Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000477726
• Subject: XM_011521247.2
• Aligned Length: 1132
• Identities: 1088
• Gaps: 37

Alignment

Query    1  ----------------------ATGCATCT--------------AAGGCGAGTTAGAACCATGCCCCGACACAG  38
                                  .|.|.|||              |||||||||.||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGGCCCAACGGAGCACTGTATTTCCTTCTCGTGTCACCAAGGAAAGGCGAGTGAGAACCATGCCCCGACACAG  74

Query   39  CCAGTCCCTGACAATGGCACCATACTCATCTGTAAGCCTCGTGGAGCAGCTGGAAGACAGGATCCTCTGCCATG  112
            ||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  CCAGTCCCTGACCATGGCACCATACTCATCTGTAAGCCTCGTGGAGCAGCTGGAAGACAGGATCCTCTGCCATG  148

Query  113  AGAAAACCACCGCCGCCCTCGTAGAGCACGCCTTTCGGATTAAAGATGACATTGTCAACAGTTTGCAGAAAATG  186
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  AGAAAACCACCGCCGCCCTCGTAGAGCACGCCTTTCGGATTAAAGATGACATTGTCAACAGTTTGCAGAAAATG  222

Query  187  CAAAACAAAGGGGGAGGTGACCGCTTGGCCAGGCTTTTCTTGGAGGAGCATATCAGAAACATAACTGCCATAGT  260
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  CAAAACAAAGGGGGAGGTGACCGCTTGGCCAGGCTTTTCTTGGAGGAGCATATCAGAAACATAACTGCCATAGT  296

Query  261  GAAGCAACTTAATCGGGATATCGAGGTACTCCAGGAGCAGATTCGTGCTCGGGACAACATTAGCTATGGAACTA  334
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  GAAGCAACTTAATCGGGATATCGAGGTACTCCAGGAGCAGATTCGTGCCCGGGACAACATTAGCTATGGAACTA  370

Query  335  ATTCTGCCTTAAAGACCCTGGAGATGCGCCAGCTCTCCGGTTTGGGAGATCTTCGAGGAAGAGTGGCAAGATGT  408
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  ATTCTGCCTTAAAGACCCTGGAGATGCGCCAGCTCTCCGGTTTGGGAGATCTTCGAGGAAGAGTGGCAAGATGT  444

Query  409  GATGCCAGCATAGCTAGACTTTCTGCAGAGCACAAAACGACCTATGAGGGGCTCCAGCACTTGAACAAAGAACA  482
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  GATGCCAGCATAGCTAGACTTTCTGCAGAGCACAAAACGACCTATGAGGGGCTCCAGCACTTGAACAAAGAACA  518

Query  483  GCAGGCTGCCAAACTTATCTTGGAAACGAAAATCAAAGATGCAGAGGGACAGATTTCTCAGCTTTTGAACAGAG  556
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  GCAGGCTGCCAAACTTATCTTGGAAACGAAAATCAAAGATGCAGAGGGACAGATTTCTCAGCTTTTGAACAGAG  592

Query  557  TGGACTTGTCAATATCAGAGCAGAGCACCAAACTGAAGATGTCTCACAGAGACAGTAACCACCAGCTTCAGCTT  630
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  TGGACTTGTCAATATCAGAGCAGAGCACCAAACTGAAGATGTCTCACAGAGACAGTAACCACCAGCTTCAGCTT  666

Query  631  TTGGACACTAAATTTAAAGGTACAGTTGAGGAACTCAGTAACCAGATATTATCTGCACGGAGTTGGTTGCAACA  704
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  TTGGACACTAAATTTAAAGGTACAGTTGAGGAACTCAGTAACCAGATATTATCTGCACGGAGTTGGTTGCAACA  740

Query  705  GGAACAAGAACGGATAGAAAAAAGAGCTTTTACAGAAAATTGATCAGCTTTCCTTGATTGTTAAGGAAAACAGT  778
            ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  GGAACAAGAACGGATAG-AAAAAGAGCTTTTACAGAAAATTGATCAGCTTTCCTTGATTGTTAAGGAAAACAGT  813

Query  779  GGAGCCAGTGAAAGGGATATGGAGAAGAAGCTCAGCCAGATGTCAGCCAGGCTTGACAAAATAGAAGAGGGTCA  852
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  814  GGAGCCAGTGAAAGGGATATGGAGAAGAAGCTCAGCCAGATGTCAGCCAGGCTTGACAAAATAGAAGAGGGTCA  887

Query  853  AAAGAAGACTTTTGATGGTCAGAGAACAAGGCAAGAAGAGGAGAAGATGCACGGGCGAATCACCAAGCTGGAGT  926
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  888  AAAGAAGACTTTTGATGGTCAGAGAACAAGGCAAGAAGAGGAGAAGATGCACGGGCGAATCACCAAGCTGGAGT  961

Query  927  TACAGATGAACCAGAACATCAAGGAAATGAAAGCAGAAGTTAATGCTGGGTTTACAGCCGTCTATGAAAGCATA  1000
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  962  TACAGATGAACCAGAACATCAAGGAAATGAAAGCAGAAGTTAATGCTGGGTTTACAGCCGTCTATGAAAGCATA  1035

Query 1001  GGATCCATCAGGCAAGTTCTCGAGGCCAAGATGAAGCTGGACAGGGACCAGCTACAGAAGCAAATCCAGCTGAT  1074
            ||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1036  GGATCCCTCAGGCAAGTTCTCGAGGCCAAGATGAAGCTGGACAGGGACCAGCTACAGAAGCAAATCCAGCTGAT  1109

Query 1075  GCAGAAGCCAGAGACCCCCATG  1096
            ||||||||||||||||||||||
Sbjct 1110  GCAGAAGCCAGAGACCCCCATG  1131