Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000477826
• Subject: XM_017019739.2
• Aligned Length: 1833
• Identities: 1667
• Gaps: 162

Alignment

Query    1  AT--GGAC---------------GACCTC-GACGCCCTGCTGGCGGACTTGGAGTCTACCACCTCCCACATCTC  56
            ||  ||||               |||..| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGAGGACACTGCGTGAAGCCAAGACAGCAGACGCCCTGCTGGCGGACTTGGAGTCTACCACCTCCCACATCTC  74

Query   57  CAAACGGCCTGTGTTCTTGTCGGAGGAGACCCCCTACTCATACCCAACTGGAAACCACACATACCAGGAGATTG  130
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  CAAACGGCCTGTGTTCTTGTCGGAGGAGACCCCCTACTCATACCCAACTGGAAACCACACATACCAGGAGATTG  148

Query  131  CCGTGCCACCCCCCGTCCCCCCACCCCCGTCCAGCGAGGCCCTCAATGGCACAATCCTTGACCCCTTAGACCAG  204
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  CCGTGCCACCCCCCGTCCCCCCACCCCCGTCCAGCGAGGCCCTCAATGGCACAATCCTTGACCCCTTAGACCAG  222

Query  205  TGGCAGCCCAGCGGCTCCCGATTCATCCACCAGCAGCCTCAGTCCTCATCACCTGTGTACGGCTCCAGTGCCAA  278
            ||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  TGGCAGCCCAGCAGCTCCCGATTCATCCACCAGCAGCCTCAGTCCTCATCACCTGTGTACGGCTCCAGTGCCAA  296

Query  279  AACTTCCAGTGTCTCCAACCCTCAGGACAGTGTTGGCTCTCCGTGCTCCCGAGTGGGTGAGGAGGAGCACGTCT  352
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  AACTTCCAGTGTCTCCAACCCTCAGGACAGTGTTGGCTCTCCGTGCTCCCGAGTGGGTGAGGAGGAGCACGTCT  370

Query  353  ACAGCTTCCCCAACAAGCAGAAATCAGCTGAGCCTTCACCCACCGTAATGAGCACGTCCCTGGGCAGCAACCTT  426
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  ACAGCTTCCCCAACAAGCAGAAATCAGCTGAGCCTTCACCCACCGTAATGAGCACGTCCCTGGGCAGCAACCTT  444

Query  427  TCTGAACTCGACCGCCTGCTGCTGGAACTGAACGCTGTACAGCATAACCCGCCAGGCTTCCCTGCAGATGAGGC  500
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  TCTGAACTCGACCGCCTGCTGCTGGAACTGAACGCTGTACAGCATAACCCGCCAGGCTTCCCTGCAGATGAGGC  518

Query  501  CAACTCAAGCCCCCCGCTTCCTGGGGCCCTGAGCCCCCTCTATGGTGTCCCAGAGACTAACAGCCCCTTGGGAG  574
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  CAACTCAAGCCCCCCGCTTCCTGGGGCCCTGAGCCCCCTCTATGGTGTCCCAGAGACTAACAGCCCCTTGGGAG  592

Query  575  GCAAAGCTGGGCCCCTGACGAAAGAGAAGCCTAAGCGGAATGGGGGCCGGGGCCTGGAGGACGTGCGGCCCAGT  648
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  GCAAAGCTGGGCCCCTGACGAAAGAGAAGCCTAAGCGGAATGGGGGCCGGGGCCTGGAGGACGTGCGGCCCAGT  666

Query  649  GTGGAGAGTCTCTTGGATGAACTGGAGAGCTCCGTGCCCAGCCCCGTCCCTGCCATCACTGTGAACCAGGGCGA  722
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  GTGGAGAGTCTCTTGGATGAACTGGAGAGCTCCGTGCCCAGCCCCGTCCCTGCCATCACTGTGAACCAGGGCGA  740

Query  723  GATGAGCAGCCCGCAGCGCGTCACCTCCACCCAACAGCAGACACGCATCTCGGCCTCCTCTGCCACCAGGGAGC  796
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  GATGAGCAGCCCGCAGCGCGTCACCTCCACCCAACAGCAGACACGCATCTCGGCCTCCTCTGCCACCAGGGAGC  814

Query  797  TGGACGAGCTGATGGCTTCGCTGTCGGATTTCA-----------------------------------------  829
            |||||||||||||||||||||||||||||||||                                         
Sbjct  815  TGGACGAGCTGATGGCTTCGCTGTCGGATTTCAAGGGCTCCTGGCCCCTGGAGGAGGTTGTACTTCTTGTCTCC  888

Query  830  --------------------------------------------------------------------------  829
                                                                                      
