Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000477889
• Subject: NM_006778.4
• Aligned Length: 1447
• Identities: 1160
• Gaps: 266

Alignment

Query    1  ATGGCCTCTGCTGCCTCTGTGACCAGCCTGGCAGATGAAGTCAACTGCCCCATCTGTCAGGGTACCCTGAGGGA  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGGCCTCTGCTGCCTCTGTGACCAGCCTGGCAGATGAAGTCAACTGCCCCATCTGTCAGGGTACCCTGAGGGA  74

Query   75  GCCGGTCACTATCGACTGCGGCCACAACTTCTGCCGGGCCTGCCTTACCCGCTACTGTGAGATACCAGGCCCAG  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  GCCGGTCACTATCGACTGCGGCCACAACTTCTGCCGGGCCTGCCTTACCCGCTACTGTGAGATACCAGGCCCAG  148

Query  149  ACCTGGAGGAGTCCCCTACTTGCCCACTCTGCAAAGAACCCTTCCGTCCTGGGAGCTTCCGGCCCAACTGGCAG  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  ACCTGGAGGAGTCCCCTACTTGCCCACTCTGCAAAGAACCCTTCCGTCCTGGGAGCTTCCGGCCCAACTGGCAG  222

Query  223  CTGGCTAACGTGGTGGAGAACATTGAGCGCCTCCAGCTGGTGTCCACACTGGGTTTGGGAGAGGAGGATGTCTG  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  CTGGCTAACGTGGTGGAGAACATTGAGCGCCTCCAGCTGGTGTCCACACTGGGTTTGGGAGAGGAGGATGTCTG  296

Query  297  CCAAGAGCACGGAGAGAAGATCTACTTCTTCTGTGAGGATGATGAGATGCAGTTGTGCGTGGTGTGCCGGGAGG  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  CCAAGAGCACGGAGAGAAGATCTACTTCTTCTGTGAGGATGATGAGATGCAGTTGTGCGTGGTGTGCCGGGAGG  370

Query  371  CTGGGGAGCACGCTACCCACACCATGCGCTTCCTGGAGGATGCAGCGGCTCCCTATAGGGAACAAATCCATAAG  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  CTGGGGAGCACGCTACCCACACCATGCGCTTCCTGGAGGATGCAGCGGCTCCCTATAGGGAACAAATCCATAAG  444

Query  445  TGTCTTAAATGTCTAAGAAAAGAGAGAGAGGAGATTCAAGAAATCCAGTCAAGAGAAAATAAAAGGATGCAAGT  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  TGTCTTAAATGTCTAAGAAAAGAGAGAGAGGAGATTCAAGAAATCCAGTCAAGAGAAAATAAAAGGATGCAAGT  518

Query  519  CCTCCTGACTCAGGTGTCCACCAAGAGACAACAGGTGATTTCTGAGTTCGCACACCTGAGGAAGTTTCTAGAGG  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  CCTCCTGACTCAGGTGTCCACCAAGAGACAACAGGTGATTTCTGAGTTCGCACACCTGAGGAAGTTTCTAGAGG  592

Query  593  AACAGCAGAGCATCCTCTTAGCACAATTGGAGAGCCAGGATGGGGACATCTTGAGGCAACGGGATGAATTTGAT  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  AACAGCAGAGCATCCTCTTAGCACAATTGGAGAGCCAGGATGGGGACATCTTGAGGCAACGGGATGAATTTGAT  666

Query  667  TTGCTGGTTGCTGGGGAGATCTGCCGGTTTAGTGCTCTTATTGAAGAACTGGAGGAGAAGAATGAGAGGCCAGC  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  TTGCTGGTTGCTGGGGAGATCTGCCGGTTTAGTGCTCTTATTGAAGAACTGGAGGAGAAGAATGAGAGGCCAGC  740

Query  741  AAGGGAGCTCCTGACGGACATCAGAAGCACTCTAATAAGATGTGAAACCAGAAAGTGCCGGAAACCGGTGGCTG  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  AAGGGAGCTCCTGACGGACATCAGAAGCACTCTAATAAGATGTGAAACCAGAAAGTGCCGGAAACCGGTGGCTG  814

Query  815  TGTCGCCAGAGCTGGGCCAGAGGATTCGGGACTTTCCCCAGCAGGCCCTCCCGCTGCAGAGGGAGATGAAGATG  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  TGTCGCCAGAGCTGGGCCAGAGGATTCGGGACTTTCCCCAGCAGGCCCTCCCGCTGCAGAGGGAGATGAAGATG  888

Query  889  TTTCTGGAAAAACTATGCTTTGAGTTGGACTATGAGCCAGCTCACATTTCTCTAGACCCTCAGACTTCCCACCC  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  TTTCTGGAAAAACTATGCTTTGAGTTGGACTATGAGCCAGCTCACATTTCTCTAGACCCTCAGACTTCCCACCC  962

Query  963  CAAGCTCCTCTTGTCCGAGGACCACCAGCGAGCTCAGTTCTCCTACAAATGGCAGAACTCACCAGACAACCCCC  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  CAAGCTCCTCTTGTCCGAGGACCACCAGCGAGCTCAGTTCTCCTACAAATGGCAGAACTCACCAGACAACCCCC  1036

Query 1037  AGCGTTTTGACCGGGCCACCTGTGTTCTGGCCCACACTGGCATCACAGGGGGGAGACACACGTGGGTGTGGA--  1108
            |.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||..||  
Sbjct 1037  AACGTTTTGACCGGGCCACCTGTGTTCTGGCCCACACTGGCATCACAGGGGGGAGACACACGTGGGTGGTGAGT  1110

Query 1109  -------TGGCC----AGGGTACCT--------------------------------------GGGGA-CTCAG  1132
                   |||||    .|||.|.||                                      ||||| ||..|
Sbjct 1111  ATAGACCTGGCCCATGGGGGCAGCTGCACCGTGGGCGTGGTGAGCGAGGATGTGCAGCGGAAGGGGGAGCTTCG  1184

Query 1133  GCTGCTGCCAG-----------------------------------TTCTGCTCACCACCATCCGTGCT-----  1166
            |||||.|||||                                   |||..|||..|    ||.|.|||     
Sbjct 1185  GCTGCGGCCAGAGGAGGGGGTGTGGGCTGTGAGGCTGGCTTGGGGCTTCGTCTCGGC----TCTGGGCTCCTTC  1254

Query 1167  ----------TGGCACAGAAGTAGCTGCA---------------------------------------------  1185
                      ||.|.|.||||.|||.||.                                             
Sbjct 1255  CCCACACGGCTGACCCTGAAGGAGCAGCCCCGGCAGGTGAGGGTGTCTCTTGACTATGAGGTGGGCTGGGTGAC  1328

Query 1186  --------------------------------------------------------------------------  1185
                                                                                      
Sbjct 1329  CTTCACCAACGCTGTCACCCGAGAGCCCATCTACACCTTCACTGCCTCCTTCACTAGGAAGGTCATTCCCTTCT  1402

Query 1186  -----------------------------------------  1185
                                                     
Sbjct 1403  TTGGGCTCTGGGGCCGAGGGTCCAGTTTCTCCCTGAGCTCC  1443