCAAACAGCCAATTGAGGATGATTCATGTAAAGGCTGG  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  TTTTATTTCTTTGCACTTTCAGTGACATAACAGCTTTCAAACAGCCAATTGAGGATGATTCATGTAAAGGCTGG  444

Query  445  GGGAAGTTTGCTCGGCTGACAAGAGCACTGACAAGCAGCAGGGGTGTCCTGCAGCAGCTGGCTCCAAGCGTGCA  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  GGGAAGTTTGCTCGGCTGACAAGAGCACTGACAAGCAGCAGGGGTGTCCTGCAGCAGCTGGCTCCAAGCGTGCA  518

Query  519  AAAAGGCGAGAATGTCCACAAGCACTCCCGCCTGGCAGAGGTCCTACAGCTGGGCTCAGACATCCTTCCCCAGT  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  AAAAGGCGAGAATGTCCACAAGCACTCCCGCCTGGCAGAGGTCCTACAGCTGGGCTCAGACATCCTTCCCCAGT  592

Query  593  ACAAGCAAGAGGCACCAAAGACTCCCCCTCACATCATCTTACATTATTGTGTTTTTAAGACCACGTGGGATTGG  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  ACAAGCAAGAGGCACCAAAGACTCCCCCTCACATCATCTTACATTATTGTGTTTTTAAGACCACGTGGGATTGG  666

Query  667  ATCATCTTGATCTTGACCTTCTATACAGCCATCTTGGTCCCTTATAATGTCTCCTTCAAAACCAGGCAGAATAA  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  ATCATCTTGATCTTGACCTTCTATACAGCCATCTTGGTCCCTTATAATGTCTCCTTCAAAACCAGGCAGAATAA  740

Query  741  TGTGGCCTGGCTGGTTGTTGATAGCATCGTGGATGTTATCTTTTTGGTGGACATTGTGCTCAATTTTCATACCA  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  TGTGGCCTGGCTGGTTGTTGATAGCATCGTGGATGTTATCTTTTTGGTGGACATTGTGCTCAATTTTCATACCA  814

Query  815  CCTTTGTTGGACCAGCAGGGGAGGTGATTTCTGACCCCAAACTTATCCGCATGAACTACCTGAAGACGTGGTTT  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  CCTTTGTTGGACCAGCAGGGGAGGTGATTTCTGACCCCAAACTTATCCGCATGAACTACCTGAAGACGTGGTTT  888

Query  889  GTGATTGACCTTCTGTCCTGTTTGCCATATGATGTCATCAACGCTTTTGAGAACGTGGATG-------------  949
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||             
Sbjct  889  GTGATTGACCTTCTGTCCTGTTTGCCATATGATGTCATCAACGCTTTTGAGAACGTGGATGAGGTTAGTGCCTT  962

Query  950  --------------------------------------------------------------------AGGGCA  955
                                                                                ||||||
Sbjct  963  TATGGGTGATCCAGGGAAGATTGGTTTTGCTGATCAGATTCCACCACCACTGGAGGGGAGAGAGAGTCAGGGCA  1036

Query  956  TCAGCAGCCTGTTCAGCTCTCTAAAAGTTGTCCGGCTGCTCCGTCTTGGGCGAGTGGCCCGTAAGCTGGACCAC  1029
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  TCAGCAGCCTGTTCAGCTCTCTAAAAGTTGTCCGGCTGCTCCGTCTTGGGCGAGTGGCCCGTAAGCTGGACCAC  1110

Query 1030  TACATTGAATATGGAGCTGCTGTGCTGGTCCTGCTGGTGTGTGTGTTTGGGCTGGCTGCACACTGGATGGCCTG  1103
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  TACATTGAATATGGAGCTGCTGTGCTGGTCCTGCTGGTGTGTGTGTTTGGGCTGGCTGCACACTGGATGGCCTG  1184

Query 1104  CATCTGGTACAGCATTGGGGACTATGAGATCTTTGACGAGGACACCAAGACAATCCGCAACAACAGCTGGCTGT  1177
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  CATCTGGTACAGCATTGGGGACTATGAGATCTTTGACGAGGACACCAAGACAATCCGCAACAACAGCTGGCTGT  1258

