Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- TRCN0000477850
- Subject:
- XM_011542037.2
- Aligned Length:
- 2930
- Identities:
- 2348
- Gaps:
- 571
Alignment
Query 1 ATGGAAAAGCAAAAGCCCTTTGCATTGTTCGTACCACCGAGATCAAGCAGCAGTCAGGTGTCTGCGGTGAAACC 74
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ATGGAAAAGCAAAAGCCCTTTGCATTGTTCGTACCACCGAGATCAAGCAGCAGTCAGGTGTCTGCGGTGAAACC 74
Query 75 TCAGACCCTGGGAGGCGATTCCACTTTCTTCAAGAGTTTCAACAAATGTACTGAAGATGATTTTGAGTTTCCAT 148
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 75 TCAGACCCTGGGAGGCGATTCCACTTTCTTCAAGAGTTTCAACAAATGTACTGAAGATGATTTTGAGTTTCCAT 148
Query 149 TTGCAAAGACTAATCTCTCCAAAAATGGGGAAAACATTGATTCAGATCCTGCTTTACAAAAAGTTAATTTCTTG 222
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 149 TTGCAAAGACTAATCTCTCCAAAAATGGGGAAAACATTGATTCAGATCCTGCTTTACAAAAAGTTAATTTCTTG 222
Query 223 CCCGTGCTTGAGCAGGTTGGTAATTCTGACTGTCACTATCAGGAAGGACTAAAAGACTCTGATTTGGAGAATTC 296
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223 CCCGTGCTTGAGCAGGTTGGTAATTCTGACTGTCACTATCAGGAAGGACTAAAAGACTCTGATTTGGAGAATTC 296
Query 297 AGAGGGATTGAGCAGAGTGTATTCAAAACTGTATAAGGAGGCTGAAAAGATAAAAAAATGGAAAGTAAGTACAG 370
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 297 AGAGGGATTGAGCAGAGTGTATTCAAAACTGTATAAGGAGGCTGAAAAGATAAAAAAATGGAAAGTAAGTACAG 370
Query 371 AAGCTGAACTGAGACAGAAAGAAAGTAAGTTGCAAGAAAACAGAAAGATAATTGAAGCACAGCGAAAAGCCATT 444
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 371 AAGCTGAACTGAGACAGAAAGAAAGTAAGTTGCAAGAAAACAGAAAGATAATTGAAGCACAGCGAAAAGCCATT 444
Query 445 CAGGAACTGCAATTTGGAAATGAAAAAGTAAGTTTGAAATTAGAAGAAGGAATACAAGAAAATAAAGATTTAAT 518
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 445 CAGGAACTGCAATTTGGAAATGAAAAAGTAAGTTTGAAATTAGAAGAAGGAATACAAGAAAATAAAGATTTAAT 518
Query 519 AAAAGAGAATAATGCCACAAGGCATTTATGTAATCTACTCAAAGAAACCTGTGCTAGATCTGCAGAAAAGACAA 592
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 519 AAAAGAGAATAATGCCACAAGGCATTTATGTAATCTACTCAAAGAAACCTGTGCTAGATCTGCAGAAAAGACAA 592
Query 593 AGAAATATGAATATGAACGGGAAGAAACCAGGCAAGTTTATATGGATCTAAATAATAACATTGAGAAAATGATA 666
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 593 AGAAATATGAATATGAACGGGAAGAAACCAGGCAAGTTTATATGGATCTAAATAATAACATTGAGAAAATGATA 666
Query 667 ACAGCTTTTGAGGAACTTCGTGTGCAAGCTGAGAATTCCAGACTGGAAATGCATTTTAAGTTAAAGGAAGATTA 740
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 667 ACAGCTTTTGAGGAACTTCGTGTGCAAGCTGAGAATTCCAGACTGGAAATGCATTTTAAGTTAAAGGAAGATTA 740
Query 741 TGAAAAAATCCAACACCTTGAACAAGAATACAAGAAGGAAATAAATGACAAGGAAAAGCAGGTATCACTACTAT 814
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 741 TGAAAAAATCCAACACCTTGAACAAGAATACAAGAAGGAAATAAATGACAAGGAAAAGCAGGTATCACTACTAT 814
Query 815 TGATCCAAATCACTGAGAAAGAAAATAAAATGAAAGATTTAACATTTCTGCTAGAGGAATCCAGAGATAAAGTT 888
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 815 TGATCCAAATCACTGAGAAAGAAAATAAAATGAAAGATTTAACATTTCTGCTAGAGGAATCCAGAGATAAAGTT 888
Query 889 AATCAATTAGAGGAAAAGACAAAATTACAGAGTGAAAACTTAAAACAATCAATTGAGAAACAGCATCATTTGAC 962
