Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000477743
• Subject: XM_011250584.2
• Aligned Length: 1237
• Identities: 1032
• Gaps: 17

Alignment

Query    1  ATGATAGGCATGTTGGAAAGTCTTCAGCATGAATCAGATCTCCTTCAGCATGATCAAATTCATACTGGAGAGAA  74
                     ||||||||.||.|||||||.|||.|||.||   ||||.||||||..||..|.||.|.|||||||.
Sbjct    1  ---------ATGTTGGAGAGCCTTCAGCCTGAGTCACAT---CTTCTGCATGACGAACCTGATCCCGGAGAGAG  62

Query   75  ACCTTATGAATGTAATGAATGTAGAAAAACTTTTAGCCTGAAGCAAAACCTTGTAGAGCATAAGAAAATGCATA  148
            ...||||||||||||||||||||...|.||.||.|||.||.|.||||||.|||||||.||||||||||.|||||
Sbjct   63  TGTTTATGAATGTAATGAATGTAAGGAGACCTTCAGCTTGGAACAAAACTTTGTAGAACATAAGAAAACGCATA  136

Query  149  CTGGAGAGAAATCTCATGAATGCACTGAATGTGGTAAAGTGTGCTCTCGAGTCTCATCTCTTACTCTACACCTT  222
            .|||||||||.||.|.|||.||.||.|..|||||..|||.||.|||.|.||.|||.||..|.||||||||.||.
Sbjct  137  GTGGAGAGAAGTCCCCTGAGTGTACAGGGTGTGGCGAAGAGTCCTCACAAGCCTCCTCATTAACTCTACATCTG  210

Query  223  AGAAGTCACACAGGAAAGAAGGCATATAAATGTAATAAATGTGGAAAAGCCTTCAGCCAGA-AGGAAAACTTCC  295
            |||||||.|.||.|.|.|.||.|.||.||.|||....|||||||.||.||||||||||||| ||| ||||||||
Sbjct  211  AGAAGTCGCCCAAGGAGGGAGTCCTACAAGTGTGGGGAATGTGGGAAGGCCTTCAGCCAGAGAGG-AAACTTCC  283

Query  296  TTTCTCATCAGAAACATCACACTGGAGAGAAACCTTATGAATGTGAAAAAGTTTCTATTCAGATGCCAACCATC  369
            ||||||||||||||||.||.||.|.|||||.|||...|||||.|.|.|||..|.|..|||..|||.||||||.|
Sbjct  284  TTTCTCATCAGAAACAACATACCGAAGAGAGACCCAGTGAATCTAAGAAAACTCCCGTTCCCATGACAACCACC  357

Query  370  ATCAGACACCAGAAAAATCATACAGGAACCAAACCCTATGCATGTAAGGAATGTGGCAAAGCCTTTAACGGCAA  443
            .|.|||.|.||||.||   |.|||||.|..|||||.||.||.||||||||.|||||.|||||||||||.|||||
Sbjct  358  GTTAGAAATCAGAGAA---ACACAGGGAATAAACCATACGCGTGTAAGGAGTGTGGGAAAGCCTTTAATGGCAA  428

Query  444  AGCATATCTCACTGAGCATGAGAAAATTCATACTGGAGAAAAACCATTTGAATGTAATCAGTGTGGAAGAGCCT  517
            ..|||||||||..||.||.|||||||||||.||.|||||.|||||.||||||||||.|||||||||||||||||
Sbjct  429  GTCATATCTCAAAGAACACGAGAAAATTCACACCGGAGAGAAACCGTTTGAATGTAGTCAGTGTGGAAGAGCCT  502

Query  518  TCAGCCAGAAGCAATACCTCATTAAACATCAGAACATCCATACTGGAAAGAAGCCCTTTAAATGTAGTGAGTGT  591
            ||||||||||||||||||||||||||||.|||||.|||||||.|||.|||||.||.|||||.||||.|||||||
Sbjct  503  TCAGCCAGAAGCAATACCTCATTAAACACCAGAATATCCATAGTGGGAAGAAACCTTTTAAGTGTAATGAGTGT  576