Query 1178  ACCAACTAGCGATGGACATTGGCACCCCTTACCAGTTTAATGGGTCTGGCTCAGGGAAGTGGGAAGGTGGTCCC  1251
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  ACCAACTAGCGATGGACATTGGCACCCCTTACCAGTTTAATGGGTCTGGCTCAGGGAAGTGGGAAGGTGGTCCC  1332

Query 1252  AGCAAGAATTCTGTCTACATCTCCTCGTTGTATTTCACAATGACCAGCCTCACCAGTGTGGGCTTTGGGAACAT  1325
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333  AGCAAGAATTCTGTCTACATCTCCTCGTTGTATTTCACAATGACCAGCCTCACCAGTGTGGGCTTTGGGAACAT  1406

Query 1326  CGCCCCATCCACAGACATTGAGAAGATCTTTGCAGTGGCCATCATGATGATTGGCTCACTTCTCTATGCCACCA  1399
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407  CGCCCCATCCACAGACATTGAGAAGATCTTTGCAGTGGCCATCATGATGATTGGCTCACTTCTCTATGCCACCA  1480

Query 1400  TCTTCGGGAATGTGACGACTATTTTCCAACAGATGTATGCCAACACCAACAGATACCATGAGATGCTCAACAGT  1473
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481  TCTTCGGGAATGTGACGACTATTTTCCAACAGATGTATGCCAACACCAACAGATACCATGAGATGCTCAACAGT  1554

Query 1474  GTTCGGGACTTCCTGAAGCTCTACCAGGTGCCAAAAGGATTGAGTGAGCGAGTAATGGATTATATTGTGTCCAC  1547
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555  GTTCGGGACTTCCTGAAGCTCTACCAGGTGCCAAAAGGATTGAGTGAGCGAGTAATGGATTATATTGTGTCCAC  1628

Query 1548  TTGGTCCATGTCCAGAGGCATTGACACAGAGAAGGTCCTGCAGATCTGCCCCAAGGACATGAGAGCCGACATCT  1621
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629  TTGGTCCATGTCCAGAGGCATTGACACAGAGAAGGTCCTGCAGATCTGCCCCAAGGACATGAGAGCCGACATCT  1702

Query 1622  GCGTGCACCTGAACCGCAAGGTGTTCAAGGAGCACCCGGCCTTCCGGCTGGCCAGTGATGGCTGCCTCCGGGCA  1695
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1703  GCGTGCACCTGAACCGCAAGGTGTTCAAGGAGCACCCGGCCTTCCGGCTGGCCAGTGATGGCTGCCTCCGGGCA  1776

Query 1696  CTGGCCATGGAGTTCCAGACGGTGCACTGTGCCCCAGGGGACCTCATCTACCATGCAGGAGAGAGCGTTGACAG  1769
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1777  CTGGCCATGGAGTTCCAGACGGTGCACTGTGCCCCAGGGGACCTCATCTACCATGCAGGAGAGAGCGTTGACAG  1850

Query 1770  CCTCTGCTTTGTGGTTTCTGGCTCCCTGGAGGTGATCCAAGATGATGAGGTGGTGGCCATTCTAGGAAAAGGAG  1843
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1851  CCTCTGCTTTGTGGTTTCTGGCTCCCTGGAGGTGATCCAAGATGATGAGGTGGTGGCCATTCTAGGAAAAGGAG  1924

Query 1844  ACGTGTTTGGAGATGTGTTCTGGAAGGAAGCCACCCTTGCCCAGTCCTGTGCCAATGTTAGGGCCTTGACCTAC  1917
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1925  ACGTGTTTGGAGATGTGTTCTGGAAGGAAGCCACCCTTGCCCAGTCCTGTGCCAATGTTAGGGCCTTGACCTAC  1998

Query 1918  TGTGATCTGCATGTGATCAAGCGGGATGCCCTGCAGAAAGTGCTGGAATTCTACACGGCCTTCTCCCATTCCTT  1991
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1999  TGTGATCTGCATGTGATCAAGCGGGATGCCCTGCAGAAAGTGCTGGAATTCTACACGGCCTTCTCCCATTCCTT  2072

Query 1992  CTCCCGGAACCTGATTCTGACGTACAACTTGAGGAAGAGGATTGTGTTCCGGAAGATCAGCGACGTGAAACGTG  2065
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||
Sbjct 2073  CTCCCGGAACCTGATTCTGACGTACAACTTGAGGAAGAGGATTGTGTTCCGGAAGATCAGCGATGTGAAACGTG  2146

