Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000477726
• Subject: XM_011521250.2
• Aligned Length: 1105
• Identities: 1091
• Gaps: 10

Alignment

Query    1  ---------ATGCATCTAAGGCGAGTTAGAACCATGCCCCGACACAGCCAGTCCCTGACAATGGCACCATACTC  65
                     |||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||
Sbjct    1  ATGGAAAATATGCATCTAAGGCGAGTGAGAACCATGCCCCGACACAGCCAGTCCCTGACCATGGCACCATACTC  74

Query   66  ATCTGTAAGCCTCGTGGAGCAGCTGGAAGACAGGATCCTCTGCCATGAGAAAACCACCGCCGCCCTCGTAGAGC  139
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  ATCTGTAAGCCTCGTGGAGCAGCTGGAAGACAGGATCCTCTGCCATGAGAAAACCACCGCCGCCCTCGTAGAGC  148

Query  140  ACGCCTTTCGGATTAAAGATGACATTGTCAACAGTTTGCAGAAAATGCAAAACAAAGGGGGAGGTGACCGCTTG  213
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  ACGCCTTTCGGATTAAAGATGACATTGTCAACAGTTTGCAGAAAATGCAAAACAAAGGGGGAGGTGACCGCTTG  222

Query  214  GCCAGGCTTTTCTTGGAGGAGCATATCAGAAACATAACTGCCATAGTGAAGCAACTTAATCGGGATATCGAGGT  287
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  GCCAGGCTTTTCTTGGAGGAGCATATCAGAAACATAACTGCCATAGTGAAGCAACTTAATCGGGATATCGAGGT  296

Query  288  ACTCCAGGAGCAGATTCGTGCTCGGGACAACATTAGCTATGGAACTAATTCTGCCTTAAAGACCCTGGAGATGC  361
            |||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  ACTCCAGGAGCAGATTCGTGCCCGGGACAACATTAGCTATGGAACTAATTCTGCCTTAAAGACCCTGGAGATGC  370

Query  362  GCCAGCTCTCCGGTTTGGGAGATCTTCGAGGAAGAGTGGCAAGATGTGATGCCAGCATAGCTAGACTTTCTGCA  435
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  GCCAGCTCTCCGGTTTGGGAGATCTTCGAGGAAGAGTGGCAAGATGTGATGCCAGCATAGCTAGACTTTCTGCA  444

Query  436  GAGCACAAAACGACCTATGAGGGGCTCCAGCACTTGAACAAAGAACAGCAGGCTGCCAAACTTATCTTGGAAAC  509
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  GAGCACAAAACGACCTATGAGGGGCTCCAGCACTTGAACAAAGAACAGCAGGCTGCCAAACTTATCTTGGAAAC  518

Query  510  GAAAATCAAAGATGCAGAGGGACAGATTTCTCAGCTTTTGAACAGAGTGGACTTGTCAATATCAGAGCAGAGCA  583
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  GAAAATCAAAGATGCAGAGGGACAGATTTCTCAGCTTTTGAACAGAGTGGACTTGTCAATATCAGAGCAGAGCA  592

Query  584  CCAAACTGAAGATGTCTCACAGAGACAGTAACCACCAGCTTCAGCTTTTGGACACTAAATTTAAAGGTACAGTT  657
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  CCAAACTGAAGATGTCTCACAGAGACAGTAACCACCAGCTTCAGCTTTTGGACACTAAATTTAAAGGTACAGTT  666

Query  658  GAGGAACTCAGTAACCAGATATTATCTGCACGGAGTTGGTTGCAACAGGAACAAGAACGGATAGAAAAAAGAGC  731
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct  667  GAGGAACTCAGTAACCAGATATTATCTGCACGGAGTTGGTTGCAACAGGAACAAGAACGGATAG-AAAAAGAGC  739

Query  732  TTTTACAGAAAATTGATCAGCTTTCCTTGATTGTTAAGGAAAACAGTGGAGCCAGTGAAAGGGATATGGAGAAG  805
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  740  TTTTACAGAAAATTGATCAGCTTTCCTTGATTGTTAAGGAAAACAGTGGAGCCAGTGAAAGGGATATGGAGAAG  813

Query  806  AAGCTCAGCCAGATGTCAGCCAGGCTTGACAAAATAGAAGAGGGTCAAAAGAAGACTTTTGATGGTCAGAGAAC  879
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  814  AAGCTCAGCCAGATGTCAGCCAGGCTTGACAAAATAGAAGAGGGTCAAAAGAAGACTTTTGATGGTCAGAGAAC  887

Query  880  AAGGCAAGAAGAGGAGAAGATGCACGGGCGAATCACCAAGCTGGAGTTACAGATGAACCAGAACATCAAGGAAA  953
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  888  AAGGCAAGAAGAGGAGAAGATGCACGGGCGAATCACCAAGCTGGAGTTACAGATGAACCAGAACATCAAGGAAA  961

Query  954  TGAAAGCAGAAGTTAATGCTGGGTTTACAGCCGTCTATGAAAGCATAGGATCCATCAGGCAAGTTCTCGAGGCC  1027
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||
Sbjct  962  TGAAAGCAGAAGTTAATGCTGGGTTTACAGCCGTCTATGAAAGCATAGGATCCCTCAGGCAAGTTCTCGAGGCC  1035

Query 1028  AAGATGAAGCTGGACAGGGACCAGCTACAGAAGCAAATCCAGCTGATGCAGAAGCCAGAGACCCCCATG  1096
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1036  AAGATGAAGCTGGACAGGGACCAGCTACAGAAGCAAATCCAGCTGATGCAGAAGCCAGAGACCCCCATG  1104