Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000477913
• Subject: XM_006519507.2
• Aligned Length: 1660
• Identities: 1243
• Gaps: 278

Alignment

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct    1  ATGGCGGGTGCCGGACTGCGGGCGACAGCTAGGCGCTTGCTGCTGTGCAGAGGCCACAGCGGACCGCGGGCCGC  74

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct   75  CTCGTCCTCACCCTCCTGCCCTGGCTGCGGCCCGCCGGGTCCCGGAGCCCACTGCCCCAGCACCCCGCGCTCGG  148

Query    1  -----------------------------------------------------ATGCGGAGACTGGTGCACGAC  21
                                                                 ||||||||.||||||||||||
Sbjct  149  CGCCCGCAGACGGCGCGGACCTCAGCGCGCACTTATGGGCTCGTTACCAGGACATGCGGAGGCTGGTGCACGAC  222

Query   22  CTCCTGCCCCCCGAGGTCTGCAGTCTCCTGAACCCAGCAGCCATCTACGCCAACAACGAGATCAGCCTGCGTGA  95
            ||.||||||||.|||||||||||.|||||.|||||||||||.||.||.||||||||.||||||||||||.||||
Sbjct  223  CTTCTGCCCCCTGAGGTCTGCAGCCTCCTAAACCCAGCAGCTATTTATGCCAACAATGAGATCAGCCTGAGTGA  296

Query   96  CGTTGAGGTCTACGGCTTTGACTACGACTACACCCTGGACCAGTATGCAGACGCACTGCACCCCGAGATCTTCA  169
            |||.||.|||||.||||||||||||||||||||.||||.|||||||||.||.|||||||||||.||||||||||
Sbjct  297  CGTCGAAGTCTATGGCTTTGACTACGACTACACGCTGGCCCAGTATGCGGATGCACTGCACCCTGAGATCTTCA  370

Query  170  GTACCGCCCGTGACATCCTGATCGAGCACTAC------------------------------------------  201
            .|.|.|||||.||||||.||||.|||||||||                                          
Sbjct  371  ATGCTGCCCGGGACATCTTGATAGAGCACTACAAGTATCCTGAGGGGATCCGGAAGTATGACTATGACCCCAGC  444

Query  202  ---------------------------------AAGAGCCTTCTGATGAAGATTGACGCCTTCCACTACGTGCA  242
                                             |||||||||||||||||.||||||||.||.|||||.||.||
Sbjct  445  TTTGCCATCCGTGGCCTGCACTACGACATTCAGAAGAGCCTTCTGATGAAAATTGACGCTTTTCACTATGTACA  518

Query  243  GCTGGGGACAGCCTACAGGGGCCTCCAGCCTGTGCCAGACGAGGAGGTGATTGAGCTGTATGGGGGTACCCAGC  316
            .|||||.||.|||||||||||||||.||||||||||.|||||.||.|||||.||.|||||.||.||.|||||||
Sbjct  519  ACTGGGAACGGCCTACAGGGGCCTCAAGCCTGTGCCGGACGATGAAGTGATCGACCTGTACGGCGGCACCCAGC  592

Query  317  ACATCCCACTATACCAGATGAGTGGCTTCTATGGCAAGGGTCCCTCCATTAAGCAGTTCATGGACATCTTCTCG  390
            ||||||||||.|||||||||||.|||||||||||||||||.||.||.||.||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  ACATCCCACTCTACCAGATGAGCGGCTTCTATGGCAAGGGCCCATCTATCAAGCAGTTCATGGACATCTTCTCG  666

Query  391  CTACCGGAGATGGCTCTGCTGTCCTGTGTGGTGGACTACTTTCTGGGCCACAGCCTGGAGTTTGACCAAGCACA  464
            ||.||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||.|||
Sbjct  667  CTCCCAGAGATGGCTCTGCTGTCCTGTGTGGTGGACTACTTTCTGGGCCACGGCCTGGAGTTTGACCAAGTACA  740

Query  465  TCTCTACAAGGACGTGACGGACGCCATCCGAGACGTGCATGTGAAGGGCCTCATGTACCAGTGGATCGAGCAGG  538
            ||||||||||||.||||||||.||.|||||.||.||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.|
Sbjct  741  TCTCTACAAGGATGTGACGGATGCTATCCGCGATGTGCATGTAAAGGGCCTCATGTACCAGTGGATCGAGCAAG  814

Query  539  ACATGGAGAAGTACATCCTGAGAGGGGATGAGACGTTTGCTGTCCTGAGCCGCCTGGTGGCCCATGGGAAGCAG  612
            |||||||||||||||||||||||||.||||||||.|||||.||.||||||||||||||||||||||||||.|||
Sbjct  815  ACATGGAGAAGTACATCCTGAGAGGAGATGAGACATTTGCGGTGCTGAGCCGCCTGGTGGCCCATGGGAAACAG  888

Query  613  CTGTTCCTCATCACCAACAGTCCTTTCAGCTTCGTAGACAAGGGGATGCGGCACATGGTGGGTCCCGATTGGCG  686
            |||||||||||.|||||||||||.||||||||.||.|||||.||.||||||||||||||.||||||||||||||
Sbjct  889  CTGTTCCTCATTACCAACAGTCCCTTCAGCTTTGTGGACAAAGGTATGCGGCACATGGTAGGTCCCGATTGGCG  962

Query  687  CCAGCTCTTCGATGTGGTCATTGTCCAGGCAGACAAGCCCAGCTTCTTCACTGACCGGCGCAAGCCTTTCAGAA  760
            |||.||||||||.||.|||||.|||||||||||||||||||.|||.|||||.|||.|||||||||||||..|.|
Sbjct  963  CCAACTCTTCGACGTCGTCATCGTCCAGGCAGACAAGCCCAACTTTTTCACCGACAGGCGCAAGCCTTTTCGCA  1036

Query  761  AACTCGATGAGAAGGGCTCACTTCAGTGGGACCGGATCACCCGCTTGGAAAAGGGCAAGATCTATCGGCAGGGA  834
            |.||.||.|||||||||||.||.||.||||||||.|||||.|||.|.||.||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  AGCTTGACGAGAAGGGCTCCCTCCACTGGGACCGTATCACTCGCCTAGAGAAGGGCAAGATCTATCGGCAGGGA  1110

Query  835  AACCTGTTTGA-CTTCTTGCGCTTGACGGAATGGCGTGGCCCCCGCGTGCTCTACTTCGGGGACCACCTCTATA  907
            ||||||||||| .||||| ||..|||||||||||||.||.||.||.||||||||||||||.||||||||.||.|
Sbjct 1111  AACCTGTTTGATTTTCTT-CGTCTGACGGAATGGCGAGGGCCGCGTGTGCTCTACTTCGGTGACCACCTTTACA  1183

Query  908  GTGATCTGGCGGATCTCATGCTGCGGCACGGCTGGCGCACAGGCGCCATCATCCCCGAGCTGGAGCGTGAGATC  981
            ||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||||||||.|||||||||||.||||||
Sbjct 1184  GTGACCTGGCGGATCTCATGCTGCGGCACGGCTGGCGCACGGGAGCCATCATCCCTGAGCTGGAGCGCGAGATC  1257

Query  982  CGCATCATCAACACGGAGCAGTACATGCACTCGCTGACGTGGCAACAGGCGCTCACGGGGCTGCTGGAGCGCAT  1055
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.|||||.|||||.|||||||||||||||||
Sbjct 1258  CGCATCATCAACACGGAGCAGTACATGCACTCGCTGACCTGGCAGCAGGCTCTCACTGGGCTGCTGGAGCGCAT  1331

Query 1056  GCAGACCTATCAGGACGCGGAGTCGAGGCAGGTGCTGGCTGCCTGGATGAAAGAGCGGCAGGAGCTGAGGTGCA  1129
            |||||||||||||||.||.|||||..||||||||||||||.||||||||||.||||||||.||.|||||.||||
Sbjct 1332  GCAGACCTATCAGGATGCAGAGTCACGGCAGGTGCTGGCTACCTGGATGAAGGAGCGGCAAGAACTGAGATGCA  1405

Query 1130  TCACCAAGGCCCTGTTCAATGCGCAGTTCGGCAGCATCTTCCGCACCTTCCACAACCCCACCTACTTCTCAAGG  1203
            ||||.||||||||.|||||.||.||||||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||..||
Sbjct 1406  TCACAAAGGCCCTATTCAACGCCCAGTTCGGGAGCATCTTCCGCACCTTCCACAACCCTACCTACTTCTCCCGG  1479

Query 1204  CGCCTCGTGCGCTTCTCTGACCTCTACATGGCCTCCCTCAGCTGCCTGCTCAACTACCGCGTGGACTTCACCTT  1277
            |||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||
Sbjct 1480  CGCCTCGTGCGCTTCTCCGACCTCTACATGGCCTCACTCAGCTGCCTGCTCAACTACCGCGTAGACTTCACCTT  1553

Query 1278  CTACCCACGCCGTACGCCGCTGCAGCACGAGGCACCCCTCTGGATGGACCAGCTCTGCACCGGCTGCATGAAGA  1351
            ||||||.|||||.||.||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.|||||||||||||
Sbjct 1554  CTACCCGCGCCGCACACCCCTGCAGCACGAGGCACCCCTCTGGATGGACCAGCTGTGCACTGGCTGCATGAAGA  1627

Query 1352  CCCCCTTCCTTGGTGACATGGCCCACATCCGC  1383
            |.|||||.||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1628  CACCCTTTCTTGGTGACATGGCCCACATCCGC  1659