Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- TRCN0000477889
- Subject:
- XM_011514223.2
- Aligned Length:
- 1504
- Identities:
- 1146
- Gaps:
- 326
Alignment
Query 1 -----------------ATGGCCTCTGCTGCCTCTGTGA-CCAGCCTGGC-------------AGA-------- 35
|||||.|||.| .|||||||| ||||.||..| |||
Sbjct 1 ATGGCAGAAAGGCTGGAATGGCATCTCC--ACTCTGTGACCCAGTCTCCCACTTGCCCCCAAAAGAATATTTCT 72
Query 36 --TGA-AGT---CAACTG------CCCCATCTGTC------AGGGTACCCTGAGGGAGCCGGTCACTATCGACT 91
||| ||| ||.||| |.||| ||.|| ..|||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 73 TCTGACAGTGGACAGCTGACATATCACCA-CTTTCCTTCTACTGGTACCCTGAGGGAGCCGGTCACTATCGACT 145
Query 92 GCGGCCACAACTTCTGCCGGGCCTGCCTTACCCGCTACTGTGAGATACCAGGCCCAGACCTGGAGGAGTCCCCT 165
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 146 GCGGCCACAACTTCTGCCGGGCCTGCCTTACCCGCTACTGTGAGATACCAGGCCCAGACCTGGAGGAGTCCCCT 219
Query 166 ACTTGCCCACTCTGCAAAGAACCCTTCCGTCCTGGGAGCTTCCGGCCCAACTGGCAGCTGGCTAACGTGGTGGA 239
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 220 ACTTGCCCACTCTGCAAAGAACCCTTCCGTCCTGGGAGCTTCCGGCCCAACTGGCAGCTGGCTAACGTGGTGGA 293
Query 240 GAACATTGAGCGCCTCCAGCTGGTGTCCACACTGGGTTTGGGAGAGGAGGATGTCTGCCAAGAGCACGGAGAGA 313
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 294 GAACATTGAGCGCCTCCAGCTGGTGTCCACACTGGGTTTGGGAGAGGAGGATGTCTGCCAAGAGCACGGAGAGA 367
Query 314 AGATCTACTTCTTCTGTGAGGATGATGAGATGCAGTTGTGCGTGGTGTGCCGGGAGGCTGGGGAGCACGCTACC 387
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 368 AGATCTACTTCTTCTGTGAGGATGATGAGATGCAGTTGTGCGTGGTGTGCCGGGAGGCTGGGGAGCACGCTACC 441
Query 388 CACACCATGCGCTTCCTGGAGGATGCAGCGGCTCCCTATAGGGAACAAATCCATAAGTGTCTTAAATGTCTAAG 461
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 442 CACACCATGCGCTTCCTGGAGGATGCAGCGGCTCCCTATAGGGAACAAATCCATAAGTGTCTTAAATGTCTAAG 515
Query 462 AAAAGAGAGAGAGGAGATTCAAGAAATCCAGTCAAGAGAAAATAAAAGGATGCAAGTCCTCCTGACTCAGGTGT 535
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 516 AAAAGAGAGAGAGGAGATTCAAGAAATCCAGTCAAGAGAAAATAAAAGGATGCAAGTCCTCCTGACTCAGGTGT 589
Query 536 CCACCAAGAGACAACAGGTGATTTCTGAGTTCGCACACCTGAGGAAGTTTCTAGAGGAACAGCAGAGCATCCTC 609
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 590 CCACCAAGAGACAACAGGTGATTTCTGAGTTCGCACACCTGAGGAAGTTTCTAGAGGAACAGCAGAGCATCCTC 663
Query 610 TTAGCACAATTGGAGAGCCAGGATGGGGACATCTTGAGGCAACGGGATGAATTTGATTTGCTGGTTGCTGGGGA 683
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 664 TTAGCACAATTGGAGAGCCAGGATGGGGACATCTTGAGGCAACGGGATGAATTTGATTTGCTGGTTGCTGGGGA 737
Query 684 GATCTGCCGGTTTAGTGCTCTTATTGAAGAACTGGAGGAGAAGAATGAGAGGCCAGCAAGGGAGCTCCTGACGG 757
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 738 GATCTGCCGGTTTAGTGCTCTTATTGAAGAACTGGAGGAGAAGAATGAGAGGCCAGCAAGGGAGCTCCTGACGG 811
Query 758 ACATCAGAAGCACTCTAATAAGATGTGAAACCAGAAAGTGCCGGAAACCGGTGGCTGTGTCGCCAGAGCTGGGC 831
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 812 ACATCAGAAGCACTCTAATAAGATGTGAAACCAGAAAGTGCCGGAAACCGGTGGCTGTGTCGCCAGAGCTGGGC 885
Query 832 CAGAGGATTCGGGACTTTCCCCAGCAGGCCCTCCCGCTGCAGAGGGAGATGAAGATGTTTCTGGAAAAACTATG 905
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 886 CAGAGGATTCGGGACTTTCCCCAGCAGGCCCTCCCGCTGCAGAGGGAGATGAAGATGTTTCTGGAAAAACTATG 959
Query 906 CTTTGAGTTGGACTATGAGCCAGCTCACATTTCTCTAGACCCTCAGACTTCCCACCCCAAGCTCCTCTTGTCCG 979
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 960 CTTTGAGTTGGACTATGAGCCAGCTCACATTTCTCTAGACCCTCAGACTTCCCACCCCAAGCTCCTCTTGTCCG 1033
Query 980 AGGACCACCAGCGAGCTCAGTTCTCCTACAAATGGCAGAACTCACCAGACAACCCCCAGCGTTTTGACCGGGCC 1053
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||
Sbjct 1034 AGGACCACCAGCGAGCTCAGTTCTCCTACAAATGGCAGAACTCACCAGACAACCCCCAACGTTTTGACCGGGCC 1107
Query 1054 ACCTGTGTTCTGGCCCACACTGGCATCACAGGGGGGAGACACACGTGGGTGTGGA---------TGGCC----A 1114
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||..|| ||||| .
Sbjct 1108 ACCTGTGTTCTGGCCCACACTGGCATCACAGGGGGGAGACACACGTGGGTGGTGAGTATAGACCTGGCCCATGG 1181
Query 1115 GGGTACCT--------------------------------------GGGGA-CTCAGGCTGCTGCCAG------ 1143
|||.|.|| ||||| ||..||||||.|||||
Sbjct 1182 GGGCAGCTGCACCGTGGGCGTGGTGAGCGAGGATGTGCAGCGGAAGGGGGAGCTTCGGCTGCGGCCAGAGGAGG 1255
Query 1144 -----------------------------TTCTGCTCACCACCATCCGTGCT---------------TGGCACA 1173
|||..|||..| ||.|.||| ||.|.|.
Sbjct 1256 GGGTGTGGGCTGTGAGGCTGGCTTGGGGCTTCGTCTCGGC----TCTGGGCTCCTTCCCCACACGGCTGACCCT 1325
Query 1174 GAAGTAGCTGCA-------------------------------------------------------------- 1185
||||.|||.||.
Sbjct 1326 GAAGGAGCAGCCCCGGCAGGTGAGGGTGTCTCTTGACTATGAGGTGGGCTGGGTGACCTTCACCAACGCTGTCA 1399
Query 1186 -------------------------------------------------------------------------- 1185
Sbjct 1400 CCCGAGAGCCCATCTACACCTTCACTGCCTCCTTCACTAGGAAGGTCATTCCCTTCTTTGGGCTCTGGGGCCGA 1473
Query 1186 ------------------------ 1185
Sbjct 1474 GGGTCCAGTTTCTCCCTGAGCTCC 1497