Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- TRCN0000477826
- Subject:
- XM_017019738.2
- Aligned Length:
- 1935
- Identities:
- 1667
- Gaps:
- 264
Alignment
Query 1 AT--GGAC---------------GACCTC-GACGCCCTGCTGGCGGACTTGGAGTCTACCACCTCCCACATCTC 56
|| |||| |||..| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ATGAGGACACTGCGTGAAGCCAAGACAGCAGACGCCCTGCTGGCGGACTTGGAGTCTACCACCTCCCACATCTC 74
Query 57 CAAACGGCCTGTGTTCTTGTCGGAGGAGACCCCCTACTCATACCCAACTGGAAACCACACATACCAGGAGATTG 130
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 75 CAAACGGCCTGTGTTCTTGTCGGAGGAGACCCCCTACTCATACCCAACTGGAAACCACACATACCAGGAGATTG 148
Query 131 CCGTGCCACCCCCCGTCCCCCCACCCCCGTCCAGCGAGGCCCTCAATGGCACAATCCTTGACCCCTTAGACCAG 204
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 149 CCGTGCCACCCCCCGTCCCCCCACCCCCGTCCAGCGAGGCCCTCAATGGCACAATCCTTGACCCCTTAGACCAG 222
Query 205 TGGCAGCCCAGCGGCTCCCGATTCATCCACCAGCAGCCTCAGTCCTCATCACCTGTGTACGGCTCCAGTGCCAA 278
||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223 TGGCAGCCCAGCAGCTCCCGATTCATCCACCAGCAGCCTCAGTCCTCATCACCTGTGTACGGCTCCAGTGCCAA 296
Query 279 AACTTCCAGTGTCTCCAACCCTCAGGACAGTGTTGGCTCTCCGTGCTCCCGAGTGGGTGAGGAGGAGCACGTCT 352
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 297 AACTTCCAGTGTCTCCAACCCTCAGGACAGTGTTGGCTCTCCGTGCTCCCGAGTGGGTGAGGAGGAGCACGTCT 370
Query 353 ACAGCTTCCCCAACAAGCAGAAATCAGCTGAGCCTTCACCCACCGTAATGAGCACGTCCCTGGGCAGCAACCTT 426
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 371 ACAGCTTCCCCAACAAGCAGAAATCAGCTGAGCCTTCACCCACCGTAATGAGCACGTCCCTGGGCAGCAACCTT 444
Query 427 TCTGAACTCGACCGCCTGCTGCTGGAACTGAACGCTGTACAGCATAACCCGCCAGGCTTCCCTGCAGATGAGGC 500
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 445 TCTGAACTCGACCGCCTGCTGCTGGAACTGAACGCTGTACAGCATAACCCGCCAGGCTTCCCTGCAGATGAGGC 518
Query 501 CAACTCAAGCCCCCCGCTTCCTGGGGCCCTGAGCCCCCTCTATGGTGTCCCAGAGACTAACAGCCCCTTGGGAG 574
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 519 CAACTCAAGCCCCCCGCTTCCTGGGGCCCTGAGCCCCCTCTATGGTGTCCCAGAGACTAACAGCCCCTTGGGAG 592
Query 575 GCAAAGCTGGGCCCCTGACGAAAGAGAAGCCTAAGCGGAATGGGGGCCGGGGCCTGGAGGACGTGCGGCCCAGT 648
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 593 GCAAAGCTGGGCCCCTGACGAAAGAGAAGCCTAAGCGGAATGGGGGCCGGGGCCTGGAGGACGTGCGGCCCAGT 666
Query 649 GTGGAGAGTCTCTTGGATGAACTGGAGAGCTCCGTGCCCAGCCCCGTCCCTGCCATCACTGTGAACCAGGGCGA 722
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 667 GTGGAGAGTCTCTTGGATGAACTGGAGAGCTCCGTGCCCAGCCCCGTCCCTGCCATCACTGTGAACCAGGGCGA 740
Query 723 GATGAGCAGCCCGCAGCGCGTCACCTCCACCCAACAGCAGACACGCATCTCGGCCTCCTCTGCCACCAGGGAGC 796
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 741 GATGAGCAGCCCGCAGCGCGTCACCTCCACCCAACAGCAGACACGCATCTCGGCCTCCTCTGCCACCAGGGAGC 814
Query 797 TGGACGAGCTGATGGCTTCGCTGTCGGATTTCA----------------------------------------- 829
|||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 815 TGGACGAGCTGATGGCTTCGCTGTCGGATTTCAAGATCCAGGGCCTGGAGCAAAGAGCGGATGGGGAGCGGTGC 888
Query 830 -------------------------------------------------------------------------- 829
