Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- TRCN0000477873
- Subject:
- XM_017007734.2
- Aligned Length:
- 1734
- Identities:
- 1299
- Gaps:
- 435
Alignment
Query 1 ATGCCGCCGCCCAGCCCCGACTCAGAGAACGGCTTCTACCCCGGGCTGCCGTCGTCCATGAACCCGGCCTTCTT 74
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 75 CCCTAGCTTCTCGCCCGTGTCGCCGCACGGCTGCACTGGGCTCAGCGTTCCGCCGCCCGCCATGAATATACCTC 148
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 149 AACAGCAGCCCCCGCCGCCCGCGGCGCCGCAGCAGCCGCAGAGCCGGAGGTCGCCCGTCAGCCCGCAGCTCCAG 222
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 223 CAGCAGCACCAGGCGGCGGCCGCCGCCTTCCTGCAGCAGAGGAACTCCTATAACCACCACCAGCCTCTTCTGAA 296
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 297 ACAGTCTCCCTGGAGCAACCATCAGAGCAGTGGCTGGGGCACTGGAAGTATGTCCTGGGGAGCAATGCATGGCA 370
|||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 -------------------------------------------------ATGTCCTGGGGAGCAATGCATGGCA 25
Query 371 GAGATCATCGTAGAACCGGAAACATGGGAATCCCAGGAACTATGAATCAGATATCTCCATTGAAGAAACCGTTT 444
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 26 GAGATCATCGTAGAACCGGAAACATGGGAATCCCAGGAACTATGAATCAGATATCTCCATTGAAGAAACCGTTT 99
Query 445 TCTGGTAATGTCATAGCACCACCGAAATTTACTCGCTCAACTCCATCACTGACTCCAAAATCTTGGATTGAAGA 518
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 100 TCTGGTAATGTCATAGCACCACCGAAATTTACTCGCTCAACTCCATCACTGACTCCAAAATCTTGGATTGAAGA 173
Query 519 TAATGTGTTCAGAACAGACAACAATAGTAATACACTCTTACCCTTACAGGTAAGAAT----------------- 575
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 174 TAATGTGTTCAGAACAGACAACAATAGTAATACACTCTTACCCTTACAGGTAAGAATGGTGAGATCTAGTTTGC 247
Query 576 -------------------------------------------------------------------------G 576
|
Sbjct 248 AGTTGCCAGCTTGGGGCTCAGATTCACTCCAAGATAGTTGGTGCACTGCAGCCGGAACATCCAGAATAGACCAG 321
Query 577 GATCGAAGTAGAATGTATGACAGTTTGAATATGCACTCTTTGGAAAATTCCCTTATCGATATTATGAGAGCAGA 650
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 322 GATCGAAGTAGAATGTATGACAGTTTGAATATGCACTCTTTGGAAAATTCCCTTATCGATATTATGAGAGCAGA 395
Query 651 GCATGATCCTCTTAAGGGTCGATTGAGCTATCCACATCCAGGAACTGACAATCTGTTGATGTTAAATGCAAGGA 724
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 396 GCATGATCCTCTTAAGGGTCGATTGAGCTATCCACATCCAGGAACTGACAATCTGTTGATGTTAAATGCAAGGA 469
Query 725 GTTATGGGCGAAGACGAGGTCGTTCTTCCCTCTTTCCAATAGATGATGGCTTGCTTGATGATGGTCACAGTGAT 798
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 470 GTTATGGGCGAAGACGAGGTCGTTCTTCCCTCTTTCCAATAGATGATGGCTTGCTTGATGATGGTCACAGTGAT 543
Query 799 CAAGTTGGAGTTTTAAATTCACCCACCTGTTATTCAGCTCACCAAAATGGAGAGCGAATAGAACGCTTCTCTCG 872