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 889 AATCAATTAGAGGAAAAGACAAAATTACAGAGTGAAAACTTAAAACAATCAATTGAGAAACAGCATCATTTGAC 962
Query 963 TAAAGAACTAGAAGATATTAAAGTGTCATTACAAAGAAGTGTGAGTACTCAAAAGGCTTTAGAGGAAGATTTAC 1036
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 963 TAAAGAACTAGAAGATATTAAAGTGTCATTACAAAGAAGTGTGAGTACTCAAAAGGCTTTAGAGGAAGATTTAC 1036
Query 1037 AGATAGCAACAAAAACAATTTGTCAGCTAACTGAAGAAAAAGAAACTCAAATGGAAGAATCTAATAAAGCTAGA 1110
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037 AGATAGCAACAAAAACAATTTGTCAGCTAACTGAAGAAAAAGAAACTCAAATGGAAGAATCTAATAAAGCTAGA 1110
Query 1111 GCTGCTCATTCGTTTGTGGTTACTGAATTTGAAACTACTGTCTGCAGCTTGGAAGAATTATTGAGAACAGAACA 1184
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111 GCTGCTCATTCGTTTGTGGTTACTGAATTTGAAACTACTGTCTGCAGCTTGGAAGAATTATTGAGAACAGAACA 1184
Query 1185 GCAAAGATTGGAAAAAAATGAAGATCAATTGAAAATACTTACCATGGAGCTTCAAAAGAAATCAAGTGAGCTGG 1258
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185 GCAAAGATTGGAAAAAAATGAAGATCAATTGAAAATACTTACCATGGAGCTTCAAAAGAAATCAAGTGAGCTGG 1258
Query 1259 AAGAGATGACTAAGCTTACAAATAACAAAGAAGTAGAACTTGAAGAATTGAAAAAAGTCTTGGGAGAAAAGGAA 1332
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259 AAGAGATGACTAAGCTTACAAATAACAAAGAAGTAGAACTTGAAGAATTGAAAAAAGTCTTGGGAGAAAAGGAA 1332
Query 1333 ACACTTTTATATGAAAATAAACAATTTGAGAAGATTGCTGAAGAATTAAAAGGAACAGAACAAGAACTAATTGG 1406
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333 ACACTTTTATATGAAAATAAACAATTTGAGAAGATTGCTGAAGAATTAAAAGGAACAGAACAAGAACTAATTGG 1406
Query 1407 TCTTCTCCAAGCCAGAGAGAAAGAAGTACATGATTTGGAAATACAGTTAACTGCCATTACCACAAGTGAACAGT 1480
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407 TCTTCTCCAAGCCAGAGAGAAAGAAGTACATGATTTGGAAATACAGTTAACTGCCATTACCACAAGTGAACAGT 1480
Query 1481 ATTATTCAAAAGAGGTTAAAGATCTAAAAACTGAGCTTGAAAACGAGAAGCTTAAGAATACTGAATTAACTTCA 1554
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481 ATTATTCAAAAGAGGTTAAAGATCTAAAAACTGAGCTTGAAAACGAGAAGCTTAAGAATACTGAATTAACTTCA 1554
Query 1555 CACTGCAACAAGCTTTCACTAGAAAACAAAGAGCTCACACAGGAAACAAGTGATATGACCCTAGAACTCAAGAA 1628
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555 CACTGCAACAAGCTTTCACTAGAAAACAAAGAGCTCACACAGGAAACAAGTGATATGACCCTAGAACTCAAGAA 1628
Query 1629 TCAGCAAGAAGATATTAATAATAACAAAAAGCAAGAAGAAAGGATGTTGAAACAAATAGAAAATCTTCAAGAAA 1702
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629 TCAGCAAGAAGATATTAATAATAACAAAAAGCAAGAAGAAAGGATGTTGAAACAAATAGAAAATCTTCAAGAAA 1702
Query 1703 CAGAAACCCAATTAAGAAATGAACTAGAATATGTGAGAGAAGAGCTAAAACAGAAAAGAGATGAAGTTAAATGT 1776
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1703 CAGAAACCCAATTAAGAAATGAACTAGAATATGTGAGAGAAGAGCTAAAACAGAAAAGAGATGAAGTTAAATGT 1776
Query 1777 AAATTGGACAAGAGTGAAGAAAATTGTAACAATTTAAGGAAACAAGTTGAAAATAAAAACAAGTATATTGAAGA 1850
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1777 AAATTGGACAAGAGTGAAGAAAATTGTAACAATTTAAGGAAACAAGTTGAAAATAAAAACAAGTATATTGAAGA 1850
Query 1851 ACTTCAGCAGGAGAATAAGGCCTTGAAAAAAAAAGGTACAGCAGAAAGCAAGCAACTGAATGTTTATGAGATAA 1924
