Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- TRCN0000477850
- Subject:
- NR_104211.2
- Aligned Length:
- 3565
- Identities:
- 2928
- Gaps:
- 637
Alignment
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 1 GGGGCCCACGCGCTCCGGGCCGCTCAGGCTGAGCGATTTCCCGCCTTTTCTGAGGTTCTGAGGCGGGAGCCATT 74
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 75 GGTTCTTTCTGTTGCCCTCATAGACCGTATGTAGCAGTTCGCGTGGGCACAGAACCCACGGTTTCCCGCTAGTT 148
Query 1 --------------------------------ATGGAAAAGCAAAAGCCCTTTGCATTGTTCGTACCACCGAGA 42
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 149 CTTCAAAGATATTTACAACCGTAACAGAGAAAATGGAAAAGCAAAAGCCCTTTGCATTGTTCGTACCACCGAGA 222
Query 43 TCAAGCAGCAGTCAGGTGTCTGCGGTGAAACCTCAGACCCTGGGAGGCGATTCCACTTTCTTCAAGAGTTTCAA 116
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223 TCAAGCAGCAGTCAGGTGTCTGCGGTGAAACCTCAGACCCTGGGAGGCGATTCCACTTTCTTCAAGAGTTTCAA 296
Query 117 CAAATGTACTGAAGATGATTTTGAGTTTCCATTTGCAAAGACTAATCTCTCCAAAAATGGGGAAAACATTGATT 190
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 297 CAAATGTACTGAAGATGATTTTGAGTTTCCATTTGCAAAGACTAATCTCTCCAAAAATGGGGAAAACATTGATT 370
Query 191 CAGATCCTGCTTTACAAAAAGTTAATTTCTTGCCCGTGCTTGAGCAGGTTGGTAATTCTGACTGTCACTATCAG 264
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 371 CAGATCCTGCTTTACAAAAAGTTAATTTCTTGCCCGTGCTTGAGCAGGTTGGTAATTCTGACTGTCACTATCAG 444
Query 265 GAAGGACTAAAAGACTCTGATTTGGAGAATTCAGAGGGATTGAGCAGAGTGTATTCAAAACTGTATAAGGAGGC 338
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 445 GAAGGACTAAAAGACTCTGATTTGGAGAATTCAGAGGGATTGAGCAGAGTGTATTCAAAACTGTATAAGGAGGC 518
Query 339 TGAAAAGATAAAAAAATGGAAAGTAAGTACAGAAGCTGAACTGAGACAGAAAGAAAGTAAGTTGCAAGAAAACA 412
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 519 TGAAAAGATAAAAAAATGGAAAGTAAGTACAGAAGCTGAACTGAGACAGAAAGAAAGTAAGTTGCAAGAAAACA 592
Query 413 GAAAGATAATTGAAGCACAGCGAAAAGCCATTCAGGAACTGCAATTTGGAAATGAAAAAGTAAGTTTGAAATTA 486
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 593 GAAAGATAATTGAAGCACAGCGAAAAGCCATTCAGGAACTGCAATTTGGAAATGAAAAAGTAAGTTTGAAATTA 666
Query 487 GAAGAAGGAATACAAGAAAATAAAGATTTAATAAAAGAGAATAATGCCACAAGGCATTTATGTAATCTACTCAA 560
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 667 GAAGAAGGAATACAAGAAAATAAAGATTTAATAAAAGAGAATAATGCCACAAGGCATTTATGTAATCTACTCAA 740
Query 561 AGAAACCTGTGCTAGATCTGCAGAAAAGACAAAGAAATATGAATATGAACGGGAAGAAACCAGGCAAGTTTATA 634
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 741 AGAAACCTGTGCTAGATCTGCAGAAAAGACAAAGAAATATGAATATGAACGGGAAGAAACCAGGCAAGTTTATA 814
Query 635 TGGATCTAAATAATAACATTGAGAAAATGATAACAGCTTTTGAGGAACTTCGTGTGCAAGCTGAGAATTCCAGA 708
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 815 TGGATCTAAATAATAACATTGAGAAAATGATAACAGCTTTTGAGGAACTTCGTGTGCAAGCTGAGAATTCCAGA 888