Sbjct 889 TGGGCGGCCGGCTGGCCTCGGGACGGCGGGCGGAGCAGCCCCGGAGGGCAGGACGAGGGAGGGGGCTCCTGGCC 962
Query 830 -------------------------------------------------------------------------- 829
Sbjct 963 CCTGGAGGAGGTTGTACTTCTTGTCTCCATCAGCTCATCTGTCCAGGAGGGAGAAAAGTACCCCCATCCCTGTG 1036
Query 830 ---------------------------------------------------------AGTTCATGGCCCAGGGG 846
|||||||||||||||||
Sbjct 1037 CTGCCAGACACCGTACCCCGAGCCTCAGGAGTCCTGACCAGCCCCCTCCGTGTCCACAGTTCATGGCCCAGGGG 1110
Query 847 AAGACAGGGAGCAGCTCACCCCCTGGGGGGCCCCCGAAGCCCGGGAGCCAGCTGGACAGCATGCTGGGGAGCCT 920
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111 AAGACAGGGAGCAGCTCACCCCCTGGGGGGCCCCCGAAGCCCGGGAGCCAGCTGGACAGCATGCTGGGGAGCCT 1184
Query 921 GCAGTCTGACCTGAACAAGCTGGGGGTCGCCACAGTCGCCAAAGGAGTCTGCGGGGCCTGCAAGAAGCCCATCG 994
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185 GCAGTCTGACCTGAACAAGCTGGGGGTCGCCACAGTCGCCAAAGGAGTCTGCGGGGCCTGCAAGAAGCCCATCG 1258
Query 995 CCGGGCAGGTTGTGACCGCCATGGGGAAGACGTGGCACCCCGAGCACTTCGTCTGCACCCACTGCCAGGAGGAG 1068
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259 CCGGGCAGGTTGTGACCGCCATGGGGAAGACGTGGCACCCCGAGCACTTCGTCTGCACCCACTGCCAGGAGGAG 1332
Query 1069 ATCGGATCCCGGAACTTCTTCGAGCGGGATGGACAGCCCTACTGTGAAAAGGACTACCACAACCTCTTCTCCCC 1142
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333 ATCGGATCCCGGAACTTCTTCGAGCGGGATGGACAGCCCTACTGTGAAAAGGACTACCACAACCTCTTCTCCCC 1406
Query 1143 GCGCTGCTACTACTGCAACGGCCCCATCCTGGATAAAGTGGTGACAGCCCTTGACCGGACGTGGCACCCTGAAC 1216
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407 GCGCTGCTACTACTGCAACGGCCCCATCCTGGATAAAGTGGTGACAGCCCTTGACCGGACGTGGCACCCTGAAC 1480
Query 1217 ACTTCTTCTGTGCACAGTGTGGAGCCTTCTTTGGTCCCGAAGGGTTCCACGAGAAGGACGGCAAGGCCTACTGT 1290
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481 ACTTCTTCTGTGCACAGTGTGGAGCCTTCTTTGGTCCCGAAGGGTTCCACGAGAAGGACGGCAAGGCCTACTGT 1554
Query 1291 CGCAAGGACTACTTCGACATGTTCGCACCCAAGTGTGGCGGCTGCGCCCGGGCCATCCTGGAGAACTATATCTC 1364
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555 CGCAAGGACTACTTCGACATGTTCGCACCCAAGTGTGGCGGCTGCGCCCGGGCCATCCTGGAGAACTATATCTC 1628
Query 1365 AGCCCTCAACACGCTGTGGCATCCTGAGTGCTTTGTGTGCCGGGAATGCTTCACGCCATTCGTGAACGGCAGCT 1438
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629 AGCCCTCAACACGCTGTGGCATCCTGAGTGCTTTGTGTGCCGGGAATGCTTCACGCCATTCGTGAACGGCAGCT 1702
Query 1439 TCTTCGAGCACGACGGGCAGCCCTACTGTGAGGTGCACTACCACGAGCGGCGCGGCTCGCTGTGTTCTGGCTGC 1512
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1703 TCTTCGAGCACGACGGGCAGCCCTACTGTGAGGTGCACTACCACGAGCGGCGCGGCTCGCTGTGTTCTGGCTGC 1776
Query 1513 CAGAAGCCCATCACCGGCCGCTGCATCACCGCCATGGCCAAGAAGTTCCACCCCGAGCACTTCGTCTGTGCCTT 1586
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1777 CAGAAGCCCATCACCGGCCGCTGCATCACCGCCATGGCCAAGAAGTTCCACCCCGAGCACTTCGTCTGTGCCTT 1850
Query 1587 CTGCCTCAAGCAGCTCAACAAGGGCACCTTCAAGGAGCAGAACGACAAGCCTTACTGTCAGAACTGCTTCCTCA 1660
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1851 CTGCCTCAAGCAGCTCAACAAGGGCACCTTCAAGGAGCAGAACGACAAGCCTTACTGTCAGAACTGCTTCCTCA 1924
Query 1661 GGCTCTTCTGC 1671
.||||||||||
Sbjct 1925 AGCTCTTCTGC 1935