Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- TRCN0000477826
- Subject:
- XM_017019740.2
- Aligned Length:
- 1791
- Identities:
- 1667
- Gaps:
- 120
Alignment
Query 1 AT--GGAC---------------GACCTC-GACGCCCTGCTGGCGGACTTGGAGTCTACCACCTCCCACATCTC 56
|| |||| |||..| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ATGAGGACACTGCGTGAAGCCAAGACAGCAGACGCCCTGCTGGCGGACTTGGAGTCTACCACCTCCCACATCTC 74
Query 57 CAAACGGCCTGTGTTCTTGTCGGAGGAGACCCCCTACTCATACCCAACTGGAAACCACACATACCAGGAGATTG 130
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 75 CAAACGGCCTGTGTTCTTGTCGGAGGAGACCCCCTACTCATACCCAACTGGAAACCACACATACCAGGAGATTG 148
Query 131 CCGTGCCACCCCCCGTCCCCCCACCCCCGTCCAGCGAGGCCCTCAATGGCACAATCCTTGACCCCTTAGACCAG 204
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 149 CCGTGCCACCCCCCGTCCCCCCACCCCCGTCCAGCGAGGCCCTCAATGGCACAATCCTTGACCCCTTAGACCAG 222
Query 205 TGGCAGCCCAGCGGCTCCCGATTCATCCACCAGCAGCCTCAGTCCTCATCACCTGTGTACGGCTCCAGTGCCAA 278
||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223 TGGCAGCCCAGCAGCTCCCGATTCATCCACCAGCAGCCTCAGTCCTCATCACCTGTGTACGGCTCCAGTGCCAA 296
Query 279 AACTTCCAGTGTCTCCAACCCTCAGGACAGTGTTGGCTCTCCGTGCTCCCGAGTGGGTGAGGAGGAGCACGTCT 352
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 297 AACTTCCAGTGTCTCCAACCCTCAGGACAGTGTTGGCTCTCCGTGCTCCCGAGTGGGTGAGGAGGAGCACGTCT 370
Query 353 ACAGCTTCCCCAACAAGCAGAAATCAGCTGAGCCTTCACCCACCGTAATGAGCACGTCCCTGGGCAGCAACCTT 426
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 371 ACAGCTTCCCCAACAAGCAGAAATCAGCTGAGCCTTCACCCACCGTAATGAGCACGTCCCTGGGCAGCAACCTT 444
Query 427 TCTGAACTCGACCGCCTGCTGCTGGAACTGAACGCTGTACAGCATAACCCGCCAGGCTTCCCTGCAGATGAGGC 500
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 445 TCTGAACTCGACCGCCTGCTGCTGGAACTGAACGCTGTACAGCATAACCCGCCAGGCTTCCCTGCAGATGAGGC 518
Query 501 CAACTCAAGCCCCCCGCTTCCTGGGGCCCTGAGCCCCCTCTATGGTGTCCCAGAGACTAACAGCCCCTTGGGAG 574
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 519 CAACTCAAGCCCCCCGCTTCCTGGGGCCCTGAGCCCCCTCTATGGTGTCCCAGAGACTAACAGCCCCTTGGGAG 592
Query 575 GCAAAGCTGGGCCCCTGACGAAAGAGAAGCCTAAGCGGAATGGGGGCCGGGGCCTGGAGGACGTGCGGCCCAGT 648
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 593 GCAAAGCTGGGCCCCTGACGAAAGAGAAGCCTAAGCGGAATGGGGGCCGGGGCCTGGAGGACGTGCGGCCCAGT 666
Query 649 GTGGAGAGTCTCTTGGATGAACTGGAGAGCTCCGTGCCCAGCCCCGTCCCTGCCATCACTGTGAACCAGGGCGA 722
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 667 GTGGAGAGTCTCTTGGATGAACTGGAGAGCTCCGTGCCCAGCCCCGTCCCTGCCATCACTGTGAACCAGGGCGA 740
Query 723 GATGAGCAGCCCGCAGCGCGTCACCTCCACCCAACAGCAGACACGCATCTCGGCCTCCTCTGCCACCAGGGAGC 796
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 741 GATGAGCAGCCCGCAGCGCGTCACCTCCACCCAACAGCAGACACGCATCTCGGCCTCCTCTGCCACCAGGGAGC 814
Query 797 TGGACGAGCTGATGGCTTCGCTGTCGGATTTCAA---------------------------------------- 830
||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 815 TGGACGAGCTGATGGCTTCGCTGTCGGATTTCAAGATCCAGGGCCTGGAGCAAAGAGCGGATGGGGAGCGGTGC 888
