Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000477913
• Subject: XM_005265406.2
• Aligned Length: 1383
• Identities: 1167
• Gaps: 213

Alignment

Query    1  ATGCGGAGACTGGTGCACGACCTCCTGCCCCCCGAGGTCTGCAGTCTCCTGAACCCAGCAGCCATCTACGCCAA  74
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query   75  CAACGAGATCAGCCTGCGTGACGTTGAGGTCTACGGCTTTGACTACGACTACACCCTGGACCAGTATGCAGACG  148
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  149  CACTGCACCCCGAGATCTTCAGTACCGCCCGTGACATCCTGATCGAGCACTACAAGAGCCTTCTGATGAAGATT  222
                                                                             |||||||||
Sbjct    1  -----------------------------------------------------------------ATGAAGATT  9

Query  223  GACGCCTTCCACTACGTGCAGCTGGGGACAGCCTACAGGGGCCTCCAGCCTGTGCCAGACGAGGAGGTGATTGA  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   10  GACGCCTTCCACTACGTGCAGCTGGGGACAGCCTACAGGGGCCTCCAGCCTGTGCCAGACGAGGAGGTGATTGA  83

Query  297  GCTGTATGGGGGTACCCAGCACATCCCACTATACCAGATGAGTGGCTTCTATGGCAAGGGTCCCTCCATTAAGC  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   84  GCTGTATGGGGGTACCCAGCACATCCCACTATACCAGATGAGTGGCTTCTATGGCAAGGGTCCCTCCATTAAGC  157

Query  371  AGTTCATGGACATCTTCTCGCTACCGGAGATGGCTCTGCTGTCCTGTGTGGTGGACTACTTTCTGGGCCACAGC  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  158  AGTTCATGGACATCTTCTCGCTACCGGAGATGGCTCTGCTGTCCTGTGTGGTGGACTACTTTCTGGGCCACAGC  231

Query  445  CTGGAGTTTGACCAAGCACATCTCTACAAGGACGTGACGGACGCCATCCGAGACGTGCATGTGAAGGGCCTCAT  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  232  CTGGAGTTTGACCAAGCACATCTCTACAAGGACGTGACGGACGCCATCCGAGACGTGCATGTGAAGGGCCTCAT  305

Query  519  GTACCAGTGGATCGAGCAGGACATGGAGAAGTACATCCTGAGAGGGGATGAGACGTTTGCTGTCCTGAGCCGCC  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  306  GTACCAGTGGATCGAGCAGGACATGGAGAAGTACATCCTGAGAGGGGATGAGACGTTTGCTGTCCTGAGCCGCC  379

Query  593  TGGTGGCCCATGGGAAGCAGCTGTTCCTCATCACCAACAGTCCTTTCAGCTTCGTAGACAAGGGGATGCGGCAC  666
            ||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  380  TGGTGGCCCATGGGAAACAGCTGTTCCTCATCACCAACAGTCCTTTCAGCTTCGTAGACAAGGGGATGCGGCAC  453

Query  667  ATGGTGGGTCCCGATTGGCGCCAGCTCTTCGATGTGGTCATTGTCCAGGCAGACAAGCCCAGCTTCTTCACTGA  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  454  ATGGTGGGTCCCGATTGGCGCCAGCTCTTCGATGTGGTCATTGTCCAGGCAGACAAGCCCAGCTTCTTCACTGA  527

Query  741  CCGGCGCAAGCCTTTCAGAAAACTCGATGAGAAGGGCTCACTTCAGTGGGACCGGATCACCCGCTTGGAAAAGG  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  528  CCGGCGCAAGCCTTTCAGAAAACTCGATGAGAAGGGCTCACTTCAGTGGGACCGGATCACCCGCTTGGAAAAGG  601

Query  815  GCAAGATCTATCGGCAGGGAAACCTGTTTGACTTCTTGCGCTTGACGGAATGGCGTGGCCCCCGCGTGCTCTAC  888
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  602  GCAAGATCTATCGGCAGGGAAACCTGTTTGACTTCTTACGCTTGACGGAATGGCGTGGCCCCCGCGTGCTCTAC  675

Query  889  TTCGGGGACCACCTCTATAGTGATCTGGCGGATCTCATGCTGCGGCACGGCTGGCGCACAGGCGCCATCATCCC  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  676  TTCGGGGACCACCTCTATAGTGATCTGGCGGATCTCATGCTGCGGCACGGCTGGCGCACAGGCGCCATCATCCC  749

Query  963  CGAGCTGGAGCGTGAGATCCGCATCATCAACACGGAGCAGTACATGCACTCGCTGACGTGGCAACAGGCGCTCA  1036
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||
Sbjct  750  CGAGCTGGAGCGTGAGATCCGCATCATCAACACGGAGCAGTACATGCACTCGCTGACGTGGCAGCAGGCGCTCA  823

Query 1037  CGGGGCTGCTGGAGCGCATGCAGACCTATCAGGACGCGGAGTCGAGGCAGGTGCTGGCTGCCTGGATGAAAGAG  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  824  CGGGGCTGCTGGAGCGCATGCAGACCTATCAGGACGCGGAGTCGAGGCAGGTGCTGGCTGCCTGGATGAAAGAG  897

Query 1111  CGGCAGGAGCTGAGGTGCATCACCAAGGCCCTGTTCAATGCGCAGTTCGGCAGCATCTTCCGCACCTTCCACAA  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  898  CGGCAGGAGCTGAGGTGCATCACCAAGGCCCTGTTCAATGCGCAGTTCGGCAGCATCTTCCGCACCTTCCACAA  971

Query 1185  CCCCACCTACTTCTCAAGGCGCCTCGTGCGCTTCTCTGACCTCTACATGGCCTCCCTCAGCTGCCTGCTCAACT  1258
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  972  CCCCACCTACTTCTCAAGGCGCCTCGTGCGCTTCTCTGACCTCTACATGGCCTCCCTCAGCTGCCTGCTCAACT  1045

Query 1259  ACCGCGTGGACTTCACCTTCTACCCACGCCGTACGCCGCTGCAGCACGAGGCACCCCTCTGGATGGACCAGCTC  1332
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1046  ACCGCGTGGACTTCACCTTCTACCCACGCCGTACGCCGCTGCAGCACGAGGCACCCCTCTGGATGGACCAGCTC  1119

Query 1333  TGCACCGGCTGCATGAAGACCCCCTTCCTTGGTGACATGGCCCACATCCGC  1383
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1120  TGCACCGGCTGCATGAAGACCCCCTTCCTTGGTGACATGGCCCACATCCGC  1170