Query 2066  AAGAGGAAGAACGCATGAAACGAAAGAATGAGGCCCCCCTGATCTTGCCCCCGGACCACCCTGTCCGGCGCCTC  2139
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2147  AAGAGGAAGAACGCATGAAACGAAAGAATGAGGCCCCCCTGATCTTGCCCCCGGACCACCCTGTCCGGCGCCTC  2220

Query 2140  TTCCAGAGATTCCGACAGCAGAAAGAGGCCAGGCTGGCAGCTGAGAGAGGGGGCCGGGACCTGGATGACCTAGA  2213
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2221  TTCCAGAGATTCCGACAGCAGAAAGAGGCCAGGCTGGCAGCTGAGAGAGGGGGCCGGGACCTGGATGACCTAGA  2294

Query 2214  TGTGGAGAAGGGCAATGTCCTTACAGAGCATGCCTCCGCCAACCACAGCCTCGTGAAGGCCAGCGTGGTCACCG  2287
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2295  TGTGGAGAAGGGCAATGTCCTTACAGAGCATGCCTCCGCCAACCACAGCCTCGTGAAGGCCAGCGTGGTCACCG  2368

Query 2288  TGCGTGAGAGTCCTGCCACGCCCGTATCCTTCCAGGCAGCCTCCACCTCCGGGGTGCCAGACCACGCAAAGCTA  2361
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2369  TGCGTGAGAGTCCTGCCACGCCCGTATCCTTCCAGGCAGCCTCCACCTCCGGGGTGCCAGACCACGCAAAGCTA  2442

Query 2362  CAGGCGCCAGGGTCCGAGTGCCTGGGCCCCAANTNGNTTGGGGGCGATTGTGCCAAGCGCAAAAGCTGGGCCCG  2435
            ||||||||||||||||||||||||||||||||...|...|||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2443  CAGGCGCCAGGGTCCGAGTGCCTGGGCCCCAAGGGGGGCGGGGGCGATTGTGCCAAGCGCAAAAGCTGGGCCCG  2516

Query 2436  CTTCAAAGATGCTTGCGGGAAGAGTGAGGACTGGAACAAGGTGTCCAAGGCTGAGTCGATGGAGACACTTCCCG  2509
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2517  CTTCAAAGATGCTTGCGGGAAGAGTGAGGACTGGAACAAGGTGTCCAAGGCTGAGTCGATGGAGACACTTCCCG  2590

Query 2510  AGAGGACAAAAGCGTCAGGCGAGGCCACACTGAAGAAGACAGACTCGTGTGACAGTGGCATCACCAAGAGCGAC  2583
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2591  AGAGGACAAAAGCGTCAGGCGAGGCCACACTGAAGAAGACAGACTCGTGTGACAGTGGCATCACCAAGAGCGAC  2664

Query 2584  TTGCGCCTGGACAACGTGGGTGAGGCCAGGAGTCCCCAGGATCGGAGTCCCATCCTGGCAGAGGTCAAGCATTC  2657
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2665  TTGCGCCTGGACAACGTGGGTGAGGCCAGGAGTCCCCAGGATCGGAGTCCCATCCTGGCAGAGGTCAAGCATTC  2738

Query 2658  GTTCTACCCCATCCCTGAGCAGACGCTGCAGGCCACAGTCCTGGAGGTGAGGCACGAGCTGAAGGAGGACATCA  2731
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2739  GTTCTACCCCATCCCTGAGCAGACGCTGCAGGCCACAGTCCTGGAGGTGAGGCACGAGCTGAAGGAGGACATCA  2812

Query 2732  AGGCCTTAAACGCCAAAATGACCAATATTGAGAAACAGCTCTCTGAGATACTCAGGATATTAACTTCCAGAAGA  2805
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2813  AGGCCTTAAACGCCAAAATGACCAATATTGAGAAACAGCTCTCTGAGATACTCAGGATATTAACTTCCAGAAGA  2886

Query 2806  TCCTCTCAGTCTCCTCAGGAGTTGTTTGAAATATCGAGGCCACAGTCCCCAGAATCAGAGAGAGACATTTTTGG  2879
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2887  TCCTCTCAGTCTCCTCAGGAGTTGTTTGAAATATCGAGGCCACAGTCCCCAGAATCAGAGAGAGACATTTTTGG  2960

Query 2880  AGCCAGC  2886
            |||||||
Sbjct 2961  AGCCAGC  2967