Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- TRCN0000477739
- Subject:
- XM_017004721.1
- Aligned Length:
- 2122
- Identities:
- 1893
- Gaps:
- 227
Alignment
Query 1 ATGGAGTCTAAACCTTCAAGGATTCCAAGAAGAATTTCTGTTCAACCTTCCAGCTCCTTAAGTGCTAGGATGAT 74
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ATGGAGTCTAAACCTTCAAGGATTCCAAGAAGAATTTCTGTTCAACCTTCCAGCTCCTTAAGTGCTAGGATGAT 74
Query 75 GTCTGGAAGCAGAGGAAGTAGTTTAAATGATACCTATCACTCAAGAGACTCTTCATTTAGATTGGATTCTGAAT 148
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 75 GTCTGGAAGCAGAGGAAGTAGTTTAAATGATACCTATCACTCAAGAGACTCTTCATTTAGATTGGATTCTGAAT 148
Query 149 ATCAGTCTACATCAGCATCAGCATCTGCGTCACCATTTCAATCTGCATGGTATAGTGAATCTGAGATAACTCAG 222
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 149 ATCAGTCTACATCAGCATCAGCATCTGCGTCACCATTTCAATCTGCATGGTATAGTGAATCTGAGATAACTCAG 222
Query 223 GGAGCACGCTCAAGATCGCAGAACCAGCAACGGGATCATGATTCAAAAAGACCTAAACTTTCCTGTACAAACTG 296
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223 GGAGCACGCTCAAGATCGCAGAACCAGCAACGGGATCATGATTCAAAAAGACCTAAACTTTCCTGTACAAACTG 296
Query 297 TACTACCTCAGCTGGGAGAAATGTTGGAAATGGTTTAAACACATTATCAGATTCATCTTGGAGGCATAGTCAAG 370
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 297 TACTACCTCAGCTGGGAGAAATGTTGGAAATGGTTTAAACACATTATCAG------------------------ 346
Query 371 TTCCTAGATCTTCATCAATGGTACTTGGATCATTTGGAACAGACTTAATGAGAGAGAGGAGAGATTTGGAGAGA 444
Sbjct 347 -------------------------------------------------------------------------- 346
Query 445 AGAACAGATTCCTCTATTAGTAATCTTATGGATTATAGTCACCGAAGTGGTGATTTCACAACTTCATCATATGT 518
||||
Sbjct 347 ----------------------------------------------------------------------ATGT 350
Query 519 TCAAGACAGAGTTCCTTCATATTCACAAGGAGCAAGACCAAAAGAAAACTCAATGAGCACTTTACAGTTGAATA 592
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 351 TCAAGACAGAGTTCCTTCATATTCACAAGGAGCAAGACCAAAAGAAAACTCAATGAGCACTTTACAGTTGAATA 424
Query 593 CATCATCCACAAACCACCAATTGCCTTCTGAACATCAGACCATACTAAGTTCTAGGGATTCCAGAAATTCTTTA 666
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||
Sbjct 425 CATCATCCACAAACCACCAATTGCCTTCTGAACATCAGACCATACTAAGTTCTAGGGACTCCAGAAATTCTTTA 498
Query 667 AGATCAAATTTTTCTTCAAGAGAATCAGAATCTTCCCGAAGCAATACGCAGCCTGGATTTTCTTACAGTTCAAG 740
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 499 AGATCAAATTTTTCTTCAAGAGAATCAGAATCTTCCCGAAGCAATACGCAGCCTGGATTTTCTTACAGTTCAAG 572
Query 741 TAGAGATGAAGCCCCAATCATAAGCAATTCAGAAAGGGTTGTTTCATCTCAAAGACCATTTCAAGAATCTTCTG 814
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 573 TAGAGATGAAGCCCCAATCATAAGCAATTCAGAAAGGGTTGTTTCATCTCAAAGACCATTTCAAGAATCTTCTG 646
Query 815 ACAATGAAGGTAGGCGGACAACGAGGAGATTGCTGTCACGCATAGCTTCTAGCATGTCATCTACTTTTTTTTCA 888
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 647 ACAATGAAGGTAGGCGGACAACGAGGAGATTGCTGTCACGCATAGCTTCTAGCATGTCATCTACTTTTTTTTCA 720
Query 889 CGAAGATCTAGTCAGGATTCCTTGAATACAAGATCATTGAATTCTGAAAATTCTTACGTTTCTCCAAGAATCTT 962
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 721 CGAAGATCTAGTCAGGATTCCTTGAATACAAGATCATTGAATTCTGAAAATTCTTACGTTTCTCCAAGAATCTT 794
Query 963 GACAGCTTCACAGTCCCGTAGTAATGTACCATCAGCTTCTGAAGTTCCCGATAATAGGGCATCTGAAGCTTCTC 1036
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 795 GACAGCTTCACAGTCCCGTAGTAATGTACCATCAGCTTCTGAAGTTCCCGATAATAGGGCATCTGAAGCTTCTC 868
Query 1037 AGGGATTTCGATTTCTTAGGCGAAGATGGGGTTTGTCATCTCTTAGCCACAATCATAGCTCTGAGTCAGATTCA 1110
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 869 AGGGATTTCGATTTCTTAGGCGAAGATGGGGTTTGTCATCTCTTAGCCACAATCATAGCTCTGAGTCAGATTCA 942
Query 1111 GAAAATTTTAACCAAGAATCTGAAGGTAGAAATACAGGACCATGGTTATCTTCCTCACTTAGAAATAGATGCAC 1184
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 943 GAAAATTTTAACCAAGAATCTGAAGGTAGAAATACAGGACCATGGTTATCTTCCTCACTTAGAAATAGATGCAC 1016
Query 1185 ACCTTTGTTCTCTAGAAGGAGGCGAGAGGGAAGAGATGAATCTTCAAGGATACCTACCTCTGATACATCATCTA 1258
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1017 ACCTTTGTTCTCTAGAAGGAGGCGAGAGGGAAGAGATGAATCTTCAAGGATACCTACCTCTGATACATCATCTA 1090
Query 1259 GATCTCATATTTTTAGAAGAGAATCAAATGAAGTGGTTCACCTTGAAGCACAGAATGATCCTCTTGGAGCTGCT 1332
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1091 GATCTCATATTTTTAGAAGAGAATCAAATGAAGTGGTTCACCTTGAAGCACAGAATGATCCTCTTGGAGCTGCT 1164
Query 1333 GCCAACAGACCACAAGCATCTGCAGCATCAAGCAGTGCCACAACAGGTGGCTCTACATCAGATTCGGCTCAAGG 1406
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1165 GCCAACAGACCACAAGCATCTGCAGCATCAAGCAGTGCCACAACAGGTGGCTCTACATCAGATTCGGCTCAAGG 1238
Query 1407 TGGAAGAAATACAGGAATATCAGGGATTCTTCCTGGTTCCTTATTCCGGTTTGCAGTCCCCCCAGCACTTGGGA 1480
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||
Sbjct 1239 TGGAAGAAATACAGGAATATCAGGGATTCTTCCTGGTTCCTTATTCCGGTTTGCAGTCCCTCCAGCACTTGGGA 1312
Query 1481 GTAATTTGACCGACAATGTCATGATCACAGTAGATATTATTCCTTCAGGTTGGAATTCAGCTGATGGTAAAAGT 1554
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1313 GTAATTTGACCGACAATGTCATGATCACAGTAGATATTATTCCTTCAGGTTGGAATTCAGCTGATGGTAAAAGT 1386
Query 1555 GATAAAACTAAAAGTGCGCCTTCAAGAGATCCAGAAAGATTGCAGAAAATAAAAGAGAGCCTCCTTTTAGAGGA 1628
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1387 GATAAAACTAAAAGTGCGCCTTCAAGAGATCCAGAAAGATTGCAGAAAATAAAAGAGAGCCTCCTTTTAGAGGA 1460
Query 1629 CTCAGAAGAAGAAGAAGGTGACTTATGTAGAATTTGTCAAATGGCAGCTGCATCATCATCTAATTTGCTGATAG 1702
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1461 CTCAGAAGAAGAAGAAGGTGACTTATGTAGAATTTGTCAAATGGCAGCTGCATCATCATCTAATTTGCTGATAG 1534
Query 1703 AGCCATGCAAGTGCACAGGAAGTTTGCAGTATGTCCACCAAGACTGTATGAAAAAGTGGTTACAGGCCAAAATT 1776
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1535 AGCCATGCAAGTGCACAGGAAGTTTGCAGTATGTCCACCAAGACTGTATGAAAAAGTGGTTACAGGCCAAAATT 1608
Query 1777 AACTCTGGTTCTTCATTAGAAGCTGTAACCACCTGTGAACTATGTAAAGAGAAGTTGGAGCTTAACCTGGAGGA 1850
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1609 AACTCTGGTTCTTCATTAGAAGCTGTAACCACCTGTGAACTATGTAAAGAGAAGTTGGAGCTTAACCTGGAGGA 1682
Query 1851 TTTTGATATTCATGAACTACATAGAGCTCATGCAAATGAACAAGCTGAGTATGAGTTTATCAGCTCTGGTCTCT 1924
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1683 TTTTGATATTCATGAACTACATAGAGCTCATGCAAATGAACAAGCTGAGTATGAGTTTATCAGCTCTGGTCTCT 1756
Query 1925 ACCTAGTGGTGTTATTGCACTTGTGCGAACAAAGCTTTTCTGATATGATGGGAAATACAAATGAACCAAGCACA 1998
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1757 ACCTAGTGGTGTTATTGCACTTGTGCGAACAAAGCTTTTCTGATATGATGGGAAATACAAATGAACCAAGCACA 1830
Query 1999 CGTGTCCGATTTATTAACCTTGCAAGAACTCTTCAGGCACATATGGAAGATCTCGAAACTTCAGAGGATGATTC 2072
|||||||| |||||||||||||||||
Sbjct 1831 CGTGTCCG-------------------------------------------------ACTTCAGAGGATGATTC 1855
Query 2073 CGAAGAAGACGGAGACCATAACAGGACATTTGATATTGCC---------- 2112
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1856 CGAAGAAGACGGAGACCATAACAGGACATTTGATATTGCCTAACTTCATA 1905