Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- TRCN0000477930
- Subject:
- NM_001042727.2
- Aligned Length:
- 1407
- Identities:
- 1153
- Gaps:
- 111
Alignment
Query 1 ATGGCCACCAATAAGGAGCGACTCTTTGCGGC-TGG-------TGCCCTGGG--------GCCTGGATCTGGCT 58
||| || ||||| || ||| ||.||.||| |.|||.||..|||.
Sbjct 1 ATG--------TA-----CGACT-------GCATGGAATCGTTTGTCCCGGGTCCGCGACGGCTGTATGGGGCG 54
Query 59 AC----CCAGGGGCAGGTTTCCCCTTCGCCTTCCCAGGGGCACT--CAGGGGGTCTCC-GCCTTTCGAGATGC- 124
.| ||.|||||.||.|| .||.|.|||.|.|||| ||| |||| || ||| ||
Sbjct 55 GCCGGGCCCGGGGCCGGCTT--------ACTACGCAGAGCCACTGGCAG-----CTCCTGC--TTC-----GCC 108
Query 125 -----TGAGCCCTAGCTTCCGGGGCCTGGGC-CAGCCTGACC--TCCCCAAGGAGATGGCCTCTCTGTCGGTGG 190
||||.|.| || |||||||| ||||||| || ||..||| |||||||
Sbjct 109 GGACTTGAGTCTT---TT-----GCCTGGGCACAGCCTG-CCAGTCTACAA----------------TCGGTGG 157
Query 191 AGACACAGAGCACCAGCTCAGAGGAGATGGTGCCCAGCTCGCCCTCGCCCCCTCCGCCTCCTCGGGTCTACAAG 264
|||||||||||||||||||.|||||||||||.||||||||.|||||.|||||.||.||||||||||||||.|||
Sbjct 158 AGACACAGAGCACCAGCTCGGAGGAGATGGTACCCAGCTCTCCCTCACCCCCACCACCTCCTCGGGTCTATAAG 231
Query 265 CCATGCTTCGTGTGCAATGACAAGTCCTCTGGCTACCACTATGGGGTCAGCTCTTGTGAAGGCTGCAAGGGCTT 338
||||||||.||.||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||
Sbjct 232 CCATGCTTTGTATGCAATGACAAGTCTTCTGGCTACCACTATGGGGTCAGCTCCTGTGAAGGCTGCAAGGGCTT 305
Query 339 CTTTCGCCGAAGCATCCAGAAGAACATGGTGTACACGTGTCACCGCGACAAAAACTGTATCATCAACAAGGTGA 412
|||..|.||.|||||.|||||.|||||||||||.||.||||||||.||||||||||||||||||||||||||.|
Sbjct 306 CTTCAGACGCAGCATTCAGAAAAACATGGTGTATACATGTCACCGTGACAAAAACTGTATCATCAACAAGGTCA 379
Query 413 CCAGGAATCGCTGCCAGTACTGCCGGCTACAGAAGTGCTTCGAAGTGGGCATGTCCAAGGAAGCTGTGCGAAAT 486
||||.|||||.||||||||||||.|||||||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||..|.||.
Sbjct 380 CCAGAAATCGATGCCAGTACTGCAGGCTACAAAAGTGTTTCGAAGTGGGCATGTCCAAGGAAGCTGTAAGGAAC 453
Query 487 GACCGGAACAAGAAGAAGAAAGAGGTGAAGGAAGAAGGGTCACCTGACAGCTATGAGCTGAGCCCTCAGTTAGA 560
||.||.|||||||||||.||.|||||.||.||.||.||.||.||.|||||||||||.|||||.||.||||||||
Sbjct 454 GATCGAAACAAGAAGAAAAAGGAGGTAAAAGAGGAGGGCTCGCCCGACAGCTATGAACTGAGTCCACAGTTAGA 527
Query 561 AGAGCTCATCACCAAGGTCAGCAAAGCCCATCAGGAGACTTTCCCCTCGCTCTGCCAGCTGGGCAAGTATACCA 634
.||.||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||.||||||||||||||||||||.||||
Sbjct 528 GGAACTCATCACCAAGGTCAGCAAAGCCCACCAGGAGACTTTTCCCTCACTCTGCCAGCTGGGCAAGTACACCA 601
Query 635 CGAACTCCAGTGCAGACCACCGCGTGCAGCTGGATCTGGGGCTGTGGGACAAGTTCAGTGAGCTGGCTACCAAG 708
||||||||||||||||.|||||.|||||||||||.|||||||||||||||||||||||.||||||||.|||||.
Sbjct 602 CGAACTCCAGTGCAGATCACCGGGTGCAGCTGGACCTGGGGCTGTGGGACAAGTTCAGCGAGCTGGCCACCAAA 675
Query 709 TGCATCATCAAGATCGTGGAGTTTGCCAAGCGGTTGCCTGGCTTTACAGGGCTCAGCATTGCTGACCAGATCAC 782
||||||||||||||.|||||||||||.||||||.|||||||.||||||||||||||||||||.|||||||||||
Sbjct 676 TGCATCATCAAGATTGTGGAGTTTGCGAAGCGGCTGCCTGGTTTTACAGGGCTCAGCATTGCCGACCAGATCAC 749
Query 783 TCTGCTCAAAGCTGCCTGCCTAGATATCCTGATGCTGCGTATCTGCACAAGGTACACCCCAGAGCAGGACACCA 856
.||||||||.|||||.||.||.||.|||||.||||||||.|||||.||||||||.|||||||||||||||||.|
Sbjct 750 GCTGCTCAAGGCTGCTTGTCTGGACATCCTAATGCTGCGGATCTGTACAAGGTATACCCCAGAGCAGGACACTA 823
Query 857 TGACCTTCTCCGACGGGCTGACCCTGAACCGGACCCAGATGCACAATGCCGGCTTCGGGCCCCTCACAGACCTT 930
||||.|||||.||.|||||||||||||||||.|||||||||||||||||.|||||.||||||||.||||||||.
Sbjct 824 TGACATTCTCGGATGGGCTGACCCTGAACCGAACCCAGATGCACAATGCTGGCTTTGGGCCCCTTACAGACCTC 897
Query 931 GTCTTTGCCTTTGCTGGGCAGCTCCTGCCCCTGGAGATGGATGACACCGAGACAGGGCTGCTCAGCGCCATCTG 1004
||||||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.|||||.||.||.||.|||||
Sbjct 898 GTCTTTGCCTTTGCCGGGCAGCTGCTGCCCCTGGAGATGGATGACACCGAGACTGGGCTACTTAGTGCTATCTG 971
Query 1005 CCTCATCTGCGGAGACCGCATGGACCTGGAGGAGCCCGAAAAAGTGGACAAGCTGCAGGAGCCACTGCTGGAAG 1078
|||||||||.||||||||.|||||||||||.||||||||.||.||||||||||||||||||||.||||||||||
Sbjct 972 CCTCATCTGTGGAGACCGAATGGACCTGGAAGAGCCCGAGAAGGTGGACAAGCTGCAGGAGCCCCTGCTGGAAG 1045
Query 1079 CCCTGAGGCTGTACGCCCGGCGCCGGCGGCCCAGCCAGCCCTACATGTTCCCAAGGATGCTAATGAAAATCACC 1152
||||||||||.||.||||||||.|||.|.||||||||.|||||||||||||||||||||||.||||||||||||
Sbjct 1046 CCCTGAGGCTCTATGCCCGGCGACGGAGACCCAGCCAACCCTACATGTTCCCAAGGATGCTGATGAAAATCACC 1119
Query 1153 GACCTCCGGGGCATCAGCACTAAGGGAGCTGAAAGGGCCATTACTCTGAAGATGGAGATTCCAGGCCCGATGCC 1226
|||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.||.||.|||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1120 GACCTCCGGGGCATCAGCACTAAGGGAGCAGAAAGGGCTATAACCCTGAAGATGGAGATTCCAGGCCCGATGCC 1193
Query 1227 TCCCTTAATCCGAGAGATGCTGGAGAACCCTGAAATGTTTGAGGATGACTCCTCGCAGCCTGGTCCCCACCCCA 1300
.|||.|.|||||||||||||||||||||||.||.|||||||||||.|||||||||.|||||||.||||||||||
Sbjct 1194 ACCCCTGATCCGAGAGATGCTGGAGAACCCGGAGATGTTTGAGGACGACTCCTCGAAGCCTGGCCCCCACCCCA 1267
Query 1301 ATGCCTCTAGCGAGGATGAGGTTCCTGGGGGCCAGGGCAAAGGGGGCCTGAAGTCCCCAGCC------------ 1362
|.||.||.||.|||||.||.|.|||.|||||||||||||||.|||||| .|||||||||.||
Sbjct 1268 AGGCTTCCAGTGAGGACGAAGCTCCAGGGGGCCAGGGCAAAAGGGGCC-AAAGTCCCCAACCTGACCAGGGGCC 1340
Query 1363 - 1362
Sbjct 1341 C 1341