Query 709 CTGGAAATGCATTTTAAGTTAAAGGAAGATTATGAAAAAATCCAACACCTTGAACAAGAATACAAGAAGGAAAT 782
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 889 CTGGAAATGCATTTTAAGTTAAAGGAAGATTATGAAAAAATCCAACACCTTGAACAAGAATACAAGAAGGAAAT 962
Query 783 AAATGACAAGGAAAAGCAGGTATCACTACTATTGATCCAAATCACTGAGAAAGAAAATAAAATGAAAGATTTAA 856
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 963 AAATGACAAGGAAAAGCAGGTATCACTACTATTGATCCAAATCACTGAGAAAGAAAATAAAATGAAAGATTTAA 1036
Query 857 CATTTCTGCTAGAGGAATCCAGAGATAAAGTTAATCAATTAGAGGAAAAGACAAAATTACAGAGTGAAAACTTA 930
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037 CATTTCTGCTAGAGGAATCCAGAGATAAAGTTAATCAATTAGAGGAAAAGACAAAATTACAGAGTGAAAACTTA 1110
Query 931 AAACAATCAATTGAGAAACAGCATCATTTGACTAAAGAACTAGAAGATATTAAAGTGTCATTACAAAGAAGTGT 1004
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111 AAACAATCAATTGAGAAACAGCATCATTTGACTAAAGAACTAGAAGATATTAAAGTGTCATTACAAAGAAGTGT 1184
Query 1005 GAGTACTCAAAAGGCTTTAGAGGAAGATTTACAGATAGCAACAAAAACAATTTGTCAGCTAACTGAAGAAAAAG 1078
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185 GAGTACTCAAAAGGCTTTAGAGGAAGATTTACAGATAGCAACAAAAACAATTTGTCAGCTAACTGAAGAAAAAG 1258
Query 1079 AAACTCAAATGGAAGAATCTAATAAAGCTAGAGCTGCTCATTCGTTTGTGGTTACTGAATTTGAAACTACTGTC 1152
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259 AAACTCAAATGGAAGAATCTAATAAAGCTAGAGCTGCTCATTCGTTTGTGGTTACTGAATTTGAAACTACTGTC 1332
Query 1153 TGCAGCTTGGAAGAATTATTGAGAACAGAACAGCAAAGATTGGAAAAAAATGAAGATCAATTGAAAATACTTAC 1226
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333 TGCAGCTTGGAAGAATTATTGAGAACAGAACAGCAAAGATTGGAAAAAAATGAAGATCAATTGAAAATACTTAC 1406
Query 1227 CATGGAGCTTCAAAAGAAATCAAGTGAGCTGGAAGAGATGACTAAGCTTACAAATAACAAAGAAGTAGAACTTG 1300
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407 CATGGAGCTTCAAAAGAAATCAAGTGAGCTGGAAGAGATGACTAAGCTTACAAATAACAAAGAAGTAGAACTTG 1480
Query 1301 AAGAATTGAAAAAAGTCTTGGGAGAAAAGGAAACACTTTTATATGAAAATAAACAATTTGAGAAGATTGCTGAA 1374
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481 AAGAATTGAAAAAAGTCTTGGGAGAAAAGGAAACACTTTTATATGAAAATAAACAATTTGAGAAGATTGCTGAA 1554
Query 1375 GAATTAAAAGGAACAGAACAAGAACTAATTGGTCTTCTCCAAGCCAGAGAGAAAGAAGTACATGATTTGGAAAT 1448
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555 GAATTAAAAGGAACAGAACAAGAACTAATTGGTCTTCTCCAAGCCAGAGAGAAAGAAGTACATGATTTGGAAAT 1628
Query 1449 ACAGTTAACTGCCATTACCACAAGTGAACAGTATTATTCAAAAGAGGTTAAAGATCTAAAAACTGAGCTTGAAA 1522
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629 ACAGTTAACTGCCATTACCACAAGTGAACAGTATTATTCAAAAGAGGTTAAAGATCTAAAAACTGAGCTTGAAA 1702
Query 1523 ACGAGAAGCTTAAGAATACTGAATTAACTTCACACTGCAACAAGCTTTCACTAGAAAACAAAGAGCTCACACAG 1596
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1703 ACGAGAAGCTTAAGAATACTGAATTAACTTCACACTGCAACAAGCTTTCACTAGAAAACAAAGAGCTCACACAG 1776
