Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000477771
• Subject: NM_001286957.2
• Aligned Length: 1452
• Identities: 1023
• Gaps: 429

Alignment

Query    1  ATGCCTAAGAAAGAAAAAATGGCCAAGACGCCCCTGTCCGATGAGAAGCAGCTGCTTCTGTTTCAGCAGAAGTT  74
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query   75  GCTGGCAGAGGAGGAGATGGCCAAAAAGAAGGAGAGGCTCCTCAGCCAGTTCTTGAAGGACAAGCTGGCCAAGG  148
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  149  AGGAACACAACAGTGCTCTGAACCTTAATAAGATTAACACACAGTGGAGAACTGTCCTTCGGGAAGTCAAGACC  222
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  223  AGAGAACTTCATAAGGACATTGAGATCCTCAGCCAAACATTTGAACGAGTGGTGGACTGTAAGGACAATGTCAT  296
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  297  CAAGTCTTTAGCTAAAGACCTGTCCGAAGCCGAGGAGCAGTACGCCCATGCCCTGCGCAGCCACTTGCACAATG  370
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  371  TTGACCAGCTCTTGGCCCTGCAGAGGCACCGGCTCAGTCTCCTGGAGGAAAGTTACAACATGGAGCTGGAAGCC  444
                                                                       |||||||||||||||
Sbjct    1  -----------------------------------------------------------ATGGAGCTGGAAGCC  15

Query  445  CTAACCAAGGAGTTTGAGACAGAAAGGAAGACAATTATTGACCAACATGAGAAAGAGATTCACTATCTGCAAGA  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   16  CTAACCAAGGAGTTTGAGACAGAAAGGAAGACAATTATTGACCAACATGAGAAAGAGATTCACTATCTGCAAGA  89

Query  519  TATCTTCATGGCCATGGAGCAGAACTATATAGATTCTGAGTATGAAAGCAAGCTGGAGTTCCAGAGCATGTGGA  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   90  TATCTTCATGGCCATGGAGCAGAACTATATAGATTCTGAGTATGAAAGCAAGCTGGAGTTCCAGAGCATGTGGA  163

Query  593  ATGATCTCAAAAACATGAATTTAGAAGAGAAGCACTTTCTAAGACTGCACCTGGAGAACAGAGTAGAAGATCTG  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  164  ATGATCTCAAAAACATGAATTTAGAAGAGAAGCACTTTCTAAGACTGCACCTGGAGAACAGAGTAGAAGATCTG  237

Query  667  TGGAGAAAGTTCCAGGATGTACTCAAGAATTACACTGATGCCACAGAGGATCGAAAGGCTGCCTTTGAGACCCT  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  238  TGGAGAAAGTTCCAGGATGTACTCAAGAATTACACTGATGCCACAGAGGATCGAAAGGCTGCCTTTGAGACCCT  311

Query  741  GCAGGTGAAGGATGAGAAGAGCTCCAAAGAGATTGAAGTACAGATGAAAAAAATACAGAAACTACAGGATGCCA  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  312  GCAGGTGAAGGATGAGAAGAGCTCCAAAGAGATTGAAGTACAGATGAAAAAAATACAGAAACTACAGGATGCCA  385

Query  815  TAACTATTTCAAAAGGCAAGATCATGATACACAGCCGTGAGAGTGAAGATGAGAACCGGTATATCCGTAATGAC  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  386  TAACTATTTCAAAAGGCAAGATCATGATACACAGCCGTGAGAGTGAAGATGAGAACCGGTATATCCGTAATGAC  459

Query  889  AAGGAATTGGTCCTTGTACAACTGCGAAAACTTAAGGCCCAAAGAACTCAGGCCCGGGCAGCATCCCAGAAGAA  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  460  AAGGAATTGGTCCTTGTACAACTGCGAAAACTTAAGGCCCAAAGAACTCAGGCCCGGGCAGCATCCCAGAAGAA  533

Query  963  CTTAGTCAGACTCACCCTGGAAAGTAATGCCACCCTCAAGGCCCTGAGAAAGATTGTTGATAAGGGTGAAAAGA  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  534  CTTAGTCAGACTCACCCTGGAAAGTAATGCCACCCTCAAGGCCCTGAGAAAGATTGTTGATAAGGGTGAAAAGA  607

Query 1037  TCCTTAAACTTGCTGAAATATGTAGGAAATTTGAAACCGAAGAAGAAAAAGTGCTGCCTTTTTATTCATCAGTA  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  608  TCCTTAAACTTGCTGAAATATGTAGGAAATTTGAAACCGAAGAAGAAAAAGTGCTGCCTTTTTATTCATCAGTA  681

Query 1111  TTGACTCCTAAGGAGCAGGAGGGGATTCAGAAGAATAATCTAGAAGAGCTTACTGAGGAGCTCACCAAGGTGAT  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  682  TTGACTCCTAAGGAGCAGGAGGGGATTCAGAAGAATAATCTAGAAGAGCTTACTGAGGAGCTCACCAAGGTGAT  755

Query 1185  GGTGGACTACATAGGAATGGAGAATTTCTGGAAAAGGTACAACAAAGTGAAACTGGAGCAACTGAGCCTCCAAC  1258
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  756  GGTGGACTACATAGGAATGGAGAATTTCTGGAAAAGGTACAACAAAGTGAAACTGGAGCAACTGAGCCTCCAAC  829

Query 1259  ATAGACGAGCCCAGCTGCTAGATATCAATGGGAAGCTGCGGGAGATGCTGAAGCAGTACTTGGATGGCATCTCA  1332
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  830  ATAGACGAGCCCAGCTGCTAGATATCAATGGGAAGCTGCGGGAGATGCTGAAGCAGTACTTGGATGGCATCTCA  903

Query 1333  GTGAGTGACGAAGTGCTGAGCCAGCTCAACCCACTCTTTATAGTCAACTATCAAAGCAACTTACTCCAGCCCTT  1406
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  904  GTGAGTGACGAAGTGCTGAGCCAGCTCAACCCACTCTTTATAGTCAACTATCAAAGCAACTTACTCCAGCCCTT  977

Query 1407  GTCCATACGTATAGCCCATCCAGGTGATAAACAACATCCAACCACT  1452
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  978  GTCCATACGTATAGCCCATCCAGGTGATAAACAACATCCAACCACT  1023