Sbjct  889  ATCAGCTCATCTGTCCAGGAGGGAGAAAAGTACCCCCATCCCTGTGCTGCCAGACACCGTACCCCGAGCCTCAG  962

Query  830  -----------------------------AGTTCATGGCCCAGGGGAAGACAGGGAGCAGCTCACCCCCTGGGG  874
                                         |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  GAGTCCTGACCAGCCCCCTCCGTGTCCACAGTTCATGGCCCAGGGGAAGACAGGGAGCAGCTCACCCCCTGGGG  1036

Query  875  GGCCCCCGAAGCCCGGGAGCCAGCTGGACAGCATGCTGGGGAGCCTGCAGTCTGACCTGAACAAGCTGGGGGTC  948
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  GGCCCCCGAAGCCCGGGAGCCAGCTGGACAGCATGCTGGGGAGCCTGCAGTCTGACCTGAACAAGCTGGGGGTC  1110

Query  949  GCCACAGTCGCCAAAGGAGTCTGCGGGGCCTGCAAGAAGCCCATCGCCGGGCAGGTTGTGACCGCCATGGGGAA  1022
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  GCCACAGTCGCCAAAGGAGTCTGCGGGGCCTGCAAGAAGCCCATCGCCGGGCAGGTTGTGACCGCCATGGGGAA  1184

Query 1023  GACGTGGCACCCCGAGCACTTCGTCTGCACCCACTGCCAGGAGGAGATCGGATCCCGGAACTTCTTCGAGCGGG  1096
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  GACGTGGCACCCCGAGCACTTCGTCTGCACCCACTGCCAGGAGGAGATCGGATCCCGGAACTTCTTCGAGCGGG  1258

Query 1097  ATGGACAGCCCTACTGTGAAAAGGACTACCACAACCTCTTCTCCCCGCGCTGCTACTACTGCAACGGCCCCATC  1170
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  ATGGACAGCCCTACTGTGAAAAGGACTACCACAACCTCTTCTCCCCGCGCTGCTACTACTGCAACGGCCCCATC  1332

Query 1171  CTGGATAAAGTGGTGACAGCCCTTGACCGGACGTGGCACCCTGAACACTTCTTCTGTGCACAGTGTGGAGCCTT  1244
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333  CTGGATAAAGTGGTGACAGCCCTTGACCGGACGTGGCACCCTGAACACTTCTTCTGTGCACAGTGTGGAGCCTT  1406

Query 1245  CTTTGGTCCCGAAGGGTTCCACGAGAAGGACGGCAAGGCCTACTGTCGCAAGGACTACTTCGACATGTTCGCAC  1318
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407  CTTTGGTCCCGAAGGGTTCCACGAGAAGGACGGCAAGGCCTACTGTCGCAAGGACTACTTCGACATGTTCGCAC  1480

Query 1319  CCAAGTGTGGCGGCTGCGCCCGGGCCATCCTGGAGAACTATATCTCAGCCCTCAACACGCTGTGGCATCCTGAG  1392
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481  CCAAGTGTGGCGGCTGCGCCCGGGCCATCCTGGAGAACTATATCTCAGCCCTCAACACGCTGTGGCATCCTGAG  1554

Query 1393  TGCTTTGTGTGCCGGGAATGCTTCACGCCATTCGTGAACGGCAGCTTCTTCGAGCACGACGGGCAGCCCTACTG  1466
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555  TGCTTTGTGTGCCGGGAATGCTTCACGCCATTCGTGAACGGCAGCTTCTTCGAGCACGACGGGCAGCCCTACTG  1628

Query 1467  TGAGGTGCACTACCACGAGCGGCGCGGCTCGCTGTGTTCTGGCTGCCAGAAGCCCATCACCGGCCGCTGCATCA  1540
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629  TGAGGTGCACTACCACGAGCGGCGCGGCTCGCTGTGTTCTGGCTGCCAGAAGCCCATCACCGGCCGCTGCATCA  1702

Query 1541  CCGCCATGGCCAAGAAGTTCCACCCCGAGCACTTCGTCTGTGCCTTCTGCCTCAAGCAGCTCAACAAGGGCACC  1614
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1703  CCGCCATGGCCAAGAAGTTCCACCCCGAGCACTTCGTCTGTGCCTTCTGCCTCAAGCAGCTCAACAAGGGCACC  1776

Query 1615  TTCAAGGAGCAGAACGACAAGCCTTACTGTCAGAACTGCTTCCTCAGGCTCTTCTGC  1671
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||
Sbjct 1777  TTCAAGGAGCAGAACGACAAGCCTTACTGTCAGAACTGCTTCCTCAAGCTCTTCTGC  1833