Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000477741
• Subject: XM_005247571.3
• Aligned Length: 1731
• Identities: 1509
• Gaps: 222

Alignment

Query    1  ATGAACCCCGTGAATGCTACTGCTCTCTACATTTCCGCGAGCCGCCTAGTGCTCAACTACGACCCCGGAGACCC  74
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query   75  CAAGGCGTTTACTGAGATTAACAGGCTCTTGCCTTACTTCCGACAGTCCCTTTCGTGCTGTGTTTGCGGACATT  148
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  149  TGCTACAAGATCCTATTGCACCCACCAACTCCACCTGCCAACATTATGTCTGCAAAACTTGTAAAGGCAAGAAA  222
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  223  ATGATGATGAAACCTTCCTGTAGCTGGTGCAAAGACTATGAGCAGTTTGAGGAAAACAAGCAGTTAAGCATCCT  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGATGATGAAACCTTCCTGTAGCTGGTGCAAAGACTATGAGCAGTTTGAGGAAAACAAGCAGTTAAGCATCCT  74

Query  297  AGTGAACTGCTACAAAAAACTATGCGAGTATATAACACAGACTACACTGGCACGGGATATAATAGAAGCAGTTG  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  AGTGAACTGCTACAAAAAACTATGCGAGTATATAACACAGACTACACTGGCACGGGATATAATAGAAGCAGTTG  148

Query  371  ACTGTTCTTCTGATATTTTGGCTTTGCTTAATGATGGATCATTGTTTTGTGAGGAGACAGAAAAACCCTCAGAT  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  ACTGTTCTTCTGATATTTTGGCTTTGCTTAATGATGGATCATTGTTTTGTGAGGAGACAGAAAAACCCTCAGAT  222

Query  445  TCATCCTTTACTTTGTGTTTGACACATTCCCCTTTACCTTCAACCTCAGAACCCACAACTGATCCTCAAGCTAG  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  TCATCCTTTACTTTGTGTTTGACACATTCCCCTTTACCTTCAACCTCAGAACCCACAACTGATCCTCAAGCTAG  296

Query  519  TTTATCTCCAATGTCTGAAAGCACCCTCAGCATTGCTATTGGCAGTTCTGTTATCAATGGTTTGCCTACTTATA  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  TTTATCTCCAATGTCTGAAAGCACCCTCAGCATTGCTATTGGCAGTTCTGTTATCAATGGTTTGCCTACTTATA  370

Query  593  ATGGGCTTTCAATAGATAGATTTGGTATAAATATTCCTTCACCTGAACATTCAAATACGATTGACGTATGTAAT  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  ATGGGCTTTCAATAGATAGATTTGGTATAAATATTCCTTCACCTGAACATTCAAATACGATTGACGTATGTAAT  444

Query  667  ACTGTTGACATAAAAACTGAGGATCTGTCTGACAGCCTGCCACCCGTTTGTGACACAGTAGCCACTGACTTATG  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  ACTGTTGACATAAAAACTGAGGATCTGTCTGACAGCCTGCCACCCGTTTGTGACACAGTAGCCACTGACTTATG  518

Query  741  TTCCACAGGCATTGATATCTGCAGTTTCAGTGAAGATATAAAACCTGGAGACTCTCTGTTACTGAGTGTTGAGG  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  TTCCACAGGCATTGATATCTGCAGTTTCAGTGAAGATATAAAACCTGGAGACTCTCTGTTACTGAGTGTTGAGG  592

Query  815  AAGTACTCCGCAGCTTAGAAACTGTTTCAAATACAGAGGTCTGTTGCCCTAATTTGCAGCCGAACTTGGAAGCC  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  AAGTACTCCGCAGCTTAGAAACTGTTTCAAATACAGAGGTCTGTTGCCCTAATTTGCAGCCGAACTTGGAAGCC  666

Query  889  ACTGTATCCAATGGACCTTTTCTGCAGCTTTCTTCCCAGTCTCTTAGCCATAATGTTTTTATGTCCACCAGTCC  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  ACTGTATCCAATGGACCTTTTCTGCAGCTTTCTTCCCAGTCTCTTAGCCATAATGTTTTTATGTCCACCAGTCC  740

Query  963  TGCACTTCATGGGTTATCATGTACAGCAGCAACTCCGAAGATAGCAAAATTGAATAGAAAACGATCCAGATCAG  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  TGCACTTCATGGGTTATCATGTACAGCAGCAACTCCGAAGATAGCAAAATTGAATAGAAAACGATCCAGATCAG  814

Query 1037  AGAGTGACAGTGAGAAAGTTCAGCCACTTCCAATTTCTACCATTATCCGAGGCCCAACACTGGGGGCATCTGCT  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  AGAGTGACAGTGAGAAAGTTCAGCCACTTCCAATTTCTACCATTATCCGAGGCCCAACACTGGGGGCATCTGCT  888

Query 1111  CCTGTGACAGTGAAACGGGAGAGCAAAATTTCTCTTCAACCTATAGCAACTGTTCCCAATGGAGGCACAACACC  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  CCTGTGACAGTGAAACGGGAGAGCAAAATTTCTCTTCAACCTATAGCAACTGTTCCCAATGGAGGCACAACACC  962

Query 1185  TAAAATCAGCAAAACTGTACTTTTATCTACTAAAAGCATGAAAAAGAGTCATGAACATGGATCCAAGAAATCTC  1258
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  TAAAATCAGCAAAACTGTACTTTTATCTACTAAAAGCATGAAAAAGAGTCATGAACATGGATCCAAGAAATCTC  1036

Query 1259  ACTCTAAAACCAAGCCAGGTATTCTTAAAAAAGACAAAGCAGTAAAGGAAAAGATTCCTAGTCATCATTTTATG  1332
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  ACTCTAAAACCAAGCCAGGTATTCTTAAAAAAGACAAAGCAGTAAAGGAAAAGATTCCTAGTCATCATTTTATG  1110

Query 1333  CCAGGAAGTCCTACCAAGACTGTGTACAAAAAACCCCAGGAAAAGAAAGGGTGTAAATGTGGGCGTGCTACTCA  1406
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  CCAGGAAGTCCTACCAAGACTGTGTACAAAAAACCCCAGGAAAAGAAAGGGTGTAAATGTGGGCGTGCTACTCA  1184

Query 1407  AAATCCAAGTGTTCTTACATGCCGAGGCCAACGCTGCCCTTGCTACTCTAACCGCAAAGCCTGCTTAGATTGTA  1480
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  AAATCCAAGTGTTCTTACATGCCGAGGCCAACGCTGCCCTTGCTACTCTAACCGCAAAGCCTGCTTAGATTGTA  1258

Query 1481  TATGTCGTGGCTGCCAAAACTCCTATATGGCCAATGGGGAGAAGAAGCTGGAGGCATTTGCCGTGCCAGAAAAG  1554
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  TATGTCGTGGCTGCCAAAACTCCTATATGGCCAATGGGGAGAAGAAGCTGGAGGCATTTGCCGTGCCAGAAAAG  1332

Query 1555  GCCTTGGAGCAGACCAGGCTCACTTTGGGCATTAACGTGACTAGCATTGCTGTGCGTAACGCTAGTACCAGCAC  1628
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333  GCCTTGGAGCAGACCAGGCTCACTTTGGGCATTAACGTGACTAGCATTGCTGTGCGTAACGCTAGTACCAGCAC  1406

Query 1629  CAGTGTAATAAATGTCACAGGGTCCCCAGTAACGACGTTTTTAGCTGCCAGTACACATGATGATAAAAGTTTGG  1702
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407  CAGTGTAATAAATGTCACAGGGTCCCCAGTAACGACGTTTTTAGCTGCCAGTACACATGATGATAAAAGTTTGG  1480

Query 1703  ATGAAGCTATAGACATGAGATTCGACTGT  1731
            |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481  ATGAAGCTATAGACATGAGATTCGACTGT  1509