Query  592  GGAAAAGCTTTTAGCCAGAAGGAAAACCTCATTATACATCAGAGAATCCATACTGGAGAGAAACCTTATGAATG  665
            ||.||.||||||||||||||.|||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.|||||||||||
Sbjct  577  GGTAAGGCTTTTAGCCAGAAAGAAAACCTCATTATACACCAGAGAATCCATACTGGAGAGAAGCCTTATGAATG  650

Query  666  TAAAGGGTGTGGGAAAGCTTTCATTCAGAAGTCAAGCCTCATTAGACACCAGAGAAGTCACACAGGAGAGAAAC  739
            ||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||||||||.||.||||||||||
Sbjct  651  TAAAGGGTGTGGGAAAGCTTTCATTCAGAAATCAAGCCTCATCAGACACCAGAGAAGTCATACTGGAGAGAAAC  724

Query  740  CTTATACGTGTAAGGAATGTGGGAAAGCCTTCAGTGGCAAGTCAAATCTCACAGAGCATGAGAAAATTCATATT  813
            |.|||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||.||||||||.||.|||||||||||||||||||||
Sbjct  725  CGTATACATGTAAGGAATGTGGAAAAGCCTTCAGTGGCAAATCAAATCTGACTGAGCATGAGAAAATTCATATT  798

Query  814  GGAGAGAAACCCTACAAATGTAATGAATGTGGAACAATCTTCAGGCAGAAGCAATACCTCATTAAACATCACAA  887
            ||||||||||||||.||.|||||.|||||||||||.||.|||||||||||.|||||||||||.|||||||||||
Sbjct  799  GGAGAGAAACCCTATAAGTGTAACGAATGTGGAACGATTTTCAGGCAGAAACAATACCTCATCAAACATCACAA  872

Query  888  TATTCATACAGGAGAGAAACCCTATGAATGTAATAAATGTGGAAAAGCCTTCTCTCGAATCACATCACTTATTG  961
            ||||||.||.||.||.||.||||||||.||.|||||.||.||.||||||||.||||||||.|||||.||.||||
Sbjct  873  TATTCACACGGGTGAAAAGCCCTATGAGTGCAATAAGTGCGGGAAAGCCTTTTCTCGAATTACATCGCTCATTG  946

Query  962  TACATGTGAGAATTCATACAGGTGATAAGCCTTATGAGTGTAAGGTCTGTGGGAAAGCCTTCTGTCAAAGCTCA  1035
            |.||||||||||||||.|||||||||||.||.|||||.|||||..||||||||||||||||||||||.||.||.
Sbjct  947  TCCATGTGAGAATTCACACAGGTGATAAACCCTATGAATGTAAAATCTGTGGGAAAGCCTTCTGTCAGAGTTCC  1020

Query 1036  TCTCTTACTGTGCACATGAGAAGCCATACAGGTGAGAAACCCTATGGTTGTAATGAATGTGGGAAAGCCTTTTC  1109
            ||||||||.|||||.|||||.||||||||.|||||||||||||||||.||.||||||||||||||.||||||||
Sbjct 1021  TCTCTTACAGTGCATATGAGGAGCCATACGGGTGAGAAACCCTATGGCTGCAATGAATGTGGGAAGGCCTTTTC  1094

Query 1110  TCAGTTCTCAACCCTTGCTCTGCACATGAGAATCCATACTGGTGAAAAACCTTATCAGTGTAGTGAATGTGGGA  1183
            ||||||||||||.||||||.|.||||||||||||||.|||||.|||||.|||||||||||.|||||.|||||||
Sbjct 1095  TCAGTTCTCAACTCTTGCTTTACACATGAGAATCCACACTGGGGAAAAGCCTTATCAGTGCAGTGAGTGTGGGA  1168

Query 1184  AAGCTTTCAGCCAAAAGTCACATCACATTAGACACCAGAGAATTCATACTCAT  1236
            |.|||||||||||.|||||.|||||||||||||||||||||||.||.|.||||
Sbjct 1169  AGGCTTTCAGCCAGAAGTCCCATCACATTAGACACCAGAGAATCCACATTCAT  1221