Query 831 --------------------------------------------------------------GTTCATGGCCCA 842
||||||||||||
Sbjct 889 TGGGCGGCCGGCTGGCCTCGGGACGGCGGGCGGAGCAGCCCCGGAGGGCAGGACGAGGGAGGGTTCATGGCCCA 962
Query 843 GGGGAAGACAGGGAGCAGCTCACCCCCTGGGGGGCCCCCGAAGCCCGGGAGCCAGCTGGACAGCATGCTGGGGA 916
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 963 GGGGAAGACAGGGAGCAGCTCACCCCCTGGGGGGCCCCCGAAGCCCGGGAGCCAGCTGGACAGCATGCTGGGGA 1036
Query 917 GCCTGCAGTCTGACCTGAACAAGCTGGGGGTCGCCACAGTCGCCAAAGGAGTCTGCGGGGCCTGCAAGAAGCCC 990
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037 GCCTGCAGTCTGACCTGAACAAGCTGGGGGTCGCCACAGTCGCCAAAGGAGTCTGCGGGGCCTGCAAGAAGCCC 1110
Query 991 ATCGCCGGGCAGGTTGTGACCGCCATGGGGAAGACGTGGCACCCCGAGCACTTCGTCTGCACCCACTGCCAGGA 1064
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111 ATCGCCGGGCAGGTTGTGACCGCCATGGGGAAGACGTGGCACCCCGAGCACTTCGTCTGCACCCACTGCCAGGA 1184
Query 1065 GGAGATCGGATCCCGGAACTTCTTCGAGCGGGATGGACAGCCCTACTGTGAAAAGGACTACCACAACCTCTTCT 1138
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185 GGAGATCGGATCCCGGAACTTCTTCGAGCGGGATGGACAGCCCTACTGTGAAAAGGACTACCACAACCTCTTCT 1258
Query 1139 CCCCGCGCTGCTACTACTGCAACGGCCCCATCCTGGATAAAGTGGTGACAGCCCTTGACCGGACGTGGCACCCT 1212
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259 CCCCGCGCTGCTACTACTGCAACGGCCCCATCCTGGATAAAGTGGTGACAGCCCTTGACCGGACGTGGCACCCT 1332
Query 1213 GAACACTTCTTCTGTGCACAGTGTGGAGCCTTCTTTGGTCCCGAAGGGTTCCACGAGAAGGACGGCAAGGCCTA 1286
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333 GAACACTTCTTCTGTGCACAGTGTGGAGCCTTCTTTGGTCCCGAAGGGTTCCACGAGAAGGACGGCAAGGCCTA 1406
Query 1287 CTGTCGCAAGGACTACTTCGACATGTTCGCACCCAAGTGTGGCGGCTGCGCCCGGGCCATCCTGGAGAACTATA 1360
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407 CTGTCGCAAGGACTACTTCGACATGTTCGCACCCAAGTGTGGCGGCTGCGCCCGGGCCATCCTGGAGAACTATA 1480
Query 1361 TCTCAGCCCTCAACACGCTGTGGCATCCTGAGTGCTTTGTGTGCCGGGAATGCTTCACGCCATTCGTGAACGGC 1434
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481 TCTCAGCCCTCAACACGCTGTGGCATCCTGAGTGCTTTGTGTGCCGGGAATGCTTCACGCCATTCGTGAACGGC 1554
Query 1435 AGCTTCTTCGAGCACGACGGGCAGCCCTACTGTGAGGTGCACTACCACGAGCGGCGCGGCTCGCTGTGTTCTGG 1508
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555 AGCTTCTTCGAGCACGACGGGCAGCCCTACTGTGAGGTGCACTACCACGAGCGGCGCGGCTCGCTGTGTTCTGG 1628
Query 1509 CTGCCAGAAGCCCATCACCGGCCGCTGCATCACCGCCATGGCCAAGAAGTTCCACCCCGAGCACTTCGTCTGTG 1582
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629 CTGCCAGAAGCCCATCACCGGCCGCTGCATCACCGCCATGGCCAAGAAGTTCCACCCCGAGCACTTCGTCTGTG 1702
Query 1583 CCTTCTGCCTCAAGCAGCTCAACAAGGGCACCTTCAAGGAGCAGAACGACAAGCCTTACTGTCAGAACTGCTTC 1656
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1703 CCTTCTGCCTCAAGCAGCTCAACAAGGGCACCTTCAAGGAGCAGAACGACAAGCCTTACTGTCAGAACTGCTTC 1776
Query 1657 CTCAGGCTCTTCTGC 1671
||||.||||||||||
Sbjct 1777 CTCAAGCTCTTCTGC 1791