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1851 ACTTCAGCAGGAGAATAAGGCCTTGAAAAAAAAAGGTACAGCAGAAAGCAAGCAACTGAATGTTTATGAGATAA 1924
Query 1925 AGGTCAATAAATTAGAGTTAGAACTAGAAAGTGCCAAACAGAAATTTGGAGAAATCACAGACACCTATCAGAAA 1998
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1925 AGGTCAATAAATTAGAGTTAGAACTAGAAAGTGCCAAACAGAAATTTGGAGAAATCACAGACACCTATCAGAAA 1998
Query 1999 GAAATTGAGGACAAAAAGATATCAGAAGAAAATCTTTTGGAAGAGGTTGAGAAAGCAAAAGTAATAGCTGATGA 2072
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1999 GAAATTGAGGACAAAAAGATATCAGAAGAAAATCTTTTGGAAGAGGTTGAGAAAGCAAAAGTAATAGCTGATGA 2072
Query 2073 AGCAGTAAAATTACAGAAAGAAATTGATAAGCGATGTCAACATAAAATAGCTGAAATGGTAGCACTTATGGAAA 2146
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2073 AGCAGTAAAATTACAGAAAGAAATTGATAAGCGATGTCAACATAAAATAGCTGAAATGGTAGCACTTATGGAAA 2146
Query 2147 AACATAAGCACCAATATGATAAGATCATTGAAGAAAGAGACTCAGAATTAGGACTTTATAAGAGCAAAGAACAA 2220
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2147 AACATAAGCACCAATATGATAAGATCATTGAAGAAAGAGACTCAGAATTAGGACTTTATAAGAGCAAAGAACAA 2220
Query 2221 GAACAGTCATCACTGAGAGCATCTTTGGAGATTGAACTATCCAATCTCAAAGCTGAACTTTTGTCTGTTAAGAA 2294
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2221 GAACAGTCATCACTGAGAGCATCTTTGGAGATTGAACTATCCAATCTCAAAGCTGAACTTTTGTCTGTTAAGAA 2294
Query 2295 GCAACTTGAAATAGAAAGAGAAGAGAAGGAAAAACTCAAAAGAGAGGCAAAAGAAAACACAGCTACTCTTAAAG 2368
||||||||||||||||||||||||||||| |...|||..||||
Sbjct 2295 GCAACTTGAAATAGAAAGAGAAGAGAAGG--------------------------------GTCCCTCCCAAAG 2336
Query 2369 AAAAAAAAGACAAGAAAACACAAACATT-TTTATTGGAAACACCT-GAAATTTATTGGAAATTGGATTCTAAAG 2440
.||.| ||| |.|||| ..||||| |.
Sbjct 2337 GAAGA--------------------ATTATGTATT---TCCACCTCGC-------------------------- 2361
Query 2441 CAGTTCCTTCACAAACTGTATCTCGAAATTTCACATCAGTTGATCATGGCATATCCAAAGATAAAAGAGACTAT 2514
Sbjct 2362 -------------------------------------------------------------------------- 2361
Query 2515 CTGTGGACATCTGCCAAAAATACTTTATCTACACCATTGCCAAAGGCATATACAGTGAAGACACCAACAAAACC 2588
Sbjct 2362 -------------------------------------------------------------------------- 2361
Query 2589 AAAACTACAGCAAAGAGAAAACTTGAATATACCCATTGAAGAAAGTAAAAAAAAGAGAAAAATGGCCTTTGAAT 2662
Sbjct 2362 -------------------------------------------------------------------------- 2361
Query 2663 TTGATATTAATTCAGATAGTTCAGAAACTACTGATCTTTTGAGCATGGTTTCAGAAGAAGAGACATTGAAAACA 2736
Sbjct 2362 -------------------------------------------------------------------------- 2361
Query 2737 CTGTATAGGAACAATAATCCACCAGCTTCTCATCTTTGTGTCAAAACACCAAAAAAGGCCCCTTCATCTCTAAC 2810
Sbjct 2362 -------------------------------------------------------------------------- 2361
Query 2811 AACCCCTGGATCTACACTGAAGTTTGGAGCTATAAGAAAAATGCGGGAGGACCGTTGGGCTGTAATTGCTAAAA 2884
Sbjct 2362 -------------------------------------------------------------------------- 2361
Query 2885 TGGATAGAAAAAAAAAACTAAAAGAAGCTGAAAAGTTATTTGTT 2928
Sbjct 2362 -------------------------------------------- 2361