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 544 CAAGTTGGAGTTTTAAATTCACCCACCTGTTATTCAGCTCACCAAAATGGAGAGCGAATAGAACGCTTCTCTCG 617
Query 873 AAAAGTTTTTGTTGGTGGTCTTCCTCCAGATATTGATGAAGATGAAATAACTGCTAGCTTCAGAAGATTTGGGC 946
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 618 AAAAGTTTTTGTTGGTGGTCTTCCTCCAGATATTGATGAAGATGAAATAACTGCTAGCTTCAGAAGATTTGGGC 691
Query 947 CTTTGGTAGTAGATTGGCCTCATAAAGCAGAAAGCAAGTCCTATTTTCCACCAAAAGGCTATGCATTTCTTCTC 1020
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 692 CTTTGGTAGTAGATTGGCCTCATAAAGCAGAAAGCAAGTCCTATTTTCCACCAAAAGGCTATGCATTTCTTCTC 765
Query 1021 TTTCAAGAAGAGAGCTCAGTTCAGGCACTCATTGATGCTTGTATTGAAGAAGATGGAAAACTCTATCTGTGTGT 1094
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 766 TTTCAAGAAGAGAGCTCAGTTCAGGCACTCATTGATGCTTGTATTGAAGAAGATGGAAAACTCTATCTGTGTGT 839
Query 1095 TTCTAGCCCTACTATCAAGGACAAACCAGTTCAAATACGTCCTTGGAATTTAAGTGATAGTGATTTTGTAATGG 1168
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 840 TTCTAGCCCTACTATCAAGGACAAACCAGTTCAAATACGTCCTTGGAATTTAAGTGATAGTGATTTTGTAATGG 913
Query 1169 ATGGTTCTCAGCCTTTGGATCCCCGAAAAACAATTTTTGTTGGAGGTGTTCCTAGGCCATTAAGGGCTGTGGAA 1242
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 914 ATGGTTCTCAGCCTTTGGATCCCCGAAAAACAATTTTTGTTGGAGGTGTTCCTAGGCCATTAAGGGCTGTGGAA 987
Query 1243 CTTGCTATGATCATGGACCGGCTGTATGGTGGAGTTTGTTATGCAGGAATTGATACAGATCCTGAGCTAAAATA 1316
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 988 CTTGCTATGATCATGGACCGGCTGTATGGTGGAGTTTGTTATGCAGGAATTGATACAGATCCTGAGCTAAAATA 1061
Query 1317 CCCAAAAGGTGCTGGGCGAGTTGCTTTCTCCAATCAGCAGAGCTATATTGCTGCCATTAGTGCTCGGTTTGTTC 1390
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1062 CCCAAAAGGTGCTGGGCGAGTTGCTTTCTCCAATCAGCAGAGCTATATTGCTGCCATTAGTGCTCGGTTTGTTC 1135
Query 1391 AGCTTCAGCATGGTGATATTGATAAACGTGTGGAGGTAAAGCCATATGTGCTAGATGACCAGATGTGTGATGAA 1464
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1136 AGCTTCAGCATGGTGATATTGATAAACGTGTGGAGGTAAAGCCATATGTGCTAGATGACCAGATGTGTGATGAA 1209
Query 1465 TGCCAGGGCGCACGCTGTGGTGGAAAATTTGCTCCCTTTTTTTGTGCCAATGTCACTTGCCTGCAGTATTACTG 1538
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1210 TGCCAGGGCGCACGCTGTGGTGGAAAATTTGCTCCCTTTTTTTGTGCCAATGTCACTTGCCTGCAGTATTACTG 1283
Query 1539 TGAGTTTTGTTGGGCAAATATCCACTCTCGTGCTGGACGTGAGTTCCATAAGCCATTGGTAAAGGAAGGTGCTG 1612
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1284 TGAGTTTTGTTGGGCAAATATCCACTCTCGTGCTGGACGTGAGTTCCATAAGCCATTGGTAAAGGAAGGTGCTG 1357
Query 1613 ATCGCCCACGTCAGATCCACTTCCGCTGGAAC 1644
||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1358 ATCGCCCACGTCAGATCCACTTCCGCTGGAAC 1389