Query 1597 GAAACAAGTGATATGACCCTAGAACTCAAGAATCAGCAAGAAGATATTAATAATAACAAAAAGCAAGAAGAAAG 1670
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1777 GAAACAAGTGATATGACCCTAGAACTCAAGAATCAGCAAGAAGATATTAATAATAACAAAAAGCAAGAAGAAAG 1850
Query 1671 GATGTTGAAACAAATAGAAAATCTTCAAGAAACAGAAACCCAATTAAGAAATGAACTAGAATATGTGAGAGAAG 1744
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1851 GATGTTGAAACAAATAGAAAATCTTCAAGAAACAGAAACCCAATTAAGAAATGAACTAGAATATGTGAGAGAAG 1924
Query 1745 AGCTAAAACAGAAAAGAGATGAAGTTAAATGTAAATTGGACAAGAGTGAAGAAAATTGTAACAATTTAAGGAAA 1818
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1925 AGCTAAAACAGAAAAGAGATGAAGTTAAATGTAAATTGGACAAGAGTGAAGAAAATTGTAACAATTTAAGGAAA 1998
Query 1819 CAAGTTGAAAATAAAAACAAGTATATTGAAGAACTTCAGCAGGAGAATAAGGCCTTGAAAAAAAAAGGTACAGC 1892
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1999 CAAGTTGAAAATAAAAACAAGTATATTGAAGAACTTCAGCAGGAGAATAAGGCCTTGAAAAAAAAAGGTACAGC 2072
Query 1893 AGAAAGCAAGCAACTGAATGTTTATGAGATAAAGGTCAATAAATTAGAGTTAGAACTAGAAAGTGCCAAACAGA 1966
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2073 AGAAAGCAAGCAACTGAATGTTTATGAGATAAAGGTCAATAAATTAGAGTTAGAACTAGAAAGTGCCAAACAGA 2146
Query 1967 AATTTGGAGAAATCACAGACACCTATCAGAAAGAAATTGAGGACAAAAAGATATCAGAAGAAAATCTTTTGGAA 2040
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2147 AATTTGGAGAAATCACAGACACCTATCAGAAAGAAATTGAGGACAAAAAGATATCAGAAGAAAATCTTTTGGAA 2220
Query 2041 GAGGTTGAGAAAGCAAAAGTAATAGCTGATGAAGCAGTAAAATTACAGAAAGAAATTGATAAGCGATGTCAACA 2114
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2221 GAGGTTGAGAAAGCAAAAGTAATAGCTGATGAAGCAGTAAAATTACAGAAAGAAATTGATAAGCGATGTCAACA 2294
Query 2115 TAAAATAGCTGAAATGGTAGCACTTATGGAAAAACATAAGCACCAATATGATAAGATCATTGAAGAAAGAGACT 2188
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2295 TAAAATAGCTGAAATGGTAGCACTTATGGAAAAACATAAGCACCAATATGATAAGATCATTGAAGAAAGAGACT 2368
Query 2189 CAGAATTAGGACTTTATAAGAGCAAAGAACAAGAACAGTCATCACTGAGAGCATCTTTGGAGATTGAACTATCC 2262
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2369 CAGAATTAGGACTTTATAAGAGCAAAGAACAAGAACAGTCATCACTGAGAGCATCTTTGGAGATTGAACTATCC 2442
Query 2263 AATCTCAAAGCTGAACTTTTGTCTGTTAAGAAGCAACTTGAAATAGAAAGAGAAGAGAAGGAAAAACTCAAAAG 2336
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2443 AATCTCAAAGCTGAACTTTTGTCTGTTAAGAAGCAACTTGAAATAGAAAGAGAAGAGAAGGAAAAACTCAAAAG 2516
Query 2337 AGAGGCAAAAGAAAACACAGCTACTCTTAAAGAAAAAAAAGACAAGAAAACACAAACATTTTTATTGGAAACAC 2410
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2517 AGAGGCAAAAGAAAACACAGCTACTCTTAAAGAAAAAAAAGACAAGAAAACACAAACATTTTTATTGGAAACAC 2590
Query 2411 CTGAAATTTATTGGAAATTGGATTCTAAAGCAGTTCCTTCACAAACTGTATCTCGAAATTTCACATCAGTTGAT 2484
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2591 CTGAAATTTATTGGAAATTGGATTCTAAAGCAGTTCCTTCACAAACTGTATCTCGAAATTTCACATCAGTTGAT 2664
Query 2485 CATGGCATATCCAAAGATAAAAGAGACTATCTGTGGACATCTGCCAAAAATACTTTATCTACACCATTGCCAAA 2558
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2665 CATGGCATATCCAAAGATAAAAGAGACTATCTGTGGACATCTGCCAAAAATACTTTATCTACACCATTGCCAAA 2738
Query 2559 GGCATATACAGTGAAGACACCAACAAAACCAAAACTACAGCAAAGAGAAAACTTGAATATACCCATTGAAGAAA 2632
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2739 GGCATATACAGTGAAGACACCAACAAAACCAAAACTACAGCAAAGAGAAAACTTGAATATACCCATTGAAGAAA 2812
Query 2633 GTAAAAAAAAGAGAAAAATGGCCTTTGAATTTGATATTAATTCAGATAGTTCAGAAACTACTGATCTTTTG--- 2703
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2813 GTAAAAAAAAGAGAAAAATGGCCTTTGAATTTGATATTAATTCAGATAGTTCAGAAACTACTGATCTTTTGTTT 2886
Query 2704 -------------------------------------------------------------------------- 2703
Sbjct 2887 ACAGATGAGGAAACTGAGTCACACAAGTATATTTTTCAAGATCACATAGTTAGTAAGACATGGAACCAAAATTT 2960
Query 2704 --------------------------AGCATGGTTTCAGAAGAAGAGACATTGAAAACACTGTATAGGAACAAT 2751
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2961 GAACACAGTCTGGCTTCATAGACTATAGCATGGTTTCAGAAGAAGAGACATTGAAAACACTGTATAGGAACAAT 3034
Query 2752 AATCCACCAGCTTCTCATCTTTGTGTCAAAACACCAAAAAAGGCCCCTTCATCTCTAACAACCCCTGGATCTAC 2825
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3035 AATCCACCAGCTTCTCATCTTTGTGTCAAAACACCAAAAAAGGCCCCTTCATCTCTAACAACCCCTGGATCTAC 3108
Query 2826 ACTGAAGTTTGGAGCTATAAGAAAAATGCGGGAGGACCGTTGGGCTGTAATTGCTAAAATGGATAGAAAAAAAA 2899
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3109 ACTGAAGTTTGGAGCTATAAGAAAAATGCGGGAGGACCGTTGGGCTGTAATTGCTAAAATGGATAGAAAAAAAA 3182
Query 2900 AACTAAAAGAAGCTGAAAAGTTATTTGTT--------------------------------------------- 2928
|||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3183 AACTAAAAGAAGCTGAAAAGTTATTTGTTTAATTTCAGAGAATCAGTGTAGTTAAGGAGCCTAATAACGTGAAA 3256
Query 2929 -------------------------------------------------------------------------- 2928
Sbjct 3257 CTTATAGTTAATATTTTGTTCTTATTTGCCAGAGCCAAATTTTATCTGGAAGTTGAGACTTAAAAAATACTTGC 3330
Query 2929 -------------------------------------------------------------------------- 2928
Sbjct 3331 ATGAATGATTTGTGTTTCTTTATATTTTTAGCCTAAATGTTAACTACATATTGTCTGGAAACCTGTCATTGTAT 3404
Query 2929 -------------------------------------------------------------------------- 2928
Sbjct 3405 TCAGATAATTAGATGATTATATATTGTTGTTACTTTTTCTTGTATTCATGAAAACTGTTTTTACTAAGTTTTCA 3478
Query 2929 -------------------------------------------------------------------------- 2928
Sbjct 3479 AATTTGTAAAGTTAGCCTTTGAATGCTAAGAATGCATTATTGAGGGTCATTCTTTATTCTTTACTATTAAAATA 3552
Query 2929 ------------- 2928
Sbjct 3553 TTTTGGATGCAAA 3565