Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- TRCN0000477893
- Subject:
- XM_011241407.1
- Aligned Length:
- 2147
- Identities:
- 1596
- Gaps:
- 439
Alignment
Query 1 ATGTCTCGCAGTCCTGATGCGAAGGAAGACCCTGTGGAGTGCCCTCTTTGCATGGAGCCCTTGGAGATAGATGA 74
||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.||||||||
Sbjct 1 ATGTCTCGCAGTCCTGATGCAAAGGAAGACCCTGTGGAATGCCCTCTTTGCATGGAGCCCTTGGAAATAGATGA 74
Query 75 TATCAACTTTTTCCCTTGCACCTGTGGCTACCAGATTTGCCGATTTTGTTGGCATCGAATTCGCACTGATGAAA 148
|||.||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.|
Sbjct 75 TATTAACTTTTTCCCTTGCACCTGTGGCTACCAGATATGCCGATTTTGTTGGCATCGAATTCGCACTGATGAGA 148
Query 149 ATGGGCTTTGTCCTGCATGTAGAAAGCCATATCCAGAAGACCCAGCAGTTTATAAACCACTCTCCCAGGAAGAG 222
|||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.|||||||||||.||||||||.|||||||||||.
Sbjct 149 ATGGGCTTTGTCCTGCATGTAGAAAACCATATCCAGAAGATCCAGCAGTTTACAAACCACTTTCCCAGGAAGAA 222
Query 223 CTGCAAAGGATAAAGAATGAGAAAAAACAGAAACAAAATGAGAGAAAACAGAAAATATCAGAAAATCGCAAACA 296
.|.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.|||||||||.|.|||||
Sbjct 223 TTACAAAGGATAAAGAATGAGAAAAAACAGAAACAAAATGAAAGAAAACAGAAAATCTCAGAAAATAGAAAACA 296
Query 297 TTTGGCTAGTGTACGTGTCGTACAAAAAAACCTCGTCTTTGTTGTAGGTTTATCTCAGCGCCTAGCAGACCCAG 370
||||||||||||||||||.||||||||||||||.||.||||||||||||.|.||.|||||||||||||||||||
Sbjct 297 TTTGGCTAGTGTACGTGTTGTACAAAAAAACCTTGTGTTTGTTGTAGGTCTGTCACAGCGCCTAGCAGACCCAG 370
Query 371 AGGTTTTAAAACGACCAGAATATTTTGGGAAGTTTGGTAAAATACATAAAGTTGTCATCAATAATAGCACATCA 444
|.|||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.
Sbjct 371 AAGTTTTAAAACGACCAGAGTATTTTGGGAAGTTTGGTAAAATACATAAAGTTGTCATCAATAATAGCACATCC 444
Query 445 TATGCAGGCTCACAGGGTCCAAGTGCCAGTGCTTATGTAACCTATATCCGGTCAGAAGACGCTCTCAGAGCCAT 518
||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.|||||||||||.||
Sbjct 445 TATGCAGGCTCACAGGGTCCGAGTGCCAGTGCTTATGTAACGTATATCCGGTCAGAAGATGCTCTCAGAGCAAT 518
Query 519 ACAGTGTGTCAACAATGTGGTAGTAGATGGCAGAACACTTAAGGCATCTCTAGGTACAACAAAATACTGCAGTT 592
|||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.|||||||||.|||||||||||||.||||||||||
Sbjct 519 ACAGTGTGTCAACAATGTGGTAGTAGATGGCAGGACACTAAAGGCATCTTTAGGTACAACAAAGTACTGCAGTT 592
Query 593 ACTTCTTAAAGAATATGCAGTGTCCAAAACCTGACTGCATGTATCTTCATGAATTGGGGGATGAGGCGGCCAGC 666
|.|||||||||||.||||||||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.||||||
Sbjct 593 ATTTCTTAAAGAACATGCAGTGCCCAAAGCCTGACTGCATGTATCTTCATGAATTGGGAGATGAGGCAGCCAGC 666
Query 667 TTCACAAAAGAGGAAATGCAGGCGGGTAAACACCAAGAATATGAACAGAAGCTACTTCAAGAATTATATAAATT 740
|||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||
Sbjct 667 TTCACAAAAGAGGAAATGCAGGCGGGTAAGCACCAAGAATATGAACAGAAGCTCCTCCAAGAATTATATAAATT 740
Query 741 AAATCCCAATTTTCTTCAGCTATCTACGGGTTCAGTTGATAAAAATAAGAACAAAGTGACACCACTGCAGAG-- 812
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||.|.||.||
Sbjct 741 AAATCCCAATTTTCTTCAGCTATCTACGGGTTCAGTTGATAAGAATAAGAACAAAGTGACACCATTACAAAGGT 814
Query 813 -------CCCCATTGACAAACCTTCAGATTCTCTCAGTATAGGGAACGGTGATAATTCCCAGCAGATATCTAAC 879
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.||||||||||||
Sbjct 815 ATGATACCCCCATTGACAAACCTTCAGATTCTCTCAGTATAGGGAATGGTGATAATTCCCAACAGATATCTAAC 888
Query 880 AGTGATACGCCTTCACCACCACCTGGTTTGTCAAAATCCAATCCAGTCATCCCCATCAGTTCATCCAATCACAG 953
|||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.||.|||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 889 AGTGATACGCCTTCACCACCACCTGGTTTATCAAAATCCAACCCTGTCATCCCCATCAGTTCATCCAATCACAG 962
Query 954 TGCACGGTCCCCTTTTGAAGGGGCAGTAACAGAGTCACAGTCGTTATTCTCAGACATTTTTCGCCATCCCAACC 1027
|||..||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||.|||||||||.|||||||
Sbjct 963 TGCGAGGTCTCCTTTTGAAGGGGCAGTAACAGAGTCACAGTCATTATTCTCAGACAATTTTCGCCACCCCAACC 1036
Query 1028 CTATCCCAAGTGGGCTTCCTCCTTTCCCCAGCTCCCCACAGACATCCAGTGACTGGCCTACAGCACCAGAACCA 1101
||||.||||||||||||||||||||.||||||||.|||||||||.|||||||.|||||||||||.|||||||||
Sbjct 1037 CTATACCAAGTGGGCTTCCTCCTTTTCCCAGCTCTCCACAGACACCCAGTGATTGGCCTACAGCTCCAGAACCA 1110
Query 1102 CAGAGCCTCTTCACATCAGAAACAATCCCAGTATCATCCTCTACAGACTGGCAAGCAGCTTTTGGCTTTGGTTC 1175
||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.||||||||||||||||||||.||.|||||||||||
Sbjct 1111 CAGAGCCTCTTCACATCAGAAACAATCCCAGTTTCATCATCTACAGACTGGCAAGCAGCATTCGGCTTTGGTTC 1184
Query 1176 TTCTAAACAACCAGAGGATGACTTGGGTTTTGATCCCTTCGATGTCACTCGAAAAGCCTTAGCAGACCTGATTG 1249
|||||||||||||||||||||||||||.|||||.|||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185 TTCTAAACAACCAGAGGATGACTTGGGGTTTGACCCCTTTGATGTCACTCGAAAAGCCTTAGCAGACCTGATTG 1258
Query 1250 AGAAGGAACTGTCCGTTCAAGACCAACCTTCCCTTTCGCCCACATCTCTTCAGAACTCCTCTTCACACACTACA 1323
||||||||||.|||||.|||||.||||||||||||||.||||||||||||||||||.||||.|||||||||||.
Sbjct 1259 AGAAGGAACTATCCGTCCAAGATCAACCTTCCCTTTCCCCCACATCTCTTCAGAACGCCTCCTCACACACTACG 1332
Query 1324 ACCGCCAAAGGTCCAGGCTCTGGATTCCTGCATCCTGCTGCAGCTACAAATGCCAATTCTCTCAATAGTACCTT 1397
|||||||||||.||||||||||||||||||||..||||||||.|||||||||||||.|||||||||||||||||
Sbjct 1333 ACCGCCAAAGGGCCAGGCTCTGGATTCCTGCACTCTGCTGCACCTACAAATGCCAACTCTCTCAATAGTACCTT 1406
Query 1398 TTCAGTCTTGCCCCAGAGGTTCCCTCAATTTCAGCAGCACCGAGCGGTTTATAATTCATTCAGTTTTCCAGGCC 1471
||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||.||||||||||||
Sbjct 1407 TTCAGTCTTGCCACAGAGGTTCCCTCAATTTCAGCAGCACCGAGCAGTTTATAATTCGTTCGGTTTTCCAGGCC 1480
Query 1472 AGGCAGCCCGCTATCCTTGGATGGCCTTTCCACGCAATAGCATCATGCACTTGAACCACACAGCAAACCCCACC 1545
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481 AGGCAGCCCGCTATCCTTGGATGGCCTTTCCACGCAATAGCATCATGCACTTGAACCACACAGCAAACCCCACC 1554
Query 1546 TCAAATAGTAATTTCTTGGACTTGAATCTCCCGCCACAGCACAACACAGGTCTGGGAGGGATCCCTGTAGCAGG 1619
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||..||||| |
Sbjct 1555 TCAAATAGTAATTTCTTGGACTTGAATCTCCCGCCACAGCACAACACAGGTCTGGGAGGGATCCCCATAGCA-G 1627
Query 1620 GGAAGAAGAGGT-----GAAGGTTT---------CGACCATGCCA-------CT---GTCAACCTCTTCCCATT 1669
..||.||.||.| ||..|||| .|| |||.|| || |.| ||.|||.|||| .
Sbjct 1628 ACAACAACAGTTCTGTAGAGAGTTTAAATATGAAGGA--ATGGCAGGACGGGCTAAGGGC-ACTTCTACCCA-A 1697
Query 1670 CATT-ACAACAA-------GGACAG-------------CAGCCTACAAGTCTCCACACTACTGTGGCC------ 1716
|||| |||.||| ||||.| |..|||.||| |.||| ||.||.|||..|
Sbjct 1698 CATTAACATCAACTTTGGTGGACTGCCCAATTCTTCTTCCCCCTCCAA--CGCCA-ACCACAGTGCACCAACGT 1768
Query 1717 -------------------------------------------------------------------------- 1716
Sbjct 1769 CCAACACTGCCACCACGGACAGCGTGAGTTGGGACAGCCCTGGCAGCTGGACAGACCCAGCCATCATCACAGGT 1842
Query 1717 -------------------------------------------------------------------------- 1716
Sbjct 1843 ATTCCAGCATCTTCAGGAAACACTTTAGACTCTATTCAAGACGACAATCCTCCACACTGGCTAAAATCCCTACA 1916
Query 1717 -------------------------------------------------------------------------- 1716
Sbjct 1917 GGCCCTCACAGAGATGGACGGCCCCAGCGCTGCCTCGTCACAACCCCATCACAGCGCCCCCTTCAGCACACAGA 1990
Query 1717 -------------------------------------------------------------------------- 1716
Sbjct 1991 TCCCTCTGCACAGAGCCAGTTGGAACCCCTACCCACCTCCTTCAAATCCCTCCAGCTTCCACTCTCCACCCCCA 2064
Query 1717 -------------------------------------------------------------------------- 1716
Sbjct 2065 GGCTTCCAGACAGCCTTCAGACCCCCCAGCAAAACCCCCACAGATCTGCTACAGAGTTCCACACTGGACCGCCA 2138
Query 1717 - 1716
Sbjct